Diversidade genética e simbiótica de bactérias fixadoras de nitrogênio isoladas de solos sob agrofloresta na Amazônia Ocidental usando o caupi como planta isca

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Jaramillo, Paula Marcela Duque
Data de Publicação: 2010
Tipo de documento: Dissertação
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Institucional da UFLA
Texto Completo: http://repositorio.ufla.br/jspui/handle/1/2639
Resumo: Microbiologia Agrícola
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spelling Diversidade genética e simbiótica de bactérias fixadoras de nitrogênio isoladas de solos sob agrofloresta na Amazônia Ocidental usando o caupi como planta iscaGenetic diversity and symbiotic efficiency of bacteria isolated from soil under Agroforestry in the Western Amazon by using cowpea as trap plantFeijão-de-corda - NodulaçãoNitrogênio - FixaçãoBactériasBiodiversidadeVigna unguiculataCNPQ_NÃO_INFORMADOMicrobiologia AgrícolaThe objective of this study was to evaluate the genetic diversity and symbiotic efficiency nitrogen-fixing bacteria isolated from nodules of the trap plant cowpea inoculated with soils under agroforestry in the Western Amazon. The isolates were obtained in previous work, from a collection of 1010 isolates from different land used systems which included 188 from agroforestry. Initially, we confirmed cultural characteristics previously described by using 79 medium. Of the 188 isolates, 148 were still viable. Experiments for authentication and symbiotic efficiency of these isolates were performed in greenhouse, in a completely randomized design with three replications. We used amber glass recycled bottles (500 mL), containing Hoagland solution diluted four times, and the cowpea (BR17 Gurguéia) as host plant. Control treatments were without inoculation (with and without mineral nitrogen) and inoculated with strains recommended as inoculants INPA 03-11B, UFLA 03-84, BR 3267. The authentication was evaluated through nodules presence (+) or absence (-) in inoculated plants. The symbiotic efficiency was evaluated 35 days after emergence, when it was determined the SPAD (Soil Plant Analysis Development) which is an indirect measurement of the nitrogen content, number and dry weight of nodules, dry and fresh matter shoot weight and relative efficiency. The data were subjected to analysis of variance and group of averages by means of the Scott-Knott test in a probability of 5%. 88 isolates showed positive nodulation and were subjected to analysis of polymorphism in DNA, with the aim of evaluating their diversity by using the BOX-PCR technique. This analysis included the type strains Azorhizobium dobereinerae (BR5401T), Azorhizobium caulinodans (ORS571T), Cupriavidus taiwanensis (LMG19424T), Burkholderia sabiae (BR3405), Mesorhizobium plurifarium (BR3804), Bradyrhizobium sp. (UFLA 03-84) and Sinorhizobium sp. (BR6806). Partial sequences of the 16S rDNA of 20 isolates were obtained and phylogenetically analyzed. According to the cultural, nine groups were formed. The symbiotic isolates was variable and 12.5% of isolates promoted a statistically significant increase in dry matter of shoots, compared to the control without inoculation and without mineral nitrogen. It was founding high genetic diversity: at the level of 70% similarity, 72 groups were found, most consisting of only one isolate. The predominant genus was Bradyrhizobium, identified for 55% of the isolates sequences. The more efficient isolate in nitrogen fixation was identified as Rhizobium sp. We also identified other generous, such as Paenibacillus, Stenotrophomonas, Enterobacter, Ochrobactrum and Bosea. These results showed high genetic diversity and symbiotic efficiency in soils under the these land-use agroforestry in the Western Amazon.O objetivo deste trabalho foi avaliar a diversidade genética e simbiótica de bactérias fixadoras de nitrogênio isoladas de nódulos da planta isca feijão-caupi de solos sob agrofloresta na Amazônia Ocidental.Os isolados foram obtidos em trabalho anterior, a partir de uma coleção de 1010 isolados provenientes de diferentes sistemas de uso da terra, que incluem 188 da agrofloresta. Inicialmente, foram confirmadas as características culturais descritas anteriormente utilizando meio 79. Dos 188 isolados, 148 apresentaram viabilidade. Experimentos de autenticação e eficiência simbiótica destes isolados foram realizados em casa de vegetação, com delineamento inteiramente casualizado com três repetições. Utilizaram-se garrafas de vidro âmbar recicláveis (500 mL), contendo solução de Hoagland diluída quatro vezes e, o feijão-caupi (BR17 Gurguéia), como planta hospedeira. Foram utilizados os tratamentos sem inoculação (com e sem nitrogênio mineral) e com inoculação das estirpes recomendadas como inoculantes INPA 03-11B, UFLA 03-84, BR 3267 como controles. A autenticação foi avaliada pela presença (+) ou ausência (-) de nódulos nas plantas inoculadas. A eficiência simbiótica foi avaliada, aos 35 dias após a emergência, quando se determinou o índice SPAD (Soil Plant Analysis Development) o qual é uma medição indireta do teor de nitrogênio, número e matéria seca de nódulos, matéria seca e fresca da parte aérea e eficiência relativa. Os dados foram submetidos à análise de variância e agrupamento de médias por meio do teste de Scott Knott, a 5% de probabilidade. 88 isolados apresentaram nodulação positiva e foram submetidos à análise de polimorfismo no DNA, com o objetivo de avaliar a sua diversidade, utilizando a técnica BOX-PCR. Nesta analise foram incluídas as estirpes tipo e referencia Azorhizobium dobereinerae (BR5401T), Azorhizobium caulinodans (ORS571T), Cupriavidus taiwanensis (LMG19424T), Burkholderia sabiae (BR3405), Mesorhizobium plurifarium (BR3804), Bradyrhizobium sp. (UFLA 03-84) e Sinorhizobium sp. (BR6806). Sequências parciais do gene 16S rDNA de 20 isolados foram obtidas e analisadas filogeneticamente. De acordo com as características culturais, nove grupos foram formados. Os isolados apresentaram eficiência simbiótica variável, onde 12,5% dos isolados promoveram um aumento estatisticamente significativo da matéria seca da parte aérea, em relação ao controle sem inoculação e sem nitrogênio mineral. Encontrou-se alta diversidade genética, a 70% de similaridade, formando-se 72 grupos, a maioria formados por um isolado só. O gênero predominante foi Bradyrhizobium, com 55% do total dos isolados sequenciados. O isolado mais eficiente na fixação de nitrogênio foi referido como Rhizobium sp. Foram também identificados outros gêneros, como Paenibacillus, Stenotrophomonas, Enterobacter, Ochrobactrum e Bosea. Os resultados mostraram alta diversidade genética e simbiótica em solos sob o sistema de uso da terra agrofloresta na Amazônia Ocidental.UNIVERSIDADE FEDERAL DE LAVRASDBI - Programa de Pós-graduaçãoUFLABRASILMoreira, Fátima Maria de SouzaAndrade, Messias José Bastos deFlorentino, Ligiane AparecidaLima, Adriana SilvaJaramillo, Paula Marcela Duque2014-08-12T19:18:20Z2014-08-12T19:18:20Z2014-08-122010-01-25info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdfJARAMILLO, P. M. D. Diversidade genética e simbiótica de bactérias fixadoras de nitrogênio isoladas de solos sob Agrofloresta na Amazônia Ocidental usando o caupi como planta isca. 2010. 66 p. Dissertação (Mestrado em Microbiologia Agrícola)-Universidade Federal de Lavras, Lavras, 2010.http://repositorio.ufla.br/jspui/handle/1/2639info:eu-repo/semantics/openAccessporreponame:Repositório Institucional da UFLAinstname:Universidade Federal de Lavras (UFLA)instacron:UFLA2023-05-02T16:17:47Zoai:localhost:1/2639Repositório InstitucionalPUBhttp://repositorio.ufla.br/oai/requestnivaldo@ufla.br || repositorio.biblioteca@ufla.bropendoar:2023-05-02T16:17:47Repositório Institucional da UFLA - Universidade Federal de Lavras (UFLA)false
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