Análise e proposta de um sistema para validar a quantificação de proteoformas

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Pacheco, Bruno Gorini de Araujo Passos
Data de Publicação: 2023
Outros Autores: Seckler, Carolina dos Santos
Tipo de documento: Trabalho de conclusão de curso
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Institucional da Universidade Federal Fluminense (RIUFF)
Texto Completo: http://app.uff.br/riuff/handle/1/30662
Resumo: A Biologia Molecular estuda a estrutura e função do material genético e seus produtos de expressão, as proteínas. Cada proteína codificada por um único gene pode ser encontrada em diversas formas moleculares, denominadas proteoformas. Tais moléculas são estudadas com o auxílio de aparelhos conhecidos como Cromatógrafo e Espectrômetro de Massa, que geram uma série de dados com o objetivo de descobrir a quantidade de cada proteoforma na amostra analisada. Atualmente, não existem sistemas estabelecidos e disseminados para quantificação dirigida de proteoformas. Uma alternativa comum é analisar manualmente os dados gerados para validar a qualidade e especificidade da quantificação de cada proteoforma. Para cada amostragem, são geradas uma ou mais centenas de dados espectrométricos. Estuda-se normalmente de cinco a 20 proteoformas por projeto. Dessa forma, são analisados milhares de gráficos por amostragem de maneira manual. O objetivo deste trabalho é propor um sistema que auxilie nesse processo de validação, verificando vários arquivos de saída do Espectrômetro de Massa por vez e gerando gráficos a partir das tabelas inseridas para melhorar a visualização dos resultados e permitir um ajuste fino nos parâmetros de seleção dos dados
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