Diversidade Genética e estrutura espacial intrapopulacional em Tibouchina papyrus(POHL) Toledo utilizando marcadores microssatélites.

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: LIMA, Jacqueline de Souza
Data de Publicação: 2011
Tipo de documento: Dissertação
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Institucional da UFG
Texto Completo: http://repositorio.bc.ufg.br/tede/handle/tde/2555
Resumo: Tibouchina papyrus is a Melastomataceae endemic to the Cerrado. It has a disjunct distribution, restricted to campos rupestres . Therefore, it can be considered a model species, helping guide Cerrado endemic plant studies. Thus, this study aimed to characterize genetic variability in microsatellite regions of T. papyrus genome and use spatial statistical analysis methods to assess genetic diversity and structure in disjunct populations. Individuals were georeferenced and leaf samples were taken from the localities of Serra dos Pirineus (216), Serra Dourada (66) and Serra de Natividade (192). In order to obtain the genotypes, we used ten microsatellite loci that were developed for T. papyrus. The locus showed a mean of 3,4 alleles and a large number of private alleles was detected (19 in total) at the populations studied. Values (f) significant were observed for two populations, indicating that populations not are following the proportions expected by Hardy-Weinberg. The global  value is significant and equal to 0.712, showing a high differentiation among the three populations studied. Thus, the three populations of T. papyrus can be treated as three different ESUs. Spatial genetic structure was weak for two populations, with low levels of SP. The low SGS corroborates the hypothesis that wind-dispersed species present no SGS due to long distance gene flow because of seed dispersal. This is plausible for T. papyrus, which is a wind-dispersed species. Despite the low intra-population SGS found in two populations, based on the relationship between kinship and distance, significant positive values were observed for the some distance class, indicating higher values for the relationship between these individuals. The intercept of the correlogram for each population may indicate the minimum distance where it is more likely that sampled individuals are less similar, which is an information applicable for the management of T. papyrus populations. Based on genetic data, it was evident that the three T. papyrus populations must be preserved, because each one contains a number of unique genetic variability that is not shared between them. Thus, theoretically it is possible to maintain the evolutionary potential of this species and to avoid local extinction in only three regions where it occurs.
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spelling TELLES, Mariana Pires de Camposhttp://lattes.cnpq.br/4648436798023532http://lattes.cnpq.br/1450876784962364LIMA, Jacqueline de Souza2014-07-29T16:21:16Z2011-05-262011-02-25LIMA, Jacqueline de Souza. Genetic Diversity and Spacial Genetic Strutuce in Tibouchina papyrus (POH) using microsatellite markers.. 2011. 64 f. Dissertação (Mestrado em Ciências Biológicas - Biologia) - Universidade Federal de Goiás, Goiânia, 2011.http://repositorio.bc.ufg.br/tede/handle/tde/2555Tibouchina papyrus is a Melastomataceae endemic to the Cerrado. It has a disjunct distribution, restricted to campos rupestres . Therefore, it can be considered a model species, helping guide Cerrado endemic plant studies. Thus, this study aimed to characterize genetic variability in microsatellite regions of T. papyrus genome and use spatial statistical analysis methods to assess genetic diversity and structure in disjunct populations. Individuals were georeferenced and leaf samples were taken from the localities of Serra dos Pirineus (216), Serra Dourada (66) and Serra de Natividade (192). In order to obtain the genotypes, we used ten microsatellite loci that were developed for T. papyrus. The locus showed a mean of 3,4 alleles and a large number of private alleles was detected (19 in total) at the populations studied. Values (f) significant were observed for two populations, indicating that populations not are following the proportions expected by Hardy-Weinberg. The global  value is significant and equal to 0.712, showing a high differentiation among the three populations studied. Thus, the three populations of T. papyrus can be treated as three different ESUs. Spatial genetic structure was weak for two populations, with low levels of SP. The low SGS corroborates the hypothesis that wind-dispersed species present no SGS due to long distance gene flow because of seed dispersal. This is plausible for T. papyrus, which is a wind-dispersed species. Despite the low intra-population SGS found in two populations, based on the relationship between kinship and distance, significant positive values were observed for the some distance class, indicating higher values for the relationship between these individuals. The intercept of the correlogram for each population may indicate the minimum distance where it is more likely that sampled individuals are less similar, which is an information applicable for the management of T. papyrus populations. Based on genetic data, it was evident that the three T. papyrus populations must be preserved, because each one contains a number of unique genetic variability that is not shared between them. Thus, theoretically it is possible to maintain the evolutionary potential of this species and to avoid local extinction in only three regions where it occurs.Tibouchina papyrus é uma Melastomataceae endêmica do Cerrado que possui distribuição disjunta e restrita aos campos rupestres, com essas características peculiares ela pode ser considerada modelo de espécie, auxiliando em estudos de outras plantas do Cerrado que exibem o mesmo conjunto de características. Neste sentido, o objetivo desse trabalho foi caracterizar a variabilidade genética existente em regiões microssatélites do genoma de T. papyrus e utilizar metodologias de análise estatística espacial para avaliar a diversidade e a estrutura genética nas três subpopulações disjuntas da espécie. Foram amostradas folhas e georreferenciados indivíduos nas Serras dos Pirineus (216) Serra Dourada (66) e Serra de Natividade (192). Para a obtenção dos genótipos foram utilizados dez locos microssatélites desenvolvidos para a espécie. Os dez locos produziram uma média de 3,4 alelos e foi detectado um grande número de alelos privados (19 no total) nas três subpopulações avaliadas. Foi observados valores de (f) significativos em duas subpopulações, indicando que estas subpopulações não estão seguindo as proporções esperadas para o equilíbrio de Hardy-Weinberg. O valor global de θ foi significativo e igual a 0,712, apresentando uma altíssima divergência genética entre as subpopulações. Sendo assim, as três subpopulações de T. papyrus podem ser tratadas como três diferentes ESUs. A estrutura genética espacial intrapopulacional apresentou-se fraca em duas subpopulações, com baixos níveis de SP. A existência de autocorrelação espacial pouco intensa corrobora com a hipótese de que espécies com dispersão pelo vento não exiba esta estrutura, em função do fluxo gênico causado pela dispersão de sementes em longas distâncias. Isso é plausível para T. papyrus, que apresenta dispersão por anemocoria. Apesar da fraca EGE intrapopulacional encontrada em duas subpopulações, baseado nos correlogramas de parentesco, foram observados valores positivos e significativos nas primeiras classes de distância, indicando um maior grau de parentesco entre esses indivíduos. O intercepto do correlograma para cada uma das subpopulações pode indicar o distanciamento mínimo onde é mais provável amostrar indivíduos menos semelhantes, que é uma informação relevante para o manejo das subpopulações da espécie T. papyrus. Com base nos dados genéticos obtidos ficou evidente que as três subpopulações da espécie T. papyrus devem ser conservadas, pois cada uma contém uma quantidade de variabilidade genética única que não é compartilhada entre elas. Sendo assim, teoricamente torna-se possível a manutenção do potencial evolutivo da espécie e evita a extinção local nas três únicas regiões de ocorrência natural da espécie.Made available in DSpace on 2014-07-29T16:21:16Z (GMT). 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Pau-papelEGE, microsatellite, wood-paperCNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS::GENETICADiversidade Genética e estrutura espacial intrapopulacional em Tibouchina papyrus(POHL) Toledo utilizando marcadores microssatélites.Genetic Diversity and Spacial Genetic Strutuce in Tibouchina papyrus (POH) using microsatellite markers.info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da UFGinstname:Universidade Federal de Goiás (UFG)instacron:UFGORIGINALDissertacao Jacqueline (final).pdfapplication/pdf503234http://repositorio.bc.ufg.br/tede/bitstreams/600b6307-bf9c-4fe1-891e-bb3a144b849d/downloadcbbe7d056e9c71e1218bf7062ca9a262MD51THUMBNAILDissertacao Jacqueline (final).pdf.jpgDissertacao Jacqueline (final).pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg3994http://repositorio.bc.ufg.br/tede/bitstreams/9038fd99-3636-4c67-b3f8-5aa418489610/download46c22af166130cf1870ed5af6f5e15f7MD52tde/25552014-07-30 03:21:27.138open.accessoai:repositorio.bc.ufg.br:tde/2555http://repositorio.bc.ufg.br/tedeRepositório InstitucionalPUBhttp://repositorio.bc.ufg.br/oai/requesttasesdissertacoes.bc@ufg.bropendoar:2014-07-30T06:21:27Repositório Institucional da UFG - Universidade Federal de Goiás (UFG)false
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description Tibouchina papyrus is a Melastomataceae endemic to the Cerrado. It has a disjunct distribution, restricted to campos rupestres . Therefore, it can be considered a model species, helping guide Cerrado endemic plant studies. Thus, this study aimed to characterize genetic variability in microsatellite regions of T. papyrus genome and use spatial statistical analysis methods to assess genetic diversity and structure in disjunct populations. Individuals were georeferenced and leaf samples were taken from the localities of Serra dos Pirineus (216), Serra Dourada (66) and Serra de Natividade (192). In order to obtain the genotypes, we used ten microsatellite loci that were developed for T. papyrus. The locus showed a mean of 3,4 alleles and a large number of private alleles was detected (19 in total) at the populations studied. Values (f) significant were observed for two populations, indicating that populations not are following the proportions expected by Hardy-Weinberg. The global  value is significant and equal to 0.712, showing a high differentiation among the three populations studied. Thus, the three populations of T. papyrus can be treated as three different ESUs. Spatial genetic structure was weak for two populations, with low levels of SP. The low SGS corroborates the hypothesis that wind-dispersed species present no SGS due to long distance gene flow because of seed dispersal. This is plausible for T. papyrus, which is a wind-dispersed species. Despite the low intra-population SGS found in two populations, based on the relationship between kinship and distance, significant positive values were observed for the some distance class, indicating higher values for the relationship between these individuals. The intercept of the correlogram for each population may indicate the minimum distance where it is more likely that sampled individuals are less similar, which is an information applicable for the management of T. papyrus populations. Based on genetic data, it was evident that the three T. papyrus populations must be preserved, because each one contains a number of unique genetic variability that is not shared between them. Thus, theoretically it is possible to maintain the evolutionary potential of this species and to avoid local extinction in only three regions where it occurs.
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