Análise bayesiana de um modelo linear generalizado misto: emprego no melhoramento de plantas

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Silva, José Waldemar da
Data de Publicação: 2004
Tipo de documento: Dissertação
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Institucional da UFLA
Texto Completo: http://repositorio.ufla.br/jspui/handle/1/3423
Resumo: Esta dissertação/tese está disponível online com base na Resolução CEPE nº 090, de 24 de março de 2015, disponível em http://www.biblioteca.ufla.br/wordpress/wp-content/uploads/res090-2015.pdf, que dispõe sobre a disponibilização da coleção retrospectiva de teses e dissertações online no Repositório Institucional da UFLA, sem autorização prévia dos autores. Parágrafo Único. Caberá ao autor ou orientador a solicitação de restrição quanto à divulgação de teses e dissertações com pedidos de patente ou qualquer embargo similar. Art. 5º A obra depositada no RIUFLA que tenha direitos autorais externos à Universidade Federal de Lavras poderá ser removida mediante solicitação por escrito, exclusivamente do autor, encaminhada à Comissão Técnica da Biblioteca Universitária./ Arquivo gerado por meio da digitalização de material impresso. Alguns caracteres podem ter sido reconhecidos erroneamente.
id UFLA_fb0d6c2fd2d0ab8019eccd5198ccef7a
oai_identifier_str oai:localhost:1/3423
network_acronym_str UFLA
network_name_str Repositório Institucional da UFLA
repository_id_str
spelling Análise bayesiana de um modelo linear generalizado misto: emprego no melhoramento de plantasBayesian annalysis of a generalized linear mixed model in plant breedingComponentes da variânciaInferência bayesianaModelos lineares generalizados mistosModelo poissonBayesian inferenceVariance componentsGeneralized mixed linear modelsPoisson modelsPotatoCNPQ_NÃO_INFORMADOEsta dissertação/tese está disponível online com base na Resolução CEPE nº 090, de 24 de março de 2015, disponível em http://www.biblioteca.ufla.br/wordpress/wp-content/uploads/res090-2015.pdf, que dispõe sobre a disponibilização da coleção retrospectiva de teses e dissertações online no Repositório Institucional da UFLA, sem autorização prévia dos autores. Parágrafo Único. Caberá ao autor ou orientador a solicitação de restrição quanto à divulgação de teses e dissertações com pedidos de patente ou qualquer embargo similar. Art. 5º A obra depositada no RIUFLA que tenha direitos autorais externos à Universidade Federal de Lavras poderá ser removida mediante solicitação por escrito, exclusivamente do autor, encaminhada à Comissão Técnica da Biblioteca Universitária./ Arquivo gerado por meio da digitalização de material impresso. Alguns caracteres podem ter sido reconhecidos erroneamente.Estatística e Experimentação AgropecuáriaA análise de dados experimentais freqüentemente envolve tratamentos de efeitos aleatórios. São também relativamente frequentes dados de contagens para características de interesse, que em geral apresentam distribuição Poisson. Nestes casos a forma adequada de analise é ajustar modelos lineares generalizados mistos (MLGM). É comum a realização de inferências de forma assintótica usando aproximações normais do modelo descrito acima. Embora muitas vezes tais aproximações sejam satisfatórias, a inferência bayesiana permite a obtenção de distribuições exatas a posteriori para cada parâmetro. Neste trabalho foi aplicada a amostragem Gibbs para o ajuste de um MLGM usando a inferência bayesiana em um ensaio envolvendo dados de contagens de tubérculos graúdos em batata, visando a obtenção de estimativas de parâmetros genéticos como herdabilidades, componentes da variância e valores genéticos. Para ilustrar a metodologia foram utilizados dados experimentais do Programa de Melhoramento Genético de Batata da Universidade Federal de Lavras (UFLA). Implementou-se um algoritmo no software R para a amostragem Gibbs das distribuições a posteriori nas quais se pôde estimar os parâmetros genéticos e fenotípicos de interesse. Foram também tomadas amostras de combinações lineares e não lineares dos parâmetros originais do modelo, gerando novas distribuições a posteriori e respectivas inferências. Em virtude dos resultados apresentados, pode-se atestar que a inferência bayesiana é uma forma adequada e confiável para a análise de dados experimentais em genética.Analysing experimental data in genetics is a common assumption that treatment effects comes from a probability distribution. Count data that shows Poisson distribution are also common responses for many economic important traits. In this case the correct analysis is based on fitting a generalized mixed linear model (GMLM). Assimptotic inference using normal approximation of the above model is a common choice. Although this usually results in good analysis, bayesian inference makes possible to get the exact posterior distributions for each parameter. In this work we had implemented Gibbs sampling to fit a GMLM using bayesian inference on data from a field trial on numbers of large tubers in potato, to get estimates of genetic parameters as heritabilities, variance components and genetic values. As an example it was used experimental data from the potato breeding program of the Universidade Federal de Lavras (UFLA). A Gibbs Sampling algorithm was implemented on R to get the posterior distributions on which inference on each genetic and phenotypic parameter can be done. Samples from linear and non-linear combinations of the original parameters of the model wer also taken, getting addictional posterior distributions and respective inferences. Results support the idea that bayesian inference is na elegant and reliable way to annalyse genetic experiments.UNIVERSIDADE FEDERAL DE LAVRASDEX - Programa de Pós-graduaçãoUFLABRASILBueno Filho, Júlio Sílvio de SousaFerreira, Daniel FurtadoRamalho, Magno Antonio PattoMuniz, Joel AugustoSilva, José Waldemar da2014-09-02T21:36:02Z2014-09-02T21:36:02Z2014-09-022004-02-03info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdfSILVA, J. W. Analise bayesiana de um modelo linear generalizado misto: emprego no melhoramento de plantas. 2004. 77 p. Dissertação (Mestrado em Estatística e Experimentação Agropecuária)- Universidade Federal de Lavras, Lavras, 2004.http://repositorio.ufla.br/jspui/handle/1/3423info:eu-repo/semantics/openAccessporreponame:Repositório Institucional da UFLAinstname:Universidade Federal de Lavras (UFLA)instacron:UFLA2023-05-11T17:10:09Zoai:localhost:1/3423Repositório InstitucionalPUBhttp://repositorio.ufla.br/oai/requestnivaldo@ufla.br || repositorio.biblioteca@ufla.bropendoar:2023-05-11T17:10:09Repositório Institucional da UFLA - Universidade Federal de Lavras (UFLA)false
dc.title.none.fl_str_mv Análise bayesiana de um modelo linear generalizado misto: emprego no melhoramento de plantas
Bayesian annalysis of a generalized linear mixed model in plant breeding
title Análise bayesiana de um modelo linear generalizado misto: emprego no melhoramento de plantas
spellingShingle Análise bayesiana de um modelo linear generalizado misto: emprego no melhoramento de plantas
Silva, José Waldemar da
Componentes da variância
Inferência bayesiana
Modelos lineares generalizados mistos
Modelo poisson
Bayesian inference
Variance components
Generalized mixed linear models
Poisson models
Potato
CNPQ_NÃO_INFORMADO
title_short Análise bayesiana de um modelo linear generalizado misto: emprego no melhoramento de plantas
title_full Análise bayesiana de um modelo linear generalizado misto: emprego no melhoramento de plantas
title_fullStr Análise bayesiana de um modelo linear generalizado misto: emprego no melhoramento de plantas
title_full_unstemmed Análise bayesiana de um modelo linear generalizado misto: emprego no melhoramento de plantas
title_sort Análise bayesiana de um modelo linear generalizado misto: emprego no melhoramento de plantas
author Silva, José Waldemar da
author_facet Silva, José Waldemar da
author_role author
dc.contributor.none.fl_str_mv Bueno Filho, Júlio Sílvio de Sousa
Ferreira, Daniel Furtado
Ramalho, Magno Antonio Patto
Muniz, Joel Augusto
dc.contributor.author.fl_str_mv Silva, José Waldemar da
dc.subject.por.fl_str_mv Componentes da variância
Inferência bayesiana
Modelos lineares generalizados mistos
Modelo poisson
Bayesian inference
Variance components
Generalized mixed linear models
Poisson models
Potato
CNPQ_NÃO_INFORMADO
topic Componentes da variância
Inferência bayesiana
Modelos lineares generalizados mistos
Modelo poisson
Bayesian inference
Variance components
Generalized mixed linear models
Poisson models
Potato
CNPQ_NÃO_INFORMADO
description Esta dissertação/tese está disponível online com base na Resolução CEPE nº 090, de 24 de março de 2015, disponível em http://www.biblioteca.ufla.br/wordpress/wp-content/uploads/res090-2015.pdf, que dispõe sobre a disponibilização da coleção retrospectiva de teses e dissertações online no Repositório Institucional da UFLA, sem autorização prévia dos autores. Parágrafo Único. Caberá ao autor ou orientador a solicitação de restrição quanto à divulgação de teses e dissertações com pedidos de patente ou qualquer embargo similar. Art. 5º A obra depositada no RIUFLA que tenha direitos autorais externos à Universidade Federal de Lavras poderá ser removida mediante solicitação por escrito, exclusivamente do autor, encaminhada à Comissão Técnica da Biblioteca Universitária./ Arquivo gerado por meio da digitalização de material impresso. Alguns caracteres podem ter sido reconhecidos erroneamente.
publishDate 2004
dc.date.none.fl_str_mv 2004-02-03
2014-09-02T21:36:02Z
2014-09-02T21:36:02Z
2014-09-02
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/masterThesis
format masterThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv SILVA, J. W. Analise bayesiana de um modelo linear generalizado misto: emprego no melhoramento de plantas. 2004. 77 p. Dissertação (Mestrado em Estatística e Experimentação Agropecuária)- Universidade Federal de Lavras, Lavras, 2004.
http://repositorio.ufla.br/jspui/handle/1/3423
identifier_str_mv SILVA, J. W. Analise bayesiana de um modelo linear generalizado misto: emprego no melhoramento de plantas. 2004. 77 p. Dissertação (Mestrado em Estatística e Experimentação Agropecuária)- Universidade Federal de Lavras, Lavras, 2004.
url http://repositorio.ufla.br/jspui/handle/1/3423
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
dc.publisher.none.fl_str_mv UNIVERSIDADE FEDERAL DE LAVRAS
DEX - Programa de Pós-graduação
UFLA
BRASIL
publisher.none.fl_str_mv UNIVERSIDADE FEDERAL DE LAVRAS
DEX - Programa de Pós-graduação
UFLA
BRASIL
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Repositório Institucional da UFLA
instname:Universidade Federal de Lavras (UFLA)
instacron:UFLA
instname_str Universidade Federal de Lavras (UFLA)
instacron_str UFLA
institution UFLA
reponame_str Repositório Institucional da UFLA
collection Repositório Institucional da UFLA
repository.name.fl_str_mv Repositório Institucional da UFLA - Universidade Federal de Lavras (UFLA)
repository.mail.fl_str_mv nivaldo@ufla.br || repositorio.biblioteca@ufla.br
_version_ 1815439328336150528