Prospecção de peptídeos antimicrobianos em solo do Cerrado e avaliação de antimicrobianos combinados no controle de Escherichia coli, Klebsiella pneumoniae e Staphylococcus aureus in vitro

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Rios, Thuanny Borba
Data de Publicação: 2020
Tipo de documento: Dissertação
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Institucional da UFJF
Texto Completo: https://repositorio.ufjf.br/jspui/handle/ufjf/11627
Resumo: A resistência bacteriana consiste em uma das maiores ameaças à saúde no mundo, visto que reduz o tratamento efetivo de infecções e aumenta a mortalidade associada a doenças bacterianas comuns. Nesse contexto, a busca por estratégias para o controle de patógenos e da resistência antimicrobiana se faz necessária. Duas das estratégias desenvolvidas para combater esses microrganismos têm sido a terapia combinada de antimicrobianos e a prospecção de peptídeos antimicrobianos. No presente trabalho investigamos a efetividade in vitro de peptídeos prospectados do solo do Cerrado e a efetividade in vitro dos antimicrobianos aceturato de diminazeno, cloranfenicol e estreptomicina sozinhos e em combinação contra isolados clínicos de E. coli, K. pneumoniae e S. aureus. Para bioprospecção, o material foi coletado em solo nativo do Cerrado, as proteínas totais foram extraídas e os peptídeos identificados por LC-MS / MS foram analisados pelos algoritmos sense the moment e CAMP, a fim de prever peptídeos antimicrobianos. De todos os peptídeos com possível atividade antimicrobiana, 7 foram selecionados, sintetizados e testados in vitro como agentes antimicrobianos contra os isolados. Assim como, foi avaliada a atividade in vitro de aceturato de diminazeno, estreptomicina e cloranfenicol contra isolados de bactérias. Os peptídeos sintetizados não demostraram atividade antimicrobiana quando desafiados por bactérias Gram-positivas e Gram-negativas. Sendo assim, para este trabalho, a prospecção in silico, metaproteômica associada aos algoritmos de predição, não se demonstrou um método eficaz para a identificação de peptídeos antimicrobianos. Além disso, para a segunda estratégia de controle, o aceturato demonstrou ser sinérgico com a estreptomicina e o cloranfenicol contra E. coli e K. pneumoniae isoladas de humanos e animais. Contra S. aureus, por outro lado, o efeito sinérgico foi observado apenas na combinação de aceturato e cloranfenicol. Essas combinações de antimicrobianos apresentaram resultados importantes, demonstrando que essa estratégia pode ser utilizada como uma alternativa no controle de patógenos.
id UFJF_602e45e4c8280942cbb3c5c8f22f9714
oai_identifier_str oai:hermes.cpd.ufjf.br:ufjf/11627
network_acronym_str UFJF
network_name_str Repositório Institucional da UFJF
repository_id_str
spelling Franco, Octávio Luizhttp://lattes.cnpq.br/8598274096498065Mehta, Angelahttp://lattes.cnpq.br/0055119344402132Dias, Simoni Camposhttp://lattes.cnpq.br/1564224041415405Santos, Marcelo de Oliveirahttp://lattes.cnpq.br/http://lattes.cnpq.br/8650906869869534Rios, Thuanny Borba2020-08-25T11:51:30Z2020-08-242020-08-25T11:51:30Z2020-05-14https://repositorio.ufjf.br/jspui/handle/ufjf/11627A resistência bacteriana consiste em uma das maiores ameaças à saúde no mundo, visto que reduz o tratamento efetivo de infecções e aumenta a mortalidade associada a doenças bacterianas comuns. Nesse contexto, a busca por estratégias para o controle de patógenos e da resistência antimicrobiana se faz necessária. Duas das estratégias desenvolvidas para combater esses microrganismos têm sido a terapia combinada de antimicrobianos e a prospecção de peptídeos antimicrobianos. No presente trabalho investigamos a efetividade in vitro de peptídeos prospectados do solo do Cerrado e a efetividade in vitro dos antimicrobianos aceturato de diminazeno, cloranfenicol e estreptomicina sozinhos e em combinação contra isolados clínicos de E. coli, K. pneumoniae e S. aureus. Para bioprospecção, o material foi coletado em solo nativo do Cerrado, as proteínas totais foram extraídas e os peptídeos identificados por LC-MS / MS foram analisados pelos algoritmos sense the moment e CAMP, a fim de prever peptídeos antimicrobianos. De todos os peptídeos com possível atividade antimicrobiana, 7 foram selecionados, sintetizados e testados in vitro como agentes antimicrobianos contra os isolados. Assim como, foi avaliada a atividade in vitro de aceturato de diminazeno, estreptomicina e cloranfenicol contra isolados de bactérias. Os peptídeos sintetizados não demostraram atividade antimicrobiana quando desafiados por bactérias Gram-positivas e Gram-negativas. Sendo assim, para este trabalho, a prospecção in silico, metaproteômica associada aos algoritmos de predição, não se demonstrou um método eficaz para a identificação de peptídeos antimicrobianos. Além disso, para a segunda estratégia de controle, o aceturato demonstrou ser sinérgico com a estreptomicina e o cloranfenicol contra E. coli e K. pneumoniae isoladas de humanos e animais. Contra S. aureus, por outro lado, o efeito sinérgico foi observado apenas na combinação de aceturato e cloranfenicol. Essas combinações de antimicrobianos apresentaram resultados importantes, demonstrando que essa estratégia pode ser utilizada como uma alternativa no controle de patógenos.Bacterial resistance is one of the greatest world health threats, reducing the effective infections treatment and increasing mortality associated to common bacterial diseases. In this context, the strategies search for pathogens and antimicrobial resistance control is necessary. Two of the strategies developed to combat these microorganisms have been the combined antimicrobials therapy and antimicrobial peptides prospection. In the present work, we have investigated the in vitro peptides effectiveness prospected from the Cerrado soil and the in vitro effectiveness of antimicrobials diminazene aceturate, chloramphenicol and streptomycin alone and in combination against clinical isolates of E. coli, K. pneumoniae and S. aureus. For bioprospection, the material was collected from native Cerrado soil, the total proteins were extracted and the peptides were further identified by LC-MS / MS. Peptides were analyzed by sense the moment and CAMP algorithms, in order to predict antimicrobial peptides. Of all peptides with possible antimicrobial activities, 7 were selected, synthesized and in vitro tested against bacterial isolates. Synthetized peptides did not show antimicrobial activity when challenged by Gram-positive and Gram-negative bacteria. Thus, for this work, in silico prospecting, the metaproteomics associated with the prediction algorithms, has not been shown to be an effective method for the identification of antimicrobial peptides. In addition, for the second control strategy, aceturate has been shown to be synergistic with streptomycin and chloramphenicol against E. coli and K. pneumoniae isolated from humans and animals. Against S. aureus, otherwise, a synergistic effect was observed in combination with aceturate and chloramphenicol. These combinations of antimicrobials showed important results, demonstrating that this strategy can be used as an alternative at pathogens control.porUniversidade Federal de Juiz de Fora (UFJF)Programa de Pós-graduação em Ciências Biológicas: Imunologia e Doenças Infecto-Parasitárias/Genética e BiotecnologiaUFJFBrasilICB – Instituto de Ciências BiológicasAttribution-NoDerivs 3.0 Brazilhttp://creativecommons.org/licenses/by-nd/3.0/br/info:eu-repo/semantics/openAccessCNPQ::CIENCIAS BIOLOGICASPeptídeosProspecçãoSinergismoPeptidesProspectionSynergismProspecção de peptídeos antimicrobianos em solo do Cerrado e avaliação de antimicrobianos combinados no controle de Escherichia coli, Klebsiella pneumoniae e Staphylococcus aureus in vitroinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisreponame:Repositório Institucional da UFJFinstname:Universidade Federal de Juiz de Fora (UFJF)instacron:UFJFCC-LICENSElicense_rdflicense_rdfapplication/rdf+xml; charset=utf-8805https://repositorio.ufjf.br/jspui/bitstream/ufjf/11627/2/license_rdfc4c98de35c20c53220c07884f4def27cMD52LICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-81748https://repositorio.ufjf.br/jspui/bitstream/ufjf/11627/3/license.txt8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33MD53TEXTthuannyborbarios.pdf.txtthuannyborbarios.pdf.txtExtracted texttext/plain87419https://repositorio.ufjf.br/jspui/bitstream/ufjf/11627/4/thuannyborbarios.pdf.txtf9ad55ed39741955613be7d9b8b02f9eMD54THUMBNAILthuannyborbarios.pdf.jpgthuannyborbarios.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg1296https://repositorio.ufjf.br/jspui/bitstream/ufjf/11627/5/thuannyborbarios.pdf.jpg8cca791d250159a335e39d6ecb5355c2MD55ORIGINALthuannyborbarios.pdfthuannyborbarios.pdfapplication/pdf25968593https://repositorio.ufjf.br/jspui/bitstream/ufjf/11627/1/thuannyborbarios.pdf5ccea4f3ef6370a91b28c9039bb5bbf7MD51ufjf/116272020-08-26 03:06:57.747oai:hermes.cpd.ufjf.br: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Repositório InstitucionalPUBhttps://repositorio.ufjf.br/oai/requestopendoar:2020-08-26T06:06:57Repositório Institucional da UFJF - Universidade Federal de Juiz de Fora (UFJF)false
dc.title.pt_BR.fl_str_mv Prospecção de peptídeos antimicrobianos em solo do Cerrado e avaliação de antimicrobianos combinados no controle de Escherichia coli, Klebsiella pneumoniae e Staphylococcus aureus in vitro
title Prospecção de peptídeos antimicrobianos em solo do Cerrado e avaliação de antimicrobianos combinados no controle de Escherichia coli, Klebsiella pneumoniae e Staphylococcus aureus in vitro
spellingShingle Prospecção de peptídeos antimicrobianos em solo do Cerrado e avaliação de antimicrobianos combinados no controle de Escherichia coli, Klebsiella pneumoniae e Staphylococcus aureus in vitro
Rios, Thuanny Borba
CNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS
Peptídeos
Prospecção
Sinergismo
Peptides
Prospection
Synergism
title_short Prospecção de peptídeos antimicrobianos em solo do Cerrado e avaliação de antimicrobianos combinados no controle de Escherichia coli, Klebsiella pneumoniae e Staphylococcus aureus in vitro
title_full Prospecção de peptídeos antimicrobianos em solo do Cerrado e avaliação de antimicrobianos combinados no controle de Escherichia coli, Klebsiella pneumoniae e Staphylococcus aureus in vitro
title_fullStr Prospecção de peptídeos antimicrobianos em solo do Cerrado e avaliação de antimicrobianos combinados no controle de Escherichia coli, Klebsiella pneumoniae e Staphylococcus aureus in vitro
title_full_unstemmed Prospecção de peptídeos antimicrobianos em solo do Cerrado e avaliação de antimicrobianos combinados no controle de Escherichia coli, Klebsiella pneumoniae e Staphylococcus aureus in vitro
title_sort Prospecção de peptídeos antimicrobianos em solo do Cerrado e avaliação de antimicrobianos combinados no controle de Escherichia coli, Klebsiella pneumoniae e Staphylococcus aureus in vitro
author Rios, Thuanny Borba
author_facet Rios, Thuanny Borba
author_role author
dc.contributor.advisor1.fl_str_mv Franco, Octávio Luiz
dc.contributor.advisor1Lattes.fl_str_mv http://lattes.cnpq.br/8598274096498065
dc.contributor.advisor-co1.fl_str_mv Mehta, Angela
dc.contributor.advisor-co1Lattes.fl_str_mv http://lattes.cnpq.br/0055119344402132
dc.contributor.referee1.fl_str_mv Dias, Simoni Campos
dc.contributor.referee1Lattes.fl_str_mv http://lattes.cnpq.br/1564224041415405
dc.contributor.referee2.fl_str_mv Santos, Marcelo de Oliveira
dc.contributor.referee2Lattes.fl_str_mv http://lattes.cnpq.br/
dc.contributor.authorLattes.fl_str_mv http://lattes.cnpq.br/8650906869869534
dc.contributor.author.fl_str_mv Rios, Thuanny Borba
contributor_str_mv Franco, Octávio Luiz
Mehta, Angela
Dias, Simoni Campos
Santos, Marcelo de Oliveira
dc.subject.cnpq.fl_str_mv CNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS
topic CNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS
Peptídeos
Prospecção
Sinergismo
Peptides
Prospection
Synergism
dc.subject.por.fl_str_mv Peptídeos
Prospecção
Sinergismo
Peptides
Prospection
Synergism
description A resistência bacteriana consiste em uma das maiores ameaças à saúde no mundo, visto que reduz o tratamento efetivo de infecções e aumenta a mortalidade associada a doenças bacterianas comuns. Nesse contexto, a busca por estratégias para o controle de patógenos e da resistência antimicrobiana se faz necessária. Duas das estratégias desenvolvidas para combater esses microrganismos têm sido a terapia combinada de antimicrobianos e a prospecção de peptídeos antimicrobianos. No presente trabalho investigamos a efetividade in vitro de peptídeos prospectados do solo do Cerrado e a efetividade in vitro dos antimicrobianos aceturato de diminazeno, cloranfenicol e estreptomicina sozinhos e em combinação contra isolados clínicos de E. coli, K. pneumoniae e S. aureus. Para bioprospecção, o material foi coletado em solo nativo do Cerrado, as proteínas totais foram extraídas e os peptídeos identificados por LC-MS / MS foram analisados pelos algoritmos sense the moment e CAMP, a fim de prever peptídeos antimicrobianos. De todos os peptídeos com possível atividade antimicrobiana, 7 foram selecionados, sintetizados e testados in vitro como agentes antimicrobianos contra os isolados. Assim como, foi avaliada a atividade in vitro de aceturato de diminazeno, estreptomicina e cloranfenicol contra isolados de bactérias. Os peptídeos sintetizados não demostraram atividade antimicrobiana quando desafiados por bactérias Gram-positivas e Gram-negativas. Sendo assim, para este trabalho, a prospecção in silico, metaproteômica associada aos algoritmos de predição, não se demonstrou um método eficaz para a identificação de peptídeos antimicrobianos. Além disso, para a segunda estratégia de controle, o aceturato demonstrou ser sinérgico com a estreptomicina e o cloranfenicol contra E. coli e K. pneumoniae isoladas de humanos e animais. Contra S. aureus, por outro lado, o efeito sinérgico foi observado apenas na combinação de aceturato e cloranfenicol. Essas combinações de antimicrobianos apresentaram resultados importantes, demonstrando que essa estratégia pode ser utilizada como uma alternativa no controle de patógenos.
publishDate 2020
dc.date.accessioned.fl_str_mv 2020-08-25T11:51:30Z
dc.date.available.fl_str_mv 2020-08-24
2020-08-25T11:51:30Z
dc.date.issued.fl_str_mv 2020-05-14
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/masterThesis
format masterThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv https://repositorio.ufjf.br/jspui/handle/ufjf/11627
url https://repositorio.ufjf.br/jspui/handle/ufjf/11627
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.rights.driver.fl_str_mv Attribution-NoDerivs 3.0 Brazil
http://creativecommons.org/licenses/by-nd/3.0/br/
info:eu-repo/semantics/openAccess
rights_invalid_str_mv Attribution-NoDerivs 3.0 Brazil
http://creativecommons.org/licenses/by-nd/3.0/br/
eu_rights_str_mv openAccess
dc.publisher.none.fl_str_mv Universidade Federal de Juiz de Fora (UFJF)
dc.publisher.program.fl_str_mv Programa de Pós-graduação em Ciências Biológicas: Imunologia e Doenças Infecto-Parasitárias/Genética e Biotecnologia
dc.publisher.initials.fl_str_mv UFJF
dc.publisher.country.fl_str_mv Brasil
dc.publisher.department.fl_str_mv ICB – Instituto de Ciências Biológicas
publisher.none.fl_str_mv Universidade Federal de Juiz de Fora (UFJF)
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Repositório Institucional da UFJF
instname:Universidade Federal de Juiz de Fora (UFJF)
instacron:UFJF
instname_str Universidade Federal de Juiz de Fora (UFJF)
instacron_str UFJF
institution UFJF
reponame_str Repositório Institucional da UFJF
collection Repositório Institucional da UFJF
bitstream.url.fl_str_mv https://repositorio.ufjf.br/jspui/bitstream/ufjf/11627/2/license_rdf
https://repositorio.ufjf.br/jspui/bitstream/ufjf/11627/3/license.txt
https://repositorio.ufjf.br/jspui/bitstream/ufjf/11627/4/thuannyborbarios.pdf.txt
https://repositorio.ufjf.br/jspui/bitstream/ufjf/11627/5/thuannyborbarios.pdf.jpg
https://repositorio.ufjf.br/jspui/bitstream/ufjf/11627/1/thuannyborbarios.pdf
bitstream.checksum.fl_str_mv c4c98de35c20c53220c07884f4def27c
8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33
f9ad55ed39741955613be7d9b8b02f9e
8cca791d250159a335e39d6ecb5355c2
5ccea4f3ef6370a91b28c9039bb5bbf7
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv MD5
MD5
MD5
MD5
MD5
repository.name.fl_str_mv Repositório Institucional da UFJF - Universidade Federal de Juiz de Fora (UFJF)
repository.mail.fl_str_mv
_version_ 1813193854935891968