Análise proteômica e epigenética de pacientes com câncer colorretal do estado do Amazonas

• Autor(a) principal: Almeida, Fabiana Greyce Oliveira
• Data de Publicação: 2017
• Outros Autores: http://lattes.cnpq.br/8643360730620783
• Tipo de documento: Tese
• Idioma: por
• Título da fonte: Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFAM
• Texto Completo: http://tede.ufam.edu.br/handle/tede/5766
• topic: Câncer colorretal; Epigenética; Proteômica; CIÊNCIAS EXATAS E DA TERRA: QUÍMICA

O câncer colorretal (CCR) é o terceiro tipo de câncer mais comum no mundo, com uma baixa taxa de sobrevivência e eficiência terapêutica. Um dos tratamentos é aretirada do tumor, que implica na remoção de um tecido aparentemente não tumoral ao redor do tumor (margem de ressecção). Nesse sentido, a margem de ressecção é uma região muito interessante para investigar as características moleculares do processo tumorigênico.Dessa forma, o objetivo desse trabalho foi realizar um estudo comparativo de amostras de tecidos tumorais e margem de ressecção através de análises epigenéticas e proteômicas de pacientes com câncer colorretal do estado do Amazonas (Brasil). Para o perfil epigenético, treze amostras, nas quais seis eram tumorais e sete eram margem de ressecção foram analisadaspela reação em cadeiadapolimerase (PCR) específica para metilação (MSP).Na análise proteômica,quatro amostras de CCR e suas respectivas margens de ressecçãoforam digeridas com tripsina, marcadas comiTRAQ 8-plex e submetidas a cromatografiadetroca catiônica forte. Cada fração foi analisada por cromatografia de fase reversa acoplada a um espectrômetro de massa Orbitrap Velos e, por fim, os dados foram analisados no programaPatternLab for Proteomics. A análise da metilação dos genes CDH1, CDKN2A, DAPK e TIMP2foi 30,8% (4/13), 30,8% (4/13), 84,6% (11/13) e 11/13 (84,6%), respectivamente.A análise proteômica identificou 1090 proteínas, das quais 56 foram apontadas como diferencialmente abundantes. Estas proteínas estão envolvidas principalmente no metabolismo energético (e.g.proteína S100A11 de ligação de cálcio),migração de células (e.g. transgelina), formação do citoesqueleto (e.g.profilina1) e participam de importantes processos biológicos (e.g.anidrase carbônica 2). A análise doGeneOntologyfeita para todas as proteínas identificadas revelou a relação dessas com processos de adesão, invasão, metástase e morte celular.Osresultados mostram padrões de metilação distintos para cada paciente que, por sua vez, podem contribuir no desenvolvimento de tratamentos individualizados e também proteínas diferencialmente abundantesrelacionadas àtumorigênese, enfatizando a importância do estudo de painéis de marcadores para o CCR no contexto das diferentes populações.