Predição e caracterização de ilhas genômicas em bactérias do gênero Mycoplasmas, utilizando o método de clusterização Mean Shift.

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: LIMA, Yuri Vinícius Verissimo de.
Data de Publicação: 2015
Tipo de documento: Trabalho de conclusão de curso
Idioma: por
Título da fonte: Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFCG
Texto Completo: https://dx.doi.org/10.52446/cursoengbiotecnologiaCDSA.2015.tccmon.lima
http://dspace.sti.ufcg.edu.br:8080/jspui/handle/riufcg/5544
Resumo: Os custos de sequenciamento genético, nos últimos anos foram bastante reduzidos, induzindo um crescimento na quantidade de espécies de Mycoplasmas sequenciadas. A disponibilidade de inúmeros dados genômicos estruturais, trouxe consigo informações a serem exploradas, com destaque para as Ilhas Genômicas (IGs). As IGs são regiões do genoma de bactérias, que podem conter genes adquiridos por transferência horizontal de outros organismos, que pode conferir adaptações, como resistência a antibióticos e virulência. A detecção e caracterização destas regiões permitem que pesquisadores identifiquem os genes responsáveis pelas adaptações e desenvolvam novas vacinas e antibióticos. Existem atualmente, métodos para a detecção de IGs, mas requerem aperfeiçoamento. Neste trabalho se propõe um método alternativo para detecção de IGs em Mycoplasmas, utilizando o método de clusterização Mean Shift, e a caracterização das IGs, agrupando as proteínas por meio de uma Classificação Filogenética de Proteínas Codificadas em Genomas Completos (COGs).
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