Caracterização de germoplasma, herança e identificação de marcadores SNP associados à resistência a Podosphaera xanthii em meloeiro
Autor(a) principal: | |
---|---|
Data de Publicação: | 2014 |
Tipo de documento: | Tese |
Idioma: | por |
Título da fonte: | Repositório Digital da Universidade Federal Rural do Semi-Árido (RDU) |
Texto Completo: | https://repositorio.ufersa.edu.br/handle/tede/177 |
Resumo: | Powdery mildew, caused by Podosphaera xanthii, is the most important foliar disease of cucurbits in the Northeast Brazil. Breeding for resistance is one of the best ways to control this pathogen. The objectives aims these work were to characterize morphologically and by microsatellites markers resistant accessions of melon, to study the inheritance and to identify SNP markers associated to resistance in the accessions AM55-1A and C-AC-15. Fifty-six melon plant accessions with different geographical origins were evaluated for resistance to P. xanthii using artificial inoculation procedure under greenhouse conditions. The resistant accessions C-AC-02, C-AC-09, C-AC-15, C-AC-34 and AM55-1A were characterized with morphological traits and microsatellites markers. The accessions C-AC-02, C-AC-09, C-AC-15, C-AC-34 exhibited characteristics of momordica botanical variety while the accession AM55-1A exhibited characteristics of acidulus botanical variety. The molecular characterization confirmed he results observed in morphological characterization. The inheritance of resistance in AM55-1A and C-AC-15 in crosses with susceptible cultivar Véndrantais was studied under greenhouses conditions. The segregations ratios for resistance/susceptibility observed in the different populations (F1, F2, BC1 and BC2) indicated a monogenic and dominant inheritance in AM55-1A and two independent genes with epispastic interaction double recessive control resistance in C-AC-15. The backcross population (BC1) derived from AM55-1A x Véndrantais and F2 population from C-AC-15 x Véndrantais were utilized to identify QTLs associated to resistance to P. xanthii using bulked segregation analysis with 243 SNP molecular markers. Two QTLs (Pm-AM55-1A_1 and Pm-A55-1A_2) were identified on ligation group V from AM55-1A x Véndrantais . One QTL (Pm-C-AC-15_5) on ligation group V and other (Pm-C-AC-15_9) on ligation group IX |
id |
UFER_e17195e58a4f8c22b28b6362d386ae71 |
---|---|
oai_identifier_str |
oai:repositorio.ufersa.edu.br:tede/177 |
network_acronym_str |
UFER |
network_name_str |
Repositório Digital da Universidade Federal Rural do Semi-Árido (RDU) |
repository_id_str |
|
spelling |
Caracterização de germoplasma, herança e identificação de marcadores SNP associados à resistência a Podosphaera xanthii em meloeiroGermplasm characterization, inheritance and identification of SNP markers associated with resistance to Podosphaera xanthii in melonGeneticsCucumis melo LPowdery mildewQTLGenéticaCucumis melo LOídioQTLCIENCIAS AGRARIAS::AGRONOMIA::FITOTECNIAPowdery mildew, caused by Podosphaera xanthii, is the most important foliar disease of cucurbits in the Northeast Brazil. Breeding for resistance is one of the best ways to control this pathogen. The objectives aims these work were to characterize morphologically and by microsatellites markers resistant accessions of melon, to study the inheritance and to identify SNP markers associated to resistance in the accessions AM55-1A and C-AC-15. Fifty-six melon plant accessions with different geographical origins were evaluated for resistance to P. xanthii using artificial inoculation procedure under greenhouse conditions. The resistant accessions C-AC-02, C-AC-09, C-AC-15, C-AC-34 and AM55-1A were characterized with morphological traits and microsatellites markers. The accessions C-AC-02, C-AC-09, C-AC-15, C-AC-34 exhibited characteristics of momordica botanical variety while the accession AM55-1A exhibited characteristics of acidulus botanical variety. The molecular characterization confirmed he results observed in morphological characterization. The inheritance of resistance in AM55-1A and C-AC-15 in crosses with susceptible cultivar Véndrantais was studied under greenhouses conditions. The segregations ratios for resistance/susceptibility observed in the different populations (F1, F2, BC1 and BC2) indicated a monogenic and dominant inheritance in AM55-1A and two independent genes with epispastic interaction double recessive control resistance in C-AC-15. The backcross population (BC1) derived from AM55-1A x Véndrantais and F2 population from C-AC-15 x Véndrantais were utilized to identify QTLs associated to resistance to P. xanthii using bulked segregation analysis with 243 SNP molecular markers. Two QTLs (Pm-AM55-1A_1 and Pm-A55-1A_2) were identified on ligation group V from AM55-1A x Véndrantais . One QTL (Pm-C-AC-15_5) on ligation group V and other (Pm-C-AC-15_9) on ligation group IXO oídio causado por Podosphaera xanthii, é a doença foliar mais importante das cucurbitáceas no Nordeste do Brasil. O melhoramento genético para resistência é uma das melhores maneiras de controlar esse patógeno. Os objetivos deste trabalho foram caracterizar morfologicamente e por marcadores microssatélites acessos resistentes de melão, estudar a herança e identificar marcadores SNP associados à resistência nos acessos AM55-1A e C-AC-15. Cinqüenta e seis acessos de meloeiro com diferentes origens geográficas foram avaliados para a resistência a P. xanthii usando inoculação artificial em casa de vegetação. Os acessos resistentes C-AC-02, C-AC-09, C-AC-15, C-AC-34 e AM55-1A posteriormente foram caracterizados utilizando descritores morfológicos e marcadores microssatélites. Os acessos C-AC-02 , C-AC-09, C-AC-15, C-AC-34 exibiram características da variedade botanica momordica, enquanto o acesso AM55-1A exibiu características da variedade botânica acidulus. A caracterização molecular confirmou os resultados observados na caracterização morfológica. A herança da resistência em AM55-1A e C-AC-15 em cruzamentos com a cultivar suscetível Véndrantais foi estudada em condições de casa de vegetação. As razões de segregação resistência/suscetibilidade observadas nas diferentes populações (F1, F2, RC1 e RC2) indicou herança monogênica e dominante em AM55-1A e dois genes independentes com interação epistática duplo recessiva no controle genético em C-AC-15. A população de retrocruzamento (RC1) derivado do cruzamento AM55 -1A x Véndrantais e a população F2 do cruzamento C-AC-15 x Véndrantais foram utilizados para identificar QTLs associados à resistência a P. xanthii usando análise de bulk segregante com 243 marcadores SNP. Dois QTLs (Pm-AM55-A_1 e Pm-A55-1A_2) foram identificados no grupo de ligação V no cruzamento AM55-1A x Véndrantais . Foram identificados um QTL (Pm-C-AC-15_5) no grupo de ligação V e outro (Pm-C-AC-15_9) no grupo de ligação IXCoordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível SuperiorUniversidade Federal Rural do Semi-ÁridoBRCentro de Ciências Agrárias - CCAUFERSAPrograma de Pós-Graduação em FitotecniaNunes, Glauber Henrique de SousaCPF:82888884453http://lattes.cnpq.br/6199153570472953Souza, Jean de OliveiraCPF:02426542403http://lattes.cnpq.br/9323075494898663Aragão, Fernando Antônio Souza deCPF:37135708334http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4705765A2Antonio, Rafaela PriscilaCPF:01172281416http://lattes.cnpq.br/4570230133800020Ferreira, Hailson AlvesCPF:00924150408http://lattes.cnpq.br/3906466772985598Nunes, Elaíne Welk Lopes Pereira2016-08-12T19:18:32Z2016-02-182014-04-04info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesisapplication/pdfapplication/pdfNUNES, Elaíne Welk Lopes Pereira. Germplasm characterization, inheritance and identification of SNP markers associated with resistance to Podosphaera xanthii in melon. 2014. 124 f. Tese (Doutorado em Agricultura Tropical) - Universidade Federal Rural do Semi-Árido, Mossoró, 2014.https://repositorio.ufersa.edu.br/handle/tede/177porCC-BY-SAinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Digital da Universidade Federal Rural do Semi-Árido (RDU)instname:Universidade Federal Rural do Semi-Árido (UFERSA)instacron:UFERSA2023-12-12T22:51:52Zoai:repositorio.ufersa.edu.br:tede/177Repositório Institucionalhttps://repositorio.ufersa.edu.br/PUBhttps://repositorio.ufersa.edu.br/server/oai/requestrepositorio@ufersa.edu.br || admrepositorio@ufersa.edu.bropendoar:2023-12-12T22:51:52Repositório Digital da Universidade Federal Rural do Semi-Árido (RDU) - Universidade Federal Rural do Semi-Árido (UFERSA)false |
dc.title.none.fl_str_mv |
Caracterização de germoplasma, herança e identificação de marcadores SNP associados à resistência a Podosphaera xanthii em meloeiro Germplasm characterization, inheritance and identification of SNP markers associated with resistance to Podosphaera xanthii in melon |
title |
Caracterização de germoplasma, herança e identificação de marcadores SNP associados à resistência a Podosphaera xanthii em meloeiro |
spellingShingle |
Caracterização de germoplasma, herança e identificação de marcadores SNP associados à resistência a Podosphaera xanthii em meloeiro Nunes, Elaíne Welk Lopes Pereira Genetics Cucumis melo L Powdery mildew QTL Genética Cucumis melo L Oídio QTL CIENCIAS AGRARIAS::AGRONOMIA::FITOTECNIA |
title_short |
Caracterização de germoplasma, herança e identificação de marcadores SNP associados à resistência a Podosphaera xanthii em meloeiro |
title_full |
Caracterização de germoplasma, herança e identificação de marcadores SNP associados à resistência a Podosphaera xanthii em meloeiro |
title_fullStr |
Caracterização de germoplasma, herança e identificação de marcadores SNP associados à resistência a Podosphaera xanthii em meloeiro |
title_full_unstemmed |
Caracterização de germoplasma, herança e identificação de marcadores SNP associados à resistência a Podosphaera xanthii em meloeiro |
title_sort |
Caracterização de germoplasma, herança e identificação de marcadores SNP associados à resistência a Podosphaera xanthii em meloeiro |
author |
Nunes, Elaíne Welk Lopes Pereira |
author_facet |
Nunes, Elaíne Welk Lopes Pereira |
author_role |
author |
dc.contributor.none.fl_str_mv |
Nunes, Glauber Henrique de Sousa CPF:82888884453 http://lattes.cnpq.br/6199153570472953 Souza, Jean de Oliveira CPF:02426542403 http://lattes.cnpq.br/9323075494898663 Aragão, Fernando Antônio Souza de CPF:37135708334 http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4705765A2 Antonio, Rafaela Priscila CPF:01172281416 http://lattes.cnpq.br/4570230133800020 Ferreira, Hailson Alves CPF:00924150408 http://lattes.cnpq.br/3906466772985598 |
dc.contributor.author.fl_str_mv |
Nunes, Elaíne Welk Lopes Pereira |
dc.subject.por.fl_str_mv |
Genetics Cucumis melo L Powdery mildew QTL Genética Cucumis melo L Oídio QTL CIENCIAS AGRARIAS::AGRONOMIA::FITOTECNIA |
topic |
Genetics Cucumis melo L Powdery mildew QTL Genética Cucumis melo L Oídio QTL CIENCIAS AGRARIAS::AGRONOMIA::FITOTECNIA |
description |
Powdery mildew, caused by Podosphaera xanthii, is the most important foliar disease of cucurbits in the Northeast Brazil. Breeding for resistance is one of the best ways to control this pathogen. The objectives aims these work were to characterize morphologically and by microsatellites markers resistant accessions of melon, to study the inheritance and to identify SNP markers associated to resistance in the accessions AM55-1A and C-AC-15. Fifty-six melon plant accessions with different geographical origins were evaluated for resistance to P. xanthii using artificial inoculation procedure under greenhouse conditions. The resistant accessions C-AC-02, C-AC-09, C-AC-15, C-AC-34 and AM55-1A were characterized with morphological traits and microsatellites markers. The accessions C-AC-02, C-AC-09, C-AC-15, C-AC-34 exhibited characteristics of momordica botanical variety while the accession AM55-1A exhibited characteristics of acidulus botanical variety. The molecular characterization confirmed he results observed in morphological characterization. The inheritance of resistance in AM55-1A and C-AC-15 in crosses with susceptible cultivar Véndrantais was studied under greenhouses conditions. The segregations ratios for resistance/susceptibility observed in the different populations (F1, F2, BC1 and BC2) indicated a monogenic and dominant inheritance in AM55-1A and two independent genes with epispastic interaction double recessive control resistance in C-AC-15. The backcross population (BC1) derived from AM55-1A x Véndrantais and F2 population from C-AC-15 x Véndrantais were utilized to identify QTLs associated to resistance to P. xanthii using bulked segregation analysis with 243 SNP molecular markers. Two QTLs (Pm-AM55-1A_1 and Pm-A55-1A_2) were identified on ligation group V from AM55-1A x Véndrantais . One QTL (Pm-C-AC-15_5) on ligation group V and other (Pm-C-AC-15_9) on ligation group IX |
publishDate |
2014 |
dc.date.none.fl_str_mv |
2014-04-04 2016-08-12T19:18:32Z 2016-02-18 |
dc.type.status.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/publishedVersion |
dc.type.driver.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/doctoralThesis |
format |
doctoralThesis |
status_str |
publishedVersion |
dc.identifier.uri.fl_str_mv |
NUNES, Elaíne Welk Lopes Pereira. Germplasm characterization, inheritance and identification of SNP markers associated with resistance to Podosphaera xanthii in melon. 2014. 124 f. Tese (Doutorado em Agricultura Tropical) - Universidade Federal Rural do Semi-Árido, Mossoró, 2014. https://repositorio.ufersa.edu.br/handle/tede/177 |
identifier_str_mv |
NUNES, Elaíne Welk Lopes Pereira. Germplasm characterization, inheritance and identification of SNP markers associated with resistance to Podosphaera xanthii in melon. 2014. 124 f. Tese (Doutorado em Agricultura Tropical) - Universidade Federal Rural do Semi-Árido, Mossoró, 2014. |
url |
https://repositorio.ufersa.edu.br/handle/tede/177 |
dc.language.iso.fl_str_mv |
por |
language |
por |
dc.rights.driver.fl_str_mv |
CC-BY-SA info:eu-repo/semantics/openAccess |
rights_invalid_str_mv |
CC-BY-SA |
eu_rights_str_mv |
openAccess |
dc.format.none.fl_str_mv |
application/pdf application/pdf |
dc.publisher.none.fl_str_mv |
Universidade Federal Rural do Semi-Árido BR Centro de Ciências Agrárias - CCA UFERSA Programa de Pós-Graduação em Fitotecnia |
publisher.none.fl_str_mv |
Universidade Federal Rural do Semi-Árido BR Centro de Ciências Agrárias - CCA UFERSA Programa de Pós-Graduação em Fitotecnia |
dc.source.none.fl_str_mv |
reponame:Repositório Digital da Universidade Federal Rural do Semi-Árido (RDU) instname:Universidade Federal Rural do Semi-Árido (UFERSA) instacron:UFERSA |
instname_str |
Universidade Federal Rural do Semi-Árido (UFERSA) |
instacron_str |
UFERSA |
institution |
UFERSA |
reponame_str |
Repositório Digital da Universidade Federal Rural do Semi-Árido (RDU) |
collection |
Repositório Digital da Universidade Federal Rural do Semi-Árido (RDU) |
repository.name.fl_str_mv |
Repositório Digital da Universidade Federal Rural do Semi-Árido (RDU) - Universidade Federal Rural do Semi-Árido (UFERSA) |
repository.mail.fl_str_mv |
repositorio@ufersa.edu.br || admrepositorio@ufersa.edu.br |
_version_ |
1809747447248846848 |