Caracterização molecular do fitoplasmas do grupo 16SrIII e um novo fitoplasma do grupo 16SrVII em Vernonia brasiliana
Autor(a) principal: | |
---|---|
Data de Publicação: | 2014 |
Tipo de documento: | Tese |
Idioma: | por |
Título da fonte: | Repositório Institucional da Universidade Estadual de Maringá (RI-UEM) |
Texto Completo: | http://repositorio.uem.br:8080/jspui/handle/1/1328 |
Resumo: | Phytoplasmas are prokaryotic cell wall and mandatory phloem parasites, disease causing in various agronomic crops. Plant Vernonia spp., Asteraceae family, with symptoms of chlorosis and overbudding were found in pastures in the city of Patos de Minas, Minas Gerais, and subsequently occurring in plants in pastures of Piracicaba, São Paulo and Maringa, Parana. The objective of this study was to detect and identify phytoplasmas possibly associated with these symptoms. For this, total DNA of the plants was subjected to double PCR assay employing universal primers for specific detection and identification phytoplasms primers. Products amplified by the universal primers revealed the presence of 42.66% of phytoplasms collected in plants. The use of specific primers showed the occurrence of phytoplasmas affiliated to group 16SrIII. Virtual RFLP Analyses based on enzymatic digestion of the 16S rDNA nucleotide sequence and phylogenetic analysis allowed classifying these as members of phytoplasms 16SrIIII-B and J-16SrIII subgroups. Also identified a phytoplasma group 16SrVII, which was quite distinct from representatives of other subgroups so far described for this group. Observations at scanning electron microscope and transmission revealed the presence of corpuscles typical pleomorphic phytoplasmas in the phloem of symptomatic plants, confirming the results of molecular detection. |
id |
UEM-10_2d24687efdaa0c5e5de05c32643cd9a6 |
---|---|
oai_identifier_str |
oai:localhost:1/1328 |
network_acronym_str |
UEM-10 |
network_name_str |
Repositório Institucional da Universidade Estadual de Maringá (RI-UEM) |
repository_id_str |
|
spelling |
Caracterização molecular do fitoplasmas do grupo 16SrIII e um novo fitoplasma do grupo 16SrVII em Vernonia brasilianaMolecular characterization of the 16Sr III group phytoplasmas and a new 16Sr VII group phytoplasma in Vernonia brasilianaVernonia brasilianaFitoplasmasCaracterização molecularAsteraceaeDuplo PCRIdentificação de fitoplasmasMollicutesHospedeira alternativaGrupo 16SrIIIGrupo 16SrVIIBrasil.VernoniaAsteraceaeAlternative hostsMollicutesNested PCRBrazil.Ciências AgráriasAgronomiaPhytoplasmas are prokaryotic cell wall and mandatory phloem parasites, disease causing in various agronomic crops. Plant Vernonia spp., Asteraceae family, with symptoms of chlorosis and overbudding were found in pastures in the city of Patos de Minas, Minas Gerais, and subsequently occurring in plants in pastures of Piracicaba, São Paulo and Maringa, Parana. The objective of this study was to detect and identify phytoplasmas possibly associated with these symptoms. For this, total DNA of the plants was subjected to double PCR assay employing universal primers for specific detection and identification phytoplasms primers. Products amplified by the universal primers revealed the presence of 42.66% of phytoplasms collected in plants. The use of specific primers showed the occurrence of phytoplasmas affiliated to group 16SrIII. Virtual RFLP Analyses based on enzymatic digestion of the 16S rDNA nucleotide sequence and phylogenetic analysis allowed classifying these as members of phytoplasms 16SrIIII-B and J-16SrIII subgroups. Also identified a phytoplasma group 16SrVII, which was quite distinct from representatives of other subgroups so far described for this group. Observations at scanning electron microscope and transmission revealed the presence of corpuscles typical pleomorphic phytoplasmas in the phloem of symptomatic plants, confirming the results of molecular detection.Fitoplasmas são procariotos sem parede celular e parasitas obrigatórios do floema, causadores de doenças em diversas culturas agronômicas. Plantas de Vernonia spp., família Asteraceae, com sintomas de clorose e superbrotamento foram encontradas em áreas de pastagens do município de Patos de Minas, Minas Gerais, e, posteriormente, em plantas ocorrentes em pastagens de Piracicaba, São Paulo e de Maringá, Paraná. O objetivo do presente trabalho foi detectar e identificar fitoplasmas possivelmente associados a estes sintomas. Para isso, o DNA total das plantas foi submetido ao teste de duplo PCR, empregando-se primers universais para a detecção e primers específicos para identificação de fitoplasmas. Produtos amplificados pelos primers universais revelaram a presença de fitoplasmas em 42,66% das plantas coletadas. O uso de primers específicos demonstrou a ocorrência de fitoplasmas afiliados ao grupo 16SrIII. Análises de RFLP virtual, baseadas na digestão enzimática da sequência nucleotídica do 16S rDNA e análises filogenéticas permitiram classificar estes fitoplasmas como membros dos subgrupos 16SrIIII-B e 16SrIII-J. Também foi identificado um fitoplasma do grupo 16SrVII, o qual se mostrou distinto dos representantes dos demais subgrupos até agora descritos para este grupo. Observações realizadas em microscópio eletrônico de varredura e de transmissão evidenciaram a presença de corpúsculos pleomórficos típicos de fitoplasmas no floema das plantas sintomáticas, confirmando os resultados da detecção molecular.ix, 49 fUniversidade Estadual de MaringáBrasilUEMMaringá, PRPrograma de Pós-Graduação em Genética e MelhoramentoAdriana GonelaIvan Paulo Bedendo - USPClaudete Aparecida Mangolin - UEMJoão Batista Vida - UEMDauri José Tessmann - UEMSilva, Jaqueline Manzatti da2018-04-05T16:26:45Z2018-04-05T16:26:45Z2014info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesishttp://repositorio.uem.br:8080/jspui/handle/1/1328porinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da Universidade Estadual de Maringá (RI-UEM)instname:Universidade Estadual de Maringá (UEM)instacron:UEM2018-04-05T16:26:45Zoai:localhost:1/1328Repositório InstitucionalPUBhttp://repositorio.uem.br:8080/oai/requestopendoar:2024-04-23T14:54:15.521351Repositório Institucional da Universidade Estadual de Maringá (RI-UEM) - Universidade Estadual de Maringá (UEM)false |
dc.title.none.fl_str_mv |
Caracterização molecular do fitoplasmas do grupo 16SrIII e um novo fitoplasma do grupo 16SrVII em Vernonia brasiliana Molecular characterization of the 16Sr III group phytoplasmas and a new 16Sr VII group phytoplasma in Vernonia brasiliana |
title |
Caracterização molecular do fitoplasmas do grupo 16SrIII e um novo fitoplasma do grupo 16SrVII em Vernonia brasiliana |
spellingShingle |
Caracterização molecular do fitoplasmas do grupo 16SrIII e um novo fitoplasma do grupo 16SrVII em Vernonia brasiliana Silva, Jaqueline Manzatti da Vernonia brasiliana Fitoplasmas Caracterização molecular Asteraceae Duplo PCR Identificação de fitoplasmas Mollicutes Hospedeira alternativa Grupo 16SrIII Grupo 16SrVII Brasil. Vernonia Asteraceae Alternative hosts Mollicutes Nested PCR Brazil. Ciências Agrárias Agronomia |
title_short |
Caracterização molecular do fitoplasmas do grupo 16SrIII e um novo fitoplasma do grupo 16SrVII em Vernonia brasiliana |
title_full |
Caracterização molecular do fitoplasmas do grupo 16SrIII e um novo fitoplasma do grupo 16SrVII em Vernonia brasiliana |
title_fullStr |
Caracterização molecular do fitoplasmas do grupo 16SrIII e um novo fitoplasma do grupo 16SrVII em Vernonia brasiliana |
title_full_unstemmed |
Caracterização molecular do fitoplasmas do grupo 16SrIII e um novo fitoplasma do grupo 16SrVII em Vernonia brasiliana |
title_sort |
Caracterização molecular do fitoplasmas do grupo 16SrIII e um novo fitoplasma do grupo 16SrVII em Vernonia brasiliana |
author |
Silva, Jaqueline Manzatti da |
author_facet |
Silva, Jaqueline Manzatti da |
author_role |
author |
dc.contributor.none.fl_str_mv |
Adriana Gonela Ivan Paulo Bedendo - USP Claudete Aparecida Mangolin - UEM João Batista Vida - UEM Dauri José Tessmann - UEM |
dc.contributor.author.fl_str_mv |
Silva, Jaqueline Manzatti da |
dc.subject.por.fl_str_mv |
Vernonia brasiliana Fitoplasmas Caracterização molecular Asteraceae Duplo PCR Identificação de fitoplasmas Mollicutes Hospedeira alternativa Grupo 16SrIII Grupo 16SrVII Brasil. Vernonia Asteraceae Alternative hosts Mollicutes Nested PCR Brazil. Ciências Agrárias Agronomia |
topic |
Vernonia brasiliana Fitoplasmas Caracterização molecular Asteraceae Duplo PCR Identificação de fitoplasmas Mollicutes Hospedeira alternativa Grupo 16SrIII Grupo 16SrVII Brasil. Vernonia Asteraceae Alternative hosts Mollicutes Nested PCR Brazil. Ciências Agrárias Agronomia |
description |
Phytoplasmas are prokaryotic cell wall and mandatory phloem parasites, disease causing in various agronomic crops. Plant Vernonia spp., Asteraceae family, with symptoms of chlorosis and overbudding were found in pastures in the city of Patos de Minas, Minas Gerais, and subsequently occurring in plants in pastures of Piracicaba, São Paulo and Maringa, Parana. The objective of this study was to detect and identify phytoplasmas possibly associated with these symptoms. For this, total DNA of the plants was subjected to double PCR assay employing universal primers for specific detection and identification phytoplasms primers. Products amplified by the universal primers revealed the presence of 42.66% of phytoplasms collected in plants. The use of specific primers showed the occurrence of phytoplasmas affiliated to group 16SrIII. Virtual RFLP Analyses based on enzymatic digestion of the 16S rDNA nucleotide sequence and phylogenetic analysis allowed classifying these as members of phytoplasms 16SrIIII-B and J-16SrIII subgroups. Also identified a phytoplasma group 16SrVII, which was quite distinct from representatives of other subgroups so far described for this group. Observations at scanning electron microscope and transmission revealed the presence of corpuscles typical pleomorphic phytoplasmas in the phloem of symptomatic plants, confirming the results of molecular detection. |
publishDate |
2014 |
dc.date.none.fl_str_mv |
2014 2018-04-05T16:26:45Z 2018-04-05T16:26:45Z |
dc.type.status.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/publishedVersion |
dc.type.driver.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/doctoralThesis |
format |
doctoralThesis |
status_str |
publishedVersion |
dc.identifier.uri.fl_str_mv |
http://repositorio.uem.br:8080/jspui/handle/1/1328 |
url |
http://repositorio.uem.br:8080/jspui/handle/1/1328 |
dc.language.iso.fl_str_mv |
por |
language |
por |
dc.rights.driver.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/openAccess |
eu_rights_str_mv |
openAccess |
dc.publisher.none.fl_str_mv |
Universidade Estadual de Maringá Brasil UEM Maringá, PR Programa de Pós-Graduação em Genética e Melhoramento |
publisher.none.fl_str_mv |
Universidade Estadual de Maringá Brasil UEM Maringá, PR Programa de Pós-Graduação em Genética e Melhoramento |
dc.source.none.fl_str_mv |
reponame:Repositório Institucional da Universidade Estadual de Maringá (RI-UEM) instname:Universidade Estadual de Maringá (UEM) instacron:UEM |
instname_str |
Universidade Estadual de Maringá (UEM) |
instacron_str |
UEM |
institution |
UEM |
reponame_str |
Repositório Institucional da Universidade Estadual de Maringá (RI-UEM) |
collection |
Repositório Institucional da Universidade Estadual de Maringá (RI-UEM) |
repository.name.fl_str_mv |
Repositório Institucional da Universidade Estadual de Maringá (RI-UEM) - Universidade Estadual de Maringá (UEM) |
repository.mail.fl_str_mv |
|
_version_ |
1813258639055519744 |