Análise metagenômica da microbiota de coprólito humano pré-colonial de 560 ± 40 anos antes do presente do Vale do Peruaçu, MG, Brasil.
Autor(a) principal: | |
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Data de Publicação: | 2022 |
Tipo de documento: | Trabalho de conclusão de curso |
Idioma: | por |
Título da fonte: | Repositório Institucional da Universidade Federal Fluminense (RIUFF) |
Texto Completo: | http://app.uff.br/riuff/handle/1/27385 |
Resumo: | A paleontologia se encontra com a parasitologia e permite aos pesquisadores compreenderem sob uma nova ótica a história das doenças e infecções parasitárias na paleoparasitologia. Ainda, há a bioinformática, em que uma de suas aplicações, a metagenômica, pode ser utilizada para analisar e compreender a composição bacteriana de uma amostra. No presente estudo, foi realizada uma análise metagenômica de coprólito proveniente de um corpo parcialmente mumificado de indivíduo sabidamente chagásico e com outras doenças, datado do período pré-colombiano encontrado no Vale do Peruaçu, em Minas Gerais, Brasil. Buscou-se descrever o perfil taxonômico e funcional da amostra, correlacionar com outros estudos, recuperar genomas completas, identificar genes de resistência a antibióticos e levar o conhecimento sobre paleoparasitologia para escolas. Para isso, três sequências de programas foram executadas para trazer inferências sobre (1) Taxonomia e atividades funcionais; (2) Recuperação de genomas completos; (3) Identificação de genes de resistência a antibióticos. Foram feitas correlações entre a grande quantidade de cáries que o indivíduo tinha e a composição de sua microbiota intestinal, rica em Actinobacteria. Ainda, a dominância expressiva deste filo bacteriano foi ligado à condição de saúde do indivíduo, que possuía um quadro de megacólon, que teria levado a diversas implicações fisiológicas e em seus hábitos. Além disso, os genomas recuperados e os genes de resistência a antibióticos identificados foram, em grande parte, identificados também como pertencentes ao filo Actinobacteria. Portanto, foram estabelecidas correlações fortes entre este filo e as patologias que acometiam o indivíduo de grande importância para a paleoparasitologia brasileira, além de inferências sobre seus hábitos de vidas, práticas culturais e semelhanças e diferenças com outros povos. Em paralelo, foi confeccionado um jogo atrelado a uma exposição sobre história e evolução da Doença de Chagas, que tem sido aplicado em escolas e Instituições de ensino e pesquisa do Brasil de forma itinerante, além da exposição e divulgação de outros materiais desenvolvidos para divulgação científica |
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Análise metagenômica da microbiota de coprólito humano pré-colonial de 560 ± 40 anos antes do presente do Vale do Peruaçu, MG, Brasil.MetagenômicaPaleoparasitologiaDoença de ChagasMúmiaActinobacteriaMetagenômicaMetagenomicsPaleoparasitologyChagas diseaseMummyActinobacteriaA paleontologia se encontra com a parasitologia e permite aos pesquisadores compreenderem sob uma nova ótica a história das doenças e infecções parasitárias na paleoparasitologia. Ainda, há a bioinformática, em que uma de suas aplicações, a metagenômica, pode ser utilizada para analisar e compreender a composição bacteriana de uma amostra. No presente estudo, foi realizada uma análise metagenômica de coprólito proveniente de um corpo parcialmente mumificado de indivíduo sabidamente chagásico e com outras doenças, datado do período pré-colombiano encontrado no Vale do Peruaçu, em Minas Gerais, Brasil. Buscou-se descrever o perfil taxonômico e funcional da amostra, correlacionar com outros estudos, recuperar genomas completas, identificar genes de resistência a antibióticos e levar o conhecimento sobre paleoparasitologia para escolas. Para isso, três sequências de programas foram executadas para trazer inferências sobre (1) Taxonomia e atividades funcionais; (2) Recuperação de genomas completos; (3) Identificação de genes de resistência a antibióticos. Foram feitas correlações entre a grande quantidade de cáries que o indivíduo tinha e a composição de sua microbiota intestinal, rica em Actinobacteria. Ainda, a dominância expressiva deste filo bacteriano foi ligado à condição de saúde do indivíduo, que possuía um quadro de megacólon, que teria levado a diversas implicações fisiológicas e em seus hábitos. Além disso, os genomas recuperados e os genes de resistência a antibióticos identificados foram, em grande parte, identificados também como pertencentes ao filo Actinobacteria. Portanto, foram estabelecidas correlações fortes entre este filo e as patologias que acometiam o indivíduo de grande importância para a paleoparasitologia brasileira, além de inferências sobre seus hábitos de vidas, práticas culturais e semelhanças e diferenças com outros povos. Em paralelo, foi confeccionado um jogo atrelado a uma exposição sobre história e evolução da Doença de Chagas, que tem sido aplicado em escolas e Instituições de ensino e pesquisa do Brasil de forma itinerante, além da exposição e divulgação de outros materiais desenvolvidos para divulgação científicaCoordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível SuperiorPaleontology meets parasitology and allows researchers to understand in a new light the history of parasitic infections and diseases in paleoparasitology. There is also bioinformatics, which one of its applications, metagenomics, can be used to analyze and understand the bacterial composition of a sample, among other aplications. In the present study, a metagenomic analysis of coprolite from a partially mummified body of an individual known to have Chagas disease and other diseases, dating from the pre-Columbian period found in the Peruaçu Valley, in Minas Gerais, Brazil and scientific dissemination on the subject was performed. It was sought to describe the taxonomic and functional profile of the sample, correlate it with other studies, retrieve complete genomes, identify antibiotic resistance genes and bring knowledge about paleoparasitology to schools. For that, three sequences of programs were executed to bring inferences about (1) taxonomy and functional activities; (2) Recovery of complete genomes; (3) Identification of antibiotic resistance genes. Correlations were made between the large amount of caries that the individual had and the composition of their gut microbiota, rich in Actinobacteria. Still, the expressive dominance of this bacterial phylum was linked to the health condition of the individual, who had a megacolon condition, which would have led to several physiological implications and in their habits. Furthermore, the recovered genomes and the identified antibiotic resistance genes were, to a large extent, also identified as belonging to the Actinobacteria phylum. Therefore, strong correlations were established between this phylum and the pathologies that affected the individual of great importance for Brazilian paleoparasitology, as well as inferences about their life habits, cultural practices and similarities and differences with other peoples. In parallel, a game was made linked to an exhibition on the history and evolution of Chagas Disease, which has been applied in schools and teaching and research institutions in Brazil on an itinerant basis, in addition to the exhibition and dissemination of other materials developed for scientific divulgation53 f.Souza, Daniela Leles dehttp://lattes.cnpq.br/0743330815026581Tschoeke, Diogo Antoniohttp://lattes.cnpq.br/6180692278763854Goulart, Patricia Riddell Millarhttp://lattes.cnpq.br/2150946398074811Mattos, Danuza Pinheiro Bastos Garcia dehttp://lattes.cnpq.br/8373835267965491Dias, Graciela Mariahttp://lattes.cnpq.br/8229415453916195Saldanha, Bruna Montenegrohttp://lattes.cnpq.br/0213492137362663http://lattes.cnpq.br/0813411001897937Brito, Enzo Antonello Terrana Bezerra de Melo2022-12-21T14:58:44Z2022-12-21T14:58:44Zinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/bachelorThesisapplication/pdfBRITO, Enzo Antonello Terrana Bezerra de Melo. Análise metagenômica da microbiota de coprólito humano pré-colonial de 560 ± 40 anos antes do presente do Vale do Peruaçu, MG, Brasil. 2022. 53 f. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciências Biológicas) - Instituto de Biologia, Universidade Federal Fluminense, Niterói, 2022.http://app.uff.br/riuff/handle/1/27385CC-BY-SAinfo:eu-repo/semantics/openAccessporreponame:Repositório Institucional da Universidade Federal Fluminense (RIUFF)instname:Universidade Federal Fluminense (UFF)instacron:UFF2023-01-18T14:14:31Zoai:app.uff.br:1/27385Repositório InstitucionalPUBhttps://app.uff.br/oai/requestriuff@id.uff.bropendoar:21202024-08-19T10:55:34.195620Repositório Institucional da Universidade Federal Fluminense (RIUFF) - Universidade Federal Fluminense (UFF)false |
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A paleontologia se encontra com a parasitologia e permite aos pesquisadores compreenderem sob uma nova ótica a história das doenças e infecções parasitárias na paleoparasitologia. Ainda, há a bioinformática, em que uma de suas aplicações, a metagenômica, pode ser utilizada para analisar e compreender a composição bacteriana de uma amostra. No presente estudo, foi realizada uma análise metagenômica de coprólito proveniente de um corpo parcialmente mumificado de indivíduo sabidamente chagásico e com outras doenças, datado do período pré-colombiano encontrado no Vale do Peruaçu, em Minas Gerais, Brasil. Buscou-se descrever o perfil taxonômico e funcional da amostra, correlacionar com outros estudos, recuperar genomas completas, identificar genes de resistência a antibióticos e levar o conhecimento sobre paleoparasitologia para escolas. Para isso, três sequências de programas foram executadas para trazer inferências sobre (1) Taxonomia e atividades funcionais; (2) Recuperação de genomas completos; (3) Identificação de genes de resistência a antibióticos. Foram feitas correlações entre a grande quantidade de cáries que o indivíduo tinha e a composição de sua microbiota intestinal, rica em Actinobacteria. Ainda, a dominância expressiva deste filo bacteriano foi ligado à condição de saúde do indivíduo, que possuía um quadro de megacólon, que teria levado a diversas implicações fisiológicas e em seus hábitos. Além disso, os genomas recuperados e os genes de resistência a antibióticos identificados foram, em grande parte, identificados também como pertencentes ao filo Actinobacteria. Portanto, foram estabelecidas correlações fortes entre este filo e as patologias que acometiam o indivíduo de grande importância para a paleoparasitologia brasileira, além de inferências sobre seus hábitos de vidas, práticas culturais e semelhanças e diferenças com outros povos. Em paralelo, foi confeccionado um jogo atrelado a uma exposição sobre história e evolução da Doença de Chagas, que tem sido aplicado em escolas e Instituições de ensino e pesquisa do Brasil de forma itinerante, além da exposição e divulgação de outros materiais desenvolvidos para divulgação científica |
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