Diversidade microbiana intestinal de suínos saudáveis e afetados por disenteria suína e enteropatia proliferativa

• Autor(a) principal: Amanda Gabrielle de Souza Daniel
• Data de Publicação: 2018
• Tipo de documento: Tese
• Idioma: por
• Título da fonte: Repositório Institucional da UFMG
• Texto Completo: http://hdl.handle.net/1843/SMOC-B8WF93
• topic: diarreia; Lawsonia intracellularis; Microbioma fecal; coinfecção; B hyodysenteriae; Diarreia em animais; Suino Doenças; Intestinos Infecções

Esta tese foi organizada em dois capítulos, ambos avaliando o microbioma fecal de animais acometidos por enfermidades entéricas. O primeiro capítulo teve o objetivo de avaliar a microbiota das fezes coletada de animais à campo com disenteria suína. Foi aplicada a técnica de sequenciamento de nova geração da região hipervariável V4 do rRNA 16S em fezes de 37 animais negativos e 32 animais positivos para B. hyodysenteriae, obtidas de submissões diagnósticas que ocorreram entre 2012 e 2016. O gênero foi o único grau taxonômico com diferenças significativas, observando-se maior abundância relativa de Anaerovorax, Mogibacterium e p-75-a5 em animais positivos e Bifidobacterium, Coprococcus, Dialister, Fibrobacter, Rummeliibacillus e Streptococcus em animais negativos. O segundo capítulo teve como objetivo avaliar o quadro clínico, alterações anatomopatológicas, eliminação nas fezes e o microbioma intestinal de animais inoculados por Brachyspira hyodysenteriae e Lawsonia intracellularis, em infecção individual e coinfecção. Foram utilizados 45 leitões de cinco semanas de idade separados em quatro grupos: coinfecção (Brachyspira hyodysenteriae e Lawsonia intracellularis), B. hyodysenteriae, L. intracellularis e controle negativo. Utilizando o método "Fusion" pelo kit Ion Torrent 16S Metagenomics, o DNA extraído das fezes dos dias -5 e 21 foram amplificados com alvo na região hipervariável V4 do gene 16S rRNA e sequenciados associado a avaliação clinica e anatomopatológica completa, qPCR, imuno-histoquímica e isolamento bacteriano. O grupo coinfecção apresentou um quadro mais grave quanto início dos sinais clínicos, número de animais afetados e gravidade das lesões macro e microscópicas. Foi possível observar maior abundância relativa com diferença estatística em comparação com os demais grupos para os gêneros Prevotella, Anaerovibrio, Bacteroides, Butyricimonas, Desulfovibrio, Fusobacterium e p75-a5 no grupo CO, maior abundância de Clostridium no grupo BRA. No grupo LAW, Megasphaera e Dialister foram estatisticamente significantes e Odoribacter para o grupo NEG. É possível concluir que existe uma alteração da microbiota à nível de gênero em animais naturalmente e experimentalmente infectados com diferenças significativas quanto à expressão do quadro clinico em animais do grupo coinfecção