Transferibilidade de primers ssr heterólogos em Pseudoplatystoma reticulatum

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Penafort, Jefferson Murici
Data de Publicação: 2020
Tipo de documento: Tese
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Institucional da Universidade Estadual de Maringá (RI-UEM)
Texto Completo: http://repositorio.uem.br:8080/jspui/handle/1/6040
Resumo: Orientador: Prof. Dr. Ricardo Pereira Ribeiro
id UEM-10_31d434d30d39c5c2bd4a5cd41473f89f
oai_identifier_str oai:localhost:1/6040
network_acronym_str UEM-10
network_name_str Repositório Institucional da Universidade Estadual de Maringá (RI-UEM)
repository_id_str
spelling Transferibilidade de primers ssr heterólogos em Pseudoplatystoma reticulatumCachara (Pseudoplatystoma reticulatum)Transferibilidade de primers639.31Ciências AgráriasZootecniaOrientador: Prof. Dr. Ricardo Pereira RibeiroTese (doutorado em Zootecnia) - Universidade Estadual de Maringá, 2020RESUMO: As cacharas pertencem ao gênero Pseudoplatystoma, têm como base sua diferenciação por meio somente de coloração padrão e morfologia externa, além de apresentarem grande potencial para a aquicultura pelas suas características zootécnicas, organolépticas e de rendimento de carcaça favoráveis ao atendimento do mercado consumidor, porém seus estoques naturais vêm sofrendo redução nos últimos anos. Para reduzir esse impacto negativo, estudos voltados à conservação estão sendo realizados e cada vez mais, a obtenção de ferramentas genéticas que permitam a discriminação de parâmetros populacionais ou de estoques se torna de grande importância. Em função de seu estado de conservação e seu potencial para o cultivo e apesar de pesquisadores terem desenvolvimento primers microssatélites para a espécie P. reticulam, objetivou-se através do presente estudo avaliar a transferibilidade de primers heterólogos SSR de espécies dos grupos Brachyplatystoma Pseudoplatystoma na cachara (P.reticulam). Foram analisadas amostras de nadadeira caudal de 222 indivíduos. A extração de DNA foi realizada utilizando protocolo com NaCl. A integridade do DNA extraído foi checada em gel de agarose 1%. Foram avaliados 11 primers desenvolvidos para as espécies: Brachyplatystoma rousseauxii, Pseudoplatystoma corruscans, Pseudoplatystoma punctifer. Foi observada amplificação cruzada de três primers específicos para a espécie B. rousseauxii (BR47, BR51 e BR61) e cinco primers específicos para a espécie P. punctifer (PPU01, PPU04, PPU09, PPU10 e PPU15), em P. reticulatum. Três primers: um de B. rousseauxii (BR38), um de P. corruscans (PCOR1) e um de P. punctifer (PPU13) não mostraram amplificação cruzada na espécie analisada. Os resultados indicaram a possibilidade de uso dos oito primers heterólogos amplificados em estudos genéticos em P. reticulatum, os quais amplificaram o total de 97 alelos, com variação de 142pb a 400pb.ABSTRACT: The cacharas belong to the genus Pseudoplatystoma, their differentiation is based on standard color and external morphology and presenting great potential for aquaculture due to their zootechnical, organoleptic characteristics and favorable carcass yield, but their stocks natural resources have been decreasing in recent years. To reduce this negative impact, studies on conservation are being carried out and increasingly, then obtaining genetic tools that allow the population parameters or stocks discrimination becomes of great importance. Due to its conservation status and its potential for cultivation and although researchers have developed microsatellite primers for the species P. reticulam, the objective of this study was to evaluate the transferability of heterologous SSR primers from groups of Brachyplatystoma and Pseudoplatystoma species in the cachara (P. reticulam). Caudal fin samples from 222 individuals were analyzed. DNA extraction was performed using NaCl protocol. The extracted DNA integrity was checked on 1% agarose gel. Eleven primers developed for the species were evaluated: Brachyplatystoma rousseauxii, Pseudoplatystoma corruscans, Pseudoplatystoma punctifer. Cross amplification of three B. rousseauxii-specific primers (BR47, BR51 and BR61) and five P. punctifer-specific primers (PPU01, PPU04, PPU09, PPU10 and PPU15) were observed in P. reticulatum. Three primers: one from B. rousseauxii (BR38), one from P. corruscans (PCOR1) and one from P. punctifer (PPU13) did not show cross amplification in the analyzed species. The results indicated the possibility of using eight amplified heterologous primers in genetic studies in P. reticulatum, which amplified a total of 97 alleles, ranging from 142bp to 400bp.63 f. : il. color., figs., tabs.Universidade Estadual de MaringáDepartamento de ZootecniaPrograma de Pós-Graduação em ZootecniaMaringá, PRCentro de Ciências AgráriasRibeiro, Ricardo Pereira, 1965-Fornari, Darci Carlos, 1978-Lopera Barrero, Nelson Mauricio, 1976-Oliveira, Carlos Antonio Lopes de, 1972-Povh, Jayme Aparecido, 1977-Penafort, Jefferson Murici2020-12-15T15:30:34Z2020-12-15T15:30:34Z2020info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesisapplication/pdfPENAFORT, Jefferson Murici. Transferibilidade de primers ssr heterólogos em Pseudoplatystoma reticulatum. 2020. 63 f. Tese (doutorado em Zootecnia) - Universidade Estadual de Maringá, 2020, Maringá, PR.http://repositorio.uem.br:8080/jspui/handle/1/6040info:eu-repo/semantics/openAccessporreponame:Repositório Institucional da Universidade Estadual de Maringá (RI-UEM)instname:Universidade Estadual de Maringá (UEM)instacron:UEM2020-12-15T15:36:09Zoai:localhost:1/6040Repositório InstitucionalPUBhttp://repositorio.uem.br:8080/oai/requestopendoar:2024-04-23T14:59:04.743359Repositório Institucional da Universidade Estadual de Maringá (RI-UEM) - Universidade Estadual de Maringá (UEM)false
dc.title.none.fl_str_mv Transferibilidade de primers ssr heterólogos em Pseudoplatystoma reticulatum
title Transferibilidade de primers ssr heterólogos em Pseudoplatystoma reticulatum
spellingShingle Transferibilidade de primers ssr heterólogos em Pseudoplatystoma reticulatum
Penafort, Jefferson Murici
Cachara (Pseudoplatystoma reticulatum)
Transferibilidade de primers
639.31
Ciências Agrárias
Zootecnia
title_short Transferibilidade de primers ssr heterólogos em Pseudoplatystoma reticulatum
title_full Transferibilidade de primers ssr heterólogos em Pseudoplatystoma reticulatum
title_fullStr Transferibilidade de primers ssr heterólogos em Pseudoplatystoma reticulatum
title_full_unstemmed Transferibilidade de primers ssr heterólogos em Pseudoplatystoma reticulatum
title_sort Transferibilidade de primers ssr heterólogos em Pseudoplatystoma reticulatum
author Penafort, Jefferson Murici
author_facet Penafort, Jefferson Murici
author_role author
dc.contributor.none.fl_str_mv Ribeiro, Ricardo Pereira, 1965-
Fornari, Darci Carlos, 1978-
Lopera Barrero, Nelson Mauricio, 1976-
Oliveira, Carlos Antonio Lopes de, 1972-
Povh, Jayme Aparecido, 1977-
dc.contributor.author.fl_str_mv Penafort, Jefferson Murici
dc.subject.por.fl_str_mv Cachara (Pseudoplatystoma reticulatum)
Transferibilidade de primers
639.31
Ciências Agrárias
Zootecnia
topic Cachara (Pseudoplatystoma reticulatum)
Transferibilidade de primers
639.31
Ciências Agrárias
Zootecnia
description Orientador: Prof. Dr. Ricardo Pereira Ribeiro
publishDate 2020
dc.date.none.fl_str_mv 2020-12-15T15:30:34Z
2020-12-15T15:30:34Z
2020
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/doctoralThesis
format doctoralThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv PENAFORT, Jefferson Murici. Transferibilidade de primers ssr heterólogos em Pseudoplatystoma reticulatum. 2020. 63 f. Tese (doutorado em Zootecnia) - Universidade Estadual de Maringá, 2020, Maringá, PR.
http://repositorio.uem.br:8080/jspui/handle/1/6040
identifier_str_mv PENAFORT, Jefferson Murici. Transferibilidade de primers ssr heterólogos em Pseudoplatystoma reticulatum. 2020. 63 f. Tese (doutorado em Zootecnia) - Universidade Estadual de Maringá, 2020, Maringá, PR.
url http://repositorio.uem.br:8080/jspui/handle/1/6040
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
dc.publisher.none.fl_str_mv Universidade Estadual de Maringá
Departamento de Zootecnia
Programa de Pós-Graduação em Zootecnia
Maringá, PR
Centro de Ciências Agrárias
publisher.none.fl_str_mv Universidade Estadual de Maringá
Departamento de Zootecnia
Programa de Pós-Graduação em Zootecnia
Maringá, PR
Centro de Ciências Agrárias
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Repositório Institucional da Universidade Estadual de Maringá (RI-UEM)
instname:Universidade Estadual de Maringá (UEM)
instacron:UEM
instname_str Universidade Estadual de Maringá (UEM)
instacron_str UEM
institution UEM
reponame_str Repositório Institucional da Universidade Estadual de Maringá (RI-UEM)
collection Repositório Institucional da Universidade Estadual de Maringá (RI-UEM)
repository.name.fl_str_mv Repositório Institucional da Universidade Estadual de Maringá (RI-UEM) - Universidade Estadual de Maringá (UEM)
repository.mail.fl_str_mv
_version_ 1801841434515472384

Registros relacionados