Polimorfismo de VNTR na região promotora do gene DGAT1 em bovinos leiteiros, caprinos e ovinos
Autor(a) principal: | |
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Data de Publicação: | 2010 |
Tipo de documento: | Dissertação |
Idioma: | por |
Título da fonte: | Repositório Institucional da Universidade Estadual de Maringá (RI-UEM) |
Texto Completo: | http://repositorio.uem.br:8080/jspui/handle/1/1790 |
Resumo: | The DGAT1 gene is a candidate gene involved in fat content in milk and due to its physiological function, this gene is of great interest for dairy cattle improvement. This gene presents a VNTR region with little information, but it suggests that the polymorphism in this region may be related to variations in production. This study analyzed DNA samples from 72 dairy cattle using blood samples taken from tail vein of animals. The genotype and gene frequency of VNTR polymorphism in the DGAT1 gene was obtained directly after PCR amplification. It was found four alleles present in homozygous and heterozygous, whose frequencies were: allele 1 (with three repetitions) of 4%, allele 2 (with four repetitions) of 50%, allele 3 (with five repetitions) of 40% and allele 4 (with six repetitions) of 6%. It was verified the Hardy-Weinberg equilibrium by Chi-square test concluding that the population was not in balance. Most studies on DGAT1 are made in cattle due to its higher representation in milk production. However, goats and sheep also have a production of milk in the market. Using the primers designed previously for the bovine species, the amplified fragments of the promoter region of DGAT1 gene were compared in cattle, goats and sheep. The extraction of genomic DNA was made from blood samples. The primers designed were not efficient, because although the region expected amplified with fragments between 700 and 800 base pairs in the three species, a small percentage of the individuals had any result, which probably occurred due to the high nucleotide variation in the region of annealing primers. There were found a VNTR polymorphism in the promoter region of the DGAT1 gene in Alpine and Saanen breeds. |
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Polimorfismo de VNTR na região promotora do gene DGAT1 em bovinos leiteiros, caprinos e ovinosDGAT1LeiteProdução de gorduraPolimorfismoVNTRDiacilglicerol aciltransferaseBovinoCaprinoOvinoProdução de leiteFrequência gênicaBrasil.DGAT1MilkFat productionPolymorphismVNTRDiacylglycerol acyltransferaseBovineCaprinoSheepMilk productionGene frequencyBrazil.Ciências AgráriasZootecniaThe DGAT1 gene is a candidate gene involved in fat content in milk and due to its physiological function, this gene is of great interest for dairy cattle improvement. This gene presents a VNTR region with little information, but it suggests that the polymorphism in this region may be related to variations in production. This study analyzed DNA samples from 72 dairy cattle using blood samples taken from tail vein of animals. The genotype and gene frequency of VNTR polymorphism in the DGAT1 gene was obtained directly after PCR amplification. It was found four alleles present in homozygous and heterozygous, whose frequencies were: allele 1 (with three repetitions) of 4%, allele 2 (with four repetitions) of 50%, allele 3 (with five repetitions) of 40% and allele 4 (with six repetitions) of 6%. It was verified the Hardy-Weinberg equilibrium by Chi-square test concluding that the population was not in balance. Most studies on DGAT1 are made in cattle due to its higher representation in milk production. However, goats and sheep also have a production of milk in the market. Using the primers designed previously for the bovine species, the amplified fragments of the promoter region of DGAT1 gene were compared in cattle, goats and sheep. The extraction of genomic DNA was made from blood samples. The primers designed were not efficient, because although the region expected amplified with fragments between 700 and 800 base pairs in the three species, a small percentage of the individuals had any result, which probably occurred due to the high nucleotide variation in the region of annealing primers. There were found a VNTR polymorphism in the promoter region of the DGAT1 gene in Alpine and Saanen breeds.O gene DGAT1 é um gene candidato envolvido com o conteúdo de gordura no leite e em razão de sua função fisiológica, esse gene é de grande interesse para o melhoramento dos rebanhos leiteiros. Este gene apresenta uma região com VNTR com poucas informações, mas sugere que o polimorfismo nesta região possa estar relacionado à variação na produção. Neste estudo foram analisadas amostras de DNA de 72 bovinos leiteiros através de amostras de sangue retiradas da veia caudal dos animais. A freqüência genotípica e gênica para o polimorfismo VNTR do gene DGAT1, foram obtidas diretamente após amplificação por PCR. Foram encontrados quatro alelos, presentes em homozigose e heterozigose, cujas frequências foram: alelo 1 (com três repetições) de 4%, alelo 2 (com quatro repetições) de 50%, alelo 3 (com cinco repetições) de 40% e alelo 4 (com seis repetições) de 6%. Foi verificado o equilíbrio de Hardy-Weinberg através do teste de Qui-quadrado concluindo que a população não se encontrava em equilíbrio. A maior parte dos estudos sobre DGAT1 é feita em bovinos por causa de sua maior representatividade na produção leiteira. Entretanto, caprinos e ovinos também apresentam uma produção de leite considerável no mercado. Utilizando-se de primers previamente desenhados para a espécie bovina, foram comparados os fragmentos amplificados da região promotora do gene DGAT1 em bovinos, caprinos e ovinos. A extração do DNA genômico foi feita a partir de amostras de sangue. Os primers desenhados se mostraram pouco eficientes, apesar de amplificar na região esperada com fragmentos entre 700 e 800 pares de base nas três espécies, uma pequena porcentagem dos indivíduos amostrados apresentou qualquer resultado, que provavelmente ocorreu pela alta variação nucleotídica na região de anelamento dos primers. Foi encontrado um 2 polimorfismo de VNTR na região promotora do gene DGAT1 nas raças Alpina e Saanen.viii, 34 fUniversidade Estadual de MaringáBrasilPrograma de Pós-Graduação em ZootecniaUEMMaringá, PRCentro de Ciências AgráriasEliane GasparinoMaria Amélia Menck Soares - UNIOESTEElias Nunes Martins - UEMLuizetti, Fabiane2018-04-06T18:27:39Z2018-04-06T18:27:39Z2010info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesishttp://repositorio.uem.br:8080/jspui/handle/1/1790porinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da Universidade Estadual de Maringá (RI-UEM)instname:Universidade Estadual de Maringá (UEM)instacron:UEM2018-04-06T18:27:39Zoai:localhost:1/1790Repositório InstitucionalPUBhttp://repositorio.uem.br:8080/oai/requestopendoar:2024-04-23T14:54:47.730702Repositório Institucional da Universidade Estadual de Maringá (RI-UEM) - Universidade Estadual de Maringá (UEM)false |
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