Caracterização de germoplasma, herança e identificação de marcadores SNP associados à resistência a Podosphaera xanthii em meloeiro

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Nunes, Elaíne Welk Lopes Pereira
Data de Publicação: 2014
Tipo de documento: Tese
Idioma: por
Título da fonte: Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFERSA
Texto Completo: https://repositorio.ufersa.edu.br/handle/tede/177
Resumo: Powdery mildew, caused by Podosphaera xanthii, is the most important foliar disease of cucurbits in the Northeast Brazil. Breeding for resistance is one of the best ways to control this pathogen. The objectives aims these work were to characterize morphologically and by microsatellites markers resistant accessions of melon, to study the inheritance and to identify SNP markers associated to resistance in the accessions AM55-1A and C-AC-15. Fifty-six melon plant accessions with different geographical origins were evaluated for resistance to P. xanthii using artificial inoculation procedure under greenhouse conditions. The resistant accessions C-AC-02, C-AC-09, C-AC-15, C-AC-34 and AM55-1A were characterized with morphological traits and microsatellites markers. The accessions C-AC-02, C-AC-09, C-AC-15, C-AC-34 exhibited characteristics of momordica botanical variety while the accession AM55-1A exhibited characteristics of acidulus botanical variety. The molecular characterization confirmed he results observed in morphological characterization. The inheritance of resistance in AM55-1A and C-AC-15 in crosses with susceptible cultivar Véndrantais was studied under greenhouses conditions. The segregations ratios for resistance/susceptibility observed in the different populations (F1, F2, BC1 and BC2) indicated a monogenic and dominant inheritance in AM55-1A and two independent genes with epispastic interaction double recessive control resistance in C-AC-15. The backcross population (BC1) derived from AM55-1A x Véndrantais and F2 population from C-AC-15 x Véndrantais were utilized to identify QTLs associated to resistance to P. xanthii using bulked segregation analysis with 243 SNP molecular markers. Two QTLs (Pm-AM55-1A_1 and Pm-A55-1A_2) were identified on ligation group V from AM55-1A x Véndrantais . One QTL (Pm-C-AC-15_5) on ligation group V and other (Pm-C-AC-15_9) on ligation group IX
id UFER_e17195e58a4f8c22b28b6362d386ae71
oai_identifier_str oai:repositorio.ufersa.edu.br:tede/177
network_acronym_str UFER
network_name_str Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFERSA
repository_id_str
spelling Nunes, Glauber Henrique de Sousahttp://lattes.cnpq.br/6199153570472953Souza, Jean de Oliveirahttp://lattes.cnpq.br/9323075494898663Aragão, Fernando Antônio Souza dehttp://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4705765A2Antonio, Rafaela Priscilahttp://lattes.cnpq.br/4570230133800020Ferreira, Hailson Alveshttp://lattes.cnpq.br/3906466772985598http://lattes.cnpq.br/4303449162504469Nunes, Elaíne Welk Lopes Pereira2016-08-12T19:18:32Z2016-02-182014-04-04NUNES, Elaíne Welk Lopes Pereira. Germplasm characterization, inheritance and identification of SNP markers associated with resistance to Podosphaera xanthii in melon. 2014. 124 f. Tese (Doutorado em Agricultura Tropical) - Universidade Federal Rural do Semi-Árido, Mossoró, 2014.https://repositorio.ufersa.edu.br/handle/tede/177Powdery mildew, caused by Podosphaera xanthii, is the most important foliar disease of cucurbits in the Northeast Brazil. Breeding for resistance is one of the best ways to control this pathogen. The objectives aims these work were to characterize morphologically and by microsatellites markers resistant accessions of melon, to study the inheritance and to identify SNP markers associated to resistance in the accessions AM55-1A and C-AC-15. Fifty-six melon plant accessions with different geographical origins were evaluated for resistance to P. xanthii using artificial inoculation procedure under greenhouse conditions. The resistant accessions C-AC-02, C-AC-09, C-AC-15, C-AC-34 and AM55-1A were characterized with morphological traits and microsatellites markers. The accessions C-AC-02, C-AC-09, C-AC-15, C-AC-34 exhibited characteristics of momordica botanical variety while the accession AM55-1A exhibited characteristics of acidulus botanical variety. The molecular characterization confirmed he results observed in morphological characterization. The inheritance of resistance in AM55-1A and C-AC-15 in crosses with susceptible cultivar Véndrantais was studied under greenhouses conditions. The segregations ratios for resistance/susceptibility observed in the different populations (F1, F2, BC1 and BC2) indicated a monogenic and dominant inheritance in AM55-1A and two independent genes with epispastic interaction double recessive control resistance in C-AC-15. The backcross population (BC1) derived from AM55-1A x Véndrantais and F2 population from C-AC-15 x Véndrantais were utilized to identify QTLs associated to resistance to P. xanthii using bulked segregation analysis with 243 SNP molecular markers. Two QTLs (Pm-AM55-1A_1 and Pm-A55-1A_2) were identified on ligation group V from AM55-1A x Véndrantais . One QTL (Pm-C-AC-15_5) on ligation group V and other (Pm-C-AC-15_9) on ligation group IXO oídio causado por Podosphaera xanthii, é a doença foliar mais importante das cucurbitáceas no Nordeste do Brasil. O melhoramento genético para resistência é uma das melhores maneiras de controlar esse patógeno. Os objetivos deste trabalho foram caracterizar morfologicamente e por marcadores microssatélites acessos resistentes de melão, estudar a herança e identificar marcadores SNP associados à resistência nos acessos AM55-1A e C-AC-15. Cinqüenta e seis acessos de meloeiro com diferentes origens geográficas foram avaliados para a resistência a P. xanthii usando inoculação artificial em casa de vegetação. Os acessos resistentes C-AC-02, C-AC-09, C-AC-15, C-AC-34 e AM55-1A posteriormente foram caracterizados utilizando descritores morfológicos e marcadores microssatélites. Os acessos C-AC-02 , C-AC-09, C-AC-15, C-AC-34 exibiram características da variedade botanica momordica, enquanto o acesso AM55-1A exibiu características da variedade botânica acidulus. A caracterização molecular confirmou os resultados observados na caracterização morfológica. A herança da resistência em AM55-1A e C-AC-15 em cruzamentos com a cultivar suscetível Véndrantais foi estudada em condições de casa de vegetação. As razões de segregação resistência/suscetibilidade observadas nas diferentes populações (F1, F2, RC1 e RC2) indicou herança monogênica e dominante em AM55-1A e dois genes independentes com interação epistática duplo recessiva no controle genético em C-AC-15. A população de retrocruzamento (RC1) derivado do cruzamento AM55 -1A x Véndrantais e a população F2 do cruzamento C-AC-15 x Véndrantais foram utilizados para identificar QTLs associados à resistência a P. xanthii usando análise de bulk segregante com 243 marcadores SNP. Dois QTLs (Pm-AM55-A_1 e Pm-A55-1A_2) foram identificados no grupo de ligação V no cruzamento AM55-1A x Véndrantais . Foram identificados um QTL (Pm-C-AC-15_5) no grupo de ligação V e outro (Pm-C-AC-15_9) no grupo de ligação IXCoordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superiorapplication/pdfhttp://repositorio.ufersa.edu.br/retrieve/533/ElaineWLPN_TESE.pdf.jpgporUniversidade Federal Rural do Semi-ÁridoPrograma de Pós-Graduação em FitotecniaUFERSABRCentro de Ciências Agrárias - CCACC-BY-SAinfo:eu-repo/semantics/openAccessGeneticsCucumis melo LPowdery mildewQTLGenéticaCucumis melo LOídioQTLCNPQ::CIENCIAS AGRARIAS::AGRONOMIACaracterização de germoplasma, herança e identificação de marcadores SNP associados à resistência a Podosphaera xanthii em meloeiroGermplasm characterization, inheritance and identification of SNP markers associated with resistance to Podosphaera xanthii in meloninfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesisreponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFERSAinstname:Universidade Federal Rural do Semi-Árido (UFERSA)instacron:UFERSATEXTElaineWLPN_TESE.pdf.txtElaineWLPN_TESE.pdf.txtExtracted texttext/plain189075https://repositorio.ufersa.edu.br//bitstream/tede/177/3/ElaineWLPN_TESE.pdf.txtbeb34efb35275feb2887ef77b9f18e71MD53ORIGINALElaineWLPN_TESE.pdfapplication/pdf787916https://repositorio.ufersa.edu.br//bitstream/tede/177/1/ElaineWLPN_TESE.pdf2087efc39ac35d1b19fedd7e4362e6bfMD51THUMBNAILElaineWLPN_TESE.pdf.jpgElaineWLPN_TESE.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg2804https://repositorio.ufersa.edu.br//bitstream/tede/177/2/ElaineWLPN_TESE.pdf.jpg3fd96c9e936ee62201883519d1caf17bMD52tede/1772022-07-05 17:01:48.258oai:repositorio.ufersa.edu.br:tede/177Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttps://repositorio.ufersa.edu.br/PUBhttp://bdtd.ufersa.edu.br/oai/requestdirecaosisbi@ufersa.edu.br|| direcaosisbi@ufersa.edu.bropendoar:2022-07-05T20:01:48Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFERSA - Universidade Federal Rural do Semi-Árido (UFERSA)false
dc.title.por.fl_str_mv Caracterização de germoplasma, herança e identificação de marcadores SNP associados à resistência a Podosphaera xanthii em meloeiro
dc.title.alternative.eng.fl_str_mv Germplasm characterization, inheritance and identification of SNP markers associated with resistance to Podosphaera xanthii in melon
title Caracterização de germoplasma, herança e identificação de marcadores SNP associados à resistência a Podosphaera xanthii em meloeiro
spellingShingle Caracterização de germoplasma, herança e identificação de marcadores SNP associados à resistência a Podosphaera xanthii em meloeiro
Nunes, Elaíne Welk Lopes Pereira
Genetics
Cucumis melo L
Powdery mildew
QTL
Genética
Cucumis melo L
Oídio
QTL
CNPQ::CIENCIAS AGRARIAS::AGRONOMIA
title_short Caracterização de germoplasma, herança e identificação de marcadores SNP associados à resistência a Podosphaera xanthii em meloeiro
title_full Caracterização de germoplasma, herança e identificação de marcadores SNP associados à resistência a Podosphaera xanthii em meloeiro
title_fullStr Caracterização de germoplasma, herança e identificação de marcadores SNP associados à resistência a Podosphaera xanthii em meloeiro
title_full_unstemmed Caracterização de germoplasma, herança e identificação de marcadores SNP associados à resistência a Podosphaera xanthii em meloeiro
title_sort Caracterização de germoplasma, herança e identificação de marcadores SNP associados à resistência a Podosphaera xanthii em meloeiro
author Nunes, Elaíne Welk Lopes Pereira
author_facet Nunes, Elaíne Welk Lopes Pereira
author_role author
dc.contributor.advisor1.fl_str_mv Nunes, Glauber Henrique de Sousa
dc.contributor.advisor1Lattes.fl_str_mv http://lattes.cnpq.br/6199153570472953
dc.contributor.referee1.fl_str_mv Souza, Jean de Oliveira
dc.contributor.referee1Lattes.fl_str_mv http://lattes.cnpq.br/9323075494898663
dc.contributor.referee2.fl_str_mv Aragão, Fernando Antônio Souza de
dc.contributor.referee2Lattes.fl_str_mv http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4705765A2
dc.contributor.referee3.fl_str_mv Antonio, Rafaela Priscila
dc.contributor.referee3Lattes.fl_str_mv http://lattes.cnpq.br/4570230133800020
dc.contributor.referee4.fl_str_mv Ferreira, Hailson Alves
dc.contributor.referee4Lattes.fl_str_mv http://lattes.cnpq.br/3906466772985598
dc.contributor.authorLattes.fl_str_mv http://lattes.cnpq.br/4303449162504469
dc.contributor.author.fl_str_mv Nunes, Elaíne Welk Lopes Pereira
contributor_str_mv Nunes, Glauber Henrique de Sousa
Souza, Jean de Oliveira
Aragão, Fernando Antônio Souza de
Antonio, Rafaela Priscila
Ferreira, Hailson Alves
dc.subject.eng.fl_str_mv Genetics
Cucumis melo L
Powdery mildew
QTL
topic Genetics
Cucumis melo L
Powdery mildew
QTL
Genética
Cucumis melo L
Oídio
QTL
CNPQ::CIENCIAS AGRARIAS::AGRONOMIA
dc.subject.por.fl_str_mv Genética
Cucumis melo L
Oídio
QTL
dc.subject.cnpq.fl_str_mv CNPQ::CIENCIAS AGRARIAS::AGRONOMIA
description Powdery mildew, caused by Podosphaera xanthii, is the most important foliar disease of cucurbits in the Northeast Brazil. Breeding for resistance is one of the best ways to control this pathogen. The objectives aims these work were to characterize morphologically and by microsatellites markers resistant accessions of melon, to study the inheritance and to identify SNP markers associated to resistance in the accessions AM55-1A and C-AC-15. Fifty-six melon plant accessions with different geographical origins were evaluated for resistance to P. xanthii using artificial inoculation procedure under greenhouse conditions. The resistant accessions C-AC-02, C-AC-09, C-AC-15, C-AC-34 and AM55-1A were characterized with morphological traits and microsatellites markers. The accessions C-AC-02, C-AC-09, C-AC-15, C-AC-34 exhibited characteristics of momordica botanical variety while the accession AM55-1A exhibited characteristics of acidulus botanical variety. The molecular characterization confirmed he results observed in morphological characterization. The inheritance of resistance in AM55-1A and C-AC-15 in crosses with susceptible cultivar Véndrantais was studied under greenhouses conditions. The segregations ratios for resistance/susceptibility observed in the different populations (F1, F2, BC1 and BC2) indicated a monogenic and dominant inheritance in AM55-1A and two independent genes with epispastic interaction double recessive control resistance in C-AC-15. The backcross population (BC1) derived from AM55-1A x Véndrantais and F2 population from C-AC-15 x Véndrantais were utilized to identify QTLs associated to resistance to P. xanthii using bulked segregation analysis with 243 SNP molecular markers. Two QTLs (Pm-AM55-1A_1 and Pm-A55-1A_2) were identified on ligation group V from AM55-1A x Véndrantais . One QTL (Pm-C-AC-15_5) on ligation group V and other (Pm-C-AC-15_9) on ligation group IX
publishDate 2014
dc.date.issued.fl_str_mv 2014-04-04
dc.date.accessioned.fl_str_mv 2016-08-12T19:18:32Z
dc.date.available.fl_str_mv 2016-02-18
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/doctoralThesis
format doctoralThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.citation.fl_str_mv NUNES, Elaíne Welk Lopes Pereira. Germplasm characterization, inheritance and identification of SNP markers associated with resistance to Podosphaera xanthii in melon. 2014. 124 f. Tese (Doutorado em Agricultura Tropical) - Universidade Federal Rural do Semi-Árido, Mossoró, 2014.
dc.identifier.uri.fl_str_mv https://repositorio.ufersa.edu.br/handle/tede/177
identifier_str_mv NUNES, Elaíne Welk Lopes Pereira. Germplasm characterization, inheritance and identification of SNP markers associated with resistance to Podosphaera xanthii in melon. 2014. 124 f. Tese (Doutorado em Agricultura Tropical) - Universidade Federal Rural do Semi-Árido, Mossoró, 2014.
url https://repositorio.ufersa.edu.br/handle/tede/177
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.rights.driver.fl_str_mv CC-BY-SA
info:eu-repo/semantics/openAccess
rights_invalid_str_mv CC-BY-SA
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
dc.publisher.none.fl_str_mv Universidade Federal Rural do Semi-Árido
dc.publisher.program.fl_str_mv Programa de Pós-Graduação em Fitotecnia
dc.publisher.initials.fl_str_mv UFERSA
dc.publisher.country.fl_str_mv BR
dc.publisher.department.fl_str_mv Centro de Ciências Agrárias - CCA
publisher.none.fl_str_mv Universidade Federal Rural do Semi-Árido
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFERSA
instname:Universidade Federal Rural do Semi-Árido (UFERSA)
instacron:UFERSA
instname_str Universidade Federal Rural do Semi-Árido (UFERSA)
instacron_str UFERSA
institution UFERSA
reponame_str Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFERSA
collection Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFERSA
bitstream.url.fl_str_mv https://repositorio.ufersa.edu.br//bitstream/tede/177/3/ElaineWLPN_TESE.pdf.txt
https://repositorio.ufersa.edu.br//bitstream/tede/177/1/ElaineWLPN_TESE.pdf
https://repositorio.ufersa.edu.br//bitstream/tede/177/2/ElaineWLPN_TESE.pdf.jpg
bitstream.checksum.fl_str_mv beb34efb35275feb2887ef77b9f18e71
2087efc39ac35d1b19fedd7e4362e6bf
3fd96c9e936ee62201883519d1caf17b
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv MD5
MD5
MD5
repository.name.fl_str_mv Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFERSA - Universidade Federal Rural do Semi-Árido (UFERSA)
repository.mail.fl_str_mv direcaosisbi@ufersa.edu.br|| direcaosisbi@ufersa.edu.br
_version_ 1766778964974501888