Variabilidade genética de duas populações de Kinosternon scorpioides No Maranhão, Nordeste do Brasil, com base na região controladora do mtDNA.
Autor(a) principal: | |
---|---|
Data de Publicação: | 2016 |
Tipo de documento: | Dissertação |
Idioma: | por |
Título da fonte: | Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFMA |
Texto Completo: | https://tedebc.ufma.br/jspui/handle/tede/tede/3475 |
Resumo: | Kinosternon scorpioides, known as swear is one of the best known species of freshwater turtles in Brazil with wide distribution in South America in Central America and Mexico. In the state of Maranhão were found 06 species of freshwater turtles. Among the Terrapins, the swear is one of the least known to science. Knowledge of the genetic makeup of some sort is necessary to evaluate the variability levels found in natural populations and defining population structure by philogeography. Thus, the aim of this study was to evaluate the genetic diversity of populations had sworn the coastal region of Curupu-MA Island (L1) and the Continental Region of Baixada Maranhense in São Bento (L2). For genetic variability analysis was used to control region of DNA mitocondrial.O blood of the animals was collected and extracted DNA. The fragments of the mtDNA control region (CR) were PCR amplified, purified and sequenced. Fifteen specimens were analyzed between these six L1 region and L2 region nine. Individuals of L1 region is not newly introduced specimens according to analyze the haplotype network have generated with genetic distance L2 of individuals. The analysis of a control region of mtDNA may be relevant to species because it was found a clade forming a haplotype different from the other two species of the genus. In these analyzes it can be concluded that populations have genetic variability, noting the difference between these in the haplotype network generated and the differences with the external groups of aligned sequences, yet the deepening of genetic studies is likely to support strategies for the conservation of the species. |
id |
UFMA_4e6f44e6aa07cbe542e55969cf30745e |
---|---|
oai_identifier_str |
oai:tede2:tede/3475 |
network_acronym_str |
UFMA |
network_name_str |
Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFMA |
repository_id_str |
2131 |
spelling |
BARRETO, Larissa NascimentoANDRADE, Marcelo Souza dehttp://lattes.cnpq.br/6267637354657076BARRETO, Larissa Nascimentohttp://lattes.cnpq.br/1295307492454506ANDRADE, Marcelo Souza dehttp://lattes.cnpq.br/6267637354657076LEAL, Emygdia Rosa Pireshttp://lattes.cnpq.br/0374728351065012SILVA, Marcelo Magalhãeshttp://lattes.cnpq.br/5367804470044420NUNES, Mayara Monteles de Almeida2022-01-24T13:52:53Z2016-06-25NUNES, Mayara Monteles de Almeida. Variabilidade genética de duas populações de Kinosternon scorpioides No Maranhão, Nordeste do Brasil, com base na região controladora do mtDNA. 2016. 31 f. Dissertação (Programa de Pós-Graduação em Biodiversidade Conservação/CCBS) - Universidade Federal do Maranhão, São Luís, 2016.https://tedebc.ufma.br/jspui/handle/tede/tede/3475Kinosternon scorpioides, known as swear is one of the best known species of freshwater turtles in Brazil with wide distribution in South America in Central America and Mexico. In the state of Maranhão were found 06 species of freshwater turtles. Among the Terrapins, the swear is one of the least known to science. Knowledge of the genetic makeup of some sort is necessary to evaluate the variability levels found in natural populations and defining population structure by philogeography. Thus, the aim of this study was to evaluate the genetic diversity of populations had sworn the coastal region of Curupu-MA Island (L1) and the Continental Region of Baixada Maranhense in São Bento (L2). For genetic variability analysis was used to control region of DNA mitocondrial.O blood of the animals was collected and extracted DNA. The fragments of the mtDNA control region (CR) were PCR amplified, purified and sequenced. Fifteen specimens were analyzed between these six L1 region and L2 region nine. Individuals of L1 region is not newly introduced specimens according to analyze the haplotype network have generated with genetic distance L2 of individuals. The analysis of a control region of mtDNA may be relevant to species because it was found a clade forming a haplotype different from the other two species of the genus. In these analyzes it can be concluded that populations have genetic variability, noting the difference between these in the haplotype network generated and the differences with the external groups of aligned sequences, yet the deepening of genetic studies is likely to support strategies for the conservation of the species.Kinosternon scorpioides, conhecida como jurará é uma das espécies mais conhecidas de quelônios de água doce do Brasil com ampla distribuição na América do Sul na América Central e no México. No Estado do Maranhão foram encontradas 06 espécies de tartarugas de água doce. Dentre as tartarugas de água doce, o jurará é uma das menos conhecidas pela ciência. O conhecimento da composição genética de uma espécie é fundamental a avaliação dos níveis de variabilidade genética encontrados em populações naturais e a definição de estruturas populacionais por meio da filogeografia. Assim, objetivou-se com este estudo avaliar a diversidade genética de populações de Jurará da região costeira da Ilha de Curupu-MA (L1) e da Região continental da Baixada Maranhense no Município de São Bento (L2). Para análise de variabilidade genética foi utilizado a região controladora do DNA mitocondrial.O sangue dos animais foi coletado e extraído o DNA. Os fragmentos do DNAmt da região controladora (RC) foram amplificados por PCR, purificados e sequenciados. Foram analisados quinze espécimes entre estas, seis da região L1 e nove da região L2. Os indivíduos da região L1 não são espécimes introduzidos recentemente de acordo com a analise da rede haplotipica gerada possuem distância genética com os indivíduos de L2. A análise de uma região controladora do DNAmt pode ser relevante para espécie, pois foi encontrado um clado formando um haplótipo diferente das outras duas espécies do gênero. Nestas análises pode se concluir que as populações possuem variabilidade genética, observando a diferença entre estas na rede haplotípica gerada bem como a diferenças com os grupos externos de sequencias alinhadas, contudo o aprofundamento dos estudos genéticos poderá vir a subsidiar estratégias para a conservação da espécie.Submitted by Sheila MONTEIRO (sheila.monteiro@ufma.br) on 2022-01-24T13:52:53Z No. of bitstreams: 1 MAYARA-NUNES.pdf: 952924 bytes, checksum: 27b79f56701d0d6a95492b04fc2d0f8e (MD5)Made available in DSpace on 2022-01-24T13:52:53Z (GMT). No. of bitstreams: 1 MAYARA-NUNES.pdf: 952924 bytes, checksum: 27b79f56701d0d6a95492b04fc2d0f8e (MD5) Previous issue date: 2016-06-25Fundação de Amparo à Pesquisa e ao Desenvolvimento Científico e Tecnológico do Maranhão - FAPEMAapplication/pdfporUniversidade Federal do MaranhãoPROGRAMA DE PÓS-GRADUAÇÃO EM BIODIVERSIDADE CONSERVAÇÃO/CCBSUFMABrasilDEPARTAMENTO DE BIOLOGIA/CCBSKinosternon scorpioidesDNA mitocondrialRegião controladoraVariabilidade genéticaKinosternon scorpioidesMitochondrial DNA control regionGenetic variabilityCiências BiológicasVariabilidade genética de duas populações de Kinosternon scorpioides No Maranhão, Nordeste do Brasil, com base na região controladora do mtDNA.Genetic variability of two populations of Kinosternon scorpioides in Maranhão, Northeastern Brazil, based on the mtDNA controller region.info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFMAinstname:Universidade Federal do Maranhão (UFMA)instacron:UFMAORIGINALMAYARA-NUNES.pdfMAYARA-NUNES.pdfapplication/pdf952924http://tedebc.ufma.br:8080/bitstream/tede/3475/2/MAYARA-NUNES.pdf27b79f56701d0d6a95492b04fc2d0f8eMD52LICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-82255http://tedebc.ufma.br:8080/bitstream/tede/3475/1/license.txt97eeade1fce43278e63fe063657f8083MD51tede/34752022-01-24 10:52:53.174oai:tede2: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Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttps://tedebc.ufma.br/jspui/PUBhttp://tedebc.ufma.br:8080/oai/requestrepositorio@ufma.br||repositorio@ufma.bropendoar:21312022-01-24T13:52:53Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFMA - Universidade Federal do Maranhão (UFMA)false |
dc.title.por.fl_str_mv |
Variabilidade genética de duas populações de Kinosternon scorpioides No Maranhão, Nordeste do Brasil, com base na região controladora do mtDNA. |
dc.title.alternative.eng.fl_str_mv |
Genetic variability of two populations of Kinosternon scorpioides in Maranhão, Northeastern Brazil, based on the mtDNA controller region. |
title |
Variabilidade genética de duas populações de Kinosternon scorpioides No Maranhão, Nordeste do Brasil, com base na região controladora do mtDNA. |
spellingShingle |
Variabilidade genética de duas populações de Kinosternon scorpioides No Maranhão, Nordeste do Brasil, com base na região controladora do mtDNA. NUNES, Mayara Monteles de Almeida Kinosternon scorpioides DNA mitocondrial Região controladora Variabilidade genética Kinosternon scorpioides Mitochondrial DNA control region Genetic variability Ciências Biológicas |
title_short |
Variabilidade genética de duas populações de Kinosternon scorpioides No Maranhão, Nordeste do Brasil, com base na região controladora do mtDNA. |
title_full |
Variabilidade genética de duas populações de Kinosternon scorpioides No Maranhão, Nordeste do Brasil, com base na região controladora do mtDNA. |
title_fullStr |
Variabilidade genética de duas populações de Kinosternon scorpioides No Maranhão, Nordeste do Brasil, com base na região controladora do mtDNA. |
title_full_unstemmed |
Variabilidade genética de duas populações de Kinosternon scorpioides No Maranhão, Nordeste do Brasil, com base na região controladora do mtDNA. |
title_sort |
Variabilidade genética de duas populações de Kinosternon scorpioides No Maranhão, Nordeste do Brasil, com base na região controladora do mtDNA. |
author |
NUNES, Mayara Monteles de Almeida |
author_facet |
NUNES, Mayara Monteles de Almeida |
author_role |
author |
dc.contributor.advisor1.fl_str_mv |
BARRETO, Larissa Nascimento |
dc.contributor.advisor-co1.fl_str_mv |
ANDRADE, Marcelo Souza de |
dc.contributor.advisor-co1Lattes.fl_str_mv |
http://lattes.cnpq.br/6267637354657076 |
dc.contributor.referee1.fl_str_mv |
BARRETO, Larissa Nascimento |
dc.contributor.referee1Lattes.fl_str_mv |
http://lattes.cnpq.br/1295307492454506 |
dc.contributor.referee2.fl_str_mv |
ANDRADE, Marcelo Souza de |
dc.contributor.referee2Lattes.fl_str_mv |
http://lattes.cnpq.br/6267637354657076 |
dc.contributor.referee3.fl_str_mv |
LEAL, Emygdia Rosa Pires |
dc.contributor.referee3Lattes.fl_str_mv |
http://lattes.cnpq.br/0374728351065012 |
dc.contributor.referee4.fl_str_mv |
SILVA, Marcelo Magalhães |
dc.contributor.referee4Lattes.fl_str_mv |
http://lattes.cnpq.br/5367804470044420 |
dc.contributor.author.fl_str_mv |
NUNES, Mayara Monteles de Almeida |
contributor_str_mv |
BARRETO, Larissa Nascimento ANDRADE, Marcelo Souza de BARRETO, Larissa Nascimento ANDRADE, Marcelo Souza de LEAL, Emygdia Rosa Pires SILVA, Marcelo Magalhães |
dc.subject.por.fl_str_mv |
Kinosternon scorpioides DNA mitocondrial Região controladora Variabilidade genética |
topic |
Kinosternon scorpioides DNA mitocondrial Região controladora Variabilidade genética Kinosternon scorpioides Mitochondrial DNA control region Genetic variability Ciências Biológicas |
dc.subject.eng.fl_str_mv |
Kinosternon scorpioides Mitochondrial DNA control region Genetic variability |
dc.subject.cnpq.fl_str_mv |
Ciências Biológicas |
description |
Kinosternon scorpioides, known as swear is one of the best known species of freshwater turtles in Brazil with wide distribution in South America in Central America and Mexico. In the state of Maranhão were found 06 species of freshwater turtles. Among the Terrapins, the swear is one of the least known to science. Knowledge of the genetic makeup of some sort is necessary to evaluate the variability levels found in natural populations and defining population structure by philogeography. Thus, the aim of this study was to evaluate the genetic diversity of populations had sworn the coastal region of Curupu-MA Island (L1) and the Continental Region of Baixada Maranhense in São Bento (L2). For genetic variability analysis was used to control region of DNA mitocondrial.O blood of the animals was collected and extracted DNA. The fragments of the mtDNA control region (CR) were PCR amplified, purified and sequenced. Fifteen specimens were analyzed between these six L1 region and L2 region nine. Individuals of L1 region is not newly introduced specimens according to analyze the haplotype network have generated with genetic distance L2 of individuals. The analysis of a control region of mtDNA may be relevant to species because it was found a clade forming a haplotype different from the other two species of the genus. In these analyzes it can be concluded that populations have genetic variability, noting the difference between these in the haplotype network generated and the differences with the external groups of aligned sequences, yet the deepening of genetic studies is likely to support strategies for the conservation of the species. |
publishDate |
2016 |
dc.date.issued.fl_str_mv |
2016-06-25 |
dc.date.accessioned.fl_str_mv |
2022-01-24T13:52:53Z |
dc.type.status.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/publishedVersion |
dc.type.driver.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/masterThesis |
format |
masterThesis |
status_str |
publishedVersion |
dc.identifier.citation.fl_str_mv |
NUNES, Mayara Monteles de Almeida. Variabilidade genética de duas populações de Kinosternon scorpioides No Maranhão, Nordeste do Brasil, com base na região controladora do mtDNA. 2016. 31 f. Dissertação (Programa de Pós-Graduação em Biodiversidade Conservação/CCBS) - Universidade Federal do Maranhão, São Luís, 2016. |
dc.identifier.uri.fl_str_mv |
https://tedebc.ufma.br/jspui/handle/tede/tede/3475 |
identifier_str_mv |
NUNES, Mayara Monteles de Almeida. Variabilidade genética de duas populações de Kinosternon scorpioides No Maranhão, Nordeste do Brasil, com base na região controladora do mtDNA. 2016. 31 f. Dissertação (Programa de Pós-Graduação em Biodiversidade Conservação/CCBS) - Universidade Federal do Maranhão, São Luís, 2016. |
url |
https://tedebc.ufma.br/jspui/handle/tede/tede/3475 |
dc.language.iso.fl_str_mv |
por |
language |
por |
dc.rights.driver.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/openAccess |
eu_rights_str_mv |
openAccess |
dc.format.none.fl_str_mv |
application/pdf |
dc.publisher.none.fl_str_mv |
Universidade Federal do Maranhão |
dc.publisher.program.fl_str_mv |
PROGRAMA DE PÓS-GRADUAÇÃO EM BIODIVERSIDADE CONSERVAÇÃO/CCBS |
dc.publisher.initials.fl_str_mv |
UFMA |
dc.publisher.country.fl_str_mv |
Brasil |
dc.publisher.department.fl_str_mv |
DEPARTAMENTO DE BIOLOGIA/CCBS |
publisher.none.fl_str_mv |
Universidade Federal do Maranhão |
dc.source.none.fl_str_mv |
reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFMA instname:Universidade Federal do Maranhão (UFMA) instacron:UFMA |
instname_str |
Universidade Federal do Maranhão (UFMA) |
instacron_str |
UFMA |
institution |
UFMA |
reponame_str |
Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFMA |
collection |
Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFMA |
bitstream.url.fl_str_mv |
http://tedebc.ufma.br:8080/bitstream/tede/3475/2/MAYARA-NUNES.pdf http://tedebc.ufma.br:8080/bitstream/tede/3475/1/license.txt |
bitstream.checksum.fl_str_mv |
27b79f56701d0d6a95492b04fc2d0f8e 97eeade1fce43278e63fe063657f8083 |
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv |
MD5 MD5 |
repository.name.fl_str_mv |
Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFMA - Universidade Federal do Maranhão (UFMA) |
repository.mail.fl_str_mv |
repositorio@ufma.br||repositorio@ufma.br |
_version_ |
1809926199734960128 |