Diversidade e estruturação genética de Brachyteles hypoxanthus (Primates: Atelidae) em um ambiente fragmentado no município de Santa Maria de Jetibá (ES) usando DNA mitocondrial e nuclear
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Data de Publicação: | 2010 |
Tipo de documento: | Dissertação |
Idioma: | por |
Título da fonte: | Repositório Institucional da Universidade Federal do Espírito Santo (riUfes) |
Texto Completo: | http://repositorio.ufes.br/handle/10/3817 |
Resumo: | Brachyteles hypoxanthus, northern muriqui, is threatened by the small number of individuals in the wild, distributed in only 12 isolated populations, being classified as "critically endangered" species. Mitochondrial DNA (mtDNA) studies revealed the population of Santa Maria de Jetibá (SMJ) as a Management Unit, despite of habitat smaller and highly fragmented. Our objective was to assess whether the populations of each fragment also form different units. We analyzed 43 individuals from six areas of the municipality using five microsatellite loci and 366 bp of hypervariable region I (D-loop, mtDNA). Moderate levels of genetic diversity (Dg=0,74) and heterozygosity (Hobs=0,60) were found with nDNA. Populations São Sebastião de Belém (SSB) and Córrego do Ouro 1 (CO1) deviated from HWE and were significants in the inbreeding coefficient (Fis=0,259 and 0,206; respectively). Were detected seven haplotypes (mtDNA), with moderate haplotype diversity (h=0,7540). The H1 haplotype was unique to SSB, while the other three populations shared haplotypes (H2, H3 and H5). Not were discarded the hypothesis of population stability. There was a weak genetic structure for nDNA (Fst=0,0768), but strong structure for mtDNA (Fst=0,58013), with SSB distinct from other populations (0,65256=Fst=0,94310). Moderate genetic diversity in SMJ unexpected for a species critically endangered and is probably due to the long generations, since the populations had weak genetic structure between themselves (nDNA). However, deviations from HWE and the predominance of one haplotype of mtDNA for SSB may be signs of the effects of genetic drift, since it does not rule out the hypothesis of demography equilibration. These effects are consistent with the proposal that genetic drift tends to be more intense in island populations, an analogy to forest fragments of SMJ. Seen the low differentiation in allele frequencies and sharing of haplotypes, our data suggest that the population of SMJ in particular should not be treated as different units. Based on this, the genetic diversity simulations show that the increased connectivity of forest fragments in SMJ over the medium and long term can be an essential step in the restoration, maintenance and conservation of northern muriqui in the municipality |
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Fagundes, ValériaAlvarenga, Clara ScarpatiFarro, Ana Paula CazertaMendes, Sérgio LucenaMeyer, Diogo2016-08-29T15:09:10Z2016-07-112016-08-29T15:09:10Z2010-02-26Brachyteles hypoxanthus, northern muriqui, is threatened by the small number of individuals in the wild, distributed in only 12 isolated populations, being classified as "critically endangered" species. Mitochondrial DNA (mtDNA) studies revealed the population of Santa Maria de Jetibá (SMJ) as a Management Unit, despite of habitat smaller and highly fragmented. Our objective was to assess whether the populations of each fragment also form different units. We analyzed 43 individuals from six areas of the municipality using five microsatellite loci and 366 bp of hypervariable region I (D-loop, mtDNA). Moderate levels of genetic diversity (Dg=0,74) and heterozygosity (Hobs=0,60) were found with nDNA. 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These effects are consistent with the proposal that genetic drift tends to be more intense in island populations, an analogy to forest fragments of SMJ. Seen the low differentiation in allele frequencies and sharing of haplotypes, our data suggest that the population of SMJ in particular should not be treated as different units. Based on this, the genetic diversity simulations show that the increased connectivity of forest fragments in SMJ over the medium and long term can be an essential step in the restoration, maintenance and conservation of northern muriqui in the municipalityBrachyteles hypoxanthus, muriqui-do-norte, encontra-se ameaçado pela redução e fragmentação do habitat, com 12 populações remanescentes isoladas, sendo classificado como criticamente em perigo de extinção. Estudos preliminares com DNA mitocondrial (DNAmt) revelaram a população de Santa Maria de Jetibá (SMJ) como uma Unidade de Manejo, apesar do habitat menor e altamente fragmentado. O principal objetivo desse estudo foi avaliar se as populações de cada fragmento de SMJ também formam unidades diferenciadas utilizando o DNA nuclear (DNAn) e DNAmt. Analisamos 43 indivíduos de seis áreas do município utilizando-se cinco locos de microssatélites e 366 pb da região hipervariável I (D-loop-DNAmt). Observou-se alta diversidade genética (Dg=0,74) e heterozigosidade (Hobs=0,60) com DNAn, mas duas populações, São Sebastião Belém (SSB) e Córrego do Ouro 1 (CO1), apresentaram desvios de HWE e valores significativos de coeficiente de endocruzamento (Fis=0,259 e 0,206, respectivamente). Foram detectados sete haplótipos (DNAmt), com diversidade haplotípica alta (h=0,7540), mas diversidade nucleotídica baixa (n=0,010683). O haplótipo H1 foi exclusivo para SSB, enquanto as demais populações compartilharam três haplótipos (H2, H3 e H5). Não foram observados sinais genéticos de gargalo e expansão populacional para a maioria das populações. Observou-se fraca estruturação genética para DNAn (Fst=0,0768), porém forte estruturação para DNAmt (Φst=0,58013), com SSB distinta das demais populações (0,65256≤Φst≤0,94310). Alta diversidade genética em SMJ deve-se provavelmente ao longo tempo das gerações, não ocorrendo tempo suficiente para afetar dramaticamente a diversidade genética, visto que as populações apresentaram fraca estruturação genética entre si apesar da maior taxa de evolução dos microssatélites. No entanto, desvios de HWE e a predominância de um haplótipo para SSB podem ser sinais sutis da perda de diversidade devido aos efeitos da deriva genética, dada à ausência de evidências genéticas de gargalo e expansão populacional e ao longo tempo das gerações. Tais efeitos são congruentes com a proposta de que a deriva genética tende a ser mais intensa em populações insulares, uma analogia aos fragmentos de mata de SMJ. Visto a baixa diferenciação na freqüência de alelos e o compartilhamento da maioria dos haplótipos, nossos dados fornecem suporte às conclusões prévias de que a população total de SMJ deve ser vista como uma unidade genética distinta, mas suas populações em particular não devem ser tratadas como unidades diferenciadas. Baseado nisso, simulações da diversidade genética mostram que o aumento da conectividade dos fragmentos florestais em SMJ a médio e longo prazo pode ser uma medida essencial para a recuperação, manutenção e conservação do muriqui-do-norte.TextALVARENGA, Clara Scarpati. Diversidade e estruturação genética de Brachyteles hypoxanthus (Primates: Atelidae) em um ambiente fragmentado no município de Santa Maria de Jetibá (ES) usando DNA mitocondrial e nuclear. Dissertação (Mestrado em Biologia animal) – Universidade Federal do Espírito Santo, Centro de Ciências Humanas e Naturais, Vitória, 2010.http://repositorio.ufes.br/handle/10/3817porUniversidade Federal do Espírito SantoMestrado em Biologia AnimalPrograma de Pós-Graduação em Ciências BiológicasUFESBRMuriqui - Santa Maria de Jetibá (ES)Microssatélites (Genética)DNAMata Atlântica - ConservaçãoZoologia57Diversidade e estruturação genética de Brachyteles hypoxanthus (Primates: Atelidae) em um ambiente fragmentado no município de Santa Maria de Jetibá (ES) usando DNA mitocondrial e nuclearinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da Universidade Federal do Espírito Santo (riUfes)instname:Universidade Federal do Espírito Santo (UFES)instacron:UFESORIGINALClara-Scarpati-Alvarenga-2010-trabalho.pdfapplication/pdf837325http://repositorio.ufes.br/bitstreams/f3c75e79-aee3-4fdc-87aa-f5b23e3a4a32/downloadd404d8a63554d67e7ab3e3852a5f7c31MD5110/38172024-07-01 16:23:46.272oai:repositorio.ufes.br:10/3817http://repositorio.ufes.brRepositório InstitucionalPUBhttp://repositorio.ufes.br/oai/requestopendoar:21082024-07-11T14:29:34.755652Repositório Institucional da Universidade Federal do Espírito Santo (riUfes) - Universidade Federal do Espírito Santo (UFES)false |
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