Evolução do genoma mitocondrial e os diferentes hábitos de vida em Elasmobranchii

• Autor(a) principal: Andrade, Maria Clara El Bayeh de
• Data de Publicação: 2023
• Tipo de documento: Trabalho de conclusão de curso
• Idioma: por
• Título da fonte: Repositório Institucional da Universidade Federal Fluminense (RIUFF)
• Texto Completo: http://app.uff.br/riuff/handle/1/29827
• topic: Elasmobranchii, mitogenoma, filogenética, uso de códons; Biologia marinha, Filogenia, Tubarão; Elasmobranchii, mitogenome, phylogenetics, codon-usage

A classe Chondrichthyes é monofilética e se divide em dois táxons também monofiléticos, Holocephali e Elasmobranchii (raias e tubarões), sendo que este último abrange a maior parte da diversidade. Com base em estudos morfológicos os elasmobrânquios foram divididos em quatro grupos: Galeomorphii, Squatinomorphii, Squalomorphii e Batoidea. Além disso Batoidea era apontado como um grupo derivado dentro dos tubarões, hipótese conhecida como Hypnosqualea. Entretanto, estudos filogenéticos moleculares vêm apontando para a monofilia recíproca de tubarões (Selachii) e raias (Batoidea), rejeitando as hipóteses anteriores. Os elasmobrânquios possuem características morfológicos e fisiológicos, que possibilitam ampla distribuição ao longo dos oceanos, tanto no perfil vertical quanto no horizontal. Certos ambientes e condições ecológicas, em teoria, podem requerer maior gasto energético, sendo assim, as mitocôndrias podem ter tido um papel essencial na evolução de diferentes hábitos de vida. Dessa forma, o projeto construiu uma filogenia e investigou como os diferentes ambientes habitados pelos tubarões e raias se relacionam a pressão seletiva em regiões codificantes do genoma mitocondrial. A partir das análises filogenéticas com os 13 genes mitocondriais e 169 espécies foram recuperadas duas árvores que corroboraram os resultados encontrados recentemente por outros estudos moleculares. Além disso, a comparação do perfil do uso de códons demostrou uma preferência pela adenina (A) na terceira posição do códon, enquanto guanina (G) é preterida na terceira posição. A análise do perfil de uso de códons demonstrou que, no geral, há maior semelhança entre espécies filogeneticamente mais próximas, como esperado. Entretanto, parte da variação em relação ao uso de códons pode ser explicada pelas diferentes zonas e regiões, variáveis estas que representam diferenças na temperatura da água. Em relação ao viés no uso de códons, a divisão entre grupos filogenéticos explica melhor as diferenças entre a quantidade de viés, embora em casos pontuais tenha sido observado maior viés para determinados hábitos de vida. Como era esperado, as principais diferenças entre os aspectos da evolução do genoma mitocondrial podem ser explicadas pelas diferenças filogenéticas, entretanto, há indícios de que o genoma mitocondrial possa ter tido um papel relevante na colonização de certos ambientes.