Taxonomia molecular e estruturação genética populacional das baleias-de-Bryde e baleias-fin (Cetartiodactyla: Balaenopteridae)

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Dias, Carolina Pereira
Data de Publicação: 2015
Tipo de documento: Dissertação
Idioma: por
Título da fonte: Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UERJ
Texto Completo: http://www.bdtd.uerj.br/handle/1/5786
Resumo: The current study aimed to assess the systematics of two Balaenopteridae whales using two mitochondrial markers, the cytochrome b and the control region, and the nuclear intron of α-lactalbumin. The taxonomy of the Bryde s whale complex is still unsettled, and many authors have argued whether Balaenoptera edeni (Anderson 1879) and B. brydei (Olsen, 1913) should be considered conspecific or not. We analyzed 13 specimens from the Brazilian coast (Rio de Janeiro, Paraná, Santa Catarina and Rio Grande do Sul) and sequences of 60 individuals from other regions worldwide (South African coast, Indian and Pacific Oceans) available on Genbank. Significant differences between B. edeni and B. brydei were found and our results support the hypothesis of two different species of Bryde s whale with recent divergence. The species present in the Southwestern Atlantic was identified as B. brydei and showed genetic structure with low rates of genetic diversity. According to the AMOVA results there are five distinct populations throughout the distribution of B. brydei (ΦCT = 0,854, P = 0,010): Southwest Atlantic, South Africa (Atlantic Southeast + Southwest Indian), Northeast Indian Ocean, East Indian Ocean and Northwest Pacific. The second chapter of this work investigated the subspecific status of another Balaenopteridae, the fin whale, Balaenoptera physalus, using the same molecular markers. Currently, three subspecies of fin whales were described and have been accepted: B. p. physalus Linnaeus, 1758 in the Northern Hemisphere; B. p. quoyi Fischer, 1829 in the Southern Hemisphere; and the pygmy form B. p. patachonica Burmeister, 1865, from Patagonia. Recently, molecular data has supported a fourth unnamed subspecies for the Pacific Ocean. In order to test this new hypothesis the present study analyzed 16 new samples collected in Antarctica in addition with sequences from Genbank of the tree ocean basins: North Atlantic, North Pacific and Southern Hemisphere. Cytochrome b phylogenetic reconstructions revealed a distinct clade with the North Pacific samples likewise the control region haplotype network presented a clear separation between the three ocean basins. The population fixation indices were calculated considering the whole species distribution and its results supported the differentiation of the tree ocean basins with very high levels of population structure found (ΦCT =0,517, P = 0,001) The global panmixia was in fact rejected by the AMOVA also for the North Pacific. Insofar the North Atlantic and Southern Hemisphere are probably panmictic.
id UERJ_6029060133c322b64940c854c2c66119
oai_identifier_str oai:www.bdtd.uerj.br:1/5786
network_acronym_str UERJ
network_name_str Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UERJ
repository_id_str 2903
spelling Azevedo, Alexandre de Freitashttp://lattes.cnpq.br/5095457245652366Cunha, Haydée Andradehttp://lattes.cnpq.br/4931150646607381Brito Junior, José Lailsonhttp://lattes.cnpq.br/3722712094233061Zilberberg, Carlahttp://lattes.cnpq.br/4852986852697885http://lattes.cnpq.br/6648293930813710Dias, Carolina Pereira2020-11-08T19:03:57Z2018-12-142015-08-21DIAS, Carolina Pereira. Taxonomia molecular e estruturação genética populacional das baleias-de-Bryde e baleias-fin (Cetartiodactyla: Balaenopteridae). 2015. 123 f. Dissertação (Mestrado em Ecologia e Evolução) - Universidade do Estado do Rio de Janeiro, Rio de Janeiro, 2015.http://www.bdtd.uerj.br/handle/1/5786The current study aimed to assess the systematics of two Balaenopteridae whales using two mitochondrial markers, the cytochrome b and the control region, and the nuclear intron of α-lactalbumin. The taxonomy of the Bryde s whale complex is still unsettled, and many authors have argued whether Balaenoptera edeni (Anderson 1879) and B. brydei (Olsen, 1913) should be considered conspecific or not. We analyzed 13 specimens from the Brazilian coast (Rio de Janeiro, Paraná, Santa Catarina and Rio Grande do Sul) and sequences of 60 individuals from other regions worldwide (South African coast, Indian and Pacific Oceans) available on Genbank. Significant differences between B. edeni and B. brydei were found and our results support the hypothesis of two different species of Bryde s whale with recent divergence. The species present in the Southwestern Atlantic was identified as B. brydei and showed genetic structure with low rates of genetic diversity. According to the AMOVA results there are five distinct populations throughout the distribution of B. brydei (ΦCT = 0,854, P = 0,010): Southwest Atlantic, South Africa (Atlantic Southeast + Southwest Indian), Northeast Indian Ocean, East Indian Ocean and Northwest Pacific. The second chapter of this work investigated the subspecific status of another Balaenopteridae, the fin whale, Balaenoptera physalus, using the same molecular markers. Currently, three subspecies of fin whales were described and have been accepted: B. p. physalus Linnaeus, 1758 in the Northern Hemisphere; B. p. quoyi Fischer, 1829 in the Southern Hemisphere; and the pygmy form B. p. patachonica Burmeister, 1865, from Patagonia. Recently, molecular data has supported a fourth unnamed subspecies for the Pacific Ocean. In order to test this new hypothesis the present study analyzed 16 new samples collected in Antarctica in addition with sequences from Genbank of the tree ocean basins: North Atlantic, North Pacific and Southern Hemisphere. Cytochrome b phylogenetic reconstructions revealed a distinct clade with the North Pacific samples likewise the control region haplotype network presented a clear separation between the three ocean basins. The population fixation indices were calculated considering the whole species distribution and its results supported the differentiation of the tree ocean basins with very high levels of population structure found (ΦCT =0,517, P = 0,001) The global panmixia was in fact rejected by the AMOVA also for the North Pacific. Insofar the North Atlantic and Southern Hemisphere are probably panmictic.No presente trabalho a taxonomia de duas espécies de balenopterídeos foi investigada por meio de marcadores moleculares. Foram utilizadas duas regiões mitocondriais, o citocromo b e a região controle, além de um marcador nuclear, o íntron do gene da α- lactalbumina. O complexo de espécies de baleias-de-Bryde foi investigado em relação ao número de espécies que o compõe, visto que diversos autores questionam se Balaenoptera edeni (Anderson, 1879) e B. brydei (Olsen, 1913) devem ou não ser sinonimizadas. Foram analisadas amostras inéditas de 13 indivíduos da costa brasileira (Rio de Janeiro, Paraná, Santa Catarina e Rio Grande do Sul) e 60 indivíduos de outras regiões do mundo com sequências depositadas no Genbank (África do Sul e Oceanos Índico e Pacífico). Diferenças significativas entre B. edeni e B. brydei foram encontradas no presente estudo, corroborando a hipótese de que se trata de duas espécies distintas com divergência recente. A espécie que ocorre no Atlântico Sudoeste foi identificada como B. brydei e mostrou um alto grau de estruturação populacional com baixos índices de diversidade genética. Cinco populações distintas de B. brydei foram encontradas a partir da AMOVA (ΦCT = 0,854, P = 0,01): Atlântico Sudoeste, África do Sul (Atlântico Sudeste + Índico Sudoeste), Índico Norte, Índico Leste e Pacífico Noroeste. A segunda parte desse trabalho teve o objetivo de investigar o status taxonômico da baleia-fin, Balaenoptera physalus (Linnaeus, 1758) em caráter subespecífico. Atualmente, três subespécies de baleia-fin são reconhecidas: B. p. physalus (Linnaeus, 1758) para o Hemisfério Norte, B. p. quoyi (Fischer, 1829) para o Hemisfério Sul, e a forma pigmeia B. p. patachonica (Burmeister, 1865), descrita para a Patagônia. Contudo, um estudo molecular recente sugeriu a hipótese de uma nova subespécie, ainda sem nome, exclusiva ao Pacífico Norte. No presente trabalho 16 novas amostras coletadas na Antártica foram analisadas conjuntamente com sequências disponíveis das três bacias oceânicas: Atlântico Norte, Pacífico Norte e Hemisfério Sul. Nas reconstruções filogenéticas a partir do citocromo b, foi encontrado um clado diferenciado formado por amostras do Pacífico Norte que podem corresponder à nova subespécie proposta. Adicionalmente, a rede de haplótipos da região controle mostrou uma clara separação entre as três bacias oceânicas. Análises de estruturação populacional foram conduzidas avaliando a distribuição global da espécie, sem considerar a hipótese de subespécies e seus resultados revelaram um elevado grau de estruturação entre as bacias oceânicas (ΦCT =0,517, P = 0,001). O cenário de panmixia para o Pacífico Norte foi rejeitado pela AMOVA, porém o Atlântico Norte e o Hemisfério Sul são provavelmente panmíticos.Submitted by Boris Flegr (boris@uerj.br) on 2020-11-08T19:03:57Z No. of bitstreams: 1 TeseCarolinaEcologiaeEvolucaorevisaofinal.pdf: 4931529 bytes, checksum: 10a0e9a1b46765f51a2a7eb7d16d7a3e (MD5)Made available in DSpace on 2020-11-08T19:03:57Z (GMT). No. of bitstreams: 1 TeseCarolinaEcologiaeEvolucaorevisaofinal.pdf: 4931529 bytes, checksum: 10a0e9a1b46765f51a2a7eb7d16d7a3e (MD5) Previous issue date: 2015-08-21application/pdfporUniversidade do Estado do Rio de JaneiroPrograma de Pós-Graduação em Ecologia e EvoluçãoUERJBRCentro Biomédico::Instituto de Biologia Roberto Alcantara GomesBalaenoptera edeniBalaenoptera brydeiBalaenoptera physalusSouthwest AtlanticMolecular taxonomyPopulation differentiationMitochondrial DNAStocksBalaenoptera edeniBalaenoptera brydeiBalaenoptera physalusAtlântico SudoesteTaxonomia molecularDiferenciação populacionalCNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS::GENETICA::GENETICA ANIMALTaxonomia molecular e estruturação genética populacional das baleias-de-Bryde e baleias-fin (Cetartiodactyla: Balaenopteridae)Molecular taxonomy and population structure of Bryde s and fin whales (Cetardiodactyla: Balaenopteridae)info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UERJinstname:Universidade do Estado do Rio de Janeiro (UERJ)instacron:UERJORIGINALTeseCarolinaEcologiaeEvolucaorevisaofinal.pdfapplication/pdf4931529http://www.bdtd.uerj.br/bitstream/1/5786/1/TeseCarolinaEcologiaeEvolucaorevisaofinal.pdf10a0e9a1b46765f51a2a7eb7d16d7a3eMD511/57862024-02-26 16:13:56.06oai:www.bdtd.uerj.br:1/5786Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttp://www.bdtd.uerj.br/PUBhttps://www.bdtd.uerj.br:8443/oai/requestbdtd.suporte@uerj.bropendoar:29032024-02-26T19:13:56Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UERJ - Universidade do Estado do Rio de Janeiro (UERJ)false
dc.title.por.fl_str_mv Taxonomia molecular e estruturação genética populacional das baleias-de-Bryde e baleias-fin (Cetartiodactyla: Balaenopteridae)
dc.title.alternative.eng.fl_str_mv Molecular taxonomy and population structure of Bryde s and fin whales (Cetardiodactyla: Balaenopteridae)
title Taxonomia molecular e estruturação genética populacional das baleias-de-Bryde e baleias-fin (Cetartiodactyla: Balaenopteridae)
spellingShingle Taxonomia molecular e estruturação genética populacional das baleias-de-Bryde e baleias-fin (Cetartiodactyla: Balaenopteridae)
Dias, Carolina Pereira
Balaenoptera edeni
Balaenoptera brydei
Balaenoptera physalus
Southwest Atlantic
Molecular taxonomy
Population differentiation
Mitochondrial DNA
Stocks
Balaenoptera edeni
Balaenoptera brydei
Balaenoptera physalus
Atlântico Sudoeste
Taxonomia molecular
Diferenciação populacional
CNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS::GENETICA::GENETICA ANIMAL
title_short Taxonomia molecular e estruturação genética populacional das baleias-de-Bryde e baleias-fin (Cetartiodactyla: Balaenopteridae)
title_full Taxonomia molecular e estruturação genética populacional das baleias-de-Bryde e baleias-fin (Cetartiodactyla: Balaenopteridae)
title_fullStr Taxonomia molecular e estruturação genética populacional das baleias-de-Bryde e baleias-fin (Cetartiodactyla: Balaenopteridae)
title_full_unstemmed Taxonomia molecular e estruturação genética populacional das baleias-de-Bryde e baleias-fin (Cetartiodactyla: Balaenopteridae)
title_sort Taxonomia molecular e estruturação genética populacional das baleias-de-Bryde e baleias-fin (Cetartiodactyla: Balaenopteridae)
author Dias, Carolina Pereira
author_facet Dias, Carolina Pereira
author_role author
dc.contributor.advisor1.fl_str_mv Azevedo, Alexandre de Freitas
dc.contributor.advisor1Lattes.fl_str_mv http://lattes.cnpq.br/5095457245652366
dc.contributor.advisor-co1.fl_str_mv Cunha, Haydée Andrade
dc.contributor.advisor-co1Lattes.fl_str_mv http://lattes.cnpq.br/4931150646607381
dc.contributor.referee1.fl_str_mv Brito Junior, José Lailson
dc.contributor.referee1Lattes.fl_str_mv http://lattes.cnpq.br/3722712094233061
dc.contributor.referee2.fl_str_mv Zilberberg, Carla
dc.contributor.referee2Lattes.fl_str_mv http://lattes.cnpq.br/4852986852697885
dc.contributor.authorLattes.fl_str_mv http://lattes.cnpq.br/6648293930813710
dc.contributor.author.fl_str_mv Dias, Carolina Pereira
contributor_str_mv Azevedo, Alexandre de Freitas
Cunha, Haydée Andrade
Brito Junior, José Lailson
Zilberberg, Carla
dc.subject.eng.fl_str_mv Balaenoptera edeni
Balaenoptera brydei
Balaenoptera physalus
Southwest Atlantic
Molecular taxonomy
Population differentiation
Mitochondrial DNA
Stocks
topic Balaenoptera edeni
Balaenoptera brydei
Balaenoptera physalus
Southwest Atlantic
Molecular taxonomy
Population differentiation
Mitochondrial DNA
Stocks
Balaenoptera edeni
Balaenoptera brydei
Balaenoptera physalus
Atlântico Sudoeste
Taxonomia molecular
Diferenciação populacional
CNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS::GENETICA::GENETICA ANIMAL
dc.subject.por.fl_str_mv Balaenoptera edeni
Balaenoptera brydei
Balaenoptera physalus
Atlântico Sudoeste
Taxonomia molecular
Diferenciação populacional
dc.subject.cnpq.fl_str_mv CNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS::GENETICA::GENETICA ANIMAL
description The current study aimed to assess the systematics of two Balaenopteridae whales using two mitochondrial markers, the cytochrome b and the control region, and the nuclear intron of α-lactalbumin. The taxonomy of the Bryde s whale complex is still unsettled, and many authors have argued whether Balaenoptera edeni (Anderson 1879) and B. brydei (Olsen, 1913) should be considered conspecific or not. We analyzed 13 specimens from the Brazilian coast (Rio de Janeiro, Paraná, Santa Catarina and Rio Grande do Sul) and sequences of 60 individuals from other regions worldwide (South African coast, Indian and Pacific Oceans) available on Genbank. Significant differences between B. edeni and B. brydei were found and our results support the hypothesis of two different species of Bryde s whale with recent divergence. The species present in the Southwestern Atlantic was identified as B. brydei and showed genetic structure with low rates of genetic diversity. According to the AMOVA results there are five distinct populations throughout the distribution of B. brydei (ΦCT = 0,854, P = 0,010): Southwest Atlantic, South Africa (Atlantic Southeast + Southwest Indian), Northeast Indian Ocean, East Indian Ocean and Northwest Pacific. The second chapter of this work investigated the subspecific status of another Balaenopteridae, the fin whale, Balaenoptera physalus, using the same molecular markers. Currently, three subspecies of fin whales were described and have been accepted: B. p. physalus Linnaeus, 1758 in the Northern Hemisphere; B. p. quoyi Fischer, 1829 in the Southern Hemisphere; and the pygmy form B. p. patachonica Burmeister, 1865, from Patagonia. Recently, molecular data has supported a fourth unnamed subspecies for the Pacific Ocean. In order to test this new hypothesis the present study analyzed 16 new samples collected in Antarctica in addition with sequences from Genbank of the tree ocean basins: North Atlantic, North Pacific and Southern Hemisphere. Cytochrome b phylogenetic reconstructions revealed a distinct clade with the North Pacific samples likewise the control region haplotype network presented a clear separation between the three ocean basins. The population fixation indices were calculated considering the whole species distribution and its results supported the differentiation of the tree ocean basins with very high levels of population structure found (ΦCT =0,517, P = 0,001) The global panmixia was in fact rejected by the AMOVA also for the North Pacific. Insofar the North Atlantic and Southern Hemisphere are probably panmictic.
publishDate 2015
dc.date.issued.fl_str_mv 2015-08-21
dc.date.available.fl_str_mv 2018-12-14
dc.date.accessioned.fl_str_mv 2020-11-08T19:03:57Z
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/masterThesis
format masterThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.citation.fl_str_mv DIAS, Carolina Pereira. Taxonomia molecular e estruturação genética populacional das baleias-de-Bryde e baleias-fin (Cetartiodactyla: Balaenopteridae). 2015. 123 f. Dissertação (Mestrado em Ecologia e Evolução) - Universidade do Estado do Rio de Janeiro, Rio de Janeiro, 2015.
dc.identifier.uri.fl_str_mv http://www.bdtd.uerj.br/handle/1/5786
identifier_str_mv DIAS, Carolina Pereira. Taxonomia molecular e estruturação genética populacional das baleias-de-Bryde e baleias-fin (Cetartiodactyla: Balaenopteridae). 2015. 123 f. Dissertação (Mestrado em Ecologia e Evolução) - Universidade do Estado do Rio de Janeiro, Rio de Janeiro, 2015.
url http://www.bdtd.uerj.br/handle/1/5786
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
dc.publisher.none.fl_str_mv Universidade do Estado do Rio de Janeiro
dc.publisher.program.fl_str_mv Programa de Pós-Graduação em Ecologia e Evolução
dc.publisher.initials.fl_str_mv UERJ
dc.publisher.country.fl_str_mv BR
dc.publisher.department.fl_str_mv Centro Biomédico::Instituto de Biologia Roberto Alcantara Gomes
publisher.none.fl_str_mv Universidade do Estado do Rio de Janeiro
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UERJ
instname:Universidade do Estado do Rio de Janeiro (UERJ)
instacron:UERJ
instname_str Universidade do Estado do Rio de Janeiro (UERJ)
instacron_str UERJ
institution UERJ
reponame_str Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UERJ
collection Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UERJ
bitstream.url.fl_str_mv http://www.bdtd.uerj.br/bitstream/1/5786/1/TeseCarolinaEcologiaeEvolucaorevisaofinal.pdf
bitstream.checksum.fl_str_mv 10a0e9a1b46765f51a2a7eb7d16d7a3e
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv MD5
repository.name.fl_str_mv Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UERJ - Universidade do Estado do Rio de Janeiro (UERJ)
repository.mail.fl_str_mv bdtd.suporte@uerj.br
_version_ 1811728615732150272