Estrutura genética e filogenia molecular dos primatas mais afetados no surto recente de febre amarela silvestre: Alouatta guariba e Callithrix spp. (Primates, Platyrrhini)

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Fonseca, João Luiz Guedes da
Data de Publicação: 2023
Tipo de documento: Tese
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Institucional da Universidade Federal do Espírito Santo (riUfes)
Texto Completo: http://repositorio.ufes.br/handle/10/16996
Resumo: In this study, we evaluated the genetic diversity of two primate genera most affected by the last yellow fever outbreak in Brazil (2016–2018). In the first chapter we used an integrative approach combining phylogenetic, population genetics and landscape genetics to test the hypothesis that fragmentation of the Atlantic Forest could have prevented the rapid spread of yellow fever among populations of howler monkeys (Alouatta guariba). However, we did not find evidence to support this hypothesis, since there is genetic connectivity among all sampled individuals and there was no discernible geographic pattern among clades retrieved by phylogenetic analysis. Thus, we have a strong indication that yellow fever can be easily transmitted between apparently isolated populations of howler monkeys. In the second chapter, we use the mitogenome and mtDNA control region to investigate the diversity and ancestry of marmosets (Callithrix jacchus) at international animal research and supply facilities. Our results suggest that analyzes of mitogenomic variation have great potential for resolving evolutionary relationships among marmoset populations, defining species boundaries and detecting hybrids. Thus, we suggest that the combination of the mitogenome with phenotypic data and nuclear genomes are essential to maintain the genetic diversity of marmosets aiming at appropriate reproduction plans, helping in the adequate selection of the phenotype for specific biomedical research.
id UFES_b2c16de8f5e6aa80e992ea7d62e08e42
oai_identifier_str oai:repositorio.ufes.br:10/16996
network_acronym_str UFES
network_name_str Repositório Institucional da Universidade Federal do Espírito Santo (riUfes)
repository_id_str 2108
spelling Leite, Yuri Luiz Reishttps://orcid.org/0000000202488738http://lattes.cnpq.br/8973606745193293Fonseca, João Luiz Guedes dahttps://orcid.org/0000000307731415http://lattes.cnpq.br/3542078007927622Rodrigues, Ana Carolina Losshttps://orcid.org/0000-0002-8298-8555http://lattes.cnpq.br/8415444657040950Bonvicino, Cibele Rodrigueshttps://orcid.org/0000-0002-1948-7643http://lattes.cnpq.br/1977014753474964Melo, Fabiano Rodrigues dehttps://orcid.org/0000-0001-9958-2036http://lattes.cnpq.br/6863533704023271Dalapicolla, Jeronymo2024-05-30T01:42:03Z2024-05-30T01:42:03Z2023-06-28In this study, we evaluated the genetic diversity of two primate genera most affected by the last yellow fever outbreak in Brazil (2016–2018). In the first chapter we used an integrative approach combining phylogenetic, population genetics and landscape genetics to test the hypothesis that fragmentation of the Atlantic Forest could have prevented the rapid spread of yellow fever among populations of howler monkeys (Alouatta guariba). However, we did not find evidence to support this hypothesis, since there is genetic connectivity among all sampled individuals and there was no discernible geographic pattern among clades retrieved by phylogenetic analysis. Thus, we have a strong indication that yellow fever can be easily transmitted between apparently isolated populations of howler monkeys. In the second chapter, we use the mitogenome and mtDNA control region to investigate the diversity and ancestry of marmosets (Callithrix jacchus) at international animal research and supply facilities. Our results suggest that analyzes of mitogenomic variation have great potential for resolving evolutionary relationships among marmoset populations, defining species boundaries and detecting hybrids. Thus, we suggest that the combination of the mitogenome with phenotypic data and nuclear genomes are essential to maintain the genetic diversity of marmosets aiming at appropriate reproduction plans, helping in the adequate selection of the phenotype for specific biomedical research.Neste estudo, avaliamos a diversidade genética de dois dos gêneros de primatas mais afetados pelo último surto de febre amarela ocorrido no Brasil (2016–2018). No primeiro capítulo usamos a abordagem integrativa entre filogenética, genética de populações e genética de paisagem para testar a hipótese de que a fragmentação da Mata Atlântica poderia ter impedido a rápida disseminação de febre amarela entre as populações de bugios (Alouatta guariba). Entretanto, não encontramos evidências para suportar essa hipótese, uma vez que existe conectividade genética entre todos os indivíduos amostrados e não houve padrão geográfico discernível entre os clados recuperados pela análise filogenética. Assim, temos um forte indicativo de que a febre amarela pode ser facilmente transmitida entre populações de bugios aparentemente isoladas. No segundo capítulo, usamos o mitogenoma e a região de controle do mtDNA com o intuito de investigar a diversidade e a ancestralidade de saguis (Callithrix jacchus) em instalações internacionais de pesquisa e fornecimento de animais. Nossos resultados sugerem que as análises da variação mitogenômica têm um grande potencial para resolver relações evolutivas entre populações de saguis, definindo limites de espécies e detectando híbridos. Assim, sugerimos que a combinação do mitogenoma com dados fenotípicos e genomas nucleares são essenciais para manter a diversidade genética dos saguis visando planos de reprodução apropriados, auxiliando na seleção adequada do fenótipo para pesquisas biomédicas específicas.Fundação Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)Texthttp://repositorio.ufes.br/handle/10/16996porUniversidade Federal do Espírito SantoDoutorado em Biologia AnimalPrograma de Pós-Graduação em Ciências Biológicas (Biologia Animal)UFESBRCentro de Ciências Humanas e Naturaissubject.br-rjbnZoologiaAtelidaeCallitrichidaeFebre amarelaMata AtlânticaPrimatasEstrutura genética e filogenia molecular dos primatas mais afetados no surto recente de febre amarela silvestre: Alouatta guariba e Callithrix spp. (Primates, Platyrrhini)title.alternativeinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesisinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da Universidade Federal do Espírito Santo (riUfes)instname:Universidade Federal do Espírito Santo (UFES)instacron:UFESORIGINALJoaoLuizGuedesFonseca-2023-Trabalho.pdfapplication/pdf5133475http://repositorio.ufes.br/bitstreams/0a62e553-1d6c-4c14-a3d6-06cff84a4e2b/downloadd04b89850506e7c7976967bff94944d3MD5110/169962024-08-26 08:32:06.551oai:repositorio.ufes.br:10/16996http://repositorio.ufes.brRepositório InstitucionalPUBhttp://repositorio.ufes.br/oai/requestopendoar:21082024-10-15T18:02:22.113200Repositório Institucional da Universidade Federal do Espírito Santo (riUfes) - Universidade Federal do Espírito Santo (UFES)false
dc.title.none.fl_str_mv Estrutura genética e filogenia molecular dos primatas mais afetados no surto recente de febre amarela silvestre: Alouatta guariba e Callithrix spp. (Primates, Platyrrhini)
dc.title.alternative.none.fl_str_mv title.alternative
title Estrutura genética e filogenia molecular dos primatas mais afetados no surto recente de febre amarela silvestre: Alouatta guariba e Callithrix spp. (Primates, Platyrrhini)
spellingShingle Estrutura genética e filogenia molecular dos primatas mais afetados no surto recente de febre amarela silvestre: Alouatta guariba e Callithrix spp. (Primates, Platyrrhini)
Fonseca, João Luiz Guedes da
Zoologia
Atelidae
Callitrichidae
Febre amarela
Mata Atlântica
Primatas
subject.br-rjbn
title_short Estrutura genética e filogenia molecular dos primatas mais afetados no surto recente de febre amarela silvestre: Alouatta guariba e Callithrix spp. (Primates, Platyrrhini)
title_full Estrutura genética e filogenia molecular dos primatas mais afetados no surto recente de febre amarela silvestre: Alouatta guariba e Callithrix spp. (Primates, Platyrrhini)
title_fullStr Estrutura genética e filogenia molecular dos primatas mais afetados no surto recente de febre amarela silvestre: Alouatta guariba e Callithrix spp. (Primates, Platyrrhini)
title_full_unstemmed Estrutura genética e filogenia molecular dos primatas mais afetados no surto recente de febre amarela silvestre: Alouatta guariba e Callithrix spp. (Primates, Platyrrhini)
title_sort Estrutura genética e filogenia molecular dos primatas mais afetados no surto recente de febre amarela silvestre: Alouatta guariba e Callithrix spp. (Primates, Platyrrhini)
author Fonseca, João Luiz Guedes da
author_facet Fonseca, João Luiz Guedes da
author_role author
dc.contributor.authorID.none.fl_str_mv https://orcid.org/0000000307731415
dc.contributor.authorLattes.none.fl_str_mv http://lattes.cnpq.br/3542078007927622
dc.contributor.advisor1.fl_str_mv Leite, Yuri Luiz Reis
dc.contributor.advisor1ID.fl_str_mv https://orcid.org/0000000202488738
dc.contributor.advisor1Lattes.fl_str_mv http://lattes.cnpq.br/8973606745193293
dc.contributor.author.fl_str_mv Fonseca, João Luiz Guedes da
dc.contributor.referee1.fl_str_mv Rodrigues, Ana Carolina Loss
dc.contributor.referee1ID.fl_str_mv https://orcid.org/0000-0002-8298-8555
dc.contributor.referee1Lattes.fl_str_mv http://lattes.cnpq.br/8415444657040950
dc.contributor.referee2.fl_str_mv Bonvicino, Cibele Rodrigues
dc.contributor.referee2ID.fl_str_mv https://orcid.org/0000-0002-1948-7643
dc.contributor.referee2Lattes.fl_str_mv http://lattes.cnpq.br/1977014753474964
dc.contributor.referee3.fl_str_mv Melo, Fabiano Rodrigues de
dc.contributor.referee3ID.fl_str_mv https://orcid.org/0000-0001-9958-2036
dc.contributor.referee3Lattes.fl_str_mv http://lattes.cnpq.br/6863533704023271
dc.contributor.referee4.fl_str_mv Dalapicolla, Jeronymo
contributor_str_mv Leite, Yuri Luiz Reis
Rodrigues, Ana Carolina Loss
Bonvicino, Cibele Rodrigues
Melo, Fabiano Rodrigues de
Dalapicolla, Jeronymo
dc.subject.cnpq.fl_str_mv Zoologia
topic Zoologia
Atelidae
Callitrichidae
Febre amarela
Mata Atlântica
Primatas
subject.br-rjbn
dc.subject.por.fl_str_mv Atelidae
Callitrichidae
Febre amarela
Mata Atlântica
Primatas
dc.subject.br-rjbn.none.fl_str_mv subject.br-rjbn
description In this study, we evaluated the genetic diversity of two primate genera most affected by the last yellow fever outbreak in Brazil (2016–2018). In the first chapter we used an integrative approach combining phylogenetic, population genetics and landscape genetics to test the hypothesis that fragmentation of the Atlantic Forest could have prevented the rapid spread of yellow fever among populations of howler monkeys (Alouatta guariba). However, we did not find evidence to support this hypothesis, since there is genetic connectivity among all sampled individuals and there was no discernible geographic pattern among clades retrieved by phylogenetic analysis. Thus, we have a strong indication that yellow fever can be easily transmitted between apparently isolated populations of howler monkeys. In the second chapter, we use the mitogenome and mtDNA control region to investigate the diversity and ancestry of marmosets (Callithrix jacchus) at international animal research and supply facilities. Our results suggest that analyzes of mitogenomic variation have great potential for resolving evolutionary relationships among marmoset populations, defining species boundaries and detecting hybrids. Thus, we suggest that the combination of the mitogenome with phenotypic data and nuclear genomes are essential to maintain the genetic diversity of marmosets aiming at appropriate reproduction plans, helping in the adequate selection of the phenotype for specific biomedical research.
publishDate 2023
dc.date.issued.fl_str_mv 2023-06-28
dc.date.accessioned.fl_str_mv 2024-05-30T01:42:03Z
dc.date.available.fl_str_mv 2024-05-30T01:42:03Z
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/doctoralThesis
format doctoralThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv http://repositorio.ufes.br/handle/10/16996
url http://repositorio.ufes.br/handle/10/16996
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv Text
dc.publisher.none.fl_str_mv Universidade Federal do Espírito Santo
Doutorado em Biologia Animal
dc.publisher.program.fl_str_mv Programa de Pós-Graduação em Ciências Biológicas (Biologia Animal)
dc.publisher.initials.fl_str_mv UFES
dc.publisher.country.fl_str_mv BR
dc.publisher.department.fl_str_mv Centro de Ciências Humanas e Naturais
publisher.none.fl_str_mv Universidade Federal do Espírito Santo
Doutorado em Biologia Animal
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Repositório Institucional da Universidade Federal do Espírito Santo (riUfes)
instname:Universidade Federal do Espírito Santo (UFES)
instacron:UFES
instname_str Universidade Federal do Espírito Santo (UFES)
instacron_str UFES
institution UFES
reponame_str Repositório Institucional da Universidade Federal do Espírito Santo (riUfes)
collection Repositório Institucional da Universidade Federal do Espírito Santo (riUfes)
bitstream.url.fl_str_mv http://repositorio.ufes.br/bitstreams/0a62e553-1d6c-4c14-a3d6-06cff84a4e2b/download
bitstream.checksum.fl_str_mv d04b89850506e7c7976967bff94944d3
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv MD5
repository.name.fl_str_mv Repositório Institucional da Universidade Federal do Espírito Santo (riUfes) - Universidade Federal do Espírito Santo (UFES)
repository.mail.fl_str_mv
_version_ 1813022577224843264