4-terpineol (-)4TRP como candidato a fármaco para COVID-19.

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: BRAZ, Luana Camilla Cordeiro.
Data de Publicação: 2021
Outros Autores: BRAZ, Liliane Karine Cordeiro., NOBREGA, Franklin Ferreira de Farias., MAIA, Rafael Trindade.
Tipo de documento: Capítulo de livro
Idioma: por
Título da fonte: Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFCG
Texto Completo: http://dspace.sti.ufcg.edu.br:8080/jspui/handle/riufcg/36386
Resumo: No final de 2019, um novo coronavírus (SARS-CoV-2) surgiu na China causando a maior pandemia viral dos últimos tempos. A inexistência de medicamentos específicos ocasionou uma incessante corrida para reposicionamento de fármacos no meio científico, para identificação de moléculas promissoras no tratamento da COVID-19. A NSP9 é uma replicase que está associada a replicação viral do SARS-CoV-2 e, portanto, representa um importante alvo para compostos inibidores. O 4-terpineol é um monoterpeno com inúmeras propriedades farmacológicas, entre elas atividade antimicrobiana e antiviral. O presente estudo adotou como objetivo fazer simulações de docking molecular entre a NSP9 e (-)-4-terpineol. As moléculas foram obtidas em base de dados públicas (PDB e ZINC). Foi utilizado o programa Autodocktools 1.5.6 para as simulações de docking, enquanto que as análises das interações e análise visual dos complexos foram realizados no programa DS-Discovery Studio. As energias de ligação obtidas tiveram valores negativos variando de -4.39 a -4.19 kcal/ mol. O monoterpeno interagiu com 8 aminoácidos do sítio catalítico da enzima, sendo a maioria hidrofóbicos. Ocorreu a formação de uma ligação de hidrogênio entre a ARG40 e o grupamento hidroxila do ligante. As outras interações foram representadas por ligações do tipo alquil e pi-alquil promovidas por três aminoácidos e interações de van der Walls com outros quatro aminoácidos. Estes resultados indicam uma afinidade entre o ligante e o sítio ativo da enzima. O 4-terpineol é um candidato interessante para ensaios in vitro e in vivo visando determinar o potencial de inibição viral do SARS-CoV-2.
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spelling 4-terpineol (-)4TRP como candidato a fármaco para COVID-19.Terpinen-4-ol (-)4TRP as a drug candidate for COVID-19.Bioinformática estrutural a aplicadaInibição viralModelagem molecularProspecção de fármacos4-terpineol (-)4TRPTerpinen-4-ol (-)4TRPCOVID-19Programa AutodocktoolsStructural to applied bioinformaticsViral inhibitionMolecular modelingDrug prospecting4-terpineol (-)4TRPAutodocktools programCiências Biológicas.No final de 2019, um novo coronavírus (SARS-CoV-2) surgiu na China causando a maior pandemia viral dos últimos tempos. A inexistência de medicamentos específicos ocasionou uma incessante corrida para reposicionamento de fármacos no meio científico, para identificação de moléculas promissoras no tratamento da COVID-19. A NSP9 é uma replicase que está associada a replicação viral do SARS-CoV-2 e, portanto, representa um importante alvo para compostos inibidores. O 4-terpineol é um monoterpeno com inúmeras propriedades farmacológicas, entre elas atividade antimicrobiana e antiviral. O presente estudo adotou como objetivo fazer simulações de docking molecular entre a NSP9 e (-)-4-terpineol. As moléculas foram obtidas em base de dados públicas (PDB e ZINC). Foi utilizado o programa Autodocktools 1.5.6 para as simulações de docking, enquanto que as análises das interações e análise visual dos complexos foram realizados no programa DS-Discovery Studio. As energias de ligação obtidas tiveram valores negativos variando de -4.39 a -4.19 kcal/ mol. O monoterpeno interagiu com 8 aminoácidos do sítio catalítico da enzima, sendo a maioria hidrofóbicos. Ocorreu a formação de uma ligação de hidrogênio entre a ARG40 e o grupamento hidroxila do ligante. As outras interações foram representadas por ligações do tipo alquil e pi-alquil promovidas por três aminoácidos e interações de van der Walls com outros quatro aminoácidos. Estes resultados indicam uma afinidade entre o ligante e o sítio ativo da enzima. O 4-terpineol é um candidato interessante para ensaios in vitro e in vivo visando determinar o potencial de inibição viral do SARS-CoV-2.In late 2019, a new coronavirus (SARS-CoV-2) emerged in China causing the biggest viral pandemic in recent times. The inexistence of speciic medications led to an incessant race for the repositioning of drugs in the scientiic world, to identify promising molecules for the treatment of COVID-19. NSP9 is a replicase that is associated with viral replication of SARSCoV-2 and therefore represents an important target for inhibitor compounds. Terpinen-4-ol is a monoterpene with numerous pharmacological properties, including antimicrobial and antiviral activities. The present study aimed to perform molecular docking simulations between NSP9 and (-)-terpinen-4-ol. The molecules were obtained from a public database (PDB and ZINC). The Autodocktools 1.5.6 program was used for the docking simulations, while the interaction analysis and visual analysis of the complexes were performed using the DS-Discovery Studio program. The binding energies obtained had negative values ranging from -4.39 to -4.19 kcal/mol. The monoterpene interacted with 8 amino acids from the enzyme’s catalytic site, most of which were hydrophobic. A hydrogen bond was formed between the ARG40 and the hydroxyl group of the ligand. The other interactions were represented by alkyl and pialkyl bonds promoted by three amino acids and van der Walls interactions with four other amino acids. These results indicate an afinity between the ligand and the active site of the enzyme. Terpinen-4-ol is an interesting candidate for in vitro and in vivo assays to determine the potential for viral inhibition of SARS-CoV-2.Universidade Federal de Campina GrandeBrasilUFCG20212024-07-01T15:31:14Z2024-07-012024-07-01T15:31:14Zinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/bookParthttp://dspace.sti.ufcg.edu.br:8080/jspui/handle/riufcg/36386BRAZ, Luana Camilla Cordeiro; BRAZ, Liliane Karine Cordeiro; NOBREGA, Franklin Ferreira de Farias; MAIA, Rafael Trindade. 4-terpineol (-)4TRP como candidato a fármaco para COVID-19. In: PESSOA, Débora Luana Ribeiro. (Org.). Expansão do conhecimento e inovação tecnológica no campo das ciências farmacêuticas. São Paulo: Atena, 2021, v. 3, p. 53-60. Disponível em: http://dspace.sti.ufcg.edu.br:8080/jspui/handle/riufcg/36386porBRAZ, Luana Camilla Cordeiro.BRAZ, Liliane Karine Cordeiro.NOBREGA, Franklin Ferreira de Farias.MAIA, Rafael Trindade.info:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFCGinstname:Universidade Federal de Campina Grande (UFCG)instacron:UFCG2024-07-01T15:32:01Zoai:localhost:riufcg/36386Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttp://bdtd.ufcg.edu.br/PUBhttp://dspace.sti.ufcg.edu.br:8080/oai/requestbdtd@setor.ufcg.edu.br || bdtd@setor.ufcg.edu.bropendoar:48512024-07-01T15:32:01Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFCG - Universidade Federal de Campina Grande (UFCG)false
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