Comparação entre métodos de estimação do coeficiente de endogamia com dados de frequências alélicas em uma população diplóide

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Muniz, Joel Augusto
Data de Publicação: 2010
Outros Autores: Costa, Gabriela Quandt, Reis, Ricardo Luis, Veiga, Ruben Delly
Tipo de documento: Artigo
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Institucional da UFLA
Texto Completo: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1413-70542010000100005
http://repositorio.ufla.br/jspui/handle/1/7143
Resumo: The present work evaluated the properties of three estimators of the inbreeding coefficient, F, in a diploid population with two alleles, using data of gene frequencies in individuals from random samples obtained from populations simulated through the SAS. We evaluated the estimators of F obtained by variance analysis of allelic frequencies, obtained by moment method, and estimator obtained by maximum likelihood method. The analysis of the means and variances of the estimators, obtained from 1000 estimates of F, calculated for each sample size, demonstrated that the three estimators were biased. However, it was observed that the estimator obtained from univariate analysis was less biased and presented smaller variance, when the inbreeding coefficient in the population was elevated, while for populations with low inbreeding, the variance of the estimator obtained by the multivariate analysis was smaller.
id UFLA_e72b09e4f0da642906d97812e6eaabf4
oai_identifier_str oai:localhost:1/7143
network_acronym_str UFLA
network_name_str Repositório Institucional da UFLA
repository_id_str
spelling Comparação entre métodos de estimação do coeficiente de endogamia com dados de frequências alélicas em uma população diplóideComparison among inbreeding coefficient estimation methods in a diploid population with two allelesMétodo dos momentosMétodo da máxima verossimilhançaAnálise de variância de freqüências alélicasTamanho amostralViés algorítmicoCoeficiente de endogamiaMoment methodMaximum likelihood methodVariance analysis of allelic frequenciesSample sizeAlgorithmic biasInbreeding coefficientThe present work evaluated the properties of three estimators of the inbreeding coefficient, F, in a diploid population with two alleles, using data of gene frequencies in individuals from random samples obtained from populations simulated through the SAS. We evaluated the estimators of F obtained by variance analysis of allelic frequencies, obtained by moment method, and estimator obtained by maximum likelihood method. The analysis of the means and variances of the estimators, obtained from 1000 estimates of F, calculated for each sample size, demonstrated that the three estimators were biased. However, it was observed that the estimator obtained from univariate analysis was less biased and presented smaller variance, when the inbreeding coefficient in the population was elevated, while for populations with low inbreeding, the variance of the estimator obtained by the multivariate analysis was smaller.Neste trabalho, objetivou-se comparar três estimadores do coeficiente de endogamia, F, em uma população diplóide com dois alelos, utilizando-se dados de frequências alélicas em amostras de indíviduos, com diferentes tamanhos obtidas em populações simuladas, por meio do software SAS. Foi avaliado o estimador de F, obtido pela análise de variância de frequências alélicas, o estimador considerando o método dos momentos e o estimador pelo método da máxima verossimilhança. Os resultados encontrados para a média e variância os estimadores, a partir de 1000 estimativas de F, calculadas para cada tamanho de amostra, mostraram que os três estimadores são tendenciosos. Entretanto, de maneira geral, observou-se que o estimador considerando a análise de variância foi menos tendencioso e apresentou menor variância, quando o coeficiente de endogamia da população foi alto. Para tamanho de amostra superior a 50, os três estimadores tiveram comportamento semelhante, independente da frequência alélica e da endogamia da população.Editora da Universidade Federal de Lavras2010-02-012015-04-30T13:35:37Z2015-04-30T13:35:37Z2015-04-30info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/articletext/htmlhttp://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1413-70542010000100005MUNIZ, J. A. et al. Comparação entre métodos de estimação do coeficiente de endogamia com dados de frequências alélicas em uma população diplóide. Ciência e Agrotecnologia, Lavras, v. 34, n. 1, p. 43-54, jan./fev. 2010.http://repositorio.ufla.br/jspui/handle/1/7143Ciência e Agrotecnologia v.34 n.1 2010reponame:Repositório Institucional da UFLAinstname:Universidade Federal de Lavras (UFLA)instacron:UFLAMuniz, Joel AugustoCosta, Gabriela QuandtReis, Ricardo LuisVeiga, Ruben Dellyporinfo:eu-repo/semantics/openAccess2021-11-17T15:49:22Zoai:localhost:1/7143Repositório InstitucionalPUBhttp://repositorio.ufla.br/oai/requestnivaldo@ufla.br || repositorio.biblioteca@ufla.bropendoar:2021-11-17T15:49:22Repositório Institucional da UFLA - Universidade Federal de Lavras (UFLA)false
dc.title.none.fl_str_mv Comparação entre métodos de estimação do coeficiente de endogamia com dados de frequências alélicas em uma população diplóide
Comparison among inbreeding coefficient estimation methods in a diploid population with two alleles
title Comparação entre métodos de estimação do coeficiente de endogamia com dados de frequências alélicas em uma população diplóide
spellingShingle Comparação entre métodos de estimação do coeficiente de endogamia com dados de frequências alélicas em uma população diplóide
Muniz, Joel Augusto
Método dos momentos
Método da máxima verossimilhança
Análise de variância de freqüências alélicas
Tamanho amostral
Viés algorítmico
Coeficiente de endogamia
Moment method
Maximum likelihood method
Variance analysis of allelic frequencies
Sample size
Algorithmic bias
Inbreeding coefficient
title_short Comparação entre métodos de estimação do coeficiente de endogamia com dados de frequências alélicas em uma população diplóide
title_full Comparação entre métodos de estimação do coeficiente de endogamia com dados de frequências alélicas em uma população diplóide
title_fullStr Comparação entre métodos de estimação do coeficiente de endogamia com dados de frequências alélicas em uma população diplóide
title_full_unstemmed Comparação entre métodos de estimação do coeficiente de endogamia com dados de frequências alélicas em uma população diplóide
title_sort Comparação entre métodos de estimação do coeficiente de endogamia com dados de frequências alélicas em uma população diplóide
author Muniz, Joel Augusto
author_facet Muniz, Joel Augusto
Costa, Gabriela Quandt
Reis, Ricardo Luis
Veiga, Ruben Delly
author_role author
author2 Costa, Gabriela Quandt
Reis, Ricardo Luis
Veiga, Ruben Delly
author2_role author
author
author
dc.contributor.author.fl_str_mv Muniz, Joel Augusto
Costa, Gabriela Quandt
Reis, Ricardo Luis
Veiga, Ruben Delly
dc.subject.por.fl_str_mv Método dos momentos
Método da máxima verossimilhança
Análise de variância de freqüências alélicas
Tamanho amostral
Viés algorítmico
Coeficiente de endogamia
Moment method
Maximum likelihood method
Variance analysis of allelic frequencies
Sample size
Algorithmic bias
Inbreeding coefficient
topic Método dos momentos
Método da máxima verossimilhança
Análise de variância de freqüências alélicas
Tamanho amostral
Viés algorítmico
Coeficiente de endogamia
Moment method
Maximum likelihood method
Variance analysis of allelic frequencies
Sample size
Algorithmic bias
Inbreeding coefficient
description The present work evaluated the properties of three estimators of the inbreeding coefficient, F, in a diploid population with two alleles, using data of gene frequencies in individuals from random samples obtained from populations simulated through the SAS. We evaluated the estimators of F obtained by variance analysis of allelic frequencies, obtained by moment method, and estimator obtained by maximum likelihood method. The analysis of the means and variances of the estimators, obtained from 1000 estimates of F, calculated for each sample size, demonstrated that the three estimators were biased. However, it was observed that the estimator obtained from univariate analysis was less biased and presented smaller variance, when the inbreeding coefficient in the population was elevated, while for populations with low inbreeding, the variance of the estimator obtained by the multivariate analysis was smaller.
publishDate 2010
dc.date.none.fl_str_mv 2010-02-01
2015-04-30T13:35:37Z
2015-04-30T13:35:37Z
2015-04-30
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/article
format article
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1413-70542010000100005
MUNIZ, J. A. et al. Comparação entre métodos de estimação do coeficiente de endogamia com dados de frequências alélicas em uma população diplóide. Ciência e Agrotecnologia, Lavras, v. 34, n. 1, p. 43-54, jan./fev. 2010.
http://repositorio.ufla.br/jspui/handle/1/7143
url http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1413-70542010000100005
http://repositorio.ufla.br/jspui/handle/1/7143
identifier_str_mv MUNIZ, J. A. et al. Comparação entre métodos de estimação do coeficiente de endogamia com dados de frequências alélicas em uma população diplóide. Ciência e Agrotecnologia, Lavras, v. 34, n. 1, p. 43-54, jan./fev. 2010.
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv text/html
dc.publisher.none.fl_str_mv Editora da Universidade Federal de Lavras
publisher.none.fl_str_mv Editora da Universidade Federal de Lavras
dc.source.none.fl_str_mv Ciência e Agrotecnologia v.34 n.1 2010
reponame:Repositório Institucional da UFLA
instname:Universidade Federal de Lavras (UFLA)
instacron:UFLA
instname_str Universidade Federal de Lavras (UFLA)
instacron_str UFLA
institution UFLA
reponame_str Repositório Institucional da UFLA
collection Repositório Institucional da UFLA
repository.name.fl_str_mv Repositório Institucional da UFLA - Universidade Federal de Lavras (UFLA)
repository.mail.fl_str_mv nivaldo@ufla.br || repositorio.biblioteca@ufla.br
_version_ 1815439277938442240