Seleção genômica ampla para volume e qualidade da madeira em eucalipto
Autor(a) principal: | |
---|---|
Data de Publicação: | 2015 |
Tipo de documento: | Tese |
Idioma: | por |
Título da fonte: | Repositório Institucional da UFLA |
Texto Completo: | http://repositorio.ufla.br/jspui/handle/1/11394 |
Resumo: | This project aimed to access the feasibility of Genome Wide Selection (GWS) on eucalypt breeding. For that, SNP and DArT markers were used for the early selection of a representative population from Fibria S.A. The population was composed from hybrids, derived from the mating of pre-selected E. grandis, E. urophylla, E. globules and E. camaldulensis plants, and also some interspecies hybrids. Matings were carried out randomly between 45 distinct genitors, which generaed 68 hybrid combinations and 611 individuals. Phenotypic data were collected at 24, 36 and 63 months old, for 20 traits related to volume and wood quality. Some traits were measured at two or more ages. Plants were also genotyped using SNP and DArT markers, totalizing 36,812 and 15,752 polymorphic markers, respectively. GWS analysis were carried out using RR-BLUP methodology. Predictive accuracies of 0.7 and higher were found for most characteristics, for both markers. In average, GWS validation accuracies were 46% and 40% inferiors than the predictive ones, for SNPs and DArTs, respectively. Validation accuracies were highly influenced by trait heritability and also marker heritability. SNPs and DArTs were very similar for predictive capacity (accuracy). GWS showed to be efficient for early selection, mainly for traits related to circumference at breast height and plant height, for both markers. |
id |
UFLA_55987a484e836733cafdfab4dfafbd29 |
---|---|
oai_identifier_str |
oai:localhost:1/11394 |
network_acronym_str |
UFLA |
network_name_str |
Repositório Institucional da UFLA |
repository_id_str |
|
spelling |
Seleção genômica ampla para volume e qualidade da madeira em eucaliptoPlantas - Melhoramento genéticoEucaliptoMarcadores genéticosPlant breedingEucalyptusGenetic markersEucaliptus spp.Genética VegetalThis project aimed to access the feasibility of Genome Wide Selection (GWS) on eucalypt breeding. For that, SNP and DArT markers were used for the early selection of a representative population from Fibria S.A. The population was composed from hybrids, derived from the mating of pre-selected E. grandis, E. urophylla, E. globules and E. camaldulensis plants, and also some interspecies hybrids. Matings were carried out randomly between 45 distinct genitors, which generaed 68 hybrid combinations and 611 individuals. Phenotypic data were collected at 24, 36 and 63 months old, for 20 traits related to volume and wood quality. Some traits were measured at two or more ages. Plants were also genotyped using SNP and DArT markers, totalizing 36,812 and 15,752 polymorphic markers, respectively. GWS analysis were carried out using RR-BLUP methodology. Predictive accuracies of 0.7 and higher were found for most characteristics, for both markers. In average, GWS validation accuracies were 46% and 40% inferiors than the predictive ones, for SNPs and DArTs, respectively. Validation accuracies were highly influenced by trait heritability and also marker heritability. SNPs and DArTs were very similar for predictive capacity (accuracy). GWS showed to be efficient for early selection, mainly for traits related to circumference at breast height and plant height, for both markers.Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)Objetivou-se, neste trabalho, avaliar a viabilidade da aplicação da seleção genômica ampla (GWS), no melhoramento do eucalipto. Para tanto, foram empregados marcadores SNPs e DArTs na seleção precoce de uma população representativa do programa de melhoramento da empresa Fibria S.A. A população foi composta de híbridos, derivados do cruzamento entre plantas pré-selecionadas de E. grandis, E. urophylla, E. globulus e E. camaldulensis e de alguns híbridos entre elas. As combinações híbridas foram feitas ao acaso, gerando 68 combinações híbridas, envolvendo 45 genitores distintos e, ao final, foram obtidos 611 indivíduos. Os dados fenotípicos foram coletados aos 24, 36 e 63 meses de idade, totalizando 20 características relacionadas ao volume e qualidade da madeira, sendo que algumas delas foram mensuradas em mais de uma idade. Estes indivíduos também foram genotipados, utilizando-se marcadores SNPs e DArTs, totalizando 36.812 e 15.742 marcadores polimórficos, respectivamente. As análises da GWS foram feitas pela metodologia do RR-BLUP. Acurácias preditivas acima de 0,7 foram encontradas para a maioria das características, para ambos marcadores. Acurácias de validação da GWS foram 46% e 40% inferiores as da predição, em média, para SNPs e DArTs, respectivamente, sendo elas altamente influenciadas pela herdabilidade da característica e também da marca. SNPs e DArTs foram equivalentes em termos de capacidade preditiva (acurácia).A GWS mostrou-se eficiente para seleção precoce principalmente para as características circunferência à altura do peito e altura total das plantas, para ambos marcadores.Universidade Federal de LavrasPrograma de Pós-Graduação em Genética e Melhoramento de PlantasUFLAbrasilDepartamento de BiologiaGonçalves, Flávia Maria AvelarRamalho, Magno Antonio PattoAguiar, Aurélio MendesRamalho, Magno Antonio PattoAguiar, Aurélio MendesMissiagia, Alexandre AlvesDias, Luiz Antônio dos SantosRezende, Breno Alvarenga2016-07-21T13:40:57Z2016-07-21T13:40:57Z2016-06-242015-04-17info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesisapplication/pdfREZENDE, B. A. Seleção genômica ampla para volume e qualidade da madeira em eucalipto. 2015. 74 p. Tese (Doutorado em Genética e Melhoramento de Plantas)-Universidade Federal de Lavras, Lavras, 2015.http://repositorio.ufla.br/jspui/handle/1/11394porinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da UFLAinstname:Universidade Federal de Lavras (UFLA)instacron:UFLA2023-04-28T17:20:17Zoai:localhost:1/11394Repositório InstitucionalPUBhttp://repositorio.ufla.br/oai/requestnivaldo@ufla.br || repositorio.biblioteca@ufla.bropendoar:2023-04-28T17:20:17Repositório Institucional da UFLA - Universidade Federal de Lavras (UFLA)false |
dc.title.none.fl_str_mv |
Seleção genômica ampla para volume e qualidade da madeira em eucalipto |
title |
Seleção genômica ampla para volume e qualidade da madeira em eucalipto |
spellingShingle |
Seleção genômica ampla para volume e qualidade da madeira em eucalipto Rezende, Breno Alvarenga Plantas - Melhoramento genético Eucalipto Marcadores genéticos Plant breeding Eucalyptus Genetic markers Eucaliptus spp. Genética Vegetal |
title_short |
Seleção genômica ampla para volume e qualidade da madeira em eucalipto |
title_full |
Seleção genômica ampla para volume e qualidade da madeira em eucalipto |
title_fullStr |
Seleção genômica ampla para volume e qualidade da madeira em eucalipto |
title_full_unstemmed |
Seleção genômica ampla para volume e qualidade da madeira em eucalipto |
title_sort |
Seleção genômica ampla para volume e qualidade da madeira em eucalipto |
author |
Rezende, Breno Alvarenga |
author_facet |
Rezende, Breno Alvarenga |
author_role |
author |
dc.contributor.none.fl_str_mv |
Gonçalves, Flávia Maria Avelar Ramalho, Magno Antonio Patto Aguiar, Aurélio Mendes Ramalho, Magno Antonio Patto Aguiar, Aurélio Mendes Missiagia, Alexandre Alves Dias, Luiz Antônio dos Santos |
dc.contributor.author.fl_str_mv |
Rezende, Breno Alvarenga |
dc.subject.por.fl_str_mv |
Plantas - Melhoramento genético Eucalipto Marcadores genéticos Plant breeding Eucalyptus Genetic markers Eucaliptus spp. Genética Vegetal |
topic |
Plantas - Melhoramento genético Eucalipto Marcadores genéticos Plant breeding Eucalyptus Genetic markers Eucaliptus spp. Genética Vegetal |
description |
This project aimed to access the feasibility of Genome Wide Selection (GWS) on eucalypt breeding. For that, SNP and DArT markers were used for the early selection of a representative population from Fibria S.A. The population was composed from hybrids, derived from the mating of pre-selected E. grandis, E. urophylla, E. globules and E. camaldulensis plants, and also some interspecies hybrids. Matings were carried out randomly between 45 distinct genitors, which generaed 68 hybrid combinations and 611 individuals. Phenotypic data were collected at 24, 36 and 63 months old, for 20 traits related to volume and wood quality. Some traits were measured at two or more ages. Plants were also genotyped using SNP and DArT markers, totalizing 36,812 and 15,752 polymorphic markers, respectively. GWS analysis were carried out using RR-BLUP methodology. Predictive accuracies of 0.7 and higher were found for most characteristics, for both markers. In average, GWS validation accuracies were 46% and 40% inferiors than the predictive ones, for SNPs and DArTs, respectively. Validation accuracies were highly influenced by trait heritability and also marker heritability. SNPs and DArTs were very similar for predictive capacity (accuracy). GWS showed to be efficient for early selection, mainly for traits related to circumference at breast height and plant height, for both markers. |
publishDate |
2015 |
dc.date.none.fl_str_mv |
2015-04-17 2016-07-21T13:40:57Z 2016-07-21T13:40:57Z 2016-06-24 |
dc.type.status.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/publishedVersion |
dc.type.driver.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/doctoralThesis |
format |
doctoralThesis |
status_str |
publishedVersion |
dc.identifier.uri.fl_str_mv |
REZENDE, B. A. Seleção genômica ampla para volume e qualidade da madeira em eucalipto. 2015. 74 p. Tese (Doutorado em Genética e Melhoramento de Plantas)-Universidade Federal de Lavras, Lavras, 2015. http://repositorio.ufla.br/jspui/handle/1/11394 |
identifier_str_mv |
REZENDE, B. A. Seleção genômica ampla para volume e qualidade da madeira em eucalipto. 2015. 74 p. Tese (Doutorado em Genética e Melhoramento de Plantas)-Universidade Federal de Lavras, Lavras, 2015. |
url |
http://repositorio.ufla.br/jspui/handle/1/11394 |
dc.language.iso.fl_str_mv |
por |
language |
por |
dc.rights.driver.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/openAccess |
eu_rights_str_mv |
openAccess |
dc.format.none.fl_str_mv |
application/pdf |
dc.publisher.none.fl_str_mv |
Universidade Federal de Lavras Programa de Pós-Graduação em Genética e Melhoramento de Plantas UFLA brasil Departamento de Biologia |
publisher.none.fl_str_mv |
Universidade Federal de Lavras Programa de Pós-Graduação em Genética e Melhoramento de Plantas UFLA brasil Departamento de Biologia |
dc.source.none.fl_str_mv |
reponame:Repositório Institucional da UFLA instname:Universidade Federal de Lavras (UFLA) instacron:UFLA |
instname_str |
Universidade Federal de Lavras (UFLA) |
instacron_str |
UFLA |
institution |
UFLA |
reponame_str |
Repositório Institucional da UFLA |
collection |
Repositório Institucional da UFLA |
repository.name.fl_str_mv |
Repositório Institucional da UFLA - Universidade Federal de Lavras (UFLA) |
repository.mail.fl_str_mv |
nivaldo@ufla.br || repositorio.biblioteca@ufla.br |
_version_ |
1815439368222932992 |