Avaliação da expressão gênica de CSNK2A1 e CSNK2B em leucemia linfoblástica aguda de células precursoras B

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Hummel, Leticia Aparecida Barbosa
Data de Publicação: 2016
Tipo de documento: Trabalho de conclusão de curso
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Institucional da Universidade Federal Fluminense (RIUFF)
Texto Completo: https://app.uff.br/riuff/handle/1/13972
Resumo: A leucemia linfoblástica aguda de células precursoras B (LLA-CPB) corresponde a 85% das LLAs pediátricas, sendo caracterizada por alterações cromossômicas primárias utilizadas na estratificação de risco, além de alterações adicionais, como deleções no gene Ikaros (ΔIKZF1), responsável por orquestrar a linfopoese através da regulação de EBF1, RAG1 e outros genes. Dessa forma, as ΔIKZF1 contribuem para a leucemogênese e também estão associadas a um pior prognóstico na LLA-CPB. Como a proteína caseína kinase 2 (CK2) inativa Ikaros, estudos propõem que a inibição farmacológica de CK2 poderia restaurar a função de Ikaros e apresentar um efeito antileucêmico em pacientes com ΔIKZF1. Portanto, este estudo teve como objetivo compreender o perfil de expressão de CSNK2A1 e CSNK2B (CK2), IKZF1 e seus genes-alvo (EBF1 e RAG1) nas LLA-CPB pediátricas. Além disso, correlacionamos o perfil de expressão destes genes com o status de IKZF1 e com as características clínicas dos pacientes. Metodologia: Foram incluídos três grupos (n=24) de acordo com o status de IKZF1 (selvagem, dominante negativo e haploinsuficiente), compostos por pacientes com LLA-CPB (2004-2016) <18 anos com >30% de blastos. Pacientes com síndromes genéticas foram excluídos. A expressão gênica foi avaliada por reação da cadeia da polimerase em tempo real, com o ensaio customizado TaqMan Array Plate (CSNK2A1, CSNK2B, EBF1 e RAG1) e SYBR green (IKZF1). Os dados foram comparados com o teste estatístico Mann Whitney no programa GraphPad Prism 5. Resultados: A maioria dos casos eram meninos (53,3%) com idade ao diagnóstico entre 1 e 9 anos (73,3%) e diagnosticados com LLA-comum (78,3%). Através da análise de expressão gênica, foi observada uma redução gradual da expressão de IKZF1, CSNK2A1 e CSNK2B de acordo com o aumento da idade ao diagnóstico dos pacientes. Em relação ao sexo, a mediana de expressão foi maior nas meninas do que nos meninos. A expressão de CSNK2A1 foi ligeiramente inferior em pacientes com alta leucocitose (≥ 50.000 leucócitos por mm3) (p=0,04). Apesar da ausência de significância estatística, a análise integrada de CK2, IKZF1 e seus genes alvos mostrou razão de expressão de CK2 e IKZF1 inversamente proporcional à expressão de EBF1 e RAG1, concordando com a hipótese de que CK2 inibe Ikaros. Conclusão: O estudo mostra que a expressão de CK2 e IKZF1 sofre variações com a idade e sexo do indivíduo, sem diferença estatística. Além disso, nossos resultados preliminares corroboram com a literatura e sugerem que CK2 pode inibir a ação de Ikaros em pacientes com LLA-CPB levando a diminuição da expressão de seus genes alvo e ao comprometimento da linfopoese.
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Como a proteína caseína kinase 2 (CK2) inativa Ikaros, estudos propõem que a inibição farmacológica de CK2 poderia restaurar a função de Ikaros e apresentar um efeito antileucêmico em pacientes com ΔIKZF1. Portanto, este estudo teve como objetivo compreender o perfil de expressão de CSNK2A1 e CSNK2B (CK2), IKZF1 e seus genes-alvo (EBF1 e RAG1) nas LLA-CPB pediátricas. Além disso, correlacionamos o perfil de expressão destes genes com o status de IKZF1 e com as características clínicas dos pacientes. Metodologia: Foram incluídos três grupos (n=24) de acordo com o status de IKZF1 (selvagem, dominante negativo e haploinsuficiente), compostos por pacientes com LLA-CPB (2004-2016) <18 anos com >30% de blastos. Pacientes com síndromes genéticas foram excluídos. A expressão gênica foi avaliada por reação da cadeia da polimerase em tempo real, com o ensaio customizado TaqMan Array Plate (CSNK2A1, CSNK2B, EBF1 e RAG1) e SYBR green (IKZF1). Os dados foram comparados com o teste estatístico Mann Whitney no programa GraphPad Prism 5. Resultados: A maioria dos casos eram meninos (53,3%) com idade ao diagnóstico entre 1 e 9 anos (73,3%) e diagnosticados com LLA-comum (78,3%). Através da análise de expressão gênica, foi observada uma redução gradual da expressão de IKZF1, CSNK2A1 e CSNK2B de acordo com o aumento da idade ao diagnóstico dos pacientes. Em relação ao sexo, a mediana de expressão foi maior nas meninas do que nos meninos. A expressão de CSNK2A1 foi ligeiramente inferior em pacientes com alta leucocitose (≥ 50.000 leucócitos por mm3) (p=0,04). Apesar da ausência de significância estatística, a análise integrada de CK2, IKZF1 e seus genes alvos mostrou razão de expressão de CK2 e IKZF1 inversamente proporcional à expressão de EBF1 e RAG1, concordando com a hipótese de que CK2 inibe Ikaros. Conclusão: O estudo mostra que a expressão de CK2 e IKZF1 sofre variações com a idade e sexo do indivíduo, sem diferença estatística. Além disso, nossos resultados preliminares corroboram com a literatura e sugerem que CK2 pode inibir a ação de Ikaros em pacientes com LLA-CPB levando a diminuição da expressão de seus genes alvo e ao comprometimento da linfopoese.B cell precursor acute lymphoblastic leukemia (BCP-ALL) corresponds to 85% of pediatric ALL. They are characterized by chromosomic alterations used in risk stratification, and also additional alterations, such as IKZF1 deletions (ΔIKZF1). This gene is responsible for orchestrating the lymphoid development process by regulating EBF1, RAG1, and other genes. Thereby, ΔIKZF1 contribute to leukemogenesis and are associated to a poor outcome in patients with BCP-ALL. Since casein-kinase 2 (CK2) protein inactive Ikaros, studies suggest that a pharmacological inhibition of CK2 can restore Ikaros function and have an antileukemic effect. The aim of this study was to evaluate the expression of CSNK2A1 and CSNK2B (CK2), IKZF1 and its target genes (EBF1 and RAG1) to understand the expression profile of these transcripts in pediatric BCP-ALL. In addition, we correlated the expression profile of these genes with the IKZF1 status and the clinical characteristics of the patients. Methodology: Three groups (n = 24) of patients with BCP-ALL (2004-2016) <18 years with > 30% of blasts were included in the study, according to IKZF1 status (wild type, dominant negative and haploinsufficient). Patients with genetic syndromes were excluded. The genes expression were evaluated by real-time polymerase chain reaction with the custom TaqMan Array Plate assay (CSNK2A1, CSNK2B, EBF1 and RAG1) and SYBR green (IKZF1). The data were compared through the Mann Whitney statistical test using the GraphPad Prism 5 program. Results: Most of the cases were male (53.3%), aged between 1 and 9 years-old at diagnosis (73.3%) and with common-ALL (78.3%). The gene expression analysis showed a gradual reduction of IKZF1, CSNK2A1 and CSNK2B expression according to the increase of the age at the diagnosis of the patients. About the gender, the median expression was higher in females than in males. CSNK2A1 expression was slightly lower in patients with high leukocytosis (≥ 50,000 leukocytes per mm3) (p = 0.04). Despite the lack of statistical significance, the integrated analysis of CK2, IKZF1 and its target genes showed that CK2 and IKZF1 expression ratio are inversely proportional to the expression of EBF1 and RAG1, agreeing with the hypothesis that CK2 inhibits Ikaros. Conclusion: The study shows that CK2 and IKZF1 expression undergoes variations regarding the age and sex of individuals, with no statistical difference. In addition, our results corroborate with the literature and suggest that CK2 may inhibit Ikaros activity in BCP-ALL patients leading to a decrease in their target genes expression and to impairment of lymphoid development.Sá, Mariana Emerenciano Cavalcanti deAlves, Gutemberg GomesMansur, Marcela BragaLopes, Bruno de AlmeidaHummel, Leticia Aparecida Barbosa2020-06-19T16:10:45Z2020-06-19T16:10:45Z2016info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/bachelorThesisapplication/pdfhttps://app.uff.br/riuff/handle/1/13972Aluno de GraduaçãoAttribution-NonCommercial-NoDerivs 3.0 Brazilhttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/br/CC-BY-SAinfo:eu-repo/semantics/openAccessporreponame:Repositório Institucional da Universidade Federal Fluminense (RIUFF)instname:Universidade Federal Fluminense (UFF)instacron:UFF2021-11-23T19:18:40Zoai:app.uff.br:1/13972Repositório InstitucionalPUBhttps://app.uff.br/oai/requestriuff@id.uff.bropendoar:21202021-11-23T19:18:40Repositório Institucional da Universidade Federal Fluminense (RIUFF) - Universidade Federal Fluminense (UFF)false
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Hummel, Leticia Aparecida Barbosa
Leucemia linfoblástica aguda
Células B
Deleções de IKZF1
CK2
Leucemia-Linfoma Linfoblástico de Células Precursoras
Linfócitos B
Caseína Quinase II
Fator de Transcrição Ikaros
Acute lymphoblastic leukemia
B-cell
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description A leucemia linfoblástica aguda de células precursoras B (LLA-CPB) corresponde a 85% das LLAs pediátricas, sendo caracterizada por alterações cromossômicas primárias utilizadas na estratificação de risco, além de alterações adicionais, como deleções no gene Ikaros (ΔIKZF1), responsável por orquestrar a linfopoese através da regulação de EBF1, RAG1 e outros genes. Dessa forma, as ΔIKZF1 contribuem para a leucemogênese e também estão associadas a um pior prognóstico na LLA-CPB. Como a proteína caseína kinase 2 (CK2) inativa Ikaros, estudos propõem que a inibição farmacológica de CK2 poderia restaurar a função de Ikaros e apresentar um efeito antileucêmico em pacientes com ΔIKZF1. Portanto, este estudo teve como objetivo compreender o perfil de expressão de CSNK2A1 e CSNK2B (CK2), IKZF1 e seus genes-alvo (EBF1 e RAG1) nas LLA-CPB pediátricas. Além disso, correlacionamos o perfil de expressão destes genes com o status de IKZF1 e com as características clínicas dos pacientes. Metodologia: Foram incluídos três grupos (n=24) de acordo com o status de IKZF1 (selvagem, dominante negativo e haploinsuficiente), compostos por pacientes com LLA-CPB (2004-2016) <18 anos com >30% de blastos. Pacientes com síndromes genéticas foram excluídos. A expressão gênica foi avaliada por reação da cadeia da polimerase em tempo real, com o ensaio customizado TaqMan Array Plate (CSNK2A1, CSNK2B, EBF1 e RAG1) e SYBR green (IKZF1). Os dados foram comparados com o teste estatístico Mann Whitney no programa GraphPad Prism 5. Resultados: A maioria dos casos eram meninos (53,3%) com idade ao diagnóstico entre 1 e 9 anos (73,3%) e diagnosticados com LLA-comum (78,3%). Através da análise de expressão gênica, foi observada uma redução gradual da expressão de IKZF1, CSNK2A1 e CSNK2B de acordo com o aumento da idade ao diagnóstico dos pacientes. Em relação ao sexo, a mediana de expressão foi maior nas meninas do que nos meninos. A expressão de CSNK2A1 foi ligeiramente inferior em pacientes com alta leucocitose (≥ 50.000 leucócitos por mm3) (p=0,04). Apesar da ausência de significância estatística, a análise integrada de CK2, IKZF1 e seus genes alvos mostrou razão de expressão de CK2 e IKZF1 inversamente proporcional à expressão de EBF1 e RAG1, concordando com a hipótese de que CK2 inibe Ikaros. Conclusão: O estudo mostra que a expressão de CK2 e IKZF1 sofre variações com a idade e sexo do indivíduo, sem diferença estatística. Além disso, nossos resultados preliminares corroboram com a literatura e sugerem que CK2 pode inibir a ação de Ikaros em pacientes com LLA-CPB levando a diminuição da expressão de seus genes alvo e ao comprometimento da linfopoese.
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