Identificação e caracterização de genes de Aquaporinas em Cnidoscolus quercifolius Pohl.

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: NÓBREGA, Gisela Formiga Queiroz.
Data de Publicação: 2017
Tipo de documento: Dissertação
Idioma: por
Título da fonte: Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFCG
Texto Completo: http://dspace.sti.ufcg.edu.br:8080/jspui/handle/riufcg/15677
Resumo: A família botânica Euphorbiaceae Juss. é uma das mais diversificadas e complexas, apresentando cerca de 50 gêneros e 240 espécies no Nordeste brasileiro, grande parte distribuídos em áreas de Caatinga. Dentre essas, destacam-se Manihot esculenta Cartz, Ricinus communis L. e Cnidoscolus quercifolius Pohl, que, devido à tolerância ao déficit hídrico, apresentam-se como espécies de importância econômica para regiões tropicais, especialmente o Brasil. C. quercifolius é uma espécie endêmica da Caatinga, sendo bastante explorada devido às várias possibilidades de utilização de suas partes (produção de forragem, óleo comestível e farinha, utilizada na regeneração de áreas degradadas e para fins medicinais). Entre os mecanismos de adaptação às condições ambientais limitantes existentes em plantas superiores, ressalta-se a importância do reajuste dos padrões de expressão gênica, que atua ativando e desativando uma variedade de genes, considerados genes estresseresponsivos, que são responsáveis pelas alterações do metabolismo celular que permite à planta a geração de respostas fisiológicas frente à exposição ao estresse. Um exemplo são as aquaporinas vegetais, que são proteínas de membrana responsáveis pelo transporte de água, gases e outros pequenos solutos e que desempenham um papel fundamental na adaptação das plantas mediante estresses como salinidade e déficit hídrico. A identificação de genes estresse-responsivos só foi possível devido às novas tecnologias de sequenciamento e às ferramentas de bioinformática, que possibilitaram, não apenas a obtenção de genomas completos, como também a manipulação e análise desses dados, facilitando a identificação de novas moléculas envolvidas em processos fisiológicos essenciais às plantas. Até o momento, não se encontra disponível em bancos de dados biológicos qualquer tipo de informação genética de C. quercifolius. A identificação de aquaporinas em C. quercifolius foi realizada pelo processo de transferabilidade de iniciadores entre espécies próximas, tendo em vista a elevada conservação entre as sequências desta família gênica. Foram identificadas sete sequências parciais de CqAQPs, sendo este o primeiro relato de aquaporinas nesta espécie, podendo, assim, ser usado para o desenho de iniciadores específicos para a espécie, favorecendo a identificação de potenciais alvos biotecnológicos.
id UFCG_27425442569857a403b268b58a76ce25
oai_identifier_str oai:localhost:riufcg/15677
network_acronym_str UFCG
network_name_str Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFCG
repository_id_str 4851
spelling Identificação e caracterização de genes de Aquaporinas em Cnidoscolus quercifolius Pohl.Identification and characterization of Aquaporines genes in Cnidoscolus quercifolius Pohl.Cnidoscolus quercifolius PohlGenes de AquaporinasBioinformáticaEuphobiaceasTransportadores de membranaBioma CaatingaRecursos genéticos vegetais - caatingaFamília EuphorbiaceaeRelações hídricas - plantasAquaporinas vegetaisSubfamílias de aquaporinas - plantas superioresFerramentas computacionais - análise de genesCaracterização de sequências - BioinformáticaModelagem comparativaExtração de DNAExtração de RNAAquaporin GenesBioinformaticsMembrane conveyorsWater relations - plantsVegetable aquaporinsAquaporin subfamilies - higher plantsSequence characterization - BioinformaticsCiências Florestais.A família botânica Euphorbiaceae Juss. é uma das mais diversificadas e complexas, apresentando cerca de 50 gêneros e 240 espécies no Nordeste brasileiro, grande parte distribuídos em áreas de Caatinga. Dentre essas, destacam-se Manihot esculenta Cartz, Ricinus communis L. e Cnidoscolus quercifolius Pohl, que, devido à tolerância ao déficit hídrico, apresentam-se como espécies de importância econômica para regiões tropicais, especialmente o Brasil. C. quercifolius é uma espécie endêmica da Caatinga, sendo bastante explorada devido às várias possibilidades de utilização de suas partes (produção de forragem, óleo comestível e farinha, utilizada na regeneração de áreas degradadas e para fins medicinais). Entre os mecanismos de adaptação às condições ambientais limitantes existentes em plantas superiores, ressalta-se a importância do reajuste dos padrões de expressão gênica, que atua ativando e desativando uma variedade de genes, considerados genes estresseresponsivos, que são responsáveis pelas alterações do metabolismo celular que permite à planta a geração de respostas fisiológicas frente à exposição ao estresse. Um exemplo são as aquaporinas vegetais, que são proteínas de membrana responsáveis pelo transporte de água, gases e outros pequenos solutos e que desempenham um papel fundamental na adaptação das plantas mediante estresses como salinidade e déficit hídrico. A identificação de genes estresse-responsivos só foi possível devido às novas tecnologias de sequenciamento e às ferramentas de bioinformática, que possibilitaram, não apenas a obtenção de genomas completos, como também a manipulação e análise desses dados, facilitando a identificação de novas moléculas envolvidas em processos fisiológicos essenciais às plantas. Até o momento, não se encontra disponível em bancos de dados biológicos qualquer tipo de informação genética de C. quercifolius. A identificação de aquaporinas em C. quercifolius foi realizada pelo processo de transferabilidade de iniciadores entre espécies próximas, tendo em vista a elevada conservação entre as sequências desta família gênica. Foram identificadas sete sequências parciais de CqAQPs, sendo este o primeiro relato de aquaporinas nesta espécie, podendo, assim, ser usado para o desenho de iniciadores específicos para a espécie, favorecendo a identificação de potenciais alvos biotecnológicos.Euphorbiaceae Juss. is one of the most diversified and complex species of the botanical family, comprising approximately 50 genera and 240 kinds in the Brazilian Northeast, widely distributed in Caatinga areas. Among them are Manihot esculenta Cartz, Ricinus communis L. and Cnidoscolus quercifolius Pohl, which, due to its tolerance to water shortage, are species of great economic importance for tropical regions, including Brazil. C. quercifolius is an endemic species of the Caatinga, and it has been extensively exploited for various uses (forage production, edible oil and flour, use in the regeneration of degraded areas and for medicinal purposes). Among the mechanisms of adaptation to the limiting environmental conditions existing in higher plants, we emphasize the importance of the readjustment of genetic gender patterns, which activates and deactivates a variety of genes that are considered genes-responsive genes responsible for cellular metabolism, which allows a generation of physiological responses to a plant from stress. An example of that are the aquaporins plants, which are membrane proteins responsible for transporting of water, gases and other small solutes, in addition to playing a key role in the adaptation of plants to adverse conditions such as salinity and water shortage. The identification of stress-responsive genes was only possible from new sequencing technologies and bioinformatics tools, which enabled not only the attainment of a complete genome, but also the manipulation and analysis of such data, facilitating the identification of new molecules involved in essential physiological processes to plants. To date, it is not available in biological databases any genetic information on C. quercifolius. The identification of aquaporins in C. quercifolius was conducted by the process of transferability of initiators between close species, considering the high conservation among the sequences of this family. Seven partial sequences of CQAQPs were identified, and this is the first report of aquaporins in that species; therefore, enabling its use for designing of specific initiators for the species, aiding the identification of potential biotechnological targets.Universidade Federal de Campina GrandeBrasilCentro de Saúde e Tecnologia Rural - CSTRPÓS-GRADUAÇÃO EM CIÊNCIAS FLORESTAISUFCGSOARES, Carlos Eduardo Alves.SOARES, C. E. A.http://lattes.cnpq.br/0870407557602038BEZERRA NETO, João Pacífico.BAKKE, Ivonete Alves.NÓBREGA, Gisela Formiga Queiroz.2017-03-282020-09-27T11:16:29Z2020-09-272020-09-27T11:16:29Zinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesishttp://dspace.sti.ufcg.edu.br:8080/jspui/handle/riufcg/15677Nóbrega, Gisela Formiga Queiroz. Identificação e caracterização de genes de Aquaporinas em Cnidoscolus quercifolius Pohl. 2017. 106f. (Dissertação de Mestrado em Ciências Florestais), Programa de Pós-graduação em Ciências Florestais, Centro de Saúde e Tecnologia Rural, Universidade Federal de Campina Grande – Campus de Patos – Paraíba Brasil, 2017. Disponível em: http://dspace.sti.ufcg.edu.br:8080/jspui/handle/riufcg/15677porinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFCGinstname:Universidade Federal de Campina Grande (UFCG)instacron:UFCG2022-03-11T13:53:39Zoai:localhost:riufcg/15677Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttp://bdtd.ufcg.edu.br/PUBhttp://dspace.sti.ufcg.edu.br:8080/oai/requestbdtd@setor.ufcg.edu.br || bdtd@setor.ufcg.edu.bropendoar:48512022-03-11T13:53:39Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFCG - Universidade Federal de Campina Grande (UFCG)false
dc.title.none.fl_str_mv Identificação e caracterização de genes de Aquaporinas em Cnidoscolus quercifolius Pohl.
Identification and characterization of Aquaporines genes in Cnidoscolus quercifolius Pohl.
title Identificação e caracterização de genes de Aquaporinas em Cnidoscolus quercifolius Pohl.
spellingShingle Identificação e caracterização de genes de Aquaporinas em Cnidoscolus quercifolius Pohl.
NÓBREGA, Gisela Formiga Queiroz.
Cnidoscolus quercifolius Pohl
Genes de Aquaporinas
Bioinformática
Euphobiaceas
Transportadores de membrana
Bioma Caatinga
Recursos genéticos vegetais - caatinga
Família Euphorbiaceae
Relações hídricas - plantas
Aquaporinas vegetais
Subfamílias de aquaporinas - plantas superiores
Ferramentas computacionais - análise de genes
Caracterização de sequências - Bioinformática
Modelagem comparativa
Extração de DNA
Extração de RNA
Aquaporin Genes
Bioinformatics
Membrane conveyors
Water relations - plants
Vegetable aquaporins
Aquaporin subfamilies - higher plants
Sequence characterization - Bioinformatics
Ciências Florestais.
title_short Identificação e caracterização de genes de Aquaporinas em Cnidoscolus quercifolius Pohl.
title_full Identificação e caracterização de genes de Aquaporinas em Cnidoscolus quercifolius Pohl.
title_fullStr Identificação e caracterização de genes de Aquaporinas em Cnidoscolus quercifolius Pohl.
title_full_unstemmed Identificação e caracterização de genes de Aquaporinas em Cnidoscolus quercifolius Pohl.
title_sort Identificação e caracterização de genes de Aquaporinas em Cnidoscolus quercifolius Pohl.
author NÓBREGA, Gisela Formiga Queiroz.
author_facet NÓBREGA, Gisela Formiga Queiroz.
author_role author
dc.contributor.none.fl_str_mv SOARES, Carlos Eduardo Alves.
SOARES, C. E. A.
http://lattes.cnpq.br/0870407557602038
BEZERRA NETO, João Pacífico.
BAKKE, Ivonete Alves.
dc.contributor.author.fl_str_mv NÓBREGA, Gisela Formiga Queiroz.
dc.subject.por.fl_str_mv Cnidoscolus quercifolius Pohl
Genes de Aquaporinas
Bioinformática
Euphobiaceas
Transportadores de membrana
Bioma Caatinga
Recursos genéticos vegetais - caatinga
Família Euphorbiaceae
Relações hídricas - plantas
Aquaporinas vegetais
Subfamílias de aquaporinas - plantas superiores
Ferramentas computacionais - análise de genes
Caracterização de sequências - Bioinformática
Modelagem comparativa
Extração de DNA
Extração de RNA
Aquaporin Genes
Bioinformatics
Membrane conveyors
Water relations - plants
Vegetable aquaporins
Aquaporin subfamilies - higher plants
Sequence characterization - Bioinformatics
Ciências Florestais.
topic Cnidoscolus quercifolius Pohl
Genes de Aquaporinas
Bioinformática
Euphobiaceas
Transportadores de membrana
Bioma Caatinga
Recursos genéticos vegetais - caatinga
Família Euphorbiaceae
Relações hídricas - plantas
Aquaporinas vegetais
Subfamílias de aquaporinas - plantas superiores
Ferramentas computacionais - análise de genes
Caracterização de sequências - Bioinformática
Modelagem comparativa
Extração de DNA
Extração de RNA
Aquaporin Genes
Bioinformatics
Membrane conveyors
Water relations - plants
Vegetable aquaporins
Aquaporin subfamilies - higher plants
Sequence characterization - Bioinformatics
Ciências Florestais.
description A família botânica Euphorbiaceae Juss. é uma das mais diversificadas e complexas, apresentando cerca de 50 gêneros e 240 espécies no Nordeste brasileiro, grande parte distribuídos em áreas de Caatinga. Dentre essas, destacam-se Manihot esculenta Cartz, Ricinus communis L. e Cnidoscolus quercifolius Pohl, que, devido à tolerância ao déficit hídrico, apresentam-se como espécies de importância econômica para regiões tropicais, especialmente o Brasil. C. quercifolius é uma espécie endêmica da Caatinga, sendo bastante explorada devido às várias possibilidades de utilização de suas partes (produção de forragem, óleo comestível e farinha, utilizada na regeneração de áreas degradadas e para fins medicinais). Entre os mecanismos de adaptação às condições ambientais limitantes existentes em plantas superiores, ressalta-se a importância do reajuste dos padrões de expressão gênica, que atua ativando e desativando uma variedade de genes, considerados genes estresseresponsivos, que são responsáveis pelas alterações do metabolismo celular que permite à planta a geração de respostas fisiológicas frente à exposição ao estresse. Um exemplo são as aquaporinas vegetais, que são proteínas de membrana responsáveis pelo transporte de água, gases e outros pequenos solutos e que desempenham um papel fundamental na adaptação das plantas mediante estresses como salinidade e déficit hídrico. A identificação de genes estresse-responsivos só foi possível devido às novas tecnologias de sequenciamento e às ferramentas de bioinformática, que possibilitaram, não apenas a obtenção de genomas completos, como também a manipulação e análise desses dados, facilitando a identificação de novas moléculas envolvidas em processos fisiológicos essenciais às plantas. Até o momento, não se encontra disponível em bancos de dados biológicos qualquer tipo de informação genética de C. quercifolius. A identificação de aquaporinas em C. quercifolius foi realizada pelo processo de transferabilidade de iniciadores entre espécies próximas, tendo em vista a elevada conservação entre as sequências desta família gênica. Foram identificadas sete sequências parciais de CqAQPs, sendo este o primeiro relato de aquaporinas nesta espécie, podendo, assim, ser usado para o desenho de iniciadores específicos para a espécie, favorecendo a identificação de potenciais alvos biotecnológicos.
publishDate 2017
dc.date.none.fl_str_mv 2017-03-28
2020-09-27T11:16:29Z
2020-09-27
2020-09-27T11:16:29Z
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/masterThesis
format masterThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv http://dspace.sti.ufcg.edu.br:8080/jspui/handle/riufcg/15677
Nóbrega, Gisela Formiga Queiroz. Identificação e caracterização de genes de Aquaporinas em Cnidoscolus quercifolius Pohl. 2017. 106f. (Dissertação de Mestrado em Ciências Florestais), Programa de Pós-graduação em Ciências Florestais, Centro de Saúde e Tecnologia Rural, Universidade Federal de Campina Grande – Campus de Patos – Paraíba Brasil, 2017. Disponível em: http://dspace.sti.ufcg.edu.br:8080/jspui/handle/riufcg/15677
url http://dspace.sti.ufcg.edu.br:8080/jspui/handle/riufcg/15677
identifier_str_mv Nóbrega, Gisela Formiga Queiroz. Identificação e caracterização de genes de Aquaporinas em Cnidoscolus quercifolius Pohl. 2017. 106f. (Dissertação de Mestrado em Ciências Florestais), Programa de Pós-graduação em Ciências Florestais, Centro de Saúde e Tecnologia Rural, Universidade Federal de Campina Grande – Campus de Patos – Paraíba Brasil, 2017. Disponível em: http://dspace.sti.ufcg.edu.br:8080/jspui/handle/riufcg/15677
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.publisher.none.fl_str_mv Universidade Federal de Campina Grande
Brasil
Centro de Saúde e Tecnologia Rural - CSTR
PÓS-GRADUAÇÃO EM CIÊNCIAS FLORESTAIS
UFCG
publisher.none.fl_str_mv Universidade Federal de Campina Grande
Brasil
Centro de Saúde e Tecnologia Rural - CSTR
PÓS-GRADUAÇÃO EM CIÊNCIAS FLORESTAIS
UFCG
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFCG
instname:Universidade Federal de Campina Grande (UFCG)
instacron:UFCG
instname_str Universidade Federal de Campina Grande (UFCG)
instacron_str UFCG
institution UFCG
reponame_str Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFCG
collection Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFCG
repository.name.fl_str_mv Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFCG - Universidade Federal de Campina Grande (UFCG)
repository.mail.fl_str_mv bdtd@setor.ufcg.edu.br || bdtd@setor.ufcg.edu.br
_version_ 1809744466506940416