Avaliação In Silico de marcadores moleculares da resposta imunológica associados ao estresse de aves
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Data de Publicação: | 2016 |
Tipo de documento: | Dissertação |
Idioma: | por |
Título da fonte: | Repositório Institucional da UFLA |
Texto Completo: | http://repositorio.ufla.br/jspui/handle/1/11896 |
Resumo: | Stress can be characterized an unspecific response for any challenge such as beak trimming, thermic discomfort, social issues, feed privation, etc. Is known that stress modify poultry immune response and increases pathogen infections leading to economic losses caused by production and reproduction delay. Studies have been done to identify different proteins expressions under stress on different species. However, poultry did not have those stress modulation and alteration by stress elucidated. Therefore the aim of this study was investigated expressed stress molecular markers on poultry. Were selected 15 mRNA genetic sequences related to immune system. Results showed a non-homology between poultry and mammals sequences. From 15 sequences, 5 could not be predicted because they were more than 2500 nucleotides; from the other 10 sequences the analysis showed 20 conformational structure per each and the most stable sequence were accept by the Minimum Free Energy. The highest antigenic epitope were accepted by the maximum score, a total of 8934 epitopes were predicted and 15 were taken. These results will support future studies to expand understanding on how stress can modulate the immune system and possibilities to have a rapid diagnostic, helping on increasing animal welfare, biosecurity and productivity. |
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Avaliação In Silico de marcadores moleculares da resposta imunológica associados ao estresse de avesIn Silico evaluation of immune response molecular markers associated to poultry stressAve - EstresseImunologia veterináriaMarcadores biológicosBioinformáticaBirds - StressVeterinary immunologyBiochemical markersBioinformaticsÁcido Ribonucleico (RNA)Medicina VeterináriaStress can be characterized an unspecific response for any challenge such as beak trimming, thermic discomfort, social issues, feed privation, etc. Is known that stress modify poultry immune response and increases pathogen infections leading to economic losses caused by production and reproduction delay. Studies have been done to identify different proteins expressions under stress on different species. However, poultry did not have those stress modulation and alteration by stress elucidated. Therefore the aim of this study was investigated expressed stress molecular markers on poultry. Were selected 15 mRNA genetic sequences related to immune system. Results showed a non-homology between poultry and mammals sequences. From 15 sequences, 5 could not be predicted because they were more than 2500 nucleotides; from the other 10 sequences the analysis showed 20 conformational structure per each and the most stable sequence were accept by the Minimum Free Energy. The highest antigenic epitope were accepted by the maximum score, a total of 8934 epitopes were predicted and 15 were taken. These results will support future studies to expand understanding on how stress can modulate the immune system and possibilities to have a rapid diagnostic, helping on increasing animal welfare, biosecurity and productivity.Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas Gerais (FAPEMIG)O estresse é caracterizado como uma resposta inespecífica a quaisquer desafios, práticas de manejo como desconforto térmico, vacinação e debicagem, problemas de socialização, privação de alimento, dentre outros. Verifica-se que o estresse pode reduzir a resposta imune das aves e aumentar a predisposição a infecções e doenças, situação que remete a prejuízos econômicos por retardo da produção e/ou reprodução. Em aves, os mecanismos moleculares envolvidos no estresse e alteração da resposta imune, ainda, são pouco conhecidos. Sendo assim, o objetivo da presente proposta foi investigar marcadores moleculares expressos em aves quando em estresse. Foram selecionadas 15 sequências genéticas de RNA mensageiro relacionadas com o seu sistema imune. Também foi realizada a predição do escore máximo de antigenicidade da proteína que cada sequência seria traduzida. Os resultados demonstraram que não há homologia entre as sequências selecionadas de aves com as de mamíferos. Das 15 sequências, foi realizada a predição do RNAm de 10, isso, porque outras 5 apresentavam tamanho superior a 2500 nucleotídeos, sendo inviável a leitura pelo software. Vinte estruturas secundárias com a mínima energia livre foram analisadas para cada sequência. Foram eleitas as com menor energia, ou seja, com maior estabilidade. Na predição da antigenicidade dos epítopos, houve 8934 resultados e foram eleitos aqueles que apresentaram maior escore d e antigenicidade. Esse resultado corroborou para a continuação das análises, uma vez que é necessário o entendimento das estruturas secundárias de RNA mensageiro e da antigenicidade dos epítopos, para o desenvolvimento de plataforma de diagnostico rápido, para auxiliar os produtores a identificar lotes de animais que estão sobre estresse e, assim, melhorar a sanidade, bem-estar animal e aumento da sua produtividade.Universidade Federal de LavrasPrograma de Pós-Graduação em Ciências VeterináriasUFLAbrasilDepartamento de Medicina VeterináriaPeconick, Ana PaulaFassani, Édison JoséChalfun, Priscilla Rochele BarriosRaymundo, Djeison LutierBarçante, Thales AugustoLara, Lucas Januzzi2016-10-07T17:39:21Z2016-10-07T17:39:21Z2016-10-072016-08-05info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdfLARA, L. J. Avaliação In Silico de marcadores moleculares da resposta imunológica associados ao estresse de aves. 2016. 81 p. Dissertação (Mestrado em Ciências Veterinárias)-Universidade Federal de Lavras, Lavras, 2016.http://repositorio.ufla.br/jspui/handle/1/11896porinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da UFLAinstname:Universidade Federal de Lavras (UFLA)instacron:UFLA2023-05-09T19:24:05Zoai:localhost:1/11896Repositório InstitucionalPUBhttp://repositorio.ufla.br/oai/requestnivaldo@ufla.br || repositorio.biblioteca@ufla.bropendoar:2023-05-09T19:24:05Repositório Institucional da UFLA - Universidade Federal de Lavras (UFLA)false |
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