Alinhamento múltiplo global de seqüências pela representação de profile e clusterização: comparação com os resultados do clustalw (embl-ebi)

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Silva, Marco Túlio Nogueira
Data de Publicação: 2006
Tipo de documento: Trabalho de conclusão de curso
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Institucional da UFLA
Texto Completo: http://repositorio.ufla.br/jspui/handle/1/5471
Resumo: The progress of the biology, mainly in the context of bioinformatics, in addition to requirements of specific systems, with the purpose of studying as well as practical use, raises the development of softwares and hardware to deal with huge amount of data. To this end, it is essential the knowledge of methods used in sequence aligment, what allows the development of new methods and theories mixing with the existent ones. In this work, we study the several methods used in sequence alignment in general and, verify the more appropriate to deal with global multiple sequences alignment. We implement this method and compared the result obtained with the one provided by the ClustalW tool (http://www.ebi.ac.uk/clustalW). The parallel implementation of the method used is required to deal with practical sequences.
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