E-SECO ProVersion: uma arquitetura para manutenção e evolução de workflows científicos

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Sirqueira, Tássio Ferenzini Martins
Data de Publicação: 2016
Tipo de documento: Dissertação
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Institucional da UFJF
Texto Completo: https://repositorio.ufjf.br/jspui/handle/ufjf/4835
Resumo: Um ecossistema de software científico, além de outras funcionalidades, busca integrar todas as etapas de um experimento, e comumente utiliza workflows científicos para a resolução de problemas complexos. Toda modificação ocorrida em um experimento deve ser propagada para os workflows associados, os quais devem ser mantidos e evoluídos para o prosseguimento com sucesso da pesquisa. Um das forma de garantir este controle é através da gerência de configuração. Para que ela possa ser utilizada, é importante o armazenamento dos dados de execução e modelagem do experimento e workflows associados. Neste trabalho, utilizamos conceitos e modelos relacionados à proveniência de dados para o armazenamento e consulta destes dados. O uso da proveniência de dados traz alguns benefícios neste armazenamento e consulta, conforme veremos nesta dissertação. Assim, nesse trabalho é proposta uma arquitetura para gerenciar a evolução e manutenção de experimentos e workflows científicos, denominada E-SECO ProVersion. A motivação para a especificação e implementação da arquitetura veio a partir da realização de uma revisão sistemática e de um estudo para verificar características de manutenção e evolução em repositórios de workflows existentes. A partir destas análises, as principais funcionalidades da arquitetura foram definidas e detalhadas. Além disso, um roteiro com diretrizes de uso e provas de conceito utilizando workflows extraídos do repositório myEx-periment foram apresentados, com o objetivo de avaliar a aplicabilidade da arquitetura.
id UFJF_b3a70ac16e94bf584e26b5f9257138a9
oai_identifier_str oai:hermes.cpd.ufjf.br:ufjf/4835
network_acronym_str UFJF
network_name_str Repositório Institucional da UFJF
repository_id_str
spelling Villela, Regina Maria Maciel Bragahttp://lattes.cnpq.brAraújo, Marco Antônio Pereirahttp://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4763431J6Oliveira, Alcione de Paivahttp://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4788574J0David, Jose Maria Nazarhttp://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4723308J4http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4490486Y8Sirqueira, Tássio Ferenzini Martins2017-06-07T13:31:29Z2017-06-072017-06-07T13:31:29Z2016-07-12https://repositorio.ufjf.br/jspui/handle/ufjf/4835Um ecossistema de software científico, além de outras funcionalidades, busca integrar todas as etapas de um experimento, e comumente utiliza workflows científicos para a resolução de problemas complexos. Toda modificação ocorrida em um experimento deve ser propagada para os workflows associados, os quais devem ser mantidos e evoluídos para o prosseguimento com sucesso da pesquisa. Um das forma de garantir este controle é através da gerência de configuração. Para que ela possa ser utilizada, é importante o armazenamento dos dados de execução e modelagem do experimento e workflows associados. Neste trabalho, utilizamos conceitos e modelos relacionados à proveniência de dados para o armazenamento e consulta destes dados. O uso da proveniência de dados traz alguns benefícios neste armazenamento e consulta, conforme veremos nesta dissertação. Assim, nesse trabalho é proposta uma arquitetura para gerenciar a evolução e manutenção de experimentos e workflows científicos, denominada E-SECO ProVersion. A motivação para a especificação e implementação da arquitetura veio a partir da realização de uma revisão sistemática e de um estudo para verificar características de manutenção e evolução em repositórios de workflows existentes. A partir destas análises, as principais funcionalidades da arquitetura foram definidas e detalhadas. Além disso, um roteiro com diretrizes de uso e provas de conceito utilizando workflows extraídos do repositório myEx-periment foram apresentados, com o objetivo de avaliar a aplicabilidade da arquitetura.A scientific software ecosystem, in addition to other features, seeks to integrate all stages of an experiment, and commonly used scientific workflows to solve complex problems. Any changes that occurred in an experiment must be propagated to the associated workflows, which must be maintained and evolved for further successful research. One of the way to ensure this control is through configuration management. So that it can be used, it is important the storage of performance data and modeling of the experiment and associated workflows. In this study, we use the concepts and models related to the source of data for storage and retrieval of this data. Use the data source brings some advantages in storage and query, as we will see in this dissertation. Thus, this paper proposes an architecture to manage the development and maintenance of scientific experiments and workflows, called E-SECO ProVersion. The motivation for the specification and implementation of architecture came from the realization of a systematic review and a study to check maintenance characteristics and evolution in existing workflows repositories. From these analyzes, the main features of the architecture are defined and detailed. In addition, a roadmap with usage guidelines and proofs of concept using workflows extracted from myExperiment repository were presented in order to evaluate the applicability of architecture.porUniversidade Federal de Juiz de Fora (UFJF)Programa de Pós-graduação em Ciência da ComputaçãoUFJFBrasilICE – Instituto de Ciências ExatasCNPQ::CIENCIAS EXATAS E DA TERRA::CIENCIA DA COMPUTACAOWorkflow científicoManutençãoEvoluçãoProveniência de dadosScientific WorkflowMaintenanceEvolutionData ProvenanceE-SECO ProVersion: uma arquitetura para manutenção e evolução de workflows científicosinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da UFJFinstname:Universidade Federal de Juiz de Fora (UFJF)instacron:UFJFTEXTtassioferenzinimartinssirqueira.pdf.txttassioferenzinimartinssirqueira.pdf.txtExtracted texttext/plain235810https://repositorio.ufjf.br/jspui/bitstream/ufjf/4835/3/tassioferenzinimartinssirqueira.pdf.txt7a4926d3e65c482c6f8655b5c43324fcMD53THUMBNAILtassioferenzinimartinssirqueira.pdf.jpgtassioferenzinimartinssirqueira.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg1263https://repositorio.ufjf.br/jspui/bitstream/ufjf/4835/4/tassioferenzinimartinssirqueira.pdf.jpgc9b13f180c60c2dd0465a495e467b559MD54ORIGINALtassioferenzinimartinssirqueira.pdftassioferenzinimartinssirqueira.pdfapplication/pdf6506958https://repositorio.ufjf.br/jspui/bitstream/ufjf/4835/1/tassioferenzinimartinssirqueira.pdf2145670dd9a80dec1aef328a3f8a0427MD51LICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-82197https://repositorio.ufjf.br/jspui/bitstream/ufjf/4835/2/license.txt000e18a5aee6ca21bb5811ddf55fc37bMD52ufjf/48352019-06-16 06:51:35.471oai:hermes.cpd.ufjf.br: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Repositório InstitucionalPUBhttps://repositorio.ufjf.br/oai/requestopendoar:2019-06-16T09:51:35Repositório Institucional da UFJF - Universidade Federal de Juiz de Fora (UFJF)false
dc.title.pt_BR.fl_str_mv E-SECO ProVersion: uma arquitetura para manutenção e evolução de workflows científicos
title E-SECO ProVersion: uma arquitetura para manutenção e evolução de workflows científicos
spellingShingle E-SECO ProVersion: uma arquitetura para manutenção e evolução de workflows científicos
Sirqueira, Tássio Ferenzini Martins
CNPQ::CIENCIAS EXATAS E DA TERRA::CIENCIA DA COMPUTACAO
Workflow científico
Manutenção
Evolução
Proveniência de dados
Scientific Workflow
Maintenance
Evolution
Data Provenance
title_short E-SECO ProVersion: uma arquitetura para manutenção e evolução de workflows científicos
title_full E-SECO ProVersion: uma arquitetura para manutenção e evolução de workflows científicos
title_fullStr E-SECO ProVersion: uma arquitetura para manutenção e evolução de workflows científicos
title_full_unstemmed E-SECO ProVersion: uma arquitetura para manutenção e evolução de workflows científicos
title_sort E-SECO ProVersion: uma arquitetura para manutenção e evolução de workflows científicos
author Sirqueira, Tássio Ferenzini Martins
author_facet Sirqueira, Tássio Ferenzini Martins
author_role author
dc.contributor.advisor1.fl_str_mv Villela, Regina Maria Maciel Braga
dc.contributor.advisor1Lattes.fl_str_mv http://lattes.cnpq.br
dc.contributor.referee1.fl_str_mv Araújo, Marco Antônio Pereira
dc.contributor.referee1Lattes.fl_str_mv http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4763431J6
dc.contributor.referee2.fl_str_mv Oliveira, Alcione de Paiva
dc.contributor.referee2Lattes.fl_str_mv http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4788574J0
dc.contributor.referee3.fl_str_mv David, Jose Maria Nazar
dc.contributor.referee3Lattes.fl_str_mv http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4723308J4
dc.contributor.authorLattes.fl_str_mv http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4490486Y8
dc.contributor.author.fl_str_mv Sirqueira, Tássio Ferenzini Martins
contributor_str_mv Villela, Regina Maria Maciel Braga
Araújo, Marco Antônio Pereira
Oliveira, Alcione de Paiva
David, Jose Maria Nazar
dc.subject.cnpq.fl_str_mv CNPQ::CIENCIAS EXATAS E DA TERRA::CIENCIA DA COMPUTACAO
topic CNPQ::CIENCIAS EXATAS E DA TERRA::CIENCIA DA COMPUTACAO
Workflow científico
Manutenção
Evolução
Proveniência de dados
Scientific Workflow
Maintenance
Evolution
Data Provenance
dc.subject.por.fl_str_mv Workflow científico
Manutenção
Evolução
Proveniência de dados
Scientific Workflow
Maintenance
Evolution
Data Provenance
description Um ecossistema de software científico, além de outras funcionalidades, busca integrar todas as etapas de um experimento, e comumente utiliza workflows científicos para a resolução de problemas complexos. Toda modificação ocorrida em um experimento deve ser propagada para os workflows associados, os quais devem ser mantidos e evoluídos para o prosseguimento com sucesso da pesquisa. Um das forma de garantir este controle é através da gerência de configuração. Para que ela possa ser utilizada, é importante o armazenamento dos dados de execução e modelagem do experimento e workflows associados. Neste trabalho, utilizamos conceitos e modelos relacionados à proveniência de dados para o armazenamento e consulta destes dados. O uso da proveniência de dados traz alguns benefícios neste armazenamento e consulta, conforme veremos nesta dissertação. Assim, nesse trabalho é proposta uma arquitetura para gerenciar a evolução e manutenção de experimentos e workflows científicos, denominada E-SECO ProVersion. A motivação para a especificação e implementação da arquitetura veio a partir da realização de uma revisão sistemática e de um estudo para verificar características de manutenção e evolução em repositórios de workflows existentes. A partir destas análises, as principais funcionalidades da arquitetura foram definidas e detalhadas. Além disso, um roteiro com diretrizes de uso e provas de conceito utilizando workflows extraídos do repositório myEx-periment foram apresentados, com o objetivo de avaliar a aplicabilidade da arquitetura.
publishDate 2016
dc.date.issued.fl_str_mv 2016-07-12
dc.date.accessioned.fl_str_mv 2017-06-07T13:31:29Z
dc.date.available.fl_str_mv 2017-06-07
2017-06-07T13:31:29Z
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/masterThesis
format masterThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv https://repositorio.ufjf.br/jspui/handle/ufjf/4835
url https://repositorio.ufjf.br/jspui/handle/ufjf/4835
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.publisher.none.fl_str_mv Universidade Federal de Juiz de Fora (UFJF)
dc.publisher.program.fl_str_mv Programa de Pós-graduação em Ciência da Computação
dc.publisher.initials.fl_str_mv UFJF
dc.publisher.country.fl_str_mv Brasil
dc.publisher.department.fl_str_mv ICE – Instituto de Ciências Exatas
publisher.none.fl_str_mv Universidade Federal de Juiz de Fora (UFJF)
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Repositório Institucional da UFJF
instname:Universidade Federal de Juiz de Fora (UFJF)
instacron:UFJF
instname_str Universidade Federal de Juiz de Fora (UFJF)
instacron_str UFJF
institution UFJF
reponame_str Repositório Institucional da UFJF
collection Repositório Institucional da UFJF
bitstream.url.fl_str_mv https://repositorio.ufjf.br/jspui/bitstream/ufjf/4835/3/tassioferenzinimartinssirqueira.pdf.txt
https://repositorio.ufjf.br/jspui/bitstream/ufjf/4835/4/tassioferenzinimartinssirqueira.pdf.jpg
https://repositorio.ufjf.br/jspui/bitstream/ufjf/4835/1/tassioferenzinimartinssirqueira.pdf
https://repositorio.ufjf.br/jspui/bitstream/ufjf/4835/2/license.txt
bitstream.checksum.fl_str_mv 7a4926d3e65c482c6f8655b5c43324fc
c9b13f180c60c2dd0465a495e467b559
2145670dd9a80dec1aef328a3f8a0427
000e18a5aee6ca21bb5811ddf55fc37b
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv MD5
MD5
MD5
MD5
repository.name.fl_str_mv Repositório Institucional da UFJF - Universidade Federal de Juiz de Fora (UFJF)
repository.mail.fl_str_mv
_version_ 1801661297787404288

Registros relacionados