Proteínas expressas durante a ontogenia do botão floral de algodoeiro (Gossypium hirsutum L.)
Autor(a) principal: | |
---|---|
Data de Publicação: | 2019 |
Tipo de documento: | Dissertação |
Idioma: | por |
Título da fonte: | Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UEPB |
Texto Completo: | http://tede.bc.uepb.edu.br/jspui/handle/tede/4287 |
Resumo: | O algodoeiro é considerado uma das principais commodities mundial. No cenário nacional, devido ao seu valor econômico e social, o algodão ocupa lugar de destaque como uma das mais importantes culturas produzidas no país. O gênero Gossypium apresenta aspectos únicos quanto a reprodução e por esse motivo atrai o interesse científico. Estudos relacionados a identificação de proteínas presentes na estrutura reprodutiva do algodoeiro e os respectivos genes podem auxiliar o melhoramento de plantas para obtenção de cultivares com resistência a insetos. Neste trabalho, objetivou-se investigar as proteínas expressas no botão floral do algodoeiro em diferentes fases de desenvolvimento. Para estabelecer a melhor metodologia de extração de proteínas foram testados dois protocolos: TCA e TCA associado ao método fenol (TCA/Fenol), sendo o segundo o que ofereceu melhor resultado, motivo pelo qual foi escolhido para as análises. As proteínas extraídas foram analisadas por eletroforese em gel de poliacrilamida em presença de Dodecil Sulfato de Sódio (SDS-PAGE). As diferentes fases de desenvolvimento do botão floral (2 a 20 mm) apresentaram perfil proteico semelhante, mas com algumas bandas diferencialmente acumuladas. Um total de 34 bandas provenientes da eletroforese de botões florais com 2, 12 e 20 mm foram excisadas para análise por espectrometria de massas em AutoFlex III ToF/ToF, através de MALDI-TOF MS. Os espectros de massas obtidos foram analisados na base de dados MASCOT que permitiu a identificação de 241 proteínas acumuladas em botão floral de algodoeiro, 132 destas caracterizadas e com papeis celulares claros, contudo apenas seis apresentaram score significativo quando comparadas com os bancos de dados, são elas: ATP sintase subunidade alfa, mitocondrial; Fator de transcrição RADIALIS; Proteína F-box associada a FBD At5g56380; Proteína semelhante ao Retículo; Proteína portadora de acilo 2, mitocondrial; e Gliceraldeído-3-fosfato desidrogenase. A partir destes resultados é possível inferir aspectos funcionais do proteoma de botão floral de algodoeiro, bem como sua associação com fatores fisiológicos e metabólicos. |
id |
UEPB_e9a9a726babdf88c826766756b32c6e6 |
---|---|
oai_identifier_str |
oai:tede.bc.uepb.edu.br:tede/4287 |
network_acronym_str |
UEPB |
network_name_str |
Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UEPB |
repository_id_str |
|
spelling |
Proteínas expressas durante a ontogenia do botão floral de algodoeiro (Gossypium hirsutum L.)ProteômicaEspectrometria de massaCultivo de algodãoMelhoramento de plantasMass spectrometryProteomicsCIENCIAS AGRARIASO algodoeiro é considerado uma das principais commodities mundial. No cenário nacional, devido ao seu valor econômico e social, o algodão ocupa lugar de destaque como uma das mais importantes culturas produzidas no país. O gênero Gossypium apresenta aspectos únicos quanto a reprodução e por esse motivo atrai o interesse científico. Estudos relacionados a identificação de proteínas presentes na estrutura reprodutiva do algodoeiro e os respectivos genes podem auxiliar o melhoramento de plantas para obtenção de cultivares com resistência a insetos. Neste trabalho, objetivou-se investigar as proteínas expressas no botão floral do algodoeiro em diferentes fases de desenvolvimento. Para estabelecer a melhor metodologia de extração de proteínas foram testados dois protocolos: TCA e TCA associado ao método fenol (TCA/Fenol), sendo o segundo o que ofereceu melhor resultado, motivo pelo qual foi escolhido para as análises. As proteínas extraídas foram analisadas por eletroforese em gel de poliacrilamida em presença de Dodecil Sulfato de Sódio (SDS-PAGE). As diferentes fases de desenvolvimento do botão floral (2 a 20 mm) apresentaram perfil proteico semelhante, mas com algumas bandas diferencialmente acumuladas. Um total de 34 bandas provenientes da eletroforese de botões florais com 2, 12 e 20 mm foram excisadas para análise por espectrometria de massas em AutoFlex III ToF/ToF, através de MALDI-TOF MS. Os espectros de massas obtidos foram analisados na base de dados MASCOT que permitiu a identificação de 241 proteínas acumuladas em botão floral de algodoeiro, 132 destas caracterizadas e com papeis celulares claros, contudo apenas seis apresentaram score significativo quando comparadas com os bancos de dados, são elas: ATP sintase subunidade alfa, mitocondrial; Fator de transcrição RADIALIS; Proteína F-box associada a FBD At5g56380; Proteína semelhante ao Retículo; Proteína portadora de acilo 2, mitocondrial; e Gliceraldeído-3-fosfato desidrogenase. A partir destes resultados é possível inferir aspectos funcionais do proteoma de botão floral de algodoeiro, bem como sua associação com fatores fisiológicos e metabólicos.Cotton is considered one of the main commodities worldwide. In the national scenario, due to its economic and social value, cotton occupies a prominent position as one of the most important crops produced in the country. The genus Gossypium presents unique aspects as to its reproduction and for that reason it attracts the scientific interest. Studies related to the identification of proteins present in the reproductive structure of the cotton plant and their respective genes can help the improvement of plants to obtain cultivars with resistance to insects. In this work, the objective was to investigate the proteins expressed in the floral bud of cotton in different stages of development. In order to establish the best methodology for protein extraction, two protocols were tested: TCA and TCA associated with the phenol method (TCA / Phenol). The second one was the best one, and was chosen for the analysis. The extracted proteins were analyzed by polyacrylamide gel electrophoresis in the presence of sodium dodecyl sulfate (SDS-PAGE). The different phases of development of the floral bud (2 to 20 mm) presented similar protein profile, but with some differentially accumulated bands. A total of 34 bands from 2, 12 and 20 mm floral bud electrophoresis were excised for analysis by mass spectrometry in AutoFlex III ToF / ToF, using MALDI-TOF MS. The mass spectra obtained were analyzed in the MASCOT database, which allowed the identification of 241 proteins accumulated in floral bud of cotton, 132 of these characterized and with clear cellular papers, however only six presented a significant score when compared with the databases, are they: ATP synthase alpha subunit, mitochondrial; Transcription factor RADIALIS; Protein F-box associated with FBD At5g56380; Reticulum-like protein; Acyl carrier protein 2, mitochondrial; and Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase. From these results it is possible to infer functional aspects of the floral bud of cotton, as well as its association with physiological and metabolic factors.Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPESUniversidade Estadual da ParaíbaPró-Reitoria de Pós-Graduação e Pesquisa - PRPGPBrasilUEPBPrograma de Pós-Graduação em Ciências Agrárias - PPGCALima, Liziane Maria de73747211453Vasconcelos, Antônio Sílvio do Egito32155140444Santos, Roseane Cavalcanti dos17469333487Bezerra, Bárbara Belchior2022-03-31T11:53:27Z2019-02-27info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdfBEZERRA, Bárbara Belchior. Proteínas expressas durante a ontogenia do botão floral de algodoeiro (Gossypium hirsutum L.). 2019. 62f. Dissertação (Programa de Pós-Graduação em Ciências Agrárias - PPGCA) - Universidade Estadual da Paraíba, Campina Grande, 2022.http://tede.bc.uepb.edu.br/jspui/handle/tede/4287porinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UEPBinstname:Universidade Estadual da Paraíba (UEPB)instacron:UEPB2022-03-31T11:53:27Zoai:tede.bc.uepb.edu.br:tede/4287Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttp://tede.bc.uepb.edu.br/jspui/PUBhttp://tede.bc.uepb.edu.br/oai/requestbc@uepb.edu.br||opendoar:2022-03-31T11:53:27Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UEPB - Universidade Estadual da Paraíba (UEPB)false |
dc.title.none.fl_str_mv |
Proteínas expressas durante a ontogenia do botão floral de algodoeiro (Gossypium hirsutum L.) |
title |
Proteínas expressas durante a ontogenia do botão floral de algodoeiro (Gossypium hirsutum L.) |
spellingShingle |
Proteínas expressas durante a ontogenia do botão floral de algodoeiro (Gossypium hirsutum L.) Bezerra, Bárbara Belchior Proteômica Espectrometria de massa Cultivo de algodão Melhoramento de plantas Mass spectrometry Proteomics CIENCIAS AGRARIAS |
title_short |
Proteínas expressas durante a ontogenia do botão floral de algodoeiro (Gossypium hirsutum L.) |
title_full |
Proteínas expressas durante a ontogenia do botão floral de algodoeiro (Gossypium hirsutum L.) |
title_fullStr |
Proteínas expressas durante a ontogenia do botão floral de algodoeiro (Gossypium hirsutum L.) |
title_full_unstemmed |
Proteínas expressas durante a ontogenia do botão floral de algodoeiro (Gossypium hirsutum L.) |
title_sort |
Proteínas expressas durante a ontogenia do botão floral de algodoeiro (Gossypium hirsutum L.) |
author |
Bezerra, Bárbara Belchior |
author_facet |
Bezerra, Bárbara Belchior |
author_role |
author |
dc.contributor.none.fl_str_mv |
Lima, Liziane Maria de 73747211453 Vasconcelos, Antônio Sílvio do Egito 32155140444 Santos, Roseane Cavalcanti dos 17469333487 |
dc.contributor.author.fl_str_mv |
Bezerra, Bárbara Belchior |
dc.subject.por.fl_str_mv |
Proteômica Espectrometria de massa Cultivo de algodão Melhoramento de plantas Mass spectrometry Proteomics CIENCIAS AGRARIAS |
topic |
Proteômica Espectrometria de massa Cultivo de algodão Melhoramento de plantas Mass spectrometry Proteomics CIENCIAS AGRARIAS |
description |
O algodoeiro é considerado uma das principais commodities mundial. No cenário nacional, devido ao seu valor econômico e social, o algodão ocupa lugar de destaque como uma das mais importantes culturas produzidas no país. O gênero Gossypium apresenta aspectos únicos quanto a reprodução e por esse motivo atrai o interesse científico. Estudos relacionados a identificação de proteínas presentes na estrutura reprodutiva do algodoeiro e os respectivos genes podem auxiliar o melhoramento de plantas para obtenção de cultivares com resistência a insetos. Neste trabalho, objetivou-se investigar as proteínas expressas no botão floral do algodoeiro em diferentes fases de desenvolvimento. Para estabelecer a melhor metodologia de extração de proteínas foram testados dois protocolos: TCA e TCA associado ao método fenol (TCA/Fenol), sendo o segundo o que ofereceu melhor resultado, motivo pelo qual foi escolhido para as análises. As proteínas extraídas foram analisadas por eletroforese em gel de poliacrilamida em presença de Dodecil Sulfato de Sódio (SDS-PAGE). As diferentes fases de desenvolvimento do botão floral (2 a 20 mm) apresentaram perfil proteico semelhante, mas com algumas bandas diferencialmente acumuladas. Um total de 34 bandas provenientes da eletroforese de botões florais com 2, 12 e 20 mm foram excisadas para análise por espectrometria de massas em AutoFlex III ToF/ToF, através de MALDI-TOF MS. Os espectros de massas obtidos foram analisados na base de dados MASCOT que permitiu a identificação de 241 proteínas acumuladas em botão floral de algodoeiro, 132 destas caracterizadas e com papeis celulares claros, contudo apenas seis apresentaram score significativo quando comparadas com os bancos de dados, são elas: ATP sintase subunidade alfa, mitocondrial; Fator de transcrição RADIALIS; Proteína F-box associada a FBD At5g56380; Proteína semelhante ao Retículo; Proteína portadora de acilo 2, mitocondrial; e Gliceraldeído-3-fosfato desidrogenase. A partir destes resultados é possível inferir aspectos funcionais do proteoma de botão floral de algodoeiro, bem como sua associação com fatores fisiológicos e metabólicos. |
publishDate |
2019 |
dc.date.none.fl_str_mv |
2019-02-27 2022-03-31T11:53:27Z |
dc.type.status.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/publishedVersion |
dc.type.driver.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/masterThesis |
format |
masterThesis |
status_str |
publishedVersion |
dc.identifier.uri.fl_str_mv |
BEZERRA, Bárbara Belchior. Proteínas expressas durante a ontogenia do botão floral de algodoeiro (Gossypium hirsutum L.). 2019. 62f. Dissertação (Programa de Pós-Graduação em Ciências Agrárias - PPGCA) - Universidade Estadual da Paraíba, Campina Grande, 2022. http://tede.bc.uepb.edu.br/jspui/handle/tede/4287 |
identifier_str_mv |
BEZERRA, Bárbara Belchior. Proteínas expressas durante a ontogenia do botão floral de algodoeiro (Gossypium hirsutum L.). 2019. 62f. Dissertação (Programa de Pós-Graduação em Ciências Agrárias - PPGCA) - Universidade Estadual da Paraíba, Campina Grande, 2022. |
url |
http://tede.bc.uepb.edu.br/jspui/handle/tede/4287 |
dc.language.iso.fl_str_mv |
por |
language |
por |
dc.rights.driver.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/openAccess |
eu_rights_str_mv |
openAccess |
dc.format.none.fl_str_mv |
application/pdf |
dc.publisher.none.fl_str_mv |
Universidade Estadual da Paraíba Pró-Reitoria de Pós-Graduação e Pesquisa - PRPGP Brasil UEPB Programa de Pós-Graduação em Ciências Agrárias - PPGCA |
publisher.none.fl_str_mv |
Universidade Estadual da Paraíba Pró-Reitoria de Pós-Graduação e Pesquisa - PRPGP Brasil UEPB Programa de Pós-Graduação em Ciências Agrárias - PPGCA |
dc.source.none.fl_str_mv |
reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UEPB instname:Universidade Estadual da Paraíba (UEPB) instacron:UEPB |
instname_str |
Universidade Estadual da Paraíba (UEPB) |
instacron_str |
UEPB |
institution |
UEPB |
reponame_str |
Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UEPB |
collection |
Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UEPB |
repository.name.fl_str_mv |
Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UEPB - Universidade Estadual da Paraíba (UEPB) |
repository.mail.fl_str_mv |
bc@uepb.edu.br|| |
_version_ |
1813709227665915904 |