Diversidade genética de isolados do complexo Diaporthe/Phomopsis em soja no Brasil
Autor(a) principal: | |
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Data de Publicação: | 2010 |
Tipo de documento: | Dissertação |
Idioma: | por |
Título da fonte: | Repositório Institucional da Universidade Estadual de Maringá (RI-UEM) |
Texto Completo: | http://repositorio.uem.br:8080/jspui/handle/1/1217 |
Resumo: | The Diaporthe/Phomopsis complex is responsible for diseases known as the pod and stem blight, stem canker and seed decay. The aim of this work were to identify and determine the genetic diversity of isolates from different regions, using morphological and molecular techniques. One hundred and thirty-five isolates were characterized morphologically and differentiated into seven groups. Were used 10 primers in the RAPD technique and polymorphism obtained was made a dendrogram showing large genetic diversity among isolates, with similarity coefficients ranging from 0.45 to 1.0. PCR-RFLP analysis were performed using restriction enzymes Alu I, Rsa I and Hha I for ITS region, ß-tubulin gene, Rsa I and HhaI for the elongation factor EF-1α gene. The comparison of digested fragments showed great polymorphism among the isolates. Phylogenetic analysis for each gene studied allowed to identify and infer the evolutionary relationships of the isolates. These results indicated high genetic diversity and the phylogenetic relationships of isolates Diaporthe/Phomopsis complex from different geographical regions of the country. |
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Diversidade genética de isolados do complexo Diaporthe/Phomopsis em soja no BrasilCancro da hasteSojaDoenças e pragasMarcadores molecularesDiversidade genéticaMarcadores moleculares (RAPD)UsoFator de alongamento 1FilogeniaBrasil.RAPDITSTubulin geneElongation factorPhylogenyBrazil.Ciências AgráriasAgronomiaThe Diaporthe/Phomopsis complex is responsible for diseases known as the pod and stem blight, stem canker and seed decay. The aim of this work were to identify and determine the genetic diversity of isolates from different regions, using morphological and molecular techniques. One hundred and thirty-five isolates were characterized morphologically and differentiated into seven groups. Were used 10 primers in the RAPD technique and polymorphism obtained was made a dendrogram showing large genetic diversity among isolates, with similarity coefficients ranging from 0.45 to 1.0. PCR-RFLP analysis were performed using restriction enzymes Alu I, Rsa I and Hha I for ITS region, ß-tubulin gene, Rsa I and HhaI for the elongation factor EF-1α gene. The comparison of digested fragments showed great polymorphism among the isolates. Phylogenetic analysis for each gene studied allowed to identify and infer the evolutionary relationships of the isolates. These results indicated high genetic diversity and the phylogenetic relationships of isolates Diaporthe/Phomopsis complex from different geographical regions of the country.O complexo Diaporthe/Phomopsis é responsável por doenças conhecidas como a queima da haste e da vagem, pelo cancro da haste e pela podridão de sementes da soja. Este estudo teve como objetivo determinar a diversidade genética de isolados de diferentes regiões do Brasil, utilizando características culturais e técnicas moleculares. Cento e trinta e cinco isolados foram caracterizados morfologicamente e diferenciados em sete grupos. Foram utilizados 10 iniciadores para amplificação de RAPD e com os perfis de polimorfismo foi construído um dendrograma mostrando grande diversidade genética entre os isolados, com coeficientes de similaridade variando de 0,45 a 1,0. A análise de PCR-RFLP foi feita utilizando as endonucleases Alu I, Rsa I e Hha I para as regiões ITS e ß-tubulina e Rsa I e Hha I para a região do fator de alongamento I α (EF-l α). A comparação dos fragmentos digeridos apresentou grande polimorfismo entre os isolados. As análises do sequenciamento permitiram a construção de árvores filogenéticas para cada região gênica estudada, sendo possível identificar e inferir as relações evolutivas dos isolados. Com os resultados obtidos foi possível verificar a grande diversidade genética e inferir as relações filogenéticas de isolados do complexo Diaporthe/Phornopsis de diferentes regiões geográficas do Brasil.viii, 53 fUniversidade Estadual de MaringáBrasilUEMMaringá, PRPrograma de Pós-Graduação em AgronomiaEliezer Rodrigues de SoutoDauri José Tessmann - UEMClaudine Dinali dos Santos Seixas - EMBRAPASoldera, Maria Cecília do Amaral2018-04-04T19:47:33Z2018-04-04T19:47:33Z2010info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesishttp://repositorio.uem.br:8080/jspui/handle/1/1217porinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da Universidade Estadual de Maringá (RI-UEM)instname:Universidade Estadual de Maringá (UEM)instacron:UEM2018-04-04T19:47:33Zoai:localhost:1/1217Repositório InstitucionalPUBhttp://repositorio.uem.br:8080/oai/requestopendoar:2024-04-23T14:54:07.863381Repositório Institucional da Universidade Estadual de Maringá (RI-UEM) - Universidade Estadual de Maringá (UEM)false |
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The Diaporthe/Phomopsis complex is responsible for diseases known as the pod and stem blight, stem canker and seed decay. The aim of this work were to identify and determine the genetic diversity of isolates from different regions, using morphological and molecular techniques. One hundred and thirty-five isolates were characterized morphologically and differentiated into seven groups. Were used 10 primers in the RAPD technique and polymorphism obtained was made a dendrogram showing large genetic diversity among isolates, with similarity coefficients ranging from 0.45 to 1.0. PCR-RFLP analysis were performed using restriction enzymes Alu I, Rsa I and Hha I for ITS region, ß-tubulin gene, Rsa I and HhaI for the elongation factor EF-1α gene. The comparison of digested fragments showed great polymorphism among the isolates. Phylogenetic analysis for each gene studied allowed to identify and infer the evolutionary relationships of the isolates. These results indicated high genetic diversity and the phylogenetic relationships of isolates Diaporthe/Phomopsis complex from different geographical regions of the country. |
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