Validação externa de modelos de predição de pneumonia pós cirurgia cardíaca

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Santos, Marisa da Silva
Data de Publicação: 2010
Tipo de documento: Tese
Idioma: por
Título da fonte: Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UERJ
Texto Completo: http://www.bdtd.uerj.br/handle/1/4818
Resumo: This study concerns the external validation of a prediction model for pneumonias after cardiac surgery. It also presents a review of methods and techniques for critical appraisal and performance assessment of clinical predictive models and nomogram applications. Methods: A consecutive series of 527 patients who underwent cardiac surgeries between June 2000 and August 2002 was used to develop a prognostic model.. Multiple logistic regression analysis was performed to predict the occurrence of pneumonia. Diverse simple and conventional preoperative risk factors were evaluated. The model was internal validated with bootstrap. A nomogram was developed to enhance clinical applicability. The performance was evaluated by calibration, discrimination and global measures. Prospective study was done to validate models predicting pneumonia after cardiac surgery with 333 adult patients who underwent cardiac surgery from October 2006 to May 2007. Previously constructed logistic regression (LRM) and classification and regression tree (CART) models were validated with external data. Results: a simple nomogram model was developed and showing low discrimination and good calibration (AUC 0.79, Brier score 0.064, discrimination slope 0.13, Hosmer-Lemeshow p=0.27). Pneumonia occurred in 7.5% of patients in the external validation set. LRM performed better with moderate discrimination (R2 7.1%, Brier=0.06, AROC=0.694) and calibration (Hosmer-Lemeshow P=0.08). Conclusions: Overall agreement between the predicted probabilities and observed frequencies was good in the development and the internal validation set. The nomogram predicts the probability of pneumonia for individual patients and may help in informing patients and surgeons before undergoing cardiac surgery. We validated a model that can identify which patients undergoing cardiac surgery are at high risk for pneumonia. CART performs well in derivation, and looses more discrimination and calibration than LRM in the validation set.
id UERJ_6cdaf447c94537c425d24496f16f862b
oai_identifier_str oai:www.bdtd.uerj.br:1/4818
network_acronym_str UERJ
network_name_str Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UERJ
repository_id_str 2903
spelling Braga, Jose Uelereshttp://lattes.cnpq.br/6027675934625064Barroso, Paulo Feijóhttp://lattes.cnpq.br/6126740128198607Costa, Antonio José Lealhttp://lattes.cnpq.br/8717846472721574Mendonça, Gulnar Azevedo e Silvahttp://lattes.cnpq.br/5225298757437978Werneck, Guilherme Loureirohttp://lattes.cnpq.br/7331062615542814http://lattes.cnpq.br/7445955509219546Santos, Marisa da Silva2020-08-02T16:56:03Z2010-10-072010-04-06SANTOS, Marisa da Silva. Validação externa de modelos de predição de pneumonia pós cirurgia cardíaca. 2010. 92 f. Tese (Doutorado em Ciências Humanas e Saúde; Epidemiologia; Política, Planejamento e Administração em Saúde; Administra) - Universidade do Estado do Rio de Janeiro, Rio de Janeiro, 2010.http://www.bdtd.uerj.br/handle/1/4818This study concerns the external validation of a prediction model for pneumonias after cardiac surgery. It also presents a review of methods and techniques for critical appraisal and performance assessment of clinical predictive models and nomogram applications. Methods: A consecutive series of 527 patients who underwent cardiac surgeries between June 2000 and August 2002 was used to develop a prognostic model.. Multiple logistic regression analysis was performed to predict the occurrence of pneumonia. Diverse simple and conventional preoperative risk factors were evaluated. The model was internal validated with bootstrap. A nomogram was developed to enhance clinical applicability. The performance was evaluated by calibration, discrimination and global measures. Prospective study was done to validate models predicting pneumonia after cardiac surgery with 333 adult patients who underwent cardiac surgery from October 2006 to May 2007. Previously constructed logistic regression (LRM) and classification and regression tree (CART) models were validated with external data. Results: a simple nomogram model was developed and showing low discrimination and good calibration (AUC 0.79, Brier score 0.064, discrimination slope 0.13, Hosmer-Lemeshow p=0.27). Pneumonia occurred in 7.5% of patients in the external validation set. LRM performed better with moderate discrimination (R2 7.1%, Brier=0.06, AROC=0.694) and calibration (Hosmer-Lemeshow P=0.08). Conclusions: Overall agreement between the predicted probabilities and observed frequencies was good in the development and the internal validation set. The nomogram predicts the probability of pneumonia for individual patients and may help in informing patients and surgeons before undergoing cardiac surgery. We validated a model that can identify which patients undergoing cardiac surgery are at high risk for pneumonia. CART performs well in derivation, and looses more discrimination and calibration than LRM in the validation set.Este trabalho versa sobre a validação externa de um modelo para predição de pneumonias em pacientes submetidos a cirurgias cardíacas. Também apresenta uma revisão dos métodos e técnicas para análise crítica e avaliação de desempenho dos modelos preditivos em medicina e discorre sobre aplicações do nomograma. Método: Dados de uma série de 527 pacientes, consecutivamente submetidos a cirurgias cardíacas entre Junho de 2000 e Agosto de 2002, foram utilizados para desenvolver os modelos de prognósticos. Foram realizadas análise de regressão logística múltipla e árvore de classificação e regressão (CART) para identificar fatores preditivos para a ocorrência de pneumonia. Diversos fatores de risco simples e convencionais pré-operatórios foram avaliados. Os modelos foram validados internamente com um método de bootstrap Um nomograma foi desenvolvido para melhorar a aplicabilidade clínica. O desempenho do nomograma foi avaliado por meio de medidas de calibração, discriminação e indicadores globais. Em uma segunda etapa estudo em um hospital público foi realizado com 333 pacientes adultos submetidos a cirurgias cardíacas entre Outubro de 2006 e Maio de 2007. Modelos construídos previamente por meio de regressão logística (LRM) e árvore de classificação e regressão (CART) foram validados com dados externos. Resultados: Um modelo de nomograma simples foi desenvolvido e validado internamente, mostrando discriminação moderada e boa calibração (AUC 0,79; escore Brier 0,064, ângulo de discriminação 0,13; Hosmer-Lemeshow p = 0,27). Pneumonia ocorreu em 7,6% dos pacientes da amostra de validação externa. LRM apresentou melhor desempenho com baixa discriminação (R2 7,1%, Brier=0,06, AUC=0,694) e com calibração adequada (Hosmer-Lemeshow p=0,08). Conclusões: As probabilidades preditas mostraram concordância global com a freqüência observada de pneumonia após cirurgia cardíaca. O nomograma forneceu uma predição satisfatória da probabilidade de pneumonia. Sua aplicabilidade para o uso clínico pode facilitar a informação do paciente e do cirurgião antes da cirurgia cardíaca. Foi validado externamente um modelo capaz de identificar pacientes de alto risco para pneumonia submetidos à cirurgias cardíacas. CART apresentou um bom desempenho na derivação e maiores perdas do que LRM, quanto à discriminação e calibração, na amostra de validação.Submitted by Boris Flegr (boris@uerj.br) on 2020-08-02T16:56:03Z No. of bitstreams: 1 Santos, Marisa - Tese completa.pdf: 1389791 bytes, checksum: 322246c3149fa65d3446b502aa6373fc (MD5)Made available in DSpace on 2020-08-02T16:56:03Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Santos, Marisa - Tese completa.pdf: 1389791 bytes, checksum: 322246c3149fa65d3446b502aa6373fc (MD5) Previous issue date: 2010-04-06application/pdfporUniversidade do Estado do Rio de JaneiroPrograma de Pós-Graduação em Saúde ColetivaUERJBRCentro Biomédico::Instituto de Medicina SocialValidation studiesEpidemiologic methodsPrediction modelsCardiac surgical proceduresPneumoniaMétodos epidemiológicosModelos de prediçãoEstudos de validaçãoCNPQ::CIENCIAS DA SAUDE::SAUDE COLETIVAValidação externa de modelos de predição de pneumonia pós cirurgia cardíacaExternal validation of prediction models for pneumonia after cardiac surgeryinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesisinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UERJinstname:Universidade do Estado do Rio de Janeiro (UERJ)instacron:UERJORIGINALSantos, Marisa - Tese completa.pdfapplication/pdf1389791http://www.bdtd.uerj.br/bitstream/1/4818/1/Santos%2C+Marisa+-+Tese+completa.pdf322246c3149fa65d3446b502aa6373fcMD511/48182024-02-26 20:21:05.623oai:www.bdtd.uerj.br:1/4818Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttp://www.bdtd.uerj.br/PUBhttps://www.bdtd.uerj.br:8443/oai/requestbdtd.suporte@uerj.bropendoar:29032024-02-26T23:21:05Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UERJ - Universidade do Estado do Rio de Janeiro (UERJ)false
dc.title.por.fl_str_mv Validação externa de modelos de predição de pneumonia pós cirurgia cardíaca
dc.title.alternative.eng.fl_str_mv External validation of prediction models for pneumonia after cardiac surgery
title Validação externa de modelos de predição de pneumonia pós cirurgia cardíaca
spellingShingle Validação externa de modelos de predição de pneumonia pós cirurgia cardíaca
Santos, Marisa da Silva
Validation studies
Epidemiologic methods
Prediction models
Cardiac surgical procedures
Pneumonia
Métodos epidemiológicos
Modelos de predição
Estudos de validação
CNPQ::CIENCIAS DA SAUDE::SAUDE COLETIVA
title_short Validação externa de modelos de predição de pneumonia pós cirurgia cardíaca
title_full Validação externa de modelos de predição de pneumonia pós cirurgia cardíaca
title_fullStr Validação externa de modelos de predição de pneumonia pós cirurgia cardíaca
title_full_unstemmed Validação externa de modelos de predição de pneumonia pós cirurgia cardíaca
title_sort Validação externa de modelos de predição de pneumonia pós cirurgia cardíaca
author Santos, Marisa da Silva
author_facet Santos, Marisa da Silva
author_role author
dc.contributor.advisor1.fl_str_mv Braga, Jose Ueleres
dc.contributor.advisor1Lattes.fl_str_mv http://lattes.cnpq.br/6027675934625064
dc.contributor.referee1.fl_str_mv Barroso, Paulo Feijó
dc.contributor.referee1Lattes.fl_str_mv http://lattes.cnpq.br/6126740128198607
dc.contributor.referee2.fl_str_mv Costa, Antonio José Leal
dc.contributor.referee2Lattes.fl_str_mv http://lattes.cnpq.br/8717846472721574
dc.contributor.referee3.fl_str_mv Mendonça, Gulnar Azevedo e Silva
dc.contributor.referee3Lattes.fl_str_mv http://lattes.cnpq.br/5225298757437978
dc.contributor.referee4.fl_str_mv Werneck, Guilherme Loureiro
dc.contributor.referee4Lattes.fl_str_mv http://lattes.cnpq.br/7331062615542814
dc.contributor.authorLattes.fl_str_mv http://lattes.cnpq.br/7445955509219546
dc.contributor.author.fl_str_mv Santos, Marisa da Silva
contributor_str_mv Braga, Jose Ueleres
Barroso, Paulo Feijó
Costa, Antonio José Leal
Mendonça, Gulnar Azevedo e Silva
Werneck, Guilherme Loureiro
dc.subject.eng.fl_str_mv Validation studies
Epidemiologic methods
Prediction models
Cardiac surgical procedures
topic Validation studies
Epidemiologic methods
Prediction models
Cardiac surgical procedures
Pneumonia
Métodos epidemiológicos
Modelos de predição
Estudos de validação
CNPQ::CIENCIAS DA SAUDE::SAUDE COLETIVA
dc.subject.por.fl_str_mv Pneumonia
Métodos epidemiológicos
Modelos de predição
Estudos de validação
dc.subject.cnpq.fl_str_mv CNPQ::CIENCIAS DA SAUDE::SAUDE COLETIVA
description This study concerns the external validation of a prediction model for pneumonias after cardiac surgery. It also presents a review of methods and techniques for critical appraisal and performance assessment of clinical predictive models and nomogram applications. Methods: A consecutive series of 527 patients who underwent cardiac surgeries between June 2000 and August 2002 was used to develop a prognostic model.. Multiple logistic regression analysis was performed to predict the occurrence of pneumonia. Diverse simple and conventional preoperative risk factors were evaluated. The model was internal validated with bootstrap. A nomogram was developed to enhance clinical applicability. The performance was evaluated by calibration, discrimination and global measures. Prospective study was done to validate models predicting pneumonia after cardiac surgery with 333 adult patients who underwent cardiac surgery from October 2006 to May 2007. Previously constructed logistic regression (LRM) and classification and regression tree (CART) models were validated with external data. Results: a simple nomogram model was developed and showing low discrimination and good calibration (AUC 0.79, Brier score 0.064, discrimination slope 0.13, Hosmer-Lemeshow p=0.27). Pneumonia occurred in 7.5% of patients in the external validation set. LRM performed better with moderate discrimination (R2 7.1%, Brier=0.06, AROC=0.694) and calibration (Hosmer-Lemeshow P=0.08). Conclusions: Overall agreement between the predicted probabilities and observed frequencies was good in the development and the internal validation set. The nomogram predicts the probability of pneumonia for individual patients and may help in informing patients and surgeons before undergoing cardiac surgery. We validated a model that can identify which patients undergoing cardiac surgery are at high risk for pneumonia. CART performs well in derivation, and looses more discrimination and calibration than LRM in the validation set.
publishDate 2010
dc.date.available.fl_str_mv 2010-10-07
dc.date.issued.fl_str_mv 2010-04-06
dc.date.accessioned.fl_str_mv 2020-08-02T16:56:03Z
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/doctoralThesis
format doctoralThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.citation.fl_str_mv SANTOS, Marisa da Silva. Validação externa de modelos de predição de pneumonia pós cirurgia cardíaca. 2010. 92 f. Tese (Doutorado em Ciências Humanas e Saúde; Epidemiologia; Política, Planejamento e Administração em Saúde; Administra) - Universidade do Estado do Rio de Janeiro, Rio de Janeiro, 2010.
dc.identifier.uri.fl_str_mv http://www.bdtd.uerj.br/handle/1/4818
identifier_str_mv SANTOS, Marisa da Silva. Validação externa de modelos de predição de pneumonia pós cirurgia cardíaca. 2010. 92 f. Tese (Doutorado em Ciências Humanas e Saúde; Epidemiologia; Política, Planejamento e Administração em Saúde; Administra) - Universidade do Estado do Rio de Janeiro, Rio de Janeiro, 2010.
url http://www.bdtd.uerj.br/handle/1/4818
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
dc.publisher.none.fl_str_mv Universidade do Estado do Rio de Janeiro
dc.publisher.program.fl_str_mv Programa de Pós-Graduação em Saúde Coletiva
dc.publisher.initials.fl_str_mv UERJ
dc.publisher.country.fl_str_mv BR
dc.publisher.department.fl_str_mv Centro Biomédico::Instituto de Medicina Social
publisher.none.fl_str_mv Universidade do Estado do Rio de Janeiro
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UERJ
instname:Universidade do Estado do Rio de Janeiro (UERJ)
instacron:UERJ
instname_str Universidade do Estado do Rio de Janeiro (UERJ)
instacron_str UERJ
institution UERJ
reponame_str Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UERJ
collection Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UERJ
bitstream.url.fl_str_mv http://www.bdtd.uerj.br/bitstream/1/4818/1/Santos%2C+Marisa+-+Tese+completa.pdf
bitstream.checksum.fl_str_mv 322246c3149fa65d3446b502aa6373fc
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv MD5
repository.name.fl_str_mv Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UERJ - Universidade do Estado do Rio de Janeiro (UERJ)
repository.mail.fl_str_mv bdtd.suporte@uerj.br
_version_ 1792352263732199424