Diagnóstico molecular de clamidiose em papagaios de um centro de triagem de animais silvestres
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Data de Publicação: | 2018 |
Tipo de documento: | Trabalho de conclusão de curso |
Idioma: | por |
Título da fonte: | Repositório Institucional da UFBA |
Texto Completo: | http://repositorio.ufba.br/ri/handle/ri/28286 |
Resumo: | Clamidiose é uma doença recorrente em aves, com destaque para psitacídeos. Esta zoonose é causada pela bactéria Chlamydophila psittaci. No Brasil, os Centros de Triagem de Animais Silvestres (CETAS), recebem, mantém, tratam e reintroduzem a natureza, animais silvestres provindos do tráfico. O objetivo do presente trabalho foi realizar diagnóstico molecular e relacioná-lo com suspeita clínica, em papagaios alocados no CETAS de Vitória da Conquista (BA), Brasil. Amostras de swab cloacal foram coletadas de 59 papagaios Amazona sp. Estas foram transportadas em água e meio de cultura. DNA foi extraído por método de fervura. O marcador molecular para clamidiose (fragmento de DNA de 264 pb, gene ompA) foi amplificado por PCR, utilizado primers CPF/CPR. O diagnóstico molecular deu-se por presença/ausência em gel de agarose do marcador molecular. Todos os indivíduos foram analisados quanto a suspeita clínica de clamidiose, considerando os sinais: conjuntivite, secreção nasal e desnutrição. Os resultados obtidos seguem. (i) Não foi detectado influência dos meios de transporte das amostras biológicas sobre o diagnóstico molecular da clamidiose. (ii) A prevalência de clamidiose detectada na amostra foi de 37% (n= 22). (iii) A coincidência entre diagnóstico molecular e suspeita clínica foi de 68% (estatisticamente significativa, p=0,0095); com suspeita clínica indicando 15% (n=9) de falsos positivos e 17% (n=10) de falsos negativos. (iv) Não houve correlação estatisticamente significativa entre quantidade e tipo de sinal clínico em particular com diagnóstico molecular. (v) O acompanhamento de parte da amostra, demonstrou que 50% (n=7) dos indivíduos passaram de diagnóstico negativo para diagnóstico positivo em no máximo 24 dias. |
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Santos, Bernardo MirabalSantos, Bernardo MirabalTomazi, LaizeMarques, Lucas MirandaFraga, Ricardo EvangelistaTomazi, Laize2019-01-02T15:11:42Z2020-01-03T03:00:34Z2019-01-022018-12-04http://repositorio.ufba.br/ri/handle/ri/28286Clamidiose é uma doença recorrente em aves, com destaque para psitacídeos. Esta zoonose é causada pela bactéria Chlamydophila psittaci. No Brasil, os Centros de Triagem de Animais Silvestres (CETAS), recebem, mantém, tratam e reintroduzem a natureza, animais silvestres provindos do tráfico. O objetivo do presente trabalho foi realizar diagnóstico molecular e relacioná-lo com suspeita clínica, em papagaios alocados no CETAS de Vitória da Conquista (BA), Brasil. Amostras de swab cloacal foram coletadas de 59 papagaios Amazona sp. Estas foram transportadas em água e meio de cultura. DNA foi extraído por método de fervura. O marcador molecular para clamidiose (fragmento de DNA de 264 pb, gene ompA) foi amplificado por PCR, utilizado primers CPF/CPR. O diagnóstico molecular deu-se por presença/ausência em gel de agarose do marcador molecular. Todos os indivíduos foram analisados quanto a suspeita clínica de clamidiose, considerando os sinais: conjuntivite, secreção nasal e desnutrição. Os resultados obtidos seguem. (i) Não foi detectado influência dos meios de transporte das amostras biológicas sobre o diagnóstico molecular da clamidiose. (ii) A prevalência de clamidiose detectada na amostra foi de 37% (n= 22). (iii) A coincidência entre diagnóstico molecular e suspeita clínica foi de 68% (estatisticamente significativa, p=0,0095); com suspeita clínica indicando 15% (n=9) de falsos positivos e 17% (n=10) de falsos negativos. (iv) Não houve correlação estatisticamente significativa entre quantidade e tipo de sinal clínico em particular com diagnóstico molecular. (v) O acompanhamento de parte da amostra, demonstrou que 50% (n=7) dos indivíduos passaram de diagnóstico negativo para diagnóstico positivo em no máximo 24 dias.Chlamydiosis is a recurrent disease in birds, especially psittacines. This zoonosis is caused by the bacterium Chlamydophila psittaci. In Brazil, the Wild Animals Triage Centers (CETAS) receive, maintain, treat and reintroduce to nature, wild animals coming from the illegal trade. The objective of the present work was to perform a molecular diagnosis and to relate it with clinical suspicion, in parrots allocated in CETAS of Vitória da Conquista, BA, Brazil. Samples of cloacal swab were collected from 59 parrots Amazona sp. These were transported in water and culture medium. DNA was extracted by boiling method. The molecular marker for chlamydiosis (264 bp DNA fragment, ompA gene) was amplified by PCR using CPF / CPR primers. The molecular diagnosis ocurred by presence/absence of the molecular marker on agarose gel. All individuals were analyzed for clinical suspicion of chlamydiosis, considering the signs: conjunctivitis, nasal secretion and malnutrition. The obtained results are as follow. (i) No influence of biological sample transport media was detected on the molecular diagnosis of chlamydiosis. (ii) The prevalence of chlamydiosis detected in the sample was 37%. (iii) The coincidence between molecular diagnosis and clinical suspicion was 68% (statistically significant, p = 0.0095); with clinical suspicion indicating 15% (n=9) of false positives and 17% (n=10) of false negatives. (iv) There was no statistically significant correlation between quantity and type of clinical signal in particular with molecular diagnosis. (v) Follow-up of part of the sample showed that 50% (n=7) of subjects moved from negative to positive diagnosis in a maximum 24 days.Biologia MolecularBiodiversidadeMicrobiologiaclamidiosepapagaiodiagnóstico molecularsuspeita clínicaDiagnóstico molecular de clamidiose em papagaios de um centro de triagem de animais silvestresinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/bachelorThesisUniversidade Federal da Bahia Instituto Multidisciplinar em Saúde, Campus Anísio TeixeiraUFBA - IMS/CATbrasilinfo:eu-repo/semantics/openAccessporreponame:Repositório Institucional da UFBAinstname:Universidade Federal da Bahia (UFBA)instacron:UFBAORIGINALDiagnóstico molecular de clamidiose.pdfDiagnóstico molecular de clamidiose.pdfapplication/pdf1071010https://repositorio.ufba.br/bitstream/ri/28286/1/Diagn%c3%b3stico%20molecular%20de%20clamidiose.pdf6f8dffb3c9af0f8fce504d0c85559378MD51open accessLICENSElicense.txtlicense.txttext/plain1345https://repositorio.ufba.br/bitstream/ri/28286/2/license.txtff6eaa8b858ea317fded99f125f5fcd0MD52open accessTEXTDiagnóstico molecular de clamidiose.pdf.txtDiagnóstico molecular de clamidiose.pdf.txtExtracted texttext/plain88890https://repositorio.ufba.br/bitstream/ri/28286/3/Diagn%c3%b3stico%20molecular%20de%20clamidiose.pdf.txtca3ef90fdaa9872816ca792b17c0e0c6MD53open accessri/282862024-03-04 14:40:06.879open accessoai:repositorio.ufba.br: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Repositório InstitucionalPUBhttp://192.188.11.11:8080/oai/requestopendoar:19322024-03-04T17:40:06Repositório Institucional da UFBA - Universidade Federal da Bahia (UFBA)false |
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