Investigação de mutações em oncogenes e genes supressores de tumores em mixomas odontogênicos por sequenciamento de nova geração

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Sousa Neto, Ernesto Santos
Data de Publicação: 2019
Tipo de documento: Tese
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Institucional da UFBA
Texto Completo: http://repositorio.ufba.br/ri/handle/ri/33690
Resumo: O mixoma odontogênico (MO) é uma neoplasia odontogênica agressiva benigna cuja patogenia ainda não foi bem esclarecida. Mutações patogênicas têm sido descritas em tumores odontogênicos (TO) epiteliais benignos, como ameloblastomas e tumores odontogênicos adenomatóides, no entanto, a patogênese molecular do MO ainda é pouco caracterizada, dificultando o desenvolvimento de um tratamento personalizado. O sequenciamento de nova geração (SNG) consiste em um dos métodos usado para traçar o perfil molecular de patologias e já está sendo utilizado para identificar mutações genéticas e polimorfismos de nucleotídeo único associados a muitas lesões odontogênicas. Com o objetivo de encontrar mutações genéticas no MO, realizou-se sequenciamento de nova geração (SNG) em nove casos utilizando o painel Ion AmpliSeqTM Cancer Hotspot Panel v2, que investiga 2.855 mutações em 207 amplicons de 50 genes. Após controle de qualidade, três amostras foram excluídas do estudo e apenas 06 amostras seguiram no experimento. O SNG revelou cinco variantes de nucleotídeo único: KDR (rs1870377); TP53 (rs1042522); PIK3CA (rs2230461); KIT (rs3822214); JAK3 (rs3213409), no entanto nenhuma mutação foi predita como patogênica. Em conclusão esses tumores agressivos não abrigam mutações patogênicas em genes comumente mutados em cânceres humanos cobertos por este painel, ou se o fazem, essas mutações provavelmente ocorrem em baixa proporção de casos.
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Com o objetivo de encontrar mutações genéticas no MO, realizou-se sequenciamento de nova geração (SNG) em nove casos utilizando o painel Ion AmpliSeqTM Cancer Hotspot Panel v2, que investiga 2.855 mutações em 207 amplicons de 50 genes. Após controle de qualidade, três amostras foram excluídas do estudo e apenas 06 amostras seguiram no experimento. O SNG revelou cinco variantes de nucleotídeo único: KDR (rs1870377); TP53 (rs1042522); PIK3CA (rs2230461); KIT (rs3822214); JAK3 (rs3213409), no entanto nenhuma mutação foi predita como patogênica. Em conclusão esses tumores agressivos não abrigam mutações patogênicas em genes comumente mutados em cânceres humanos cobertos por este painel, ou se o fazem, essas mutações provavelmente ocorrem em baixa proporção de casos.Odontogenic myxoma (OM) is a benign aggressive odontogenic neoplasm whose pathogenesis has not yet been well understood. Pathogenic mutations have been described in benign epithelial odontogenic tumors (OT), such as ameloblastomas and adenomatoid odontogenic tumors; however, the molecular pathogenesis of OM is still poorly characterized, making it difficult to develop a personalized treatment. New generation sequencing (SNG) is one of the methods used to trace the molecular profile of pathologies and is already being used to identify genetic mutations and single nucleotide polymorphisms associated with many odontogenic lesions. In order to find genetic mutations in the MO, new generation sequencing (SNG) was performed in nine cases using the Ion AmpliSeq ™ Panel Cancer Hotspot Panel v2, which investigates 2,855 mutations in 207 amplicons of 50 genes. After quality control, three samples were excluded from the study and only six samples were followed in the experiment. The SNG revealed five single nucleotide variants: KDR (rs1870377); TP53 (rs1042522); PIK3CA (rs2230461); KIT (rs3822214); JAK3 (rs3213409), however no mutation was predicted as pathogenic. In conclusion, these aggressive tumors do not harbor pathogenic mutations in commonly mutated genes in human cancers covered by this panel, or if they do, such mutations probably occur in a low proportion of cSubmitted by Programa de Pós-Graduação em Odontologia Saúde (mestrodo@ufba.br) on 2021-06-29T15:18:05Z No. of bitstreams: 1 TESE-VERSÃ-O-FINAL-ERNESTO-240619.pdf: 861649 bytes, checksum: 827125087937eefcb82d8e16de9162be (MD5)Approved for entry into archive by Delba Rosa (delba@ufba.br) on 2021-06-30T20:30:14Z (GMT) No. of bitstreams: 1 TESE-VERSÃ-O-FINAL-ERNESTO-240619.pdf: 861649 bytes, checksum: 827125087937eefcb82d8e16de9162be (MD5)Made available in DSpace on 2021-06-30T20:30:14Z (GMT). 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