Seleção assistida por marcadores para teor de matéria seca e açúcares redutores em tubérculos de batata

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Bhering, Leonardo Lopes
Data de Publicação: 2009
Outros Autores: Pinto, César Augusto Brasil Pereira, Benites, Flávio Rodrigo Gandolfi, Leite, Monik Evelin, Silva, Felipe Lopes da
Tipo de documento: Artigo
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Institucional da UFLA
Texto Completo: http://repositorio.ufla.br/jspui/handle/1/15175
Resumo: Early generation selection for clones with high content of tuber dry matter and low levels of reducing sugars is required for potato (Solanum tuberosum L.) processing. Selection of superior clones at early generations became possible with the deployment of genetic markers, and can precisely identify the superior individuals. Therefore, it is necessary to identify genetic markers closely linked to genes of interest to do assisted selection. The aim of this research was to evaluate the efficiency of marker assisted selection with genetic markers previously identified by ANDREU (2004), which are assumed to be associated with dry matter and reducing sugars content in potato tubers. Clones from 20 families were evaluated during the seedling generation (S), first clonal generation (C1) and second clonal generation (C2). The estimated coefficients of correlation for all traits among generations were significant, even though of low magnitude, confirming that selection at early generation based only on phenotypic traits is inviable. A total of sixteen bands were amplified using these markers. However, by multiple stepwise regression, only seven of these bands showed association with the evaluated traits. Moreover, no markers associated with dry matter and reducing sugars content in the C1 were significantly associated with these traits in the C2, suggesting the existence of QTLs x environment interactions. The marker assisted selection resulted less efficient than the phenotypic selection in all cases studied, and thus is not recommended for early generation selection of clones for the processing industry. These results suggest that the markers used are not closely linked to the genes controlling the traits most important for processing. Therefore, it is important to identify new markers closely linked with such traits of interest that could improve the efficiency of marker assisted selection.
id UFLA_ff754be460c2944905d832a7fcdada1c
oai_identifier_str oai:localhost:1/15175
network_acronym_str UFLA
network_name_str Repositório Institucional da UFLA
repository_id_str
spelling Seleção assistida por marcadores para teor de matéria seca e açúcares redutores em tubérculos de batataMarker assisted selection for dry matter and reducing sugars in potato tubersBatata - Melhoramento genéticoBatata - ProcessamentoBatata - Seleção precoceQualidades de tubérculosMarcadores genéticosPotato - Genetic improvementPotato - ProcessingPotato - Early SelectionQualities of tubersGenetic markersEarly generation selection for clones with high content of tuber dry matter and low levels of reducing sugars is required for potato (Solanum tuberosum L.) processing. Selection of superior clones at early generations became possible with the deployment of genetic markers, and can precisely identify the superior individuals. Therefore, it is necessary to identify genetic markers closely linked to genes of interest to do assisted selection. The aim of this research was to evaluate the efficiency of marker assisted selection with genetic markers previously identified by ANDREU (2004), which are assumed to be associated with dry matter and reducing sugars content in potato tubers. Clones from 20 families were evaluated during the seedling generation (S), first clonal generation (C1) and second clonal generation (C2). The estimated coefficients of correlation for all traits among generations were significant, even though of low magnitude, confirming that selection at early generation based only on phenotypic traits is inviable. A total of sixteen bands were amplified using these markers. However, by multiple stepwise regression, only seven of these bands showed association with the evaluated traits. Moreover, no markers associated with dry matter and reducing sugars content in the C1 were significantly associated with these traits in the C2, suggesting the existence of QTLs x environment interactions. The marker assisted selection resulted less efficient than the phenotypic selection in all cases studied, and thus is not recommended for early generation selection of clones for the processing industry. These results suggest that the markers used are not closely linked to the genes controlling the traits most important for processing. Therefore, it is important to identify new markers closely linked with such traits of interest that could improve the efficiency of marker assisted selection.A seleção precoce de clones que possuam níveis elevados de matéria seca e baixos teores de açúcares redutores é uma necessidade nos programas de melhoramento para a qualidade de processamento da batata (Solanum tuberosum L.) na forma de palitos fritos ou chips. A seleção precoce tornou-se possível com a utilização de marcadores genéticos, visto que permitem a identificação precisa de indivíduos superiores. Assim, procura-se cada vez mais encontrar marcadores capazes de caracterizar tais indivíduos e utilizá-los via seleção assistida. O objetivo deste trabalho foi avaliar a eficiência da seleção assistida, utilizando os marcadores identificados por ANDREU (2004) que estariam associados ao teor de matéria seca e açúcares redutores em tubérculos de batata. Clones provenientes de 20 famílias foram avaliados nas gerações de plântula (P), primeira geração clonal (C1) e segunda geração clonal (C2). As estimativas das correlações simples para os caracteres entre gerações foram significativas, porém, baixas, confirmando a inviabilidade de se efetuar a seleção precoce nas primeiras gerações com base apenas em informações fenotípicas. Os marcadores utilizados forneceram um total de 16 marcas. Pela regressão múltipla stepwise, apenas sete dessas marcas tiveram associação com os caracteres estudados. Além disso, nenhuma marca associada ao teor de matéria seca de tubérculos na geração C1 teve associação significativa na geração C2. Isso também foi observado com o teor de açúcares redutores, o que é um indicativo da interação QTLs x ambientes. A seleção assistida não se mostrou eficiente em relação à fenotípica em nenhum dos casos avaliados, portanto, não sendo útil em uma possível seleção precoce. Esses resultados indicam que tais marcadores não estão próximos aos genes controladores dos caracteres desejados, sendo necessária a identificação de novos marcadores mais associados que possibilitem maior eficiência da seleção assistida.Universidade Federal de Santa Maria2017-08-14T13:52:04Z2017-08-14T13:52:04Z2009-01info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/articleapplication/pdfBHERING, L. L. et al. Seleção assistida por marcadores para teor de matéria seca e açúcares redutores em tubérculos de batata. Ciência Rural, Santa Maria, v. 39, n. 1, p. 38-44, jan./fev. 2009.http://repositorio.ufla.br/jspui/handle/1/15175Ciência Ruralreponame:Repositório Institucional da UFLAinstname:Universidade Federal de Lavras (UFLA)instacron:UFLABhering, Leonardo LopesPinto, César Augusto Brasil PereiraBenites, Flávio Rodrigo GandolfiLeite, Monik EvelinSilva, Felipe Lopes dainfo:eu-repo/semantics/openAccesspor2017-08-14T13:52:43Zoai:localhost:1/15175Repositório InstitucionalPUBhttp://repositorio.ufla.br/oai/requestnivaldo@ufla.br || repositorio.biblioteca@ufla.bropendoar:2017-08-14T13:52:43Repositório Institucional da UFLA - Universidade Federal de Lavras (UFLA)false
dc.title.none.fl_str_mv Seleção assistida por marcadores para teor de matéria seca e açúcares redutores em tubérculos de batata
Marker assisted selection for dry matter and reducing sugars in potato tubers
title Seleção assistida por marcadores para teor de matéria seca e açúcares redutores em tubérculos de batata
spellingShingle Seleção assistida por marcadores para teor de matéria seca e açúcares redutores em tubérculos de batata
Bhering, Leonardo Lopes
Batata - Melhoramento genético
Batata - Processamento
Batata - Seleção precoce
Qualidades de tubérculos
Marcadores genéticos
Potato - Genetic improvement
Potato - Processing
Potato - Early Selection
Qualities of tubers
Genetic markers
title_short Seleção assistida por marcadores para teor de matéria seca e açúcares redutores em tubérculos de batata
title_full Seleção assistida por marcadores para teor de matéria seca e açúcares redutores em tubérculos de batata
title_fullStr Seleção assistida por marcadores para teor de matéria seca e açúcares redutores em tubérculos de batata
title_full_unstemmed Seleção assistida por marcadores para teor de matéria seca e açúcares redutores em tubérculos de batata
title_sort Seleção assistida por marcadores para teor de matéria seca e açúcares redutores em tubérculos de batata
author Bhering, Leonardo Lopes
author_facet Bhering, Leonardo Lopes
Pinto, César Augusto Brasil Pereira
Benites, Flávio Rodrigo Gandolfi
Leite, Monik Evelin
Silva, Felipe Lopes da
author_role author
author2 Pinto, César Augusto Brasil Pereira
Benites, Flávio Rodrigo Gandolfi
Leite, Monik Evelin
Silva, Felipe Lopes da
author2_role author
author
author
author
dc.contributor.author.fl_str_mv Bhering, Leonardo Lopes
Pinto, César Augusto Brasil Pereira
Benites, Flávio Rodrigo Gandolfi
Leite, Monik Evelin
Silva, Felipe Lopes da
dc.subject.por.fl_str_mv Batata - Melhoramento genético
Batata - Processamento
Batata - Seleção precoce
Qualidades de tubérculos
Marcadores genéticos
Potato - Genetic improvement
Potato - Processing
Potato - Early Selection
Qualities of tubers
Genetic markers
topic Batata - Melhoramento genético
Batata - Processamento
Batata - Seleção precoce
Qualidades de tubérculos
Marcadores genéticos
Potato - Genetic improvement
Potato - Processing
Potato - Early Selection
Qualities of tubers
Genetic markers
description Early generation selection for clones with high content of tuber dry matter and low levels of reducing sugars is required for potato (Solanum tuberosum L.) processing. Selection of superior clones at early generations became possible with the deployment of genetic markers, and can precisely identify the superior individuals. Therefore, it is necessary to identify genetic markers closely linked to genes of interest to do assisted selection. The aim of this research was to evaluate the efficiency of marker assisted selection with genetic markers previously identified by ANDREU (2004), which are assumed to be associated with dry matter and reducing sugars content in potato tubers. Clones from 20 families were evaluated during the seedling generation (S), first clonal generation (C1) and second clonal generation (C2). The estimated coefficients of correlation for all traits among generations were significant, even though of low magnitude, confirming that selection at early generation based only on phenotypic traits is inviable. A total of sixteen bands were amplified using these markers. However, by multiple stepwise regression, only seven of these bands showed association with the evaluated traits. Moreover, no markers associated with dry matter and reducing sugars content in the C1 were significantly associated with these traits in the C2, suggesting the existence of QTLs x environment interactions. The marker assisted selection resulted less efficient than the phenotypic selection in all cases studied, and thus is not recommended for early generation selection of clones for the processing industry. These results suggest that the markers used are not closely linked to the genes controlling the traits most important for processing. Therefore, it is important to identify new markers closely linked with such traits of interest that could improve the efficiency of marker assisted selection.
publishDate 2009
dc.date.none.fl_str_mv 2009-01
2017-08-14T13:52:04Z
2017-08-14T13:52:04Z
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/article
format article
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv BHERING, L. L. et al. Seleção assistida por marcadores para teor de matéria seca e açúcares redutores em tubérculos de batata. Ciência Rural, Santa Maria, v. 39, n. 1, p. 38-44, jan./fev. 2009.
http://repositorio.ufla.br/jspui/handle/1/15175
identifier_str_mv BHERING, L. L. et al. Seleção assistida por marcadores para teor de matéria seca e açúcares redutores em tubérculos de batata. Ciência Rural, Santa Maria, v. 39, n. 1, p. 38-44, jan./fev. 2009.
url http://repositorio.ufla.br/jspui/handle/1/15175
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
dc.publisher.none.fl_str_mv Universidade Federal de Santa Maria
publisher.none.fl_str_mv Universidade Federal de Santa Maria
dc.source.none.fl_str_mv Ciência Rural
reponame:Repositório Institucional da UFLA
instname:Universidade Federal de Lavras (UFLA)
instacron:UFLA
instname_str Universidade Federal de Lavras (UFLA)
instacron_str UFLA
institution UFLA
reponame_str Repositório Institucional da UFLA
collection Repositório Institucional da UFLA
repository.name.fl_str_mv Repositório Institucional da UFLA - Universidade Federal de Lavras (UFLA)
repository.mail.fl_str_mv nivaldo@ufla.br || repositorio.biblioteca@ufla.br
_version_ 1807835089342562304