Anatomia e citometria de fluxo em cana-de-açúcar

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Oliveira, Ana Catarina Lima de
Data de Publicação: 2013
Tipo de documento: Tese
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Institucional da UFLA
Texto Completo: http://repositorio.ufla.br/jspui/handle/1/1341
Resumo: Tese apresentada à Universidade Federal de Lavras, como parte das exigências do Programa de Pós-Graduação em Agronomia/Fitotecnia, área de concentração em Produção Vegetal, para a obtenção do título de Doutor.
id UFLA_09c477058593a4da64e1a65d84ffcdfe
oai_identifier_str oai:localhost:1/1341
network_acronym_str UFLA
network_name_str Repositório Institucional da UFLA
repository_id_str
spelling Anatomia e citometria de fluxo em cana-de-açúcarCana-de-açúcar - Conteúdo de DNACana-de-açúcar - HistologiaCitômetroPoaceaeHistologyCytometerDNA contentCNPQ_NÃO_INFORMADOTese apresentada à Universidade Federal de Lavras, como parte das exigências do Programa de Pós-Graduação em Agronomia/Fitotecnia, área de concentração em Produção Vegetal, para a obtenção do título de Doutor.Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (Capes)Produção VegetalObjetivou-se diferenciar cultivares/espécies do gênero Saccharum quanto à anatomia foliar e do colmo, estabelecer um protocolo confiável para a realização da análise de citometria de fluxo, bem como comparar espécies e cultivares de cana-de-açúcar quanto ao conteúdo de DNA genômico. A anatomia foliar foi realizada em 17 cultivares e 2 espécies, nas quais foram feitas secções transversais e paradérmicas para cada indivíduo estudado. As variáveis analisadas foram espessura do limbo foliar, distância entre feixes vasculares, número de feixes vasculares, número de células buliformes, espessuras da cutícula, da epiderme abaxial e adaxial. Nas secções paradérmicas, nas faces adaxial e abaxial das folhas, foram mensurados a densidade estomática (número de estômatos.mm-2), o diâmetro polar dos estômatos, o diâmetro equatorial e a relação entre esses dois últimos. No colmo, as variáveis analisadas foram teor de lignina e celulose. Os dados foram submetidos à análise de variância, pelo programa Sisvar® e as médias agrupadas pelo teste de Scott-Knott, a 5% de probabilidade. Para análise de cluster utilizou-se uma matriz de dados agrupados pela técnica de ligação de média de grupos (UPGMA) e, a partir desta análise, foi gerado um dendrograma. Os indivíduos puderam ser separados de acordo com as características da anatomia foliar. O dendrograma gerado a partir dos resultados das 18 variáveis avaliadas classificou os indivíduos em três grupos, considerando a distância euclidiana = 20. Para quantificar o conteúdo de DNA, foram analisadas 16 cultivares e 3 espécies pertencentes a este gênero. A determinação do protocolo confiável foi realizada na espécie S. officinarum, tendo sido avaliados a influência de tampões de extração, a presença, a ausência de RNase, as doses de iodeto de propídeo, os períodos de exposição ao iodeto de propídeo e os padrões de referência externos, nos quais foram determinados o coeficiente de variação e o conteúdo de DNA. Para análise estatística utilizaram-se os programas Sisvar® e o XLSTAT®. São recomendados o tampão de extração Marie e a utilização de no mínimo 15 µL de iodeto de propídeo. Não se deve realizar a leitura das amostras imediatamente após a adição deste. O uso de RNase é dispensável e, como padrão externo de referência, deve ser utilizado o tomateiro. Os indivíduos analisados podem ser separados em quatro grupos, pela análise das coordenadas principais, em função do conteúdo de DNA mensurado pelo protocolo confiável anteriormente determinado.The objective was to differentiate cultivars / species of the genus Saccharum regarding the leaf and stem anatomy, establish a reliable protocol for carrying out the flow cytometry analysis and compare species and cultivars of sugar cane as to their genomic DNA content. Leaf anatomy was conducted in 17 cultivars and 2 species, in which cross- and paradermic sections were made for each individual studied. The variables analyzed were leaf blade thickness, distance between vascular bundles, number of vascular bundles, number of bulliform cells and thickness of the abaxial and adaxial cuticles. The stomatal density (number of stomata.mm-2), the polar diameter of the stomata, their equatorial diameter and the ratio between these last two were measured in paradermic sections of the adaxial and abaxial leaf surfaces. In the stem, the variables analyzed were lignin and cellulose. Data were subjected to analysis of variance by the Sisvar® program and averages grouped by the Scott - Knott test at 5 % probability. For cluster analysis we used a matrix of data grouped by Unweighted Pair Group Method with Arithmetic Mean (UPGMA), and from this analysis, a dendrogram was generated. The indivuals could be separated according to their leaf anatomy characteristics. The dendrogram generated from the results of the 18 evaluated variables classified individuals into three groups considering the Euclidean distance = 20. To quantify the DNA content, 16 cultivars and 3 species belonging to this genus were analyzed. The determination of reliable protocol was performed in the species S. officinarum, having evaluated the influence of extraction buffers, the presence and absence of Rnase, the propidium iodide doses, propidium iodide exposure periods and external reference standards, in which were determined the coefficient of variation and DNA content. For statistical analysis we used the programs Sisvar ® and XLSTAT ®. The Marie extraction buffer and the use of at least 15 µL of propidium iodide are recommended. One should not perform the reading of samples immediately after their addition. The use of RNase is dispensable, and as an external reference standard, the tomato should be used. Individuals analyzed can be separated into four groups through analysis of principal coordinates, in function of the DNA content measured by the previously determined reliable protocol.UNIVERSIDADE FEDERAL DE LAVRASDAG - Programa de Pós-graduaçãoUFLABRASILPasqual, MoacirBruzi, Adriano TeodoroOliveira, Cynthia dePio, Leila Aparecida SallesArrigoni-Blank, Maria de FátimaOliveira, Ana Catarina Lima de2013-11-11T17:47:02Z2013-11-11T17:47:02Z201320132013-09-03info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesisapplication/pdfOLIVEIRA, A. C. L. de. Anatomia e citometria de fluxo em cana-de-açúcar. 2013. 92 p. Tese (Doutorado em Agronomia/Fitotecnia) – Universidade Federal de Lavras, Lavras, 2013.http://repositorio.ufla.br/jspui/handle/1/1341info:eu-repo/semantics/openAccessporreponame:Repositório Institucional da UFLAinstname:Universidade Federal de Lavras (UFLA)instacron:UFLA2019-11-22T16:50:55Zoai:localhost:1/1341Repositório InstitucionalPUBhttp://repositorio.ufla.br/oai/requestnivaldo@ufla.br || repositorio.biblioteca@ufla.bropendoar:2019-11-22T16:50:55Repositório Institucional da UFLA - Universidade Federal de Lavras (UFLA)false
dc.title.none.fl_str_mv Anatomia e citometria de fluxo em cana-de-açúcar
title Anatomia e citometria de fluxo em cana-de-açúcar
spellingShingle Anatomia e citometria de fluxo em cana-de-açúcar
Oliveira, Ana Catarina Lima de
Cana-de-açúcar - Conteúdo de DNA
Cana-de-açúcar - Histologia
Citômetro
Poaceae
Histology
Cytometer
DNA content
CNPQ_NÃO_INFORMADO
title_short Anatomia e citometria de fluxo em cana-de-açúcar
title_full Anatomia e citometria de fluxo em cana-de-açúcar
title_fullStr Anatomia e citometria de fluxo em cana-de-açúcar
title_full_unstemmed Anatomia e citometria de fluxo em cana-de-açúcar
title_sort Anatomia e citometria de fluxo em cana-de-açúcar
author Oliveira, Ana Catarina Lima de
author_facet Oliveira, Ana Catarina Lima de
author_role author
dc.contributor.none.fl_str_mv Pasqual, Moacir
Bruzi, Adriano Teodoro
Oliveira, Cynthia de
Pio, Leila Aparecida Salles
Arrigoni-Blank, Maria de Fátima
dc.contributor.author.fl_str_mv Oliveira, Ana Catarina Lima de
dc.subject.por.fl_str_mv Cana-de-açúcar - Conteúdo de DNA
Cana-de-açúcar - Histologia
Citômetro
Poaceae
Histology
Cytometer
DNA content
CNPQ_NÃO_INFORMADO
topic Cana-de-açúcar - Conteúdo de DNA
Cana-de-açúcar - Histologia
Citômetro
Poaceae
Histology
Cytometer
DNA content
CNPQ_NÃO_INFORMADO
description Tese apresentada à Universidade Federal de Lavras, como parte das exigências do Programa de Pós-Graduação em Agronomia/Fitotecnia, área de concentração em Produção Vegetal, para a obtenção do título de Doutor.
publishDate 2013
dc.date.none.fl_str_mv 2013-11-11T17:47:02Z
2013-11-11T17:47:02Z
2013
2013
2013-09-03
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/doctoralThesis
format doctoralThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv OLIVEIRA, A. C. L. de. Anatomia e citometria de fluxo em cana-de-açúcar. 2013. 92 p. Tese (Doutorado em Agronomia/Fitotecnia) – Universidade Federal de Lavras, Lavras, 2013.
http://repositorio.ufla.br/jspui/handle/1/1341
identifier_str_mv OLIVEIRA, A. C. L. de. Anatomia e citometria de fluxo em cana-de-açúcar. 2013. 92 p. Tese (Doutorado em Agronomia/Fitotecnia) – Universidade Federal de Lavras, Lavras, 2013.
url http://repositorio.ufla.br/jspui/handle/1/1341
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
dc.publisher.none.fl_str_mv UNIVERSIDADE FEDERAL DE LAVRAS
DAG - Programa de Pós-graduação
UFLA
BRASIL
publisher.none.fl_str_mv UNIVERSIDADE FEDERAL DE LAVRAS
DAG - Programa de Pós-graduação
UFLA
BRASIL
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Repositório Institucional da UFLA
instname:Universidade Federal de Lavras (UFLA)
instacron:UFLA
instname_str Universidade Federal de Lavras (UFLA)
instacron_str UFLA
institution UFLA
reponame_str Repositório Institucional da UFLA
collection Repositório Institucional da UFLA
repository.name.fl_str_mv Repositório Institucional da UFLA - Universidade Federal de Lavras (UFLA)
repository.mail.fl_str_mv nivaldo@ufla.br || repositorio.biblioteca@ufla.br
_version_ 1784550018126970880