Caracterização e funcionalização de aminoácidos em nanoestruturas 3d de carbono tipo Cx (X = 60 e 70).
Autor(a) principal: | |
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Data de Publicação: | 2023 |
Tipo de documento: | Trabalho de conclusão de curso |
Idioma: | por |
Título da fonte: | Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFCG |
Texto Completo: | http://dspace.sti.ufcg.edu.br:8080/jspui/handle/riufcg/33590 |
Resumo: | Os aminoácidos são as unidades estruturais fundamentais das proteínas e peptídeos, e são essenciais para o corpo humano. A funcionalização com aminoácidos aumenta a solubilidade de fulerenos em água e soluções aquosas, por isso, apresenta várias aplicações, especialmente as biológicas. Nesse sentido, este trabalho tem como objetivo caracterizar as moléculas de aminoácidos essenciais apolares (alanina, isoleucina, fenilalanina e valina) e sua funcionalização com fulerenos C50, C60 e C70, por meio de simulações computacionais baseadas na Dinâmica Molecular (com o UFF) e na DFT (com LDA-PWC e GGA-PBE). Primeiramente, realizou-se a análise estrutural individual de cada molécula de aminoácido, incluindo a determinação dos comprimentos de ligação, ângulos de ligação e torções. Além disso, observou-se as propriedades dos orbitais moleculares de fronteira, a densidade de estados e a capacidade de adsorção dos aminoácidos em relação ao fulereno. Isso foi realizado por meio do cálculo das energias potenciais de interação da distância entre os centroides, tanto em uma perspectiva quântica quanto clássica. Como resultado, o funcional GGA-PBE apresentou a menor energia para os quatro aminoácidos. Foi observada uma predominância dos orbitais HOMO no grupo amino e do orbital LUMO na carbonila e no anel fenil (para fenilalanina). A simulação com os fulerenos C60 e C70 junto as moléculas de aminoácidos foram bem-sucedidos, exceto com C50 pois ele é muito instável e as ligações foram quebradas no cálculo quântico. Assim, os resultados obtidos por meio das simulações foram satisfatórios e permitiram obter as propriedades dos aminoácidos estudados e da sua adsorção com fulerenos, visando o aumento da solubilidade dos fulerenos. |
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Caracterização e funcionalização de aminoácidos em nanoestruturas 3d de carbono tipo Cx (X = 60 e 70).Characterization and functionalization of amino acids in 3d nanostructures carbon type Cx (X = 60 and 70).Caracterización y funcionalización de aminoácidos en nanoestructuras 3d. carbono tipo Cx (X = 60 y 70).BioquímicaAminoácidosFulerenoMoléculas de aminoácidosNanoestrutura 3d - aminoácidosBiochemistryAmino acidsFullereneMolecules amino acids3d nanostructure - amino acidsFísicaOs aminoácidos são as unidades estruturais fundamentais das proteínas e peptídeos, e são essenciais para o corpo humano. A funcionalização com aminoácidos aumenta a solubilidade de fulerenos em água e soluções aquosas, por isso, apresenta várias aplicações, especialmente as biológicas. Nesse sentido, este trabalho tem como objetivo caracterizar as moléculas de aminoácidos essenciais apolares (alanina, isoleucina, fenilalanina e valina) e sua funcionalização com fulerenos C50, C60 e C70, por meio de simulações computacionais baseadas na Dinâmica Molecular (com o UFF) e na DFT (com LDA-PWC e GGA-PBE). Primeiramente, realizou-se a análise estrutural individual de cada molécula de aminoácido, incluindo a determinação dos comprimentos de ligação, ângulos de ligação e torções. Além disso, observou-se as propriedades dos orbitais moleculares de fronteira, a densidade de estados e a capacidade de adsorção dos aminoácidos em relação ao fulereno. Isso foi realizado por meio do cálculo das energias potenciais de interação da distância entre os centroides, tanto em uma perspectiva quântica quanto clássica. Como resultado, o funcional GGA-PBE apresentou a menor energia para os quatro aminoácidos. Foi observada uma predominância dos orbitais HOMO no grupo amino e do orbital LUMO na carbonila e no anel fenil (para fenilalanina). A simulação com os fulerenos C60 e C70 junto as moléculas de aminoácidos foram bem-sucedidos, exceto com C50 pois ele é muito instável e as ligações foram quebradas no cálculo quântico. Assim, os resultados obtidos por meio das simulações foram satisfatórios e permitiram obter as propriedades dos aminoácidos estudados e da sua adsorção com fulerenos, visando o aumento da solubilidade dos fulerenos.Amino acids are the fundamental structural units of proteins and peptides, and are essential for the human body. Functionalization with amino acids increases solubility of fullerenes in water and aqueous solutions, therefore, it has several applications, especially biological ones. In this sense, this work aims to characterize the nonpolar essential amino acid molecules (alanine, isoleucine, phenylalanine and valine) and its functionalization with fullerenes C50, C60 and C70, through computational simulations based on Molecular Dynamics (with UFF) and DFT (with LDA-PWC and GGA-PBE). Firstly, an individual structural analysis of each amino acid molecule was carried out, including determining bond lengths, bond angles and torsions. In addition Furthermore, the properties of the frontier molecular orbitals, the density of states and adsorption capacity of amino acids in relation to fullerene. That was carried out by calculating the potential interaction energies of the distance between the centroids, both from a quantum and classical perspective. As a result, the functional GGA-PBE presented the lowest energy for the four amino acids. It was observed a predominance of the HOMO orbitals in the amino group and the LUMO orbital in the carbonyl and phenyl ring (for phenylalanine). The simulation with the C60 and C70 fullerenes together with the amino acids were successful, except with C50 as it is very unstable and the bonds were broken down in quantum calculation. Thus, the results obtained through simulations were satisfactory and allowed us to obtain the properties of the studied amino acids and their adsorption with fullerenes, aiming to increase the solubility of fullerenes.Los aminoácidos son las unidades estructurales fundamentales de proteínas y péptidos, y son esencial para el cuerpo humano. La funcionalización con aminoácidos aumenta la solubilidad. de fullerenos en agua y soluciones acuosas, por lo tanto, tiene varias aplicaciones, especialmente los biológicos. En este sentido, este trabajo pretende caracterizar la moléculas de aminoácidos esenciales no polares (alanina, isoleucina, fenilalanina y valina) y su funcionalización con fullerenos C50, C60 y C70, mediante simulaciones computacionales basado en Dinámica Molecular (con UFF) y DFT (con LDA-PWC y GGA-PBE). En primer lugar, se llevó a cabo un análisis estructural individual de cada molécula de aminoácido, incluyendo la determinación de longitudes de enlace, ángulos de enlace y torsiones. Además Además, las propiedades de los orbitales moleculares de frontera, la densidad de Estados y capacidad de adsorción de los aminoácidos en relación al fullereno. Eso fue se lleva a cabo calculando las energías potenciales de interacción de la distancia entre los centroides, tanto desde una perspectiva cuántica como clásica. Como resultado, el funcional GGA-PBE presentó la energía más baja para los cuatro aminoácidos. Se observó un predominio de los orbitales HOMO en el grupo amino y del orbital LUMO en el grupo carbonilo y anillo de fenilo (para fenilalanina). La simulación con los fullerenos C60 y C70 junto con el Los aminoácidos tuvieron éxito, excepto con C50, ya que es muy inestable y los enlaces se desglosaron en el cálculo cuántico. Así, los resultados obtenidos mediante simulaciones fueron satisfactorios y nos permitieron obtener las propiedades de los aminoácidos estudiados y sus adsorción con fullerenos, con el objetivo de aumentar la solubilidad de los fullerenos.Universidade Federal de Campina GrandeBrasilCentro de Educação e Saúde - CESUFCGFRAZÃO, Nilton Ferreira.FRAZÃO, Nilton Ferreira;;FRAZÃO, N. Fhttp://lattes.cnpq.br/8166419576714173GOMES, Djardiel da Silva.GOMES, D. S.GOMES, DJARDIEL DA SILVA.DA SILVA, DJARDIEL GOMES.http://lattes.cnpq.br/5985409695793926DANTAS, Joseclécio Dutra.DANTAS, J. D.J. D. 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Os aminoácidos são as unidades estruturais fundamentais das proteínas e peptídeos, e são essenciais para o corpo humano. A funcionalização com aminoácidos aumenta a solubilidade de fulerenos em água e soluções aquosas, por isso, apresenta várias aplicações, especialmente as biológicas. Nesse sentido, este trabalho tem como objetivo caracterizar as moléculas de aminoácidos essenciais apolares (alanina, isoleucina, fenilalanina e valina) e sua funcionalização com fulerenos C50, C60 e C70, por meio de simulações computacionais baseadas na Dinâmica Molecular (com o UFF) e na DFT (com LDA-PWC e GGA-PBE). Primeiramente, realizou-se a análise estrutural individual de cada molécula de aminoácido, incluindo a determinação dos comprimentos de ligação, ângulos de ligação e torções. Além disso, observou-se as propriedades dos orbitais moleculares de fronteira, a densidade de estados e a capacidade de adsorção dos aminoácidos em relação ao fulereno. Isso foi realizado por meio do cálculo das energias potenciais de interação da distância entre os centroides, tanto em uma perspectiva quântica quanto clássica. Como resultado, o funcional GGA-PBE apresentou a menor energia para os quatro aminoácidos. Foi observada uma predominância dos orbitais HOMO no grupo amino e do orbital LUMO na carbonila e no anel fenil (para fenilalanina). A simulação com os fulerenos C60 e C70 junto as moléculas de aminoácidos foram bem-sucedidos, exceto com C50 pois ele é muito instável e as ligações foram quebradas no cálculo quântico. Assim, os resultados obtidos por meio das simulações foram satisfatórios e permitiram obter as propriedades dos aminoácidos estudados e da sua adsorção com fulerenos, visando o aumento da solubilidade dos fulerenos. |
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