Influência da ancestralidade genética na distribuição de alelos e haplótipos HLA -DR e -DQ em uma amostra de pacientes com Diabetes Mellitus Tipo 1
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Data de Publicação: | 2015 |
Tipo de documento: | Dissertação |
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Título da fonte: | Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UERJ |
Texto Completo: | http://www.bdtd.uerj.br/handle/1/7873 |
Resumo: | It is undeniable the influence of human leukocyte antigen class II DR-DQ in the outbreak of type 1 diabetes mellitus. However, the frequency of alleles and haplotypes associated with the disease and their respective effect is diversified among different ethnic groups and geographic regions. Studies in admixed or not Caucasian populations are scarce and face inadequate population stratification, generating spurious associations. In view of this, this study aimed to investigate the genetic ancestry from the distribution of HLA-DRB1, -DQA1 -DQB1 and within ethnic groups observed in the Brazilian population. The genetic ancestry of 972 DM1 patients from different regions of the country was estimated using 46 informative markers of ancestry (AIMs), of whom 479 had the HLA class II loci typed. With the inference of ancestry was observed that the study sample was not properly stratified using the ethnic self-declaration only. Across the country there was a predominance of European ancestry with some regional differences. It was not possible to see differences in the frequencies of HLA haplotypes between ethnic groups, but we found significant differences in the diversity of alleles between groups, the presence of heterozygotes DR3 / DR4 and influence of ethnic origin of haplotype and related effects even at the age diagnosis. In the DM1 Brazilian population the presence of protective haplotypes was higher than expected (28%), of these, 41% was found in the Caucasian group. The presence of protective haplotypes can justify the average age at diagnosis higher observed in our population when compared to the findings of the American population. These data help us understand the genetic variation present in the brazilian population and also the differences in the clinical presentation of type 1 diabetes in different ethnic groups. |
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Studies in admixed or not Caucasian populations are scarce and face inadequate population stratification, generating spurious associations. In view of this, this study aimed to investigate the genetic ancestry from the distribution of HLA-DRB1, -DQA1 -DQB1 and within ethnic groups observed in the Brazilian population. The genetic ancestry of 972 DM1 patients from different regions of the country was estimated using 46 informative markers of ancestry (AIMs), of whom 479 had the HLA class II loci typed. With the inference of ancestry was observed that the study sample was not properly stratified using the ethnic self-declaration only. Across the country there was a predominance of European ancestry with some regional differences. It was not possible to see differences in the frequencies of HLA haplotypes between ethnic groups, but we found significant differences in the diversity of alleles between groups, the presence of heterozygotes DR3 / DR4 and influence of ethnic origin of haplotype and related effects even at the age diagnosis. In the DM1 Brazilian population the presence of protective haplotypes was higher than expected (28%), of these, 41% was found in the Caucasian group. The presence of protective haplotypes can justify the average age at diagnosis higher observed in our population when compared to the findings of the American population. These data help us understand the genetic variation present in the brazilian population and also the differences in the clinical presentation of type 1 diabetes in different ethnic groups.É irrefutável a influência do antígeno leucocitário humano classe II DR-DQ na deflagração do diabetes mellitus tipo 1. Entretanto, a frequência dos alelos e haplótipos ligados à doença e o seu respectivo efeito pode ser distinto entre os diferentes grupos étnicos e regiões geográficas. Estudos em populações miscigenadas ou não caucasianas são escassos e esbarram com a estratificação populacional inadequada, gerando associações espúrias. Diante disto, este estudo buscou investigar a partir da ancestralidade genômica a distribuição dos haplótipos HLA-DRB1, -DQA1 e -DQB1 dentro dos grupos étnicos observados na população brasileira. A ancestralidade genômica de 972 pacientes DM1 de diferentes regiões do país foi estimada utilizando 46 marcadores informativos de ancestralidade (AIMs), destes, 479 tiveram os loci HLA de classe II tipificados. Com a inferência da ancestralidade foi possível observar que a população analisada não seria estratificada corretamente utilizando apenas a autodeclaração étnica. Em todo o país houve predominância de ancestralidade europeia com algumas diferenças regionais. Não foi possível visualizar diferenças nas frequências dos haplótipos HLA entre os grupos étnicos, mas verificamos diferenças relevantes quanto à diversidade de alelos entre os grupos, a presença de indivíduos heterozigotos DR3/DR4 e influência da origem étnica do haplótipo e efeito relacionado ao mesmo na idade ao diagnóstico. Na população DM1 brasileira a presença de haplótipos de proteção foi maior do que o esperado (28%), destes, 41% foi encontrado no grupo caucasiano. A presença de haplótipos de proteção pode justificar a média de idade ao diagnóstico mais elevada observada na nossa população quando comparada aos achados da população americana. Estes dados ajudam a compreender a variação genética presente na população brasileira e também as diferenças observadas na apresentação clínica do DM1 em diferentes grupos étnicos.Submitted by Boris Flegr (boris@uerj.br) on 2021-01-05T18:14:03Z No. of bitstreams: 1 Aline Brazao Gabrielli Dissertacao completa.pdf: 3330237 bytes, checksum: f72b1c4a320d9997291aee099e3136f3 (MD5)Made available in DSpace on 2021-01-05T18:14:03Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Aline Brazao Gabrielli Dissertacao completa.pdf: 3330237 bytes, checksum: f72b1c4a320d9997291aee099e3136f3 (MD5) Previous issue date: 2015-08-26application/pdfporUniversidade do Estado do Rio de JaneiroPrograma de Pós-Graduação em Biologia Humana e ExperimentalUERJBRCentro Biomédico::Instituto de Biologia Roberto Alcantara GomesDiabetes type 1Genetic ancestryHLAHuman Leukocyte AntigenMixed populationAncestryAIM-IndelsDiabetes Mellitus tipo 1Hereditariedade humanaAntígenos de histocompatibilidade HLAAntígenos HLA-DRAntígenos HLA-DPDiabetes Mellitus tipo 1Ancestralidade genéticaHLAAntígenoLeucocitário HumanoPopulação miscigenadaAIM-IndelsCNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS::GENETICAInfluência da ancestralidade genética na distribuição de alelos e haplótipos HLA -DR e -DQ em uma amostra de pacientes com Diabetes Mellitus Tipo 1Influence of genetic ancestry in the distribution of alleles and haplotypes HLA-DR and -DQ in a sample of patients with type 1 diabetesinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UERJinstname:Universidade do Estado do Rio de Janeiro (UERJ)instacron:UERJORIGINALAline Brazao Gabrielli Dissertacao completa.pdfapplication/pdf3330237http://www.bdtd.uerj.br/bitstream/1/7873/1/Aline+Brazao+Gabrielli+Dissertacao+completa.pdff72b1c4a320d9997291aee099e3136f3MD511/78732024-02-26 15:24:03.355oai:www.bdtd.uerj.br:1/7873Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttp://www.bdtd.uerj.br/PUBhttps://www.bdtd.uerj.br:8443/oai/requestbdtd.suporte@uerj.bropendoar:29032024-02-26T18:24:03Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UERJ - Universidade do Estado do Rio de Janeiro (UERJ)false |
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