Identificação e caracterização In silico da expressão de genes do tipo Miraculina em citros.

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: RODRIGUES, Adeilma Dantas.
Data de Publicação: 2013
Tipo de documento: Trabalho de conclusão de curso
Idioma: por
Título da fonte: Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFCG
Texto Completo: http://dspace.sti.ufcg.edu.br:8080/jspui/handle/riufcg/10776
Resumo: O Brasil é considerado o maior produtor de citros do mundo detendo atualmente cerca de 26% da produção de laranjas e 53% de suco, gerando em torno de 1,5 bilhão de dólares anuais com a exportação de suco concentrado congelado de laranja. No entanto, ao longo dos anos, os citros vêm sofrendo perdas significativas na produção devido a fatores ambientais e, principalmente, patológicos. Phytophthora parasitica, clorose variegada dos citros (CVC), leprose dos citros e vírus da tristeza dos citros (CTV) são os principais agentes causadores de doenças em citros. Uma estratégia relevante atualmente é explorar bancos de dados para analisar a expressão de genes envolvidos nas respostas de plantas a patógenos, visando o entendimento das funções biológicas destes genes bem como o direcionamento de trabalhos futuros considerando sua aplicação biotecnológica. O objetivo desse trabalho foi identificar e caracterizar a expressão de genes miraculina de citros presentes no banco de dados CitEST, usando ferramentas computacionais e caracterizar in silico a expressão de genes miraculina em pelo menos uma espécie de citros encontrada no CitEST. Foram feitas buscas por genes do tipo miraculina em citros no banco de dados do genoma funcional dos citros – CitEST, usando o programa Unigene Editor e a palavra-chave “miraculin” e as sequencias identificadas foram analisadas usando o BLASTx para encontrar sequencias homólogas a miraculina no banco de dados GenBank. Foram encontrados 127 genes do tipo miraculina no banco de dados CitEST, os quais estão expressos em órgãos das espécies Poncirus trifoliata, Citrus reticulata, C. sinensis e C. aurantium. Além disso, existem genes miraculina com homologia ao inibidor de proteinase e expressos em órgãos de Poncirus trifoliata induzidos sob condições de patógenos.
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Phytophthora parasitica, clorose variegada dos citros (CVC), leprose dos citros e vírus da tristeza dos citros (CTV) são os principais agentes causadores de doenças em citros. Uma estratégia relevante atualmente é explorar bancos de dados para analisar a expressão de genes envolvidos nas respostas de plantas a patógenos, visando o entendimento das funções biológicas destes genes bem como o direcionamento de trabalhos futuros considerando sua aplicação biotecnológica. O objetivo desse trabalho foi identificar e caracterizar a expressão de genes miraculina de citros presentes no banco de dados CitEST, usando ferramentas computacionais e caracterizar in silico a expressão de genes miraculina em pelo menos uma espécie de citros encontrada no CitEST. Foram feitas buscas por genes do tipo miraculina em citros no banco de dados do genoma funcional dos citros – CitEST, usando o programa Unigene Editor e a palavra-chave “miraculin” e as sequencias identificadas foram analisadas usando o BLASTx para encontrar sequencias homólogas a miraculina no banco de dados GenBank. Foram encontrados 127 genes do tipo miraculina no banco de dados CitEST, os quais estão expressos em órgãos das espécies Poncirus trifoliata, Citrus reticulata, C. sinensis e C. aurantium. Além disso, existem genes miraculina com homologia ao inibidor de proteinase e expressos em órgãos de Poncirus trifoliata induzidos sob condições de patógenos.Brazil is considered the largest producer of citrus in the world currently holding about 26% of production and 53% orange juice, generating approximately $ 1.5 billion with annual exports of frozen concentrated orange juice. However, over the years, the citrus have suffered significant losses due to environmental factors and particularly pathological. Phytophthora parasitica, citrus variegated chlorosis (CVC), leprosis citrus and citrus sadness virus (CTV) are the major causative agents of disease in citrus. A strategy is currently exploring relevant databases to analyze the expression of genes involved in plant responses to pathogens in order to understand the biological functions of these genes and the direction of future work considering their biotechnological applications. The aim of this study was to identify and characterize the expression of genes present in citrus miraculin database CitEST, using computational tools to characterize and in silico miraculin gene expression in at least one citrus species found in CitEST. We searched for genes in citrus type miraculin in the database of functional genome of citrus - CitEST using Unigene Editor program and the keyword "miraculin" and identified the sequences were analyzed using BLASTx to find homologous sequences in miraculin GenBank database. We found 127 genes in the type miraculin database CitEST, which are expressed in organs of species Poncirus trifoliata, Citrus reticulata, C. sinensis and C. aurantium. Furthermore, there are miraculin genes with homology to proteinase inhibitor expressed in organs and Poncirus trifoliata induced under conditions of pathogens.Brasil es considerado el mayor productor de cítricos del mundo, actualmente posee cerca del 26% de la producción de naranjas y el 53% de jugo, generando alrededor de 1.500 millones de dólares anuales con la exportación de jugo de naranja concentrado congelado. Sin embargo, a lo largo de los años, los cítricos han sufrido pérdidas importantes en la producción debido a factores ambientales y, principalmente, patológicos. Phytophthora parasitica, la clorosis variegada de los cítricos (CVC), la leprosis de los cítricos y el virus de la tristeza de los cítricos (CTV) son los principales agentes causantes de la enfermedad de los cítricos. Actualmente, una estrategia relevante es explorar bases de datos para analizar la expresión de genes involucrados en las respuestas de las plantas a los patógenos, con el objetivo de comprender las funciones biológicas de estos genes y orientar el trabajo futuro considerando su aplicación biotecnológica. El objetivo de este trabajo fue identificar y caracterizar la expresión de genes de miraculina de cítricos presentes en la base de datos de CitEST, utilizando herramientas computacionales y caracterizar in silico la expresión de genes de miraculina en al menos una especie de cítrico encontrada en CitEST. Las búsquedas de genes similares a miraculina en cítricos se realizaron en la base de datos del genoma funcional de cítricos - CitEST, utilizando el programa Unigene Editor y la palabra clave "miraculin" y las secuencias identificadas se analizaron utilizando BLASTx para encontrar secuencias homólogas a miraculin en la base de datos GenBank. En la base de datos CitEST se encontraron un total de 127 genes similares a la miraculina, que se expresan en órganos de las especies Poncirus trifoliata, Citrus reticulata, C. sinensis y C. aurantium. Además, existen genes de miraculina con homología con el inhibidor de proteinasa y expresados ​​en órganos de Poncirus trifoliata inducidos en condiciones patógenas.Universidade Federal de Campina GrandeBrasilCentro de Educação e Saúde - CESUFCGCAMPOS, Magnólia de Araújo.CAMPOS, M. A.http://lattes.cnpq.br/0904596179326111CASTRO, Francisco José Victor de.LEITE, Renner de Souza.RODRIGUES, Adeilma Dantas.20132020-01-08T12:08:00Z2020-01-082020-01-08T12:08:00Zinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/bachelorThesishttp://dspace.sti.ufcg.edu.br:8080/jspui/handle/riufcg/10776RODRIGUES, Adeilma Dantas. Identificação e caracterização In silico da expressão de genes do tipo Miraculina em citros. 2013. 50 fl. (Trabalho de Conclusão de Curso – Monografia), Curso de Licenciatura em Ciências Biológicas, Centro de Educação e Saúde, Universidade Federal de Campina Grande, Cuité – Paraíba – Brasil, 2013.porinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFCGinstname:Universidade Federal de Campina Grande (UFCG)instacron:UFCG2022-06-23T12:05:28Zoai:localhost:riufcg/10776Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttp://bdtd.ufcg.edu.br/PUBhttp://dspace.sti.ufcg.edu.br:8080/oai/requestbdtd@setor.ufcg.edu.br || bdtd@setor.ufcg.edu.bropendoar:48512022-06-23T12:05:28Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFCG - Universidade Federal de Campina Grande (UFCG)false
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