Semi-nested PCR para a detecção molecular do fungo Paracoccidioides brasiliensis

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Koishi, Andrea Cristine
Data de Publicação: 2008
Tipo de documento: Dissertação
Idioma: por
Título da fonte: Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UEL
Texto Completo: https://repositorio.uel.br/handle/123456789/8861
Resumo: Resumo: Paracoccidioides brasiliensis é um fungo termo-dimórfico e agente etiológico da paracoccidioidomicose (PCM), uma micose sistêmica endêmica na América Latina A PCM é rotineiramente diagnosticada pela observação direta das células do fungo, por cultura celular ou ainda por métodos sorológicos Entretanto, essas técnicas apresentam limitações que podem levar a atrasos para o início do tratamento ou mesmo a resultados falso negativos Neste estudo foi desenvolvida uma reação de semi-nested PCR para a detecção do DNA de P brasiliensis, utilizando a seqüência do DNA ribossomal como alvo Inicialmente, amostras de DNA de P brasiliensis (cepas Pb18 e LDR1) e de outros fungos patogênicos foram extraídas e usadas para se determinar o limite de detecção da reação e a ocorrência de reações cruzadas Para avaliar a reação de semi-nested, ela foi comparada com os métodos de cultivo e histopatologia quanto à capacidade de detecção de P brasiliensis Pb18 em amostras de tecidos de camundongos experimentalmente infectados E ainda, a reação desenvolvida neste trabalho foi utilizada para a detecção do fungo em amostras de biópsia bucal de pacientes com suspeita de PCM e solo de tocas de tatu e formigueiros Na tentativa de otimizar a reação foi desenvolvida uma semi-nested PCR em uma única etapa A semi-nested PCR mostrou-se específica para P brasiliensis e o limite de detecção foi de 2,5 pg de DNA ou 1 células do fungo No estudo comparativo a semi-nested PCR e a histopatologia foram positivas para todas as amostras de animais infectados, inclusive quando parafinadas, enquanto que a cultura foi positiva apenas para 6% das amostras A semi-nested PCR também foi positiva para as 4 amostras de pacientes com PCM e para duas amostras de solo, uma de toca de tatu e outra de formigueiro A semi-nested PCR em um tubo foi específica para P brasiliensis, porém, com um limite de detecção de ,25 ng de DNA Este estudo mostrou a alta sensibilidade e especificidade dessa nova reação de semi-nested PCR para a detecção molecular de P brasiliensis em amostras de biópsias, em tecidos embebidos em parafina e mesmo do solo
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Universidade Estadual de Londrina, Centro de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Patologia ExperimentalAbstract: Paracoccidioides brasiliensis is a thermally dimorphic fungus and the etiologic agent of paracoccidioidomycosis (PCM), a systemic mycosis endemic in Latin America PCM is routinely diagnosed by direct observation of fungi cells, by culture or serological tests However, these techniques present limitations that could result in delay for the beginning of treatment or even false negatives results In this study a semi-nested PCR assay for the detection of P brasiliensis was evaluated, using sequences of the rDNA as a target Initially, DNA samples of two P brasiliensis isolates (LDR1 and Pb18) and other pathogenic fungi were extracted and used to determine the limit of detection and cross-reactivity To evaluate the semi-nested PCR assay, it was compared to culture and histopathology methods in detecting P brasiliensis Pb18 in tissue samples of experimentally infected mice Furthermore, the assay developed in this study was used for the fungus detection in oral biopsy specimens of patients with a PCM suspect and in soil of armadillo’s burrow and ant-hill To improve the reaction a one tube semi-nested PCR was also padronized The semi-nested PCR assay was specific for P brasiliensis and the detection limit was 2,5 pg of DNA or 1 fungi cells In the comparative study, the semi-nested assay and histopathology were positive for all infected samples, including the paraffin-embedded ones, while only 6% were positive by cellular culture The semi-nested PCR assay was also positive for 4 PCM patients’ samples and in two environmental samples, one from an armadillo burrow and the other one from an ant-hill One tube semi-nested PCR was specific for P brasiliensis, however, with a detection limit of ,25 ng of DNA This study showed the high sensitivity and specificity of this new semi-nested PCR assay for the detection of P brasiliensis in fresh and paraffin-embedded tissues, and soilVenâncio, Emerson José [Orientador]Silva, Silvana Petrofeza daSaridakis, Halha OstrenskyKoishi, Andrea Cristine2024-05-01T11:40:59Z2024-05-01T11:40:59Z2009.002008info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdfhttps://repositorio.uel.br/handle/123456789/8861porMestradoPatologia ExperimentalCentro de Ciências BiológicasPrograma de Pós-Graduação em Patologia ExperimentalLondrinareponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UELinstname:Universidade Estadual de Londrina (UEL)instacron:UELinfo:eu-repo/semantics/openAccess2024-07-04T01:59:05Zoai:repositorio.uel.br:123456789/8861Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttp://www.bibliotecadigital.uel.br/PUBhttp://www.bibliotecadigital.uel.br/OAI/oai2.phpbcuel@uel.br||opendoar:2024-07-04T01:59:05Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UEL - 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