Mapeamento quântico do monômero de insulina
Autor(a) principal: | |
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Data de Publicação: | 2016 |
Tipo de documento: | Trabalho de conclusão de curso |
Idioma: | por |
Título da fonte: | Repositório Digital da Universidade Federal Rural do Semi-Árido (RDU) |
Texto Completo: | https://repositorio.ufersa.edu.br/handle/prefix/11327 |
Resumo: | Para se conseguir combater a diabetes com maior eficiência é necessário conhecer cada vez mais a molécula da insulina, responsável direta pela regulação de açúcar no organismo humano. Este trabalho apresenta a construção do mapeamento quântico das energias de interações presentes na insulina que traz informações a nível atômico sobre tal estrutura. Através dele, é possível adquirir novos dados que sirvam de base para futuras pesquisas voltadas a insulina e a melhorias do seu uso no tratamento da diabetes. Dessa forma, a partir de uma estrutura do monômero de insulina humana escolhida nos bancos de dados experimentais contidos na literatura, foi aplicada uma adaptação da metodologia MFCC para o cálculo das interações entre todos os pares de resíduos presentes na proteína. O processo de fragmentação da molécula forneceu 4716 estruturas para o cálculo individual de energia que foi realizado com a utilização de DFT e do software Dmol3, implementado no ambiente computacional Materials Studio e considerando nas simulações o vácuo como sendo o meio em que a estrutura está inserida. Após tratamento e análise dos dados fornecidos pelas simulações dos resíduos no vácuo, construiu-se um mapa quântico das interações entre todos (exceto os primeiros vizinhos) os pares de resíduos do monômero de insulina, o que permitiu identificar quais resíduos eram os principais responsáveis pela manutenção da estrutura como um todo. |
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Mapeamento quântico do monômero de insulinaCIENCIAS EXATAS E DA TERRA::CIENCIA E TECNOLOGIADiabetesInsulinaDFTMFCCSimulaçãoPara se conseguir combater a diabetes com maior eficiência é necessário conhecer cada vez mais a molécula da insulina, responsável direta pela regulação de açúcar no organismo humano. Este trabalho apresenta a construção do mapeamento quântico das energias de interações presentes na insulina que traz informações a nível atômico sobre tal estrutura. Através dele, é possível adquirir novos dados que sirvam de base para futuras pesquisas voltadas a insulina e a melhorias do seu uso no tratamento da diabetes. Dessa forma, a partir de uma estrutura do monômero de insulina humana escolhida nos bancos de dados experimentais contidos na literatura, foi aplicada uma adaptação da metodologia MFCC para o cálculo das interações entre todos os pares de resíduos presentes na proteína. O processo de fragmentação da molécula forneceu 4716 estruturas para o cálculo individual de energia que foi realizado com a utilização de DFT e do software Dmol3, implementado no ambiente computacional Materials Studio e considerando nas simulações o vácuo como sendo o meio em que a estrutura está inserida. Após tratamento e análise dos dados fornecidos pelas simulações dos resíduos no vácuo, construiu-se um mapa quântico das interações entre todos (exceto os primeiros vizinhos) os pares de resíduos do monômero de insulina, o que permitiu identificar quais resíduos eram os principais responsáveis pela manutenção da estrutura como um todo.To combat the diabetes with greater efficiency it is necessary to know ever more the molecule of insulin, directly responsible for adjustment of sugar in the human body. This work presents the construction of quantum mapping energies of interactions present in insulin that brings information the atomic level on this structure. Through it, it is possible to acquire new data that serve as the basis for future research directed insulin and improvements of their use in the treatment of diabetes. In this way, from a structure of the monomer of human insulin chosen in the banks of experimental data contained in the literature, was applied an adaptation of the methodology for the calculation of the lending envelope interactions between all pairs of residues present in protein. The process of fragmentation of the molecule has provided 4716 structures for the individual calculation of energy that was carried out with the use of DFT and software Dmol3, implemented in computational environment Materials Studio and whereas in the simulations the vacuum as being the environment in which the structure is inserted. After treatment and analysis of data provided by the simulations of the waste in vacuum, built a quantum map of interactions between all (except the first neighbors) pairs of residues of monomer of insulin allowing identify which wastes are the main responsible for the maintenance of the structure as a whole.54 f.Centro Multidisciplinar de Caraúbas - CMCBrasilUFERSAUniversidade Federal Rural Semi-ÁridoSilva, José Júnior AlvesCosta, Roner FerreiraSilva, José Júnior Alves daCosta, Roner Ferreira daMaia Júnior, Francisco FrancinéLopes, Luann Marcos Gondim2024-08-15T22:18:44Z2024-08-15T22:18:44Z2016-05-20info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/bachelorThesispdfapplication/pdfLOPES, Luann Marcos Gondim. Mapeamento quântico do monômero de insulina. 2016. 54 f. TCC (Graduação) - Curso de Bacharelado em Ciência e Tecnologia, Universidade Federal Rural do Semi-Árido, Caraúbas, 2016.https://repositorio.ufersa.edu.br/handle/prefix/11327CaraúbasAttribution-ShareAlike 3.0 BrazilUFERSAhttp://creativecommons.org/licenses/by-sa/3.0/br/info:eu-repo/semantics/openAccessporreponame:Repositório Digital da Universidade Federal Rural do Semi-Árido (RDU)instname:Universidade Federal Rural do Semi-Árido (UFERSA)instacron:UFERSA2024-08-16T21:41:19Zoai:repositorio.ufersa.edu.br:prefix/11327Repositório Institucionalhttps://repositorio.ufersa.edu.br/PUBhttps://repositorio.ufersa.edu.br/server/oai/requestrepositorio@ufersa.edu.br || admrepositorio@ufersa.edu.bropendoar:2024-08-16T21:41:19Repositório Digital da Universidade Federal Rural do Semi-Árido (RDU) - Universidade Federal Rural do Semi-Árido (UFERSA)false |
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Para se conseguir combater a diabetes com maior eficiência é necessário conhecer cada vez mais a molécula da insulina, responsável direta pela regulação de açúcar no organismo humano. Este trabalho apresenta a construção do mapeamento quântico das energias de interações presentes na insulina que traz informações a nível atômico sobre tal estrutura. Através dele, é possível adquirir novos dados que sirvam de base para futuras pesquisas voltadas a insulina e a melhorias do seu uso no tratamento da diabetes. Dessa forma, a partir de uma estrutura do monômero de insulina humana escolhida nos bancos de dados experimentais contidos na literatura, foi aplicada uma adaptação da metodologia MFCC para o cálculo das interações entre todos os pares de resíduos presentes na proteína. O processo de fragmentação da molécula forneceu 4716 estruturas para o cálculo individual de energia que foi realizado com a utilização de DFT e do software Dmol3, implementado no ambiente computacional Materials Studio e considerando nas simulações o vácuo como sendo o meio em que a estrutura está inserida. Após tratamento e análise dos dados fornecidos pelas simulações dos resíduos no vácuo, construiu-se um mapa quântico das interações entre todos (exceto os primeiros vizinhos) os pares de resíduos do monômero de insulina, o que permitiu identificar quais resíduos eram os principais responsáveis pela manutenção da estrutura como um todo. |
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