Estudos quantitativos multidimensionais de correlação estrutura-atividade de inibidores peptídicos da HIV-1 protease
Autor(a) principal: | |
---|---|
Data de Publicação: | 2009 |
Tipo de documento: | Dissertação |
Idioma: | por |
Título da fonte: | Repositório Institucional da UFLA |
Texto Completo: | http://repositorio.ufla.br/jspui/handle/1/1338 |
Resumo: | Dissertação apresentada à Universidade Federal de Lavras, como parte das exigências do Programa de Pós-Graduação em Agroquímica, área de concentração em Agroquímica, para a obtenção do título de Mestre. |
id |
UFLA_9353118c44dae118420cae76f59fe949 |
---|---|
oai_identifier_str |
oai:localhost:1/1338 |
network_acronym_str |
UFLA |
network_name_str |
Repositório Institucional da UFLA |
repository_id_str |
|
spelling |
Estudos quantitativos multidimensionais de correlação estrutura-atividade de inibidores peptídicos da HIV-1 proteaseQuantitative studies of correlation structure activity of peptides inhibiters of the HIV-1 proteaseAIDSProteaseInibidor peptídicoHIV-1QSAR-5/6DProteasePeptide inhibitorCNPQ_NÃO_INFORMADODissertação apresentada à Universidade Federal de Lavras, como parte das exigências do Programa de Pós-Graduação em Agroquímica, área de concentração em Agroquímica, para a obtenção do título de Mestre.Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)AgroquímicaAIDS is a disease provoked by a specific virus, which affects the immunologic defense system. HIV-1 protease is a homodimer, which plays the role of "molecular scissors" in cleaving several non-functional polyproteins into smaller and functional proteins in order to generate mature proteins. According to The Joint United Nations Programme on HIV/AIDS - UNAIDS (2009), latest informative, it is estimated that 34,000,000 persons live with HIV/AIDS all over the world. Quantitative studies of structure-activity relationship on 5D and 6D (QSAR-5D and 6D) of 46 peptide inhibitors with central vicinal diol grouping of HIV-1 protease, were performed by using QSAR-5D (RAPTOR, Receptor as Poly Tier Object Representation) and QSAR-6D (QUASAR, The quase-atomistic receptor modeling). Twelve compounds, which did not make part of the calculations at the step of generating the models, were used to validate the QSAR-5D and 6D methods. The QSAR-5D and 6D models were generated only by utilizing the partial least square methodology. The best model of the QSAR-5D method generated values of R2Training and R2Test equal to 0.944 and 0.793, respectively. The best model of the QSAR-6D method generated values of e R2Training and R2Test equal to 0.001 and 0.-0,040, respectively. Then, the methods will be useful to map the interaction sites of compounds under study and propose structural modifications with the objective of making them more potent and, consequently, better HIV-1 protease inhibitors.A AIDS é uma doença provocada por um vírus específico, que afeta o sistema de defesa imunológico. HIV-1 protease é um homodímero, que desempenha o papel de "tesoura molecular" ao clivar diversas poliproteínas não funcionais em proteínas menores e funcionais, de forma a produzir proteínas maduras. Segundo o último informativo da The Joint United Nations Programme on HIV/AIDS - UNAIDS (2009), estima-se que vivem com HIV/AIDS 34.000.000 de pessoas em todo o mundo. Estudos quantitativos de relação estrutura-atividade em 5D e 6D (QSAR-5D e 6D), de 46 inibidores peptídicos com grupamento diol vicinal central da HIV-1 protease, foram realizados usando QSAR-5D (RAPTOR, Receptor as Poly Tier Object Representation) e QSAR-6D (QUASAR, The quase-atomistic receptor modeling). Doze compostos, que não fizeram parte dos cálculos na etapa de geração dos modelos, foram usados para validar os métodos QSAR-5D e 6D. Os modelos de QSAR-5D e 6D foram gerados apenas utilizando a metodologia dos mínimos quadrados parciais. O melhor modelo do método QSAR-5D gerou valores de R2Treinamento e R2Teste iguais a 0,944 e 0,793, respectivamente. O melhor modelo do método QSAR-6D gerou valores de R2Treinamento e R2Teste iguais a 0,001 e 0,-0,040, respectivamente. Os métodos servirão, portanto, para mapear os sítios de interação da série de compostos em estudo e propor modificações estruturais com o objetivo de torná-los mais potentes e, conseqüentemente, melhores inibidores da HIV-1 protease.UNIVERSIDADE FEDERAL DE LAVRASDQI - Programa de Pós-graduaçãoUFLABRASILCunha, Elaine Fontes Ferreira daPaiva, Luciano VilelaFreitas, Matheus Puggina deSouza, Thaís Cristina Silva de2013-11-11T11:58:11Z2013-11-11T11:58:11Z201320132009-07-09info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdfSOUZA, T. C. S. de. Estudos quantitativos multidimensionais de correlação estrutura-atividade de inibidores peptídicos da HIV-1 protease. 2009. 100 p. Dissertação (Mestrado em Agroquímica)-Universidade Federal de Lavras, Lavras, 2009.http://repositorio.ufla.br/jspui/handle/1/1338info:eu-repo/semantics/openAccessporreponame:Repositório Institucional da UFLAinstname:Universidade Federal de Lavras (UFLA)instacron:UFLA2013-11-11T13:05:29Zoai:localhost:1/1338Repositório InstitucionalPUBhttp://repositorio.ufla.br/oai/requestnivaldo@ufla.br || repositorio.biblioteca@ufla.bropendoar:2013-11-11T13:05:29Repositório Institucional da UFLA - Universidade Federal de Lavras (UFLA)false |
dc.title.none.fl_str_mv |
Estudos quantitativos multidimensionais de correlação estrutura-atividade de inibidores peptídicos da HIV-1 protease Quantitative studies of correlation structure activity of peptides inhibiters of the HIV-1 protease |
title |
Estudos quantitativos multidimensionais de correlação estrutura-atividade de inibidores peptídicos da HIV-1 protease |
spellingShingle |
Estudos quantitativos multidimensionais de correlação estrutura-atividade de inibidores peptídicos da HIV-1 protease Souza, Thaís Cristina Silva de AIDS Protease Inibidor peptídico HIV-1 QSAR-5/6D Protease Peptide inhibitor CNPQ_NÃO_INFORMADO |
title_short |
Estudos quantitativos multidimensionais de correlação estrutura-atividade de inibidores peptídicos da HIV-1 protease |
title_full |
Estudos quantitativos multidimensionais de correlação estrutura-atividade de inibidores peptídicos da HIV-1 protease |
title_fullStr |
Estudos quantitativos multidimensionais de correlação estrutura-atividade de inibidores peptídicos da HIV-1 protease |
title_full_unstemmed |
Estudos quantitativos multidimensionais de correlação estrutura-atividade de inibidores peptídicos da HIV-1 protease |
title_sort |
Estudos quantitativos multidimensionais de correlação estrutura-atividade de inibidores peptídicos da HIV-1 protease |
author |
Souza, Thaís Cristina Silva de |
author_facet |
Souza, Thaís Cristina Silva de |
author_role |
author |
dc.contributor.none.fl_str_mv |
Cunha, Elaine Fontes Ferreira da Paiva, Luciano Vilela Freitas, Matheus Puggina de |
dc.contributor.author.fl_str_mv |
Souza, Thaís Cristina Silva de |
dc.subject.por.fl_str_mv |
AIDS Protease Inibidor peptídico HIV-1 QSAR-5/6D Protease Peptide inhibitor CNPQ_NÃO_INFORMADO |
topic |
AIDS Protease Inibidor peptídico HIV-1 QSAR-5/6D Protease Peptide inhibitor CNPQ_NÃO_INFORMADO |
description |
Dissertação apresentada à Universidade Federal de Lavras, como parte das exigências do Programa de Pós-Graduação em Agroquímica, área de concentração em Agroquímica, para a obtenção do título de Mestre. |
publishDate |
2009 |
dc.date.none.fl_str_mv |
2009-07-09 2013-11-11T11:58:11Z 2013-11-11T11:58:11Z 2013 2013 |
dc.type.status.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/publishedVersion |
dc.type.driver.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/masterThesis |
format |
masterThesis |
status_str |
publishedVersion |
dc.identifier.uri.fl_str_mv |
SOUZA, T. C. S. de. Estudos quantitativos multidimensionais de correlação estrutura-atividade de inibidores peptídicos da HIV-1 protease. 2009. 100 p. Dissertação (Mestrado em Agroquímica)-Universidade Federal de Lavras, Lavras, 2009. http://repositorio.ufla.br/jspui/handle/1/1338 |
identifier_str_mv |
SOUZA, T. C. S. de. Estudos quantitativos multidimensionais de correlação estrutura-atividade de inibidores peptídicos da HIV-1 protease. 2009. 100 p. Dissertação (Mestrado em Agroquímica)-Universidade Federal de Lavras, Lavras, 2009. |
url |
http://repositorio.ufla.br/jspui/handle/1/1338 |
dc.language.iso.fl_str_mv |
por |
language |
por |
dc.rights.driver.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/openAccess |
eu_rights_str_mv |
openAccess |
dc.format.none.fl_str_mv |
application/pdf |
dc.publisher.none.fl_str_mv |
UNIVERSIDADE FEDERAL DE LAVRAS DQI - Programa de Pós-graduação UFLA BRASIL |
publisher.none.fl_str_mv |
UNIVERSIDADE FEDERAL DE LAVRAS DQI - Programa de Pós-graduação UFLA BRASIL |
dc.source.none.fl_str_mv |
reponame:Repositório Institucional da UFLA instname:Universidade Federal de Lavras (UFLA) instacron:UFLA |
instname_str |
Universidade Federal de Lavras (UFLA) |
instacron_str |
UFLA |
institution |
UFLA |
reponame_str |
Repositório Institucional da UFLA |
collection |
Repositório Institucional da UFLA |
repository.name.fl_str_mv |
Repositório Institucional da UFLA - Universidade Federal de Lavras (UFLA) |
repository.mail.fl_str_mv |
nivaldo@ufla.br || repositorio.biblioteca@ufla.br |
_version_ |
1815439030952656896 |