Avaliação in silico de padrões moleculares associados ao dano (DAMPs) e seus receptores em seres humanos
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Data de Publicação: | 2019 |
Tipo de documento: | Dissertação |
Idioma: | por |
Título da fonte: | Repositório Institucional da UFLA |
Texto Completo: | http://repositorio.ufla.br/jspui/handle/1/34355 |
Resumo: | Damage associated molecular patterns (DAMPs) are intracellular molecules that are released into the extracellular environment after cell damage, and are pattern recognition receptors (PRRs) and activate the innate immune system, triggering an inflammatory response. The immune response trigg ered by DAMPs is called sterile inflammation because it is initiated after trauma, ischemia, cellular necrosis, without pathogenic action. Among the PRRs are the Toll -like Receptor (TLRs), the Receptor for Advanced Glycation Endproducts (RAGEs), Interleukin 1 Receptor (IL1R1), Nod-like Receptor (NLRs), and Melanoma 2 Absent Receptor (AIM- 2). These PRRs are expressed in macrophages, dendritic cells and in several other defense cells, and trigger signaling cascades, such as activation of nuclear factor κB (NF-κB), mitogen-activated protein kinase (MAPK), interferon I (IFN- I), phosphatidylinositol-3-kinase (PI3K), inducing transcription of genes for expression of pro inflammatory cytokines and chemokines important in the immune response. Among the most commonly mentioned DAMPs are S100 proteins, Heat Shock Proteins (HSPs) and the High Mobility Box Group 1 (HMGB1). These molecules are closely involved in the etiopathogenesis of chronic diseases such as cancer, diabetes, liver disease, heart disease; and neurodegenerative diseases. In this context, the creation of specific markers that allow the assembly of biological assays, with a view to elucidating the molecular mechanisms implicit in these diseases, is of great relevance. Thus, with the aid of bioinformatics, the present work investigated different human DAMPs and their receptors, obtaining their amino acid sequences, free energy prediction, prediction of epitope antigenicity, similarity analysis and primer designs with the potential to amplify target sequences. The results presented are promising and could be used as immuno modulators or diagnostic and prognostic platforms in various diseases. |
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Avaliação in silico de padrões moleculares associados ao dano (DAMPs) e seus receptores em seres humanosIn silico assessment of damage associated molecular patterns (damps) and their receptors humansBioinformáticaSistema imunológicoDoençasmRNABioinformaticsImmune systemDiseasesCiências da SaúdeDamage associated molecular patterns (DAMPs) are intracellular molecules that are released into the extracellular environment after cell damage, and are pattern recognition receptors (PRRs) and activate the innate immune system, triggering an inflammatory response. The immune response trigg ered by DAMPs is called sterile inflammation because it is initiated after trauma, ischemia, cellular necrosis, without pathogenic action. Among the PRRs are the Toll -like Receptor (TLRs), the Receptor for Advanced Glycation Endproducts (RAGEs), Interleukin 1 Receptor (IL1R1), Nod-like Receptor (NLRs), and Melanoma 2 Absent Receptor (AIM- 2). These PRRs are expressed in macrophages, dendritic cells and in several other defense cells, and trigger signaling cascades, such as activation of nuclear factor κB (NF-κB), mitogen-activated protein kinase (MAPK), interferon I (IFN- I), phosphatidylinositol-3-kinase (PI3K), inducing transcription of genes for expression of pro inflammatory cytokines and chemokines important in the immune response. Among the most commonly mentioned DAMPs are S100 proteins, Heat Shock Proteins (HSPs) and the High Mobility Box Group 1 (HMGB1). These molecules are closely involved in the etiopathogenesis of chronic diseases such as cancer, diabetes, liver disease, heart disease; and neurodegenerative diseases. In this context, the creation of specific markers that allow the assembly of biological assays, with a view to elucidating the molecular mechanisms implicit in these diseases, is of great relevance. Thus, with the aid of bioinformatics, the present work investigated different human DAMPs and their receptors, obtaining their amino acid sequences, free energy prediction, prediction of epitope antigenicity, similarity analysis and primer designs with the potential to amplify target sequences. The results presented are promising and could be used as immuno modulators or diagnostic and prognostic platforms in various diseases.Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas Gerais (FAPEMIG)Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)Os padrões moleculares associados ao dano (DAMPs) são moléculas intracelulares que são lançadas para o meio extracelular após lesão celular, e são reconhecidas por receptores de reconhecimento de padrão (PRRs) e ativam o sistema imune inato, desencadeando resposta inflamatória. A resposta imune desencadeada por DAMPs é chamada de inflamação estéril por ser iniciada após trauma, isquemia, necrose celular, sem ação patogênica. Dentre os PRRs, estão o Receptor Toll-like (TLRs), o Receptor para Produtos Finais de Glicação Avançada (RAGEs), Receptor de Interleucina 1 (IL1R1), Receptor Nod-like (NLRs) e Receptor Ausente no Melanoma 2 (AIM-2). Esses PRRs são expressos em macrófagos, células dendríticas e em várias outras células de defesa, e desencadeiam cascatas d e sinalização, como a ativação do fator nuclear κB (NF-κB), proteína quinase ativada por mitógenos (MAPK), interferon I (IFN-I), fosfatidilinositol-3-quinase (PI3K), induzindo a transcrição de genes para expressão de citocinas pró -inflamatórias e quimiocinas importantes na resposta imunológica. Dentre os DAMPs mais comumente citados encontram-se as proteínas S100, as Proteínas de Choque Térmico (HSPs) e o Grupo Box de Alta Mobilidade 1 (HMGB1). Essas moléculas encontram-se intimamente envolvidas na etiopato genia de doenças crônicas como câncer, diabetes, hepatopatias, cardiopatias; e doenças neurodegenerativas. Nesse contexto, a criação de marcadores específicos que viabilizem a montagem de ensaios biológicos, com vistas à elucidação dos mecanismos moleculares implícitos nessas enfermidades, assume grande relevância. Assim, com o auxílio da bioinformática, o presente trabalho investigou diferentes DAMPs humanos e seus receptores, obtendosuas sequências de aminoácidos, predição de energia livre, predição de antigenicidade de epítopos, análise de similaridade e desenhos de primers com potencial de amplificar sequências alvos. Os resultados apresentados são promissores e poderão ser utilizados como imuno moduladores ou como plataformas de diagnóstico e prognóstico em várias enfermidades.Universidade Federal de LavrasPrograma de Pós-Graduação em Ciências da SaúdeUFLAbrasilDepartamento de Ciências da SaúdePeconick, Ana PaulaPereira, Luciano JoséPorto, Laura Cristina JardimUtiumi, Kiyoko UemuraFoureaux, Renata de CarvalhoMoura, Rodrigo Ferreira deOliveira, Erika Aparecida2019-05-22T13:47:09Z2019-05-22T13:47:09Z2019-05-222019-03-22info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdfOLIVEIRA, E. A. Avaliação in silico de padrões moleculares associados ao dano (DAMPs) e seus receptores em seres humanos. 2019. 84 p. Dissertação (Mestrado em Ciências da Saúde) – Universidade Federal de Lavras, Lavras, 2019.http://repositorio.ufla.br/jspui/handle/1/34355porinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da UFLAinstname:Universidade Federal de Lavras (UFLA)instacron:UFLA2023-04-10T12:04:00Zoai:localhost:1/34355Repositório InstitucionalPUBhttp://repositorio.ufla.br/oai/requestnivaldo@ufla.br || repositorio.biblioteca@ufla.bropendoar:2023-04-10T12:04Repositório Institucional da UFLA - Universidade Federal de Lavras (UFLA)false |
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