Análise de genes de resistência no transcriptoma de Panicum maximum Cv. tamani

• Autor(a) principal: Andrade, Thayná Cristina Stofel
• Data de Publicação: 2018
• Tipo de documento: Trabalho de conclusão de curso
• Idioma: por
• Título da fonte: Repositório Institucional da UFGD
• Texto Completo: http://repositorio.ufgd.edu.br/jspui/handle/prefix/3017
• topic: Panicum maximum; CNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS; Planta forrageira; Estresse hídrico; Feed crops; Drought stress

As espécies do gênero Panicum englobam importantes forrageiras que se destacam no Brasil, devido a alta produtividade, capacidade de adaptação ao pastejo, a condições ambientais e ao manejo, principalmente em áreas cultivadas. Essa alta capacidade de adaptação é de grande importância para a comunidade científica, principalmente em condições de estresse, pois revela genes que podem ser usados para transformação genética. O estresse hídrico pode apresentar impactos significativos no crescimento e desenvolvimento das plantas. Os genes que são expressos nessas condições, podem ser analisados através da bioinformática, que é uma ferramenta que possibilita diferentes análises como a transcriptômica. Com o presente trabalho, objetivou-se buscar genes de resistência a doenças em P. maximum através da transcriptômica, levantando os domínios e classes de proteínas de resistência e fazendo a modelagem 3D de proteínas com os domínios encontrados. Isso foi feito realizando um alinhamento local dos transcritos, organizando os resultados em um banco de dados. Em seguida, foi realizado um levantamento de domínios e classes de resistência, seguido da modelagem 3D. A partir da condição fisiológica de estresse hídrico de Panicum maximum foi verificado a presença de 8 diferentes domínios de proteínas relacionadas à resistência, sendo os domínios mais expressivos Serina-Treonina-Quinase, NBS e LRR. Observou-se a expressão de 10 diferentes classes de proteínas relacionadas à resistência, sendo as classes mais expressivas RLP, NL e CNL; e foi observado similaridade das sequências de resistência entre Panicum maximum e 13 diferentes espécies, sendo as espécies com mais sequências similares Setaria italica, Panicum virgatum e Sorghum bicolor. A modelagem 3D de proteínas de cada domínio observado possibilitou uma compreensão maior das funções de cada uma das proteínas modeladas, tendo como resultado modelos com um alto padrão de qualidade.