Descrição de uma nova variante cariotípica e caracterização do mitogenoma e satelitoma de Rineloricaria lanceolata (Siluriformes, Loricaridae)

• Autor(a) principal: Oliveira, Juliane Vida Lemos de
• Data de Publicação: 2022
• Tipo de documento: Dissertação
• Idioma: por
• Título da fonte: Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UEPG
• Texto Completo: http://tede2.uepg.br/jspui/handle/prefix/3804
• topic: CNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS; Rineloricaria; Satelitoma; Mitogenoma; Polimorfismo; Rineloricaria; Satellitetome; Mitogenome; Polymorphism

Dentre os peixes neotropicais, o gênero Rineloricaria é caracterizado por possuir uma grande diversidade cariotípica. São peixes popularmente conhecidos como bagres blindados. Os dados citogenéticos para o gênero mostram um polimorfismo evidente nessas espécies, com diferentes números diploides e fórmulas cariotípicas, que podem ter a sua origem a partir de rearranjos cromossômicos, como fissões, fussões ou translocações. Neste sentido, os avanços das tecnologias de sequenciamento de genomas e a bioinformática, tem fornecido ferramentas e abordagens para estudos genéticos nesses organismos. Nessa dissertação, exploramos dados obtidos do sequenciamento de Nova Geração (NGS) de Rineloricaria lanceolata e utilizamos uma série de ferramentas de bioinformática. Com isso, objetivamos evidenciar o polimorfismo cariotípico em Rineloricaria lanceolata e explorar os dados obtidos pelo sequenciamento do genoma da espécie, na intenção de levantar hipóteses sobre o surgimento da variação cariotípica no grupo. O mitogenoma parcial foi obtido e a anotação funcional realizada, sendo possível estabelecer o primeiro mitogenoma parcial descrito para o gênero Rineloricaria. O satelitoma de R. lanceolata evidenciou 40 sequências de DNAs repetitivos para a espécie classificadas em diferentes famílias. Com a descoberta das sequências, sugerimos a confecção de marcadores citogenéticos para as sequências mais abundantes no genoma da espécie. A caracterização citogenética da amostra de uma população de R. lanceolata também revelou diferenças significativas nos cariótipos, como uma nova variante ainda não observada para a espécie. Por fim, concluímos que abordagens in silico é um importante complemento para futuras técnicas in situ como FISH, sendo essenciais para responder possíveis questões que cercam a espécie. Portanto, o trabalho atual é um ponto de partida para novas abordagens cario-evolutivas envolvendo o gênero.