Perfis de resistência a antimicrobianos e virulência de amostras de Enterococcus spp. isoladas da microbiota intestinal de cães domiciliados na região metropolitana no Estado do Rio de Janeiro

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Sabino, Hellen dos Santos
Data de Publicação: 2022
Tipo de documento: Dissertação
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Institucional da Universidade Federal Fluminense (RIUFF)
Texto Completo: http://app.uff.br/riuff/handle/1/27110
http://dx.doi.org/10.22409/PPGMPA.2022.m.12888428725
Resumo: Enterococcus spp. são membros comuns da microbiota intestinal humana e animal.Além de Enterococcus faecalis (Efc) e Enterococcus faecium (Efm), outras espécies nãoE. faecalis ou E. faecium (NEfc-Efm) têm sido responsáveis por infecções relacionadasà assistência em saúde (IRAS). Além disso, cepas de NEfc-Efm também foramidentificadas em animais, tal fato é preocupante, pois o contato próximo entre humanose animais pode permitir a transmissão interespécie de cepas multirresistentes compotencial patogênico. Desta forma, o presente estudo tem como objetivos de investigaros perfis de resistência aos antimicrobianos e a virulência de amostras de NEfc-Efm deorigem canina isoladas da microbiota intestinal. Para o estudo, 260 swabs retais foramcoletados de cães do Estado do Rio de Janeiro, no período entre 2015 e 2017.Subsequentemente a identificação por espectrometria de massas pordessorção/ionização a laser assistida por matriz com analisador por tempo de voo(MALDI-TOF MS), um total de 115 amostras de NEfc-Efm, Enterococcus gallinarum (n:48), Enterococcus casseliflavus (n= 17), Enterococcus hirae (n= 17), Enterococcusavium (n= 14), Enterococcus canintestini (n= 9), Enterococcus raffinosus (n= 9) eEnterococcus canis (n= 1) foram incluídas no estudo. O perfil fenotípico de resistênciaaos antimicrobianos foi determinado pelo método de disco-difusão para 16antimicrobianos pertencentes às classes dos glicopeptídeos, aminoglicosídeos, beta-lactâmicos, macrolídeos, fenicol, quinolonas, tetraciclinas e oxazolidinona e outros.Também foi investigada a concentração mínima inibitória pelo E-test para vancomicina elinezolida para amostras não susceptíveis a estes antimicrobianos. Foram pesquisados14 genes de resistência pela reação em cadeia da polimerase (PCR) nas amostras nãosusceptíveis aos antimicrobianos testados por disco-difusão. A presença dos genes devirulência cylA (citolisina), esp (proteína de superfície enterocócica), asa1 (substânciade agregação), gelE (gelatinase) e hyl (glicosil hidrolase) também foi investigada por suadetecção direta por PCR. A maior taxa de resistência foi observada para rifampicina(38%), tetraciclina (26%) e eritromicina (16%). Para a maioria dos antimicrobianostestados, as taxas de resistência foram inferiores a 5%. Não foram observadas amostrasresistentes à gentamicina e linezolida. E. raffinosus apresentou o maior percentual deamostras com perfis de multirresistência (56%), seguido de E. canintestini (22%) e E.gallinarum (13%). Nesta espécie, foram detectados os genes ant(6)-Ia (6%), erm(B)(6%), tet(L) (14%) e tet(M) (22%). Também foram detectados os genes tet(L) (17%) etet(M) (11%) em amostras de E. hirae, tet(M) de E. avium (7%) e de E. raffinosus (11%).Os genes de virulência investigados foram detectados em amostras de E. gallinarum[hyl (2%) e gelE (6%)], E. avium [asa1 (7%) e esp (42%)], E. canintestini [esp (44%)] eE. raffinosus [esp (33%)]. Apesar de ter sido encontrada uma baixa frequência deresistência aos antimicrobianos usados no tratamento de infecções enterocócicas, alémde um pequeno número de amostras com genes de resistência e virulência em espéciesNEfc-NEfm isoladas de cães, o monitoramento contínuo animais domésticos são deextrema importância, pois há pouco conhecimento sobre as características deresistência e virulência de amostras de NEfc-NEfm de cães e seu risco potencial parahumanos
id UFF-2_7fc6f133941c53afeb1c3140b7e5c524
oai_identifier_str oai:app.uff.br:1/27110
network_acronym_str UFF-2
network_name_str Repositório Institucional da Universidade Federal Fluminense (RIUFF)
repository_id_str 2120
spelling Perfis de resistência a antimicrobianos e virulência de amostras de Enterococcus spp. isoladas da microbiota intestinal de cães domiciliados na região metropolitana no Estado do Rio de JaneiroEnterococcusColonizaçãoCãoResistência a antimicrobianosVirulênciaEnterococcusFarmacorresistência bacterianaVirulênciaCãoEnterococcusColonizationDogAntimicrobial resistanceVirulenceEnterococcus spp. são membros comuns da microbiota intestinal humana e animal.Além de Enterococcus faecalis (Efc) e Enterococcus faecium (Efm), outras espécies nãoE. faecalis ou E. faecium (NEfc-Efm) têm sido responsáveis por infecções relacionadasà assistência em saúde (IRAS). Além disso, cepas de NEfc-Efm também foramidentificadas em animais, tal fato é preocupante, pois o contato próximo entre humanose animais pode permitir a transmissão interespécie de cepas multirresistentes compotencial patogênico. Desta forma, o presente estudo tem como objetivos de investigaros perfis de resistência aos antimicrobianos e a virulência de amostras de NEfc-Efm deorigem canina isoladas da microbiota intestinal. Para o estudo, 260 swabs retais foramcoletados de cães do Estado do Rio de Janeiro, no período entre 2015 e 2017.Subsequentemente a identificação por espectrometria de massas pordessorção/ionização a laser assistida por matriz com analisador por tempo de voo(MALDI-TOF MS), um total de 115 amostras de NEfc-Efm, Enterococcus gallinarum (n:48), Enterococcus casseliflavus (n= 17), Enterococcus hirae (n= 17), Enterococcusavium (n= 14), Enterococcus canintestini (n= 9), Enterococcus raffinosus (n= 9) eEnterococcus canis (n= 1) foram incluídas no estudo. O perfil fenotípico de resistênciaaos antimicrobianos foi determinado pelo método de disco-difusão para 16antimicrobianos pertencentes às classes dos glicopeptídeos, aminoglicosídeos, beta-lactâmicos, macrolídeos, fenicol, quinolonas, tetraciclinas e oxazolidinona e outros.Também foi investigada a concentração mínima inibitória pelo E-test para vancomicina elinezolida para amostras não susceptíveis a estes antimicrobianos. Foram pesquisados14 genes de resistência pela reação em cadeia da polimerase (PCR) nas amostras nãosusceptíveis aos antimicrobianos testados por disco-difusão. A presença dos genes devirulência cylA (citolisina), esp (proteína de superfície enterocócica), asa1 (substânciade agregação), gelE (gelatinase) e hyl (glicosil hidrolase) também foi investigada por suadetecção direta por PCR. A maior taxa de resistência foi observada para rifampicina(38%), tetraciclina (26%) e eritromicina (16%). Para a maioria dos antimicrobianostestados, as taxas de resistência foram inferiores a 5%. Não foram observadas amostrasresistentes à gentamicina e linezolida. E. raffinosus apresentou o maior percentual deamostras com perfis de multirresistência (56%), seguido de E. canintestini (22%) e E.gallinarum (13%). Nesta espécie, foram detectados os genes ant(6)-Ia (6%), erm(B)(6%), tet(L) (14%) e tet(M) (22%). Também foram detectados os genes tet(L) (17%) etet(M) (11%) em amostras de E. hirae, tet(M) de E. avium (7%) e de E. raffinosus (11%).Os genes de virulência investigados foram detectados em amostras de E. gallinarum[hyl (2%) e gelE (6%)], E. avium [asa1 (7%) e esp (42%)], E. canintestini [esp (44%)] eE. raffinosus [esp (33%)]. Apesar de ter sido encontrada uma baixa frequência deresistência aos antimicrobianos usados no tratamento de infecções enterocócicas, alémde um pequeno número de amostras com genes de resistência e virulência em espéciesNEfc-NEfm isoladas de cães, o monitoramento contínuo animais domésticos são deextrema importância, pois há pouco conhecimento sobre as características deresistência e virulência de amostras de NEfc-NEfm de cães e seu risco potencial parahumanosCoordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível SuperiorConselho Nacional de Desenvolvimento Científico e TecnológicoEnterococcus spp.are common members of the human and animal gut microbiota. Inaddition to Enterococcus faecalis (Efc) and Enterococcus faecium (Efm), other speciesno E. faecalis and E. faecium (NEfc-Efm) have been responsible for associated healthcare (HAI). Furthermore, NEfc-Efm strains have also been identified in animals, which isworrisome, as close contact between humans and animals may allow interspeciestransmission of multidrug-resistant strains with pathogenic potential. Therefore, thepresent study aims to investigate the antimicrobial resistance profiles and virulence of asample of NEfc-Efm of origin that can be isolated from the intestinal microbiota.Subsequent identification by matrix-assisted laser desorption/ionization massspectrometry with time-of-flight analyzer (MALDI-TOF MS), a total of 115 samples ofNEfc-Efm, Enterococcus gallinarum (n= 48), Enterococcus casseliflavus (n= 17),Enterococcus hirae (n= 17), Enterococcus avium (n= 14), Enterococcus canintestini (n=9), Enterococcus raffinosus (n= 9) and Enterococcus canis (n= 1) were included in thestudy. The phenotypic profile of antimicrobial resistance was determined by the disk-diffusion method for 16 antimicrobial agents belonging to the classes of glycopeptides,aminoglycosides, beta-lactams, macrolides, phenicol, quinolones, tetracyclines andoxazolidinone and others. The minimum inhibitory concentration by E-test forvancomycin and linezolid for a sample not susceptible to antimicrobials was alsoinvestigated. Fourteen resistance genes were determined by polymerase chain reaction(PCR) screening in non-antimicrobial samples tested by disk diffusion. The presence ofvirulence genes cylA (cytolysin), esp (enterococcal surface protein), asa1 (aggregationsubstance), gelE (gelatinase) and hyl (glycosyl hydrolase) was also investigated for itsdirect detection by PCR. The highest resistance rate was observed for rifampicin (38%),tetracycline (26%) and erythromycin (16%). For most antimicrobials tested the resistancerates were less than 5%. Resistance to gentamicin and linezolid was not observed.E.raffinosus had the highest percentage of samples with multidrug resistance profiles(56%), followed by E. canintestini (22%) and E. gallinarum (13%). In this species, thegenes ant(6)-Ia (6%), erm(B)(6%), tet(L)(14%) and tet(M)(22%) were detected.Thegenes tet(L) (17%) and tet(M) (11%) were also detected in samples of E. hirae, tet(M) ofE. avium (7%) and E. raffinosus (11%). The investigated virulence genes were found inisolate of E. gallinarum [hyl (2%) and gelE (6%)], E. avium [asa1 (7%) and esp (42%) ],E. canintestini [esp (44%)]and E. raffinosus [esp (33%)]. Despite a low frequency ofresistance to antimicrobials used in the treatment of enterococcal infections, in additionto a small number of samples with resistance and virulence genes in NEfc-NEfm speciesisolated from dogs, continuous monitoring of domestic animals is extremely important, asthere is little knowledge about the resistance and virulence characteristics of NEfc-NEfmisolate from dogs and their potential risk to humans98 f.Neves, Felipe Piedade Gonçalveshttp://lattes.cnpq.br/5289973921789746Rabello, Renata Fernandeshttp://lattes.cnpq.br/5848374921522741Andrade, Laura Maria deSilva, Márcia Ribeiro Pinto dahttp://lattes.cnpq.br/0275917863369590Sabino, Hellen dos Santos2022-11-29T18:29:27Z2022-11-29T18:29:27Zinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdfhttp://app.uff.br/riuff/handle/1/27110http://dx.doi.org/10.22409/PPGMPA.2022.m.12888428725CC-BY-SAinfo:eu-repo/semantics/openAccessporreponame:Repositório Institucional da Universidade Federal Fluminense (RIUFF)instname:Universidade Federal Fluminense (UFF)instacron:UFF2022-11-29T18:29:32Zoai:app.uff.br:1/27110Repositório InstitucionalPUBhttps://app.uff.br/oai/requestriuff@id.uff.bropendoar:21202022-11-29T18:29:32Repositório Institucional da Universidade Federal Fluminense (RIUFF) - Universidade Federal Fluminense (UFF)false
dc.title.none.fl_str_mv Perfis de resistência a antimicrobianos e virulência de amostras de Enterococcus spp. isoladas da microbiota intestinal de cães domiciliados na região metropolitana no Estado do Rio de Janeiro
title Perfis de resistência a antimicrobianos e virulência de amostras de Enterococcus spp. isoladas da microbiota intestinal de cães domiciliados na região metropolitana no Estado do Rio de Janeiro
spellingShingle Perfis de resistência a antimicrobianos e virulência de amostras de Enterococcus spp. isoladas da microbiota intestinal de cães domiciliados na região metropolitana no Estado do Rio de Janeiro
Sabino, Hellen dos Santos
Enterococcus
Colonização
Cão
Resistência a antimicrobianos
Virulência
Enterococcus
Farmacorresistência bacteriana
Virulência
Cão
Enterococcus
Colonization
Dog
Antimicrobial resistance
Virulence
title_short Perfis de resistência a antimicrobianos e virulência de amostras de Enterococcus spp. isoladas da microbiota intestinal de cães domiciliados na região metropolitana no Estado do Rio de Janeiro
title_full Perfis de resistência a antimicrobianos e virulência de amostras de Enterococcus spp. isoladas da microbiota intestinal de cães domiciliados na região metropolitana no Estado do Rio de Janeiro
title_fullStr Perfis de resistência a antimicrobianos e virulência de amostras de Enterococcus spp. isoladas da microbiota intestinal de cães domiciliados na região metropolitana no Estado do Rio de Janeiro
title_full_unstemmed Perfis de resistência a antimicrobianos e virulência de amostras de Enterococcus spp. isoladas da microbiota intestinal de cães domiciliados na região metropolitana no Estado do Rio de Janeiro
title_sort Perfis de resistência a antimicrobianos e virulência de amostras de Enterococcus spp. isoladas da microbiota intestinal de cães domiciliados na região metropolitana no Estado do Rio de Janeiro
author Sabino, Hellen dos Santos
author_facet Sabino, Hellen dos Santos
author_role author
dc.contributor.none.fl_str_mv Neves, Felipe Piedade Gonçalves
http://lattes.cnpq.br/5289973921789746
Rabello, Renata Fernandes
http://lattes.cnpq.br/5848374921522741
Andrade, Laura Maria de
Silva, Márcia Ribeiro Pinto da
http://lattes.cnpq.br/0275917863369590
dc.contributor.author.fl_str_mv Sabino, Hellen dos Santos
dc.subject.por.fl_str_mv Enterococcus
Colonização
Cão
Resistência a antimicrobianos
Virulência
Enterococcus
Farmacorresistência bacteriana
Virulência
Cão
Enterococcus
Colonization
Dog
Antimicrobial resistance
Virulence
topic Enterococcus
Colonização
Cão
Resistência a antimicrobianos
Virulência
Enterococcus
Farmacorresistência bacteriana
Virulência
Cão
Enterococcus
Colonization
Dog
Antimicrobial resistance
Virulence
description Enterococcus spp. são membros comuns da microbiota intestinal humana e animal.Além de Enterococcus faecalis (Efc) e Enterococcus faecium (Efm), outras espécies nãoE. faecalis ou E. faecium (NEfc-Efm) têm sido responsáveis por infecções relacionadasà assistência em saúde (IRAS). Além disso, cepas de NEfc-Efm também foramidentificadas em animais, tal fato é preocupante, pois o contato próximo entre humanose animais pode permitir a transmissão interespécie de cepas multirresistentes compotencial patogênico. Desta forma, o presente estudo tem como objetivos de investigaros perfis de resistência aos antimicrobianos e a virulência de amostras de NEfc-Efm deorigem canina isoladas da microbiota intestinal. Para o estudo, 260 swabs retais foramcoletados de cães do Estado do Rio de Janeiro, no período entre 2015 e 2017.Subsequentemente a identificação por espectrometria de massas pordessorção/ionização a laser assistida por matriz com analisador por tempo de voo(MALDI-TOF MS), um total de 115 amostras de NEfc-Efm, Enterococcus gallinarum (n:48), Enterococcus casseliflavus (n= 17), Enterococcus hirae (n= 17), Enterococcusavium (n= 14), Enterococcus canintestini (n= 9), Enterococcus raffinosus (n= 9) eEnterococcus canis (n= 1) foram incluídas no estudo. O perfil fenotípico de resistênciaaos antimicrobianos foi determinado pelo método de disco-difusão para 16antimicrobianos pertencentes às classes dos glicopeptídeos, aminoglicosídeos, beta-lactâmicos, macrolídeos, fenicol, quinolonas, tetraciclinas e oxazolidinona e outros.Também foi investigada a concentração mínima inibitória pelo E-test para vancomicina elinezolida para amostras não susceptíveis a estes antimicrobianos. Foram pesquisados14 genes de resistência pela reação em cadeia da polimerase (PCR) nas amostras nãosusceptíveis aos antimicrobianos testados por disco-difusão. A presença dos genes devirulência cylA (citolisina), esp (proteína de superfície enterocócica), asa1 (substânciade agregação), gelE (gelatinase) e hyl (glicosil hidrolase) também foi investigada por suadetecção direta por PCR. A maior taxa de resistência foi observada para rifampicina(38%), tetraciclina (26%) e eritromicina (16%). Para a maioria dos antimicrobianostestados, as taxas de resistência foram inferiores a 5%. Não foram observadas amostrasresistentes à gentamicina e linezolida. E. raffinosus apresentou o maior percentual deamostras com perfis de multirresistência (56%), seguido de E. canintestini (22%) e E.gallinarum (13%). Nesta espécie, foram detectados os genes ant(6)-Ia (6%), erm(B)(6%), tet(L) (14%) e tet(M) (22%). Também foram detectados os genes tet(L) (17%) etet(M) (11%) em amostras de E. hirae, tet(M) de E. avium (7%) e de E. raffinosus (11%).Os genes de virulência investigados foram detectados em amostras de E. gallinarum[hyl (2%) e gelE (6%)], E. avium [asa1 (7%) e esp (42%)], E. canintestini [esp (44%)] eE. raffinosus [esp (33%)]. Apesar de ter sido encontrada uma baixa frequência deresistência aos antimicrobianos usados no tratamento de infecções enterocócicas, alémde um pequeno número de amostras com genes de resistência e virulência em espéciesNEfc-NEfm isoladas de cães, o monitoramento contínuo animais domésticos são deextrema importância, pois há pouco conhecimento sobre as características deresistência e virulência de amostras de NEfc-NEfm de cães e seu risco potencial parahumanos
publishDate 2022
dc.date.none.fl_str_mv 2022-11-29T18:29:27Z
2022-11-29T18:29:27Z
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/masterThesis
format masterThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv http://app.uff.br/riuff/handle/1/27110
http://dx.doi.org/10.22409/PPGMPA.2022.m.12888428725
url http://app.uff.br/riuff/handle/1/27110
http://dx.doi.org/10.22409/PPGMPA.2022.m.12888428725
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.rights.driver.fl_str_mv CC-BY-SA
info:eu-repo/semantics/openAccess
rights_invalid_str_mv CC-BY-SA
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Repositório Institucional da Universidade Federal Fluminense (RIUFF)
instname:Universidade Federal Fluminense (UFF)
instacron:UFF
instname_str Universidade Federal Fluminense (UFF)
instacron_str UFF
institution UFF
reponame_str Repositório Institucional da Universidade Federal Fluminense (RIUFF)
collection Repositório Institucional da Universidade Federal Fluminense (RIUFF)
repository.name.fl_str_mv Repositório Institucional da Universidade Federal Fluminense (RIUFF) - Universidade Federal Fluminense (UFF)
repository.mail.fl_str_mv riuff@id.uff.br
_version_ 1802135277922156544