Caracterização do potencial de degradação de um isolado bacteriano oriundo da região Amazônica

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Castro, Diogo Pereira de
Data de Publicação: 2015
Outros Autores: http://lattes.cnpq.br/5143585130152199
Tipo de documento: Tese
Idioma: por
Título da fonte: Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFAM
Texto Completo: https://tede.ufam.edu.br/handle/tede/6260
Resumo: A biorremediação é a utilização de microrganismos capazes de metabolizar contaminantes e transforma-los em produtos menos tóxicos. Em estudos anteriores, foi realizado o isolamento de bactérias provenientes de área contaminada por resíduos de petróleo na Amazônia. Apesar de possuírem o potencial de degradação de petróleo, a aplicação de bactérias em ambientes contaminados pode interferir em seu equilíbrio ecológico. Este estudo propôs-se a seleção de uma linhagem bacteriana para promover estudos de caracterização gênica, identificação do potencial de degradação de hidrocarbonetos e definição das proteínas envolvidas no processo de degradação. Para alcançar os objetivos, foram identificadas substâncias degradadas por cromatografia gasosa e proteínas envolvidas por proteômica; A análise do genoma permitiu a caracterização dos genes relacionados a degradação de compostos xenobióticos através da revisão da literatura. A cepa foi identificada como Pseudomonas putida S16. Foram detectadas 51 substâncias por cromatografia gasosa, destas, 23 foram completamente degradadas, incluindo HPAs contendo naftaleno (100%), antraceno (11,49%) e fenantreno (7,41%). Foram identificados 89 genes relacionados a degradação de xenobíoticos no genoma da P. putida S16 AM, genes capazes de degradar naftaleno, antraceno e fenantreno (nah, phn, fdx, catA), produção de citocromo e quimiotaxia. Na análise proteômica, foram expressas proteínas de óxido-redução, processos metabólicos, poliaminas, aldeído desidrogenase, armazenamento de carbono, quimiotaxia e síntese de aminoácidos. Foram identificadas 355 proteínas com redundância expressas durante o contato de 7h da P. putida S16 AM (I4) com o petróleo, e 268 no contato de 75h; Para o glicerol, foram identificadas 467 na interação de 7h, e 228 no contato de 75h. A presença de proteínas relacionadas ao metabolismo e óxidoredução quando a cepa em estudo esteve em contato com o petróleo evidenciam a utilização deste como fonte de carbono para o metabolismo bacteriano. Estes estudos são importantes devido à identificação de genes e proteínas que possuem o potencial de se tornarem produtos biotecnológicos de aplicação prática.
id UFAM_486cb8258e0791e0c44e0f05a5f38513
oai_identifier_str oai:https://tede.ufam.edu.br/handle/:tede/6260
network_acronym_str UFAM
network_name_str Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFAM
repository_id_str 6592
spelling Caracterização do potencial de degradação de um isolado bacteriano oriundo da região AmazônicaPetróleoBiorremediaçãoDegradação de HidrocarbonetosProteômicaCIENCIAS BIOLOGICASA biorremediação é a utilização de microrganismos capazes de metabolizar contaminantes e transforma-los em produtos menos tóxicos. Em estudos anteriores, foi realizado o isolamento de bactérias provenientes de área contaminada por resíduos de petróleo na Amazônia. Apesar de possuírem o potencial de degradação de petróleo, a aplicação de bactérias em ambientes contaminados pode interferir em seu equilíbrio ecológico. Este estudo propôs-se a seleção de uma linhagem bacteriana para promover estudos de caracterização gênica, identificação do potencial de degradação de hidrocarbonetos e definição das proteínas envolvidas no processo de degradação. Para alcançar os objetivos, foram identificadas substâncias degradadas por cromatografia gasosa e proteínas envolvidas por proteômica; A análise do genoma permitiu a caracterização dos genes relacionados a degradação de compostos xenobióticos através da revisão da literatura. A cepa foi identificada como Pseudomonas putida S16. Foram detectadas 51 substâncias por cromatografia gasosa, destas, 23 foram completamente degradadas, incluindo HPAs contendo naftaleno (100%), antraceno (11,49%) e fenantreno (7,41%). Foram identificados 89 genes relacionados a degradação de xenobíoticos no genoma da P. putida S16 AM, genes capazes de degradar naftaleno, antraceno e fenantreno (nah, phn, fdx, catA), produção de citocromo e quimiotaxia. Na análise proteômica, foram expressas proteínas de óxido-redução, processos metabólicos, poliaminas, aldeído desidrogenase, armazenamento de carbono, quimiotaxia e síntese de aminoácidos. Foram identificadas 355 proteínas com redundância expressas durante o contato de 7h da P. putida S16 AM (I4) com o petróleo, e 268 no contato de 75h; Para o glicerol, foram identificadas 467 na interação de 7h, e 228 no contato de 75h. A presença de proteínas relacionadas ao metabolismo e óxidoredução quando a cepa em estudo esteve em contato com o petróleo evidenciam a utilização deste como fonte de carbono para o metabolismo bacteriano. Estes estudos são importantes devido à identificação de genes e proteínas que possuem o potencial de se tornarem produtos biotecnológicos de aplicação prática.Bioremediation is the use of microorganisms capable of metabolizing contaminants and converts them into less toxic products. In previous studies, we performed bacteria isolation from contaminated area for oil waste in Amazon. Despite its oil degradation potential, the application of bacteria in contaminated sites may interfere with their ecological balance. This study aimed to promote studies of gene characterization and hydrocarbon degradation potential with a selected bacterial strain and identify and define the proteins involved in degradation process. To achieve this objectives degraded substances have been identified by gas chromatography and proteins involved by proteomics; Genome analysis allowed characterization of genes related to xenobiotics degradation. The strain was identified as Pseudomonas putida S16. 51 substances were detected by gas chromatography, of these, 23 were completely degraded, including PAH containing naphthalene (100%), anthracene (11.49%) and phenanthrene (7.41%). We identified 89 genes related to xenobiotic degradation in P. putida S16 AM genome, genes capable of degrading naphthalene, anthracene and phenanthrene (nah, phn, fdx, catA), cytochrome production and chemotaxis. In proteome analysis, proteins were expressed oxidation-reduction, metabolic processes, polyamines, aldehyde dehydrogenase, carbon storage, chemotaxis and amino acid synthesis. 355 proteins were identified with redundancy expressed during 7h contact to P. putida S16 AM (I4) with petroleum, and 268 during 75h contact; For glycerol, 467 were identified in 7h interaction, and 228 in 75h contact. The presence of proteins related to metabolism and oxidationreduction when the strain under study was in contact to the petroleum suggest the use of this as a carbon source for bacterial metabolism. These studies are important because of identification of genes and proteins with potential to become practical application of biotechnology products.FAPEAM - Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado do AmazonasUniversidade Federal do AmazonasInstituto de Ciências BiológicasBrasilUFAMPrograma de Pós-Graduação em BiotecnologiaOrlandi, Patrícia Puccinellihttp://lattes.cnpq.br/1887686774621627Batista, Ieda HortêncioTeixeira, Ana FrazãoChapeaurouge, Donat Alexander deCastro, Diogo Pereira dehttp://lattes.cnpq.br/51435851301521992018-03-21T14:52:21Z2015-11-30info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesisapplication/pdfCASTRO, Diogo Pereira de. Caracterização do potencial de degradação de um isolado bacteriano oriundo da região Amazônica. 2015. 154 f. Tese (Doutorado em Biotecnologia) - Universidade Federal do Amazonas, Manaus, 2015.https://tede.ufam.edu.br/handle/tede/6260porhttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/info:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFAMinstname:Universidade Federal do Amazonas (UFAM)instacron:UFAM2018-03-22T05:03:36Zoai:https://tede.ufam.edu.br/handle/:tede/6260Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttp://200.129.163.131:8080/PUBhttp://200.129.163.131:8080/oai/requestddbc@ufam.edu.br||ddbc@ufam.edu.bropendoar:65922018-03-22T05:03:36Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFAM - Universidade Federal do Amazonas (UFAM)false
dc.title.none.fl_str_mv Caracterização do potencial de degradação de um isolado bacteriano oriundo da região Amazônica
title Caracterização do potencial de degradação de um isolado bacteriano oriundo da região Amazônica
spellingShingle Caracterização do potencial de degradação de um isolado bacteriano oriundo da região Amazônica
Castro, Diogo Pereira de
Petróleo
Biorremediação
Degradação de Hidrocarbonetos
Proteômica
CIENCIAS BIOLOGICAS
title_short Caracterização do potencial de degradação de um isolado bacteriano oriundo da região Amazônica
title_full Caracterização do potencial de degradação de um isolado bacteriano oriundo da região Amazônica
title_fullStr Caracterização do potencial de degradação de um isolado bacteriano oriundo da região Amazônica
title_full_unstemmed Caracterização do potencial de degradação de um isolado bacteriano oriundo da região Amazônica
title_sort Caracterização do potencial de degradação de um isolado bacteriano oriundo da região Amazônica
author Castro, Diogo Pereira de
author_facet Castro, Diogo Pereira de
http://lattes.cnpq.br/5143585130152199
author_role author
author2 http://lattes.cnpq.br/5143585130152199
author2_role author
dc.contributor.none.fl_str_mv Orlandi, Patrícia Puccinelli
http://lattes.cnpq.br/1887686774621627
Batista, Ieda Hortêncio
Teixeira, Ana Frazão
Chapeaurouge, Donat Alexander de
dc.contributor.author.fl_str_mv Castro, Diogo Pereira de
http://lattes.cnpq.br/5143585130152199
dc.subject.por.fl_str_mv Petróleo
Biorremediação
Degradação de Hidrocarbonetos
Proteômica
CIENCIAS BIOLOGICAS
topic Petróleo
Biorremediação
Degradação de Hidrocarbonetos
Proteômica
CIENCIAS BIOLOGICAS
description A biorremediação é a utilização de microrganismos capazes de metabolizar contaminantes e transforma-los em produtos menos tóxicos. Em estudos anteriores, foi realizado o isolamento de bactérias provenientes de área contaminada por resíduos de petróleo na Amazônia. Apesar de possuírem o potencial de degradação de petróleo, a aplicação de bactérias em ambientes contaminados pode interferir em seu equilíbrio ecológico. Este estudo propôs-se a seleção de uma linhagem bacteriana para promover estudos de caracterização gênica, identificação do potencial de degradação de hidrocarbonetos e definição das proteínas envolvidas no processo de degradação. Para alcançar os objetivos, foram identificadas substâncias degradadas por cromatografia gasosa e proteínas envolvidas por proteômica; A análise do genoma permitiu a caracterização dos genes relacionados a degradação de compostos xenobióticos através da revisão da literatura. A cepa foi identificada como Pseudomonas putida S16. Foram detectadas 51 substâncias por cromatografia gasosa, destas, 23 foram completamente degradadas, incluindo HPAs contendo naftaleno (100%), antraceno (11,49%) e fenantreno (7,41%). Foram identificados 89 genes relacionados a degradação de xenobíoticos no genoma da P. putida S16 AM, genes capazes de degradar naftaleno, antraceno e fenantreno (nah, phn, fdx, catA), produção de citocromo e quimiotaxia. Na análise proteômica, foram expressas proteínas de óxido-redução, processos metabólicos, poliaminas, aldeído desidrogenase, armazenamento de carbono, quimiotaxia e síntese de aminoácidos. Foram identificadas 355 proteínas com redundância expressas durante o contato de 7h da P. putida S16 AM (I4) com o petróleo, e 268 no contato de 75h; Para o glicerol, foram identificadas 467 na interação de 7h, e 228 no contato de 75h. A presença de proteínas relacionadas ao metabolismo e óxidoredução quando a cepa em estudo esteve em contato com o petróleo evidenciam a utilização deste como fonte de carbono para o metabolismo bacteriano. Estes estudos são importantes devido à identificação de genes e proteínas que possuem o potencial de se tornarem produtos biotecnológicos de aplicação prática.
publishDate 2015
dc.date.none.fl_str_mv 2015-11-30
2018-03-21T14:52:21Z
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/doctoralThesis
format doctoralThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv CASTRO, Diogo Pereira de. Caracterização do potencial de degradação de um isolado bacteriano oriundo da região Amazônica. 2015. 154 f. Tese (Doutorado em Biotecnologia) - Universidade Federal do Amazonas, Manaus, 2015.
https://tede.ufam.edu.br/handle/tede/6260
identifier_str_mv CASTRO, Diogo Pereira de. Caracterização do potencial de degradação de um isolado bacteriano oriundo da região Amazônica. 2015. 154 f. Tese (Doutorado em Biotecnologia) - Universidade Federal do Amazonas, Manaus, 2015.
url https://tede.ufam.edu.br/handle/tede/6260
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.rights.driver.fl_str_mv http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
info:eu-repo/semantics/openAccess
rights_invalid_str_mv http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
dc.publisher.none.fl_str_mv Universidade Federal do Amazonas
Instituto de Ciências Biológicas
Brasil
UFAM
Programa de Pós-Graduação em Biotecnologia
publisher.none.fl_str_mv Universidade Federal do Amazonas
Instituto de Ciências Biológicas
Brasil
UFAM
Programa de Pós-Graduação em Biotecnologia
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFAM
instname:Universidade Federal do Amazonas (UFAM)
instacron:UFAM
instname_str Universidade Federal do Amazonas (UFAM)
instacron_str UFAM
institution UFAM
reponame_str Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFAM
collection Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFAM
repository.name.fl_str_mv Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFAM - Universidade Federal do Amazonas (UFAM)
repository.mail.fl_str_mv ddbc@ufam.edu.br||ddbc@ufam.edu.br
_version_ 1809732025603588096