Diversidade genética dos peixes serrasalmídeos na Amazônia

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Machado, Valéria Nogueira
Data de Publicação: 2016
Outros Autores: http://lattes.cnpq.br/7662550713275071
Tipo de documento: Tese
Idioma: por
Título da fonte: Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFAM
Texto Completo: http://tede.ufam.edu.br/handle/tede/5567
Resumo: Serrasalmidae é uma família de peixes neotropicais com ocorrência natural exclusivamente no continente Sul-Americano. Esses peixes estão distribuídos nas principais bacias de drenagens desse continente, sendo abundantes no Amazonas e Orinoco, porém ocorrem também no sistema Paraná-Paraguaia e na bacia do rio São Francisco. Habita uma grande variedade de corpos de água, incluindo o canal principal dos rios, os lagos, a floresta alagada até ambientes de corredeiras e cachoeiras nas cabeceiras dos rios. Muitas espécies de Serrasalmídeos, principalmente dos gêneros Piaractus, Colossoma e Mylossoma são economicamente importantes, representando uma importante fração da pesca comercial no Amazonas e também são utilizados na aqüicultura. Outras espécies são importantes para o mercado de peixes ornamentais como as espécies do gênero Metynnis, e representantes dos gêneros Mylesinus, Myleus e Tometes estão entre as espécies de peixes mais importantes para alimentação nas comunidades indígenas amazônicas. Embora a monofilia desse grupo já seja definida, alguns gêneros de pacus como os gêneros Tometes, Mylesinus, Myleus e Myloplus e as espécies de piranha Serrasalmus rhombeus e Pristobrycon striolatus ainda permanecem problemáticas taxonomicamente. Em consequência da indefinição no posicionamento desses táxons, o estado atual da estrutura e variabilidade genética das populações de muitas espécies de Serrasalmidae não é conhecido. Nesse sentido nós utilizamos a metodologia do DNA barcode pra analisar a diversidade desses peixes na América do Sul e também foi realizada uma análise filogeográfica através do sequenciamento dos genes do DNA mitocondrial (região controle e o gene citocromo c oxidase (COI)), com o objetivo de avaliar a real diversidade de piranhas e pacus na Amazônia e também analisar comparativamente a distribuição de alguns táxons de Serrasalmideos com ampla distribuição na Amazônia. Para a análise de diversidade foram usadas 1.036 sequências do gene COI de 68 espécies e morfotipos de Serrasalmídeos e para a análise filogeográfica foram usadas de forma concatenada, 71 sequências do gene COI e região controle de S. rhombeus, 35 de Pygocentrus nattereri, 26 de Myloplus schomburgkii e 26 de Myleus setiger. Os resultados indicam altos níveis de diversidade críptica dentro dos Serrasalmídeos. De 68 espécies morfológicas analisadas, foram identificadas molecularmente 82 espécies. O maior número de linhagens intraespecíficas foi observado dentro dos pacus dos gêneros Myleus, Myloplus e Mylesinus e das piranhas dos gêneros Serrasalmus e Pygocentrus. Essa grande divergência intraespecífica ocorre justamente nos gêneros com maiores incertezas taxonômicas e com mais ampla distribuição geográfica de suas espécies. Os resultados mostram ainda que S. rhombeus, P. nattereri, M. schomburgkii e M. setiger não se comportam como populações panmíticas dentro de suas áreas de ocorrência apresentando linhagens estruturadas com divergência datando do Plioceno. Eventos vicariantes nesse período parecem ser os responsáveis pela estrutura atual dessas linhagens na Amazônia.
id UFAM_a51879150c868a94c41c32f4795fa431
oai_identifier_str oai:https://tede.ufam.edu.br/handle/:tede/5567
network_acronym_str UFAM
network_name_str Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFAM
repository_id_str 6592
spelling Diversidade genética dos peixes serrasalmídeos na AmazôniaFilogeografiaPeixes de água docePeixes SerrasalmídeosCIÊNCIAS BIOLÓGICASSerrasalmidae é uma família de peixes neotropicais com ocorrência natural exclusivamente no continente Sul-Americano. Esses peixes estão distribuídos nas principais bacias de drenagens desse continente, sendo abundantes no Amazonas e Orinoco, porém ocorrem também no sistema Paraná-Paraguaia e na bacia do rio São Francisco. Habita uma grande variedade de corpos de água, incluindo o canal principal dos rios, os lagos, a floresta alagada até ambientes de corredeiras e cachoeiras nas cabeceiras dos rios. Muitas espécies de Serrasalmídeos, principalmente dos gêneros Piaractus, Colossoma e Mylossoma são economicamente importantes, representando uma importante fração da pesca comercial no Amazonas e também são utilizados na aqüicultura. Outras espécies são importantes para o mercado de peixes ornamentais como as espécies do gênero Metynnis, e representantes dos gêneros Mylesinus, Myleus e Tometes estão entre as espécies de peixes mais importantes para alimentação nas comunidades indígenas amazônicas. Embora a monofilia desse grupo já seja definida, alguns gêneros de pacus como os gêneros Tometes, Mylesinus, Myleus e Myloplus e as espécies de piranha Serrasalmus rhombeus e Pristobrycon striolatus ainda permanecem problemáticas taxonomicamente. Em consequência da indefinição no posicionamento desses táxons, o estado atual da estrutura e variabilidade genética das populações de muitas espécies de Serrasalmidae não é conhecido. Nesse sentido nós utilizamos a metodologia do DNA barcode pra analisar a diversidade desses peixes na América do Sul e também foi realizada uma análise filogeográfica através do sequenciamento dos genes do DNA mitocondrial (região controle e o gene citocromo c oxidase (COI)), com o objetivo de avaliar a real diversidade de piranhas e pacus na Amazônia e também analisar comparativamente a distribuição de alguns táxons de Serrasalmideos com ampla distribuição na Amazônia. Para a análise de diversidade foram usadas 1.036 sequências do gene COI de 68 espécies e morfotipos de Serrasalmídeos e para a análise filogeográfica foram usadas de forma concatenada, 71 sequências do gene COI e região controle de S. rhombeus, 35 de Pygocentrus nattereri, 26 de Myloplus schomburgkii e 26 de Myleus setiger. Os resultados indicam altos níveis de diversidade críptica dentro dos Serrasalmídeos. De 68 espécies morfológicas analisadas, foram identificadas molecularmente 82 espécies. O maior número de linhagens intraespecíficas foi observado dentro dos pacus dos gêneros Myleus, Myloplus e Mylesinus e das piranhas dos gêneros Serrasalmus e Pygocentrus. Essa grande divergência intraespecífica ocorre justamente nos gêneros com maiores incertezas taxonômicas e com mais ampla distribuição geográfica de suas espécies. Os resultados mostram ainda que S. rhombeus, P. nattereri, M. schomburgkii e M. setiger não se comportam como populações panmíticas dentro de suas áreas de ocorrência apresentando linhagens estruturadas com divergência datando do Plioceno. Eventos vicariantes nesse período parecem ser os responsáveis pela estrutura atual dessas linhagens na Amazônia.Serrasalmidae is a family of Neotropical fishes with exclusive natural occurrence in the South American continent. These fishes are distributed in the main drainage basins of the continent, being abundant in the Amazon and Orinoco, but also occurring in the Paraná-Paraguay system and São Francisco River Basin. It inhabits a wide variety of water bodies, including the main channel of the rivers, lakes, the flooded forest and rapids or waterfalls environments in the headwaters of rivers. Many species of Serrasalmids, mainly from the genera Piaractus, Colossoma and Mylossoma, are economically important, representing a significant proportion of commercial fishing in the Amazon and used in aquaculture. Other species are important for the ornamental fish market as the species of the genus Metynnis. Some representative species of Mylesinus, Myleus and Tometes genera are among the most important species of fish for feeding in Amazonian indigenous communities. While the monophyly of this group is already defined, some pacus genera as Tometes, Mylesinus, Myleus and Myloplus, and piranha species as Serrasalmus rhombeus and Pristobrycon striolatus remain problematic taxonomically. As a result of uncertainty in the positioning of these taxa, the current status of the structure and genetic variability of populations of many species of Serrasalmidae is unknown yet. In order to contribute for resolve this problem, we use the DNA barcode methodology and performed a phylogeographic analysis by sequencing of the mitochondrial DNA genes [control region and cytochrome gene c oxidase (COI)] with the aim of evaluate the real diversity of piranhas and pacus in the Amazon; and also to perform a comparative analysis of some Serrasalmids taxa widely distributed in the Amazon. For diversity analysis were used 1,036 sequences of the COI gene from 68 species and morphotypes of Serrasalmids. For the phylogeographic analysis were used concatenated sequences of COI gene and control region from 74 individuals of S. rhombeus, 35 of Pygocentrus nattereri, 26 of Myloplus schomburgkii and 26 of Myleus setiger. The results indicate high levels cryptic diversity within Serrasalmids. From a total of 68 morphological species analyzed, 82 species were molecularly identified. The largest number of intraspecific lineages was observed within the pacus of the Myleus, Myloplus and Mylesinus genera; and within the piranhas of Serrasalmus and Pygocentrus genera. This wide intraspecific divergence occurs exactly in the genera with higher taxonomic uncertainties and wider distribution of its species. The results also show that S. rhombeus, P. nattereri, M. schomburgkii and M. setiger not behave like panmitic populations within their occurrence areas, showing structured lineages with divergence time dating from the Pliocene. Vicariant events during this period appear to be responsible for the current structure of these lineages in the Amazon.CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível SuperiorUniversidade Federal do AmazonasInstituto de Ciências BiológicasBrasilUFAMPrograma de Pós-Graduação em Biodiversidade e Biotecnologia da Amazônia Legal - BIONORTEHrbek, Tomashttp://lattes.cnpq.br/4139866243228811Machado, Valéria Nogueirahttp://lattes.cnpq.br/76625507132750712017-03-09T09:56:49Z2016-11-10info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesisapplication/pdfMACHADO, Valéria Nogueira. Diversidade genética dos peixes serrasalmídeos na Amazônia. 2016. 120 f. Tese (Doutorado em Biodiversidade e Biotecnologia da Amazônia Legal - BIONORTE) - Universidade Federal do Amazonas, Manaus, 2016.http://tede.ufam.edu.br/handle/tede/5567porhttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/info:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFAMinstname:Universidade Federal do Amazonas (UFAM)instacron:UFAM2018-11-23T15:00:53Zoai:https://tede.ufam.edu.br/handle/:tede/5567Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttp://200.129.163.131:8080/PUBhttp://200.129.163.131:8080/oai/requestddbc@ufam.edu.br||ddbc@ufam.edu.bropendoar:65922018-11-23T15:00:53Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFAM - Universidade Federal do Amazonas (UFAM)false
dc.title.none.fl_str_mv Diversidade genética dos peixes serrasalmídeos na Amazônia
title Diversidade genética dos peixes serrasalmídeos na Amazônia
spellingShingle Diversidade genética dos peixes serrasalmídeos na Amazônia
Machado, Valéria Nogueira
Filogeografia
Peixes de água doce
Peixes Serrasalmídeos
CIÊNCIAS BIOLÓGICAS
title_short Diversidade genética dos peixes serrasalmídeos na Amazônia
title_full Diversidade genética dos peixes serrasalmídeos na Amazônia
title_fullStr Diversidade genética dos peixes serrasalmídeos na Amazônia
title_full_unstemmed Diversidade genética dos peixes serrasalmídeos na Amazônia
title_sort Diversidade genética dos peixes serrasalmídeos na Amazônia
author Machado, Valéria Nogueira
author_facet Machado, Valéria Nogueira
http://lattes.cnpq.br/7662550713275071
author_role author
author2 http://lattes.cnpq.br/7662550713275071
author2_role author
dc.contributor.none.fl_str_mv Hrbek, Tomas
http://lattes.cnpq.br/4139866243228811
dc.contributor.author.fl_str_mv Machado, Valéria Nogueira
http://lattes.cnpq.br/7662550713275071
dc.subject.por.fl_str_mv Filogeografia
Peixes de água doce
Peixes Serrasalmídeos
CIÊNCIAS BIOLÓGICAS
topic Filogeografia
Peixes de água doce
Peixes Serrasalmídeos
CIÊNCIAS BIOLÓGICAS
description Serrasalmidae é uma família de peixes neotropicais com ocorrência natural exclusivamente no continente Sul-Americano. Esses peixes estão distribuídos nas principais bacias de drenagens desse continente, sendo abundantes no Amazonas e Orinoco, porém ocorrem também no sistema Paraná-Paraguaia e na bacia do rio São Francisco. Habita uma grande variedade de corpos de água, incluindo o canal principal dos rios, os lagos, a floresta alagada até ambientes de corredeiras e cachoeiras nas cabeceiras dos rios. Muitas espécies de Serrasalmídeos, principalmente dos gêneros Piaractus, Colossoma e Mylossoma são economicamente importantes, representando uma importante fração da pesca comercial no Amazonas e também são utilizados na aqüicultura. Outras espécies são importantes para o mercado de peixes ornamentais como as espécies do gênero Metynnis, e representantes dos gêneros Mylesinus, Myleus e Tometes estão entre as espécies de peixes mais importantes para alimentação nas comunidades indígenas amazônicas. Embora a monofilia desse grupo já seja definida, alguns gêneros de pacus como os gêneros Tometes, Mylesinus, Myleus e Myloplus e as espécies de piranha Serrasalmus rhombeus e Pristobrycon striolatus ainda permanecem problemáticas taxonomicamente. Em consequência da indefinição no posicionamento desses táxons, o estado atual da estrutura e variabilidade genética das populações de muitas espécies de Serrasalmidae não é conhecido. Nesse sentido nós utilizamos a metodologia do DNA barcode pra analisar a diversidade desses peixes na América do Sul e também foi realizada uma análise filogeográfica através do sequenciamento dos genes do DNA mitocondrial (região controle e o gene citocromo c oxidase (COI)), com o objetivo de avaliar a real diversidade de piranhas e pacus na Amazônia e também analisar comparativamente a distribuição de alguns táxons de Serrasalmideos com ampla distribuição na Amazônia. Para a análise de diversidade foram usadas 1.036 sequências do gene COI de 68 espécies e morfotipos de Serrasalmídeos e para a análise filogeográfica foram usadas de forma concatenada, 71 sequências do gene COI e região controle de S. rhombeus, 35 de Pygocentrus nattereri, 26 de Myloplus schomburgkii e 26 de Myleus setiger. Os resultados indicam altos níveis de diversidade críptica dentro dos Serrasalmídeos. De 68 espécies morfológicas analisadas, foram identificadas molecularmente 82 espécies. O maior número de linhagens intraespecíficas foi observado dentro dos pacus dos gêneros Myleus, Myloplus e Mylesinus e das piranhas dos gêneros Serrasalmus e Pygocentrus. Essa grande divergência intraespecífica ocorre justamente nos gêneros com maiores incertezas taxonômicas e com mais ampla distribuição geográfica de suas espécies. Os resultados mostram ainda que S. rhombeus, P. nattereri, M. schomburgkii e M. setiger não se comportam como populações panmíticas dentro de suas áreas de ocorrência apresentando linhagens estruturadas com divergência datando do Plioceno. Eventos vicariantes nesse período parecem ser os responsáveis pela estrutura atual dessas linhagens na Amazônia.
publishDate 2016
dc.date.none.fl_str_mv 2016-11-10
2017-03-09T09:56:49Z
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/doctoralThesis
format doctoralThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv MACHADO, Valéria Nogueira. Diversidade genética dos peixes serrasalmídeos na Amazônia. 2016. 120 f. Tese (Doutorado em Biodiversidade e Biotecnologia da Amazônia Legal - BIONORTE) - Universidade Federal do Amazonas, Manaus, 2016.
http://tede.ufam.edu.br/handle/tede/5567
identifier_str_mv MACHADO, Valéria Nogueira. Diversidade genética dos peixes serrasalmídeos na Amazônia. 2016. 120 f. Tese (Doutorado em Biodiversidade e Biotecnologia da Amazônia Legal - BIONORTE) - Universidade Federal do Amazonas, Manaus, 2016.
url http://tede.ufam.edu.br/handle/tede/5567
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.rights.driver.fl_str_mv http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
info:eu-repo/semantics/openAccess
rights_invalid_str_mv http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
dc.publisher.none.fl_str_mv Universidade Federal do Amazonas
Instituto de Ciências Biológicas
Brasil
UFAM
Programa de Pós-Graduação em Biodiversidade e Biotecnologia da Amazônia Legal - BIONORTE
publisher.none.fl_str_mv Universidade Federal do Amazonas
Instituto de Ciências Biológicas
Brasil
UFAM
Programa de Pós-Graduação em Biodiversidade e Biotecnologia da Amazônia Legal - BIONORTE
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFAM
instname:Universidade Federal do Amazonas (UFAM)
instacron:UFAM
instname_str Universidade Federal do Amazonas (UFAM)
instacron_str UFAM
institution UFAM
reponame_str Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFAM
collection Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFAM
repository.name.fl_str_mv Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFAM - Universidade Federal do Amazonas (UFAM)
repository.mail.fl_str_mv ddbc@ufam.edu.br||ddbc@ufam.edu.br
_version_ 1800234108414066688