Detecção e caracterização molecular de norovírus em casos de gastroenterite aguda ocorridos na região do médio Paraíba, Estado do Rio de Janeiro, 2005.
Autor(a) principal: | |
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Data de Publicação: | 2006 |
Tipo de documento: | Dissertação |
Idioma: | por |
Título da fonte: | Repositório Institucional da Universidade Federal Fluminense (RIUFF) |
Texto Completo: | https://app.uff.br/riuff/handle/1/18446 |
Resumo: | In March 2005, the Epidemiological Surveillance Service of Resende, municipality of the Middle Paraiba Valley, State of Rio de Janeiro, reported a sudden spontaneous occurrence of acute gastroenteritis cases in children in a public day care center. The follow investigation showed that children s relative were also affected. From May to June, two other municipalities, Piraí and Rio Claro, also localized in the Middle Paraiba Valley, reported gastroenteritis outbreaks or sporadic cases. A total of 50 fecal samples were collected from March to June 2005. Since bacterial and parasitic investigations were negative in those samples, we performed virus investigation in those outbreaks and sporadic cases of acute gastroenteritis. Polyacrylamide gel electrophoresis for rotaviruses, enzyme immunoassay for adenovirus and rotavirus, reverse transcription-polymerase chain reaction (RT-PCR) were performed to investigate the presence of noroviruses (NoV) and astroviruses. Also, a quantitative TaqMan real time PCR for NoV was performed to detect, quantified samples and to compare these results with those obtained by conventional RT-PCR. NoV was detected in 33 out of 50 (66%) samples showing an agreement of 100% between both methodologies. Partial nucleotide sequence analysis of the genome sequence for the capsid showed that the circulating strain belonged to genogroup II and genotype 4. The results highlight the role of NoV infection in children and adults in outbreaks as well as in sporadic cases of acute gastroenteritis. |
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Detecção e caracterização molecular de norovírus em casos de gastroenterite aguda ocorridos na região do médio Paraíba, Estado do Rio de Janeiro, 2005.GastroenteriteNorovírusMEDICINACIÊNCIAS MÉDICASGastroenterite agudaEpidemiologia molecularCNPQ::CIENCIAS DA SAUDE::MEDICINA::CLINICA MEDICAIn March 2005, the Epidemiological Surveillance Service of Resende, municipality of the Middle Paraiba Valley, State of Rio de Janeiro, reported a sudden spontaneous occurrence of acute gastroenteritis cases in children in a public day care center. The follow investigation showed that children s relative were also affected. From May to June, two other municipalities, Piraí and Rio Claro, also localized in the Middle Paraiba Valley, reported gastroenteritis outbreaks or sporadic cases. A total of 50 fecal samples were collected from March to June 2005. Since bacterial and parasitic investigations were negative in those samples, we performed virus investigation in those outbreaks and sporadic cases of acute gastroenteritis. Polyacrylamide gel electrophoresis for rotaviruses, enzyme immunoassay for adenovirus and rotavirus, reverse transcription-polymerase chain reaction (RT-PCR) were performed to investigate the presence of noroviruses (NoV) and astroviruses. Also, a quantitative TaqMan real time PCR for NoV was performed to detect, quantified samples and to compare these results with those obtained by conventional RT-PCR. NoV was detected in 33 out of 50 (66%) samples showing an agreement of 100% between both methodologies. Partial nucleotide sequence analysis of the genome sequence for the capsid showed that the circulating strain belonged to genogroup II and genotype 4. The results highlight the role of NoV infection in children and adults in outbreaks as well as in sporadic cases of acute gastroenteritis.Fundação Oswaldo CruzEm março de 2005, o Serviço de Epidemiologia do município de Resende, no estado do Rio de Janeiro, relatou a ocorrência de casos agudos de gastroenterite em crianças pertencentes a uma creche do município. A investigação epidemiológica realizada demonstrou que os familiares das crianças também foram afetados. Entre os meses de maio e junho, outros dois municípios, Piraí e Rio Claro, localizados no vale do Médio Paraíba, notificaram surto ou casos esporádicos de gastroenterite aguda. Um total de 50 amostras fecais foram coletadas entre março a junho de 2005 dos três municípios. As amostras fecais foram submetidas à investigação bacteriana e parasitológica e foram negativas. Iniciamos a investigação dos possíveis vírus envolvidos naqueles surtos e nos casos esporádicos de gastroenterite aguda. Foram utilizados os métodos de eletroforese em gel de poliacrilamida para detecção de rotavírus, ensaio imunoenzimático para detecção de adenovírus e rotavírus e a reação em cadeia pela polimerase precedida de transcrição reversa (RT-PCR) para investigar a presença de norovírus e astrovírus. Foi realizada ainda a reação em cadeia pela polimerase em tempo real - TaqMan (qPCR) para detectar, quantificar e comparar os resultados com aqueles obtidos com a RT-PCR convencional. O norovírus foi detectado em 33 das 50 amostras (66%) por ambos os métodos demostrando concordância de 100%. A análise parcial da seqüência do genoma que codifica para a proteína do capsídeo viral demonstrou que a amostra circulante pertencia ao genótipo GII.4. Os resultados deste estudo destacam o papel da infecção pelo norovírus em crianças e adultos em surtos bem como em casos esporádicos de gastroenterite aguda.Programa de Pós-graduação em Ciências MédicasCiências MédicasOliveira, Solange Artimos deCPF:00988978622http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4780837E7Miagostovich, Marize PereiraCPF:01560526822Setúbal, SérgioCPF:20977963122http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4768484J6Spano, Liliana CruzCPF:00989765322http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4786788A1Santos, Flavia Barreto dosCPF:89281891122Soares, Caroline CorediroCPF:20171528822Garcia, Rita de Cássia Nasser CubelCPF:40256389522http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4785495Y4Ferreira, Mônica Simões Rocha2021-03-10T20:44:36Z2009-06-172021-03-10T20:44:36Z2006-10-11info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdfhttps://app.uff.br/riuff/handle/1/18446porCC-BY-SAinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da Universidade Federal Fluminense (RIUFF)instname:Universidade Federal Fluminense (UFF)instacron:UFF2021-03-10T20:44:36Zoai:app.uff.br:1/18446Repositório InstitucionalPUBhttps://app.uff.br/oai/requestriuff@id.uff.bropendoar:21202024-08-19T11:12:06.564738Repositório Institucional da Universidade Federal Fluminense (RIUFF) - Universidade Federal Fluminense (UFF)false |
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