Prevalência e caracterização molecular de enterobacterales resistentes a carbapenêmicos em pacientes de um hospital público de referência em uma região não metropolitana do Brasil durante e após a pandemia de SARS-CoV-2
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Data de Publicação: | 2024 |
Tipo de documento: | Dissertação |
Idioma: | por |
Título da fonte: | Repositório Institucional da UFJF |
Texto Completo: | https://repositorio.ufjf.br/jspui/handle/ufjf/16678 |
Resumo: | A resistência antimicrobiana (RAM) é uma ameaça global crítica, e as Enterobacterales resistentes a carbapenêmicos (ERC) representam uma preocupação significativa devido às opções terapêuticas limitadas. Este estudo transversal retrospectivo investigou a prevalência de genes de carbapenemase (blaKPC, blaOXA-48, blaNDM, blaVIM e blaIMP) em linhagens de ERC isoladas de aspirados traqueais de pacientes em um hospital universitário na Zona da Mata Mineira, no período de janeiro de 2020 a agosto de 2023. A identificação dos isolados bacterianos foi realizada por espectrometria de massa por ionização/dessorção em matriz assistida por laser (MALDI-TOF), enquanto a detecção dos genes de carbapenemase ocorreu por meio da Reação da Cadeia da Polimerase em Tempo Real (qPCR). Das 1.133 amostras de aspirados traqueais analisadas, 111 (9,79%) apresentaram crescimento de ERC. Após confirmação bacteriana e análise de prontuários, 46 isolados, provenientes do mesmo número de pacientes, foram incluídos na amostra final, mostrando predominância de Klebsiella pneumoniae (65,21%) e Serratia marcescens (19,57%). O gene blaKPC foi identificado como prevalente (78,26%), enquanto o blaNDM foi encontrado em 21,74% dos isolados; os genes blaVIM, blaIMP e blaOXA-48 não foram identificados. A análise demográfica e de dados hospitalares revelou uma população predominantemente masculina (67,39%), idosa (69,57%), autodeclarada branca (56,52%), não casada (63,04%) e com baixa escolaridade (56,52%). A maioria dos pacientes (69,57%) encontrava-se na Unidade de Terapia Intensiva e permaneceu mais de 30 dias no hospital (76,08%). A infecção por COVID-19 foi registrada em 34,78% dos casos. Houve uma tendência inversamente significativa entre a prevalência de Klebsiella pneumoniae e faixa etária (p = 0,045), bem como uma tendência linear direta entre as proporções de ERC que carregam o gene blaNDM e a tendência anual do aumento do número de casos novos de COVID-19 no Brasil (p = 0,050). Além disso, este estudo encontrou uma probabilidade significativamente elevada de encontrar bactérias Não Klebsiella pneumoniae em pacientes com tempo de permanência hospitalar prolongado, independente do resultado de COVID-19 (p = 0,006) e do tipo de gene de resistência (p = 0,020). Este estudo destaca a prevalência persistente de ERC, principalmente com o gene blaKPC, resultado este que serve para apoiar as ações de vigilância em saúde e apoiar políticas públicas com medidas de controle para enfrentar a RAM, uma crise que pode ser considerada uma das maiores pandemias mundiais. |
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Este estudo transversal retrospectivo investigou a prevalência de genes de carbapenemase (blaKPC, blaOXA-48, blaNDM, blaVIM e blaIMP) em linhagens de ERC isoladas de aspirados traqueais de pacientes em um hospital universitário na Zona da Mata Mineira, no período de janeiro de 2020 a agosto de 2023. A identificação dos isolados bacterianos foi realizada por espectrometria de massa por ionização/dessorção em matriz assistida por laser (MALDI-TOF), enquanto a detecção dos genes de carbapenemase ocorreu por meio da Reação da Cadeia da Polimerase em Tempo Real (qPCR). Das 1.133 amostras de aspirados traqueais analisadas, 111 (9,79%) apresentaram crescimento de ERC. Após confirmação bacteriana e análise de prontuários, 46 isolados, provenientes do mesmo número de pacientes, foram incluídos na amostra final, mostrando predominância de Klebsiella pneumoniae (65,21%) e Serratia marcescens (19,57%). 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Além disso, este estudo encontrou uma probabilidade significativamente elevada de encontrar bactérias Não Klebsiella pneumoniae em pacientes com tempo de permanência hospitalar prolongado, independente do resultado de COVID-19 (p = 0,006) e do tipo de gene de resistência (p = 0,020). Este estudo destaca a prevalência persistente de ERC, principalmente com o gene blaKPC, resultado este que serve para apoiar as ações de vigilância em saúde e apoiar políticas públicas com medidas de controle para enfrentar a RAM, uma crise que pode ser considerada uma das maiores pandemias mundiais.Antimicrobial resistance (AMR) poses a critical global threat, and CarbapenemResistant Enterobacterales (CRE) are of significant concern due to limited therapeutic options. This retrospective cross-sectional study investigated the prevalence of carbapenemase genes (blaKPC, blaOXA-48, blaNDM, blaVIM, and blaIMP) in CRE strains isolated from tracheal aspirates of patients in a university hospital in the Zona da Mata Mineira region, from January 2020 to August 2023. The identification of bacterial isolates was performed using Matrix-Assisted Laser Desorption/Ionization Time-of-Flight Mass Spectrometry (MALDI-TOF), while carbapenemase gene detection was carried out through Real-Time Polymerase Chain Reaction (qPCR). Among the 1,133 analyzed tracheal aspirate samples, 111 (9.79%) showed CRE growth. Following bacterial confirmation and chart analysis, 46 isolates from an equal number of patients were included in the final sample, with a predominance of Klebsiella pneumoniae (65.21%) and Serratia marcescens (19.57%). The blaKPC gene was prevalent (78.26%), while blaNDM was found in 21.74% of isolates; blaVIM, blaIMP, and blaOXA-48 genes were not identified. Demographic and hospital data analysis revealed a predominantly male (67.39%), elderly (69.57%), self-declared white (56.52%), unmarried (63.04%), and low-educated population (56.52%). The majority of patients (69.57%) were admitted to the Intensive Care Unit and remained hospitalized for more than 30 days (76.08%). COVID-19 infection was documented in 34.78% of the cases. Statistical analysis revealed a significantly inverse trend between Klebsiella pneumoniae prevalence and age group (p = 0.045) and a direct linear trend between proportions of CRE carrying the blaNDM gene and the annual trend of new COVID-19 cases in Brazil (p = 0.050). Furthermore, this study found a significantly higher probability of encountering Non-Klebsiella pneumoniae bacteria in patients with prolonged hospital stay, regardless of COVID-19 status (p = 0.006) and type of resistance gene (p = 0.020). This study underscores the persistent prevalence of CRE, particularly those with the blaKPC gene, supporting health surveillance actions and advocating for public policies with control measures to address AMR, a crisis that can be considered one of the greatest global pandemics.porUniversidade Federal de Juiz de Fora (UFJF)Programa de Pós-graduação em Saúde ColetivaUFJFBrasilFaculdade de MedicinaAttribution-NonCommercial-NoDerivs 3.0 Brazilhttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/br/info:eu-repo/semantics/embargoedAccessCNPQ::CIENCIAS DA SAUDE::SAUDE COLETIVAResistência antimicrobianaAspirado traquealKlebsiella pneumoniaeSerratia marcescensBlaKPCBlaNDMAntimicrobial resistanceTracheal aspirateKlebsiella pneumoniaeSerratia marcescensPrevalência e caracterização molecular de enterobacterales resistentes a carbapenêmicos em pacientes de um hospital público de referência em uma região não metropolitana do Brasil durante e após a pandemia de SARS-CoV-2info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisreponame:Repositório Institucional da UFJFinstname:Universidade Federal de Juiz de Fora (UFJF)instacron:UFJFCC-LICENSElicense_rdflicense_rdfapplication/rdf+xml; charset=utf-8811https://repositorio.ufjf.br/jspui/bitstream/ufjf/16678/1/license_rdfe39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34MD51LICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-81748https://repositorio.ufjf.br/jspui/bitstream/ufjf/16678/2/license.txt8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33MD52ufjf/166782024-05-27 16:10:04.284oai:hermes.cpd.ufjf.br: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Repositório InstitucionalPUBhttps://repositorio.ufjf.br/oai/requestopendoar:2024-05-27T19:10:04Repositório Institucional da UFJF - Universidade Federal de Juiz de Fora (UFJF)false |
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Prevalência e caracterização molecular de enterobacterales resistentes a carbapenêmicos em pacientes de um hospital público de referência em uma região não metropolitana do Brasil durante e após a pandemia de SARS-CoV-2 Fochat, Romário Costa CNPQ::CIENCIAS DA SAUDE::SAUDE COLETIVA Resistência antimicrobiana Aspirado traqueal Klebsiella pneumoniae Serratia marcescens BlaKPC BlaNDM Antimicrobial resistance Tracheal aspirate Klebsiella pneumoniae Serratia marcescens |
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