A linguagem médica utilizada em prontuários e suas representações em Sistemas de Informação: as ontologias e os modelos de informação
Autor(a) principal: | |
---|---|
Data de Publicação: | 2013 |
Tipo de documento: | Tese |
Idioma: | por |
Título da fonte: | Repositório Institucional da UFMG |
Texto Completo: | http://hdl.handle.net/1843/BUBD-9HHGLS |
Resumo: | O enorme volume de dados produzido em pesquisa e no curso da atividade médica exige o uso de soluções baseadas em sistemas informatizados. Uma implementação técnica eficaz desta solução exige que sistemas possam manipular e interpretar as mensagens trocadas entre sistemas, armazenar registros, requisitar informações contidas no outro sistema, atender a requisições de informação, dentre outros vários usos para a informação médica. O presente trabalho busca investigar a representação de dados dos pacientes através de modelos de informação e ontologias biomédicas para identificar pontos de ligação entre uma metodologia bem fundamentada, como o realismo ontológico; e uma metodologia flexível, como os modelos de informação em saúde. Por "modelos de informação médica" entendem-se propostas para definição consensual de termos, variáveis e tipos de dados, que objetivam permitir que os dados médicos disponíveis sejam compartilhados entre sistemas diversos; por "ontologias", entende-se a estrutura de categorias, rigorosamente definida, que espelha a organização pretendida para a informação. O objetivo geral da pesquisa é avaliar a representação ontológica de dados do prontuário, a partir da estruturação do conhecimento contido em modelos de informação médicos. A revisão de literatura cobriu o estado da arte sobre padrões de interoperabilidade em medicina, abordou as ontologias como artefatos de sistemas informatizados e como disciplina filosófica, além de apresentar aspectos relacionados a linguagem e a comunicação. Ao longo da realização da parte empírica foram estudados modelos de informação médica (arquétipos) e fragmentos sentenciais de prontuários, utilizando o realismo ontológico como arcabouço para criar uma representação ontológica de modelos e de afirmações sobre pacientes. A pesquisa foi metodologicamente organizada em 3 etapas: 1) Construção do arcabouço teórico; 2) Análise ontológica do modelo OpenEHR; 3) Representação ontológica da informação médica. O arcabouço, baseado na teoria de três mundos de Karl Popper, reconhece a existência de 4 tipos de entidades representacionais: as entidades de caráter ontológico, as entidades de caráter epistemológico, os registros informacionais e os processos de raciocínio. A análise do modelo de arquétipos openEHR demonstrou que existem limites para a representação exclusivamente realista do prontúario médico, mas que esta representação, se conduzida, reduz significativamente a ambiguidade. Conclui-se que a grande maioria dos fragmentos de informação de cunho médico foi representada adequadamente na ontologia. Observou-se que foi possível representar e recuperar adequadamente a informação médica através de ontologias representadas em lógica descritiva. Concluiu-se ainda que a abordagem ontológica apresenta limitações práticas que devem ser observadas e tratadas de acordo com a tecnologia utilizada e as necessidades de uso. Nesse sentido, os problemas mais imediatos detectados se referem ao tratamento de diferentes tipos de dados por ontologias realistas (por, exemplo, interpretações clínicas e qualidade de processos). Foram encontradas limitações inerentes à tecnologia utillizada (implementações baseadas em lógica descritiva) e mesmo inerentes à maleabilidade de interpretação da linguagem natural por seres humanos, que ainda está longe de ser imitada por sistemas automatizados. |
id |
UFMG_612ee2d1add2f1ab59925f62f7645a11 |
---|---|
oai_identifier_str |
oai:repositorio.ufmg.br:1843/BUBD-9HHGLS |
network_acronym_str |
UFMG |
network_name_str |
Repositório Institucional da UFMG |
repository_id_str |
|
spelling |
Mauricio Barcellos AlmeidaRenato Rocha SouzaManoel Palhares MoreiraEduardo de Mattos Pinto CoelhoRenata Maria Abrantes Baracho PortoBeatriz Valadares CendonAndré Queiroz de Andrade2019-08-10T05:09:40Z2019-08-10T05:09:40Z2013-11-08http://hdl.handle.net/1843/BUBD-9HHGLSO enorme volume de dados produzido em pesquisa e no curso da atividade médica exige o uso de soluções baseadas em sistemas informatizados. Uma implementação técnica eficaz desta solução exige que sistemas possam manipular e interpretar as mensagens trocadas entre sistemas, armazenar registros, requisitar informações contidas no outro sistema, atender a requisições de informação, dentre outros vários usos para a informação médica. O presente trabalho busca investigar a representação de dados dos pacientes através de modelos de informação e ontologias biomédicas para identificar pontos de ligação entre uma metodologia bem fundamentada, como o realismo ontológico; e uma metodologia flexível, como os modelos de informação em saúde. Por "modelos de informação médica" entendem-se propostas para definição consensual de termos, variáveis e tipos de dados, que objetivam permitir que os dados médicos disponíveis sejam compartilhados entre sistemas diversos; por "ontologias", entende-se a estrutura de categorias, rigorosamente definida, que espelha a organização pretendida para a informação. O objetivo geral da pesquisa é avaliar a representação ontológica de dados do prontuário, a partir da estruturação do conhecimento contido em modelos de informação médicos. A revisão de literatura cobriu o estado da arte sobre padrões de interoperabilidade em medicina, abordou as ontologias como artefatos de sistemas informatizados e como disciplina filosófica, além de apresentar aspectos relacionados a linguagem e a comunicação. Ao longo da realização da parte empírica foram estudados modelos de informação médica (arquétipos) e fragmentos sentenciais de prontuários, utilizando o realismo ontológico como arcabouço para criar uma representação ontológica de modelos e de afirmações sobre pacientes. A pesquisa foi metodologicamente organizada em 3 etapas: 1) Construção do arcabouço teórico; 2) Análise ontológica do modelo OpenEHR; 3) Representação ontológica da informação médica. O arcabouço, baseado na teoria de três mundos de Karl Popper, reconhece a existência de 4 tipos de entidades representacionais: as entidades de caráter ontológico, as entidades de caráter epistemológico, os registros informacionais e os processos de raciocínio. A análise do modelo de arquétipos openEHR demonstrou que existem limites para a representação exclusivamente realista do prontúario médico, mas que esta representação, se conduzida, reduz significativamente a ambiguidade. Conclui-se que a grande maioria dos fragmentos de informação de cunho médico foi representada adequadamente na ontologia. Observou-se que foi possível representar e recuperar adequadamente a informação médica através de ontologias representadas em lógica descritiva. Concluiu-se ainda que a abordagem ontológica apresenta limitações práticas que devem ser observadas e tratadas de acordo com a tecnologia utilizada e as necessidades de uso. Nesse sentido, os problemas mais imediatos detectados se referem ao tratamento de diferentes tipos de dados por ontologias realistas (por, exemplo, interpretações clínicas e qualidade de processos). Foram encontradas limitações inerentes à tecnologia utillizada (implementações baseadas em lógica descritiva) e mesmo inerentes à maleabilidade de interpretação da linguagem natural por seres humanos, que ainda está longe de ser imitada por sistemas automatizados.The huge volume of data produced in the course of research and medical practice requires the use of computerized systems. Moreover, a technical implementation of these softwares requires effective systems to "understand" the "semantic meaning" of the messages, store records, ask for specific information, meet other requests for information, besides being actually useful for a given medical informatics use case. The present study provides a thorough research on the representation of patient data through information models and biomedical ontologies, in order to identify linking points between a robust methodology, such as the ontological realism, and a flexible methodology, such as health information models. The objective of the research is to evaluate the ontological representation of clinical data, by analyzing the knowledge structure of clinical health information models. The literature review covered the state of the art of interoperability standards in medicine, ontologies as artifacts of computer systems and as a philosophical discipline, language and communication. On the empirical stage, we studied clinical models of medical data representation (archetypes) and sentential fragments of records, using the ontological realism as a framework to create a representation of ontological models and statements about patients. The methodology consisted of three steps: 1) theoretical framework creation, 2) ontological analysis of the openEHR archetype model; 3) ontological representation of medical information. The framework, based on the three worlds theory by Karl Popper, recognizes the existence of four types of representational entity: ontological entities, epistemological entities, informational records and reasoning processes. The openEHR archetype model analysis demonstrated that there are limits to the exclusive realistic representation of medical records, but also that this philosophically sound analysis significantly reduces the ambiguity in representation. Finally, the vast majority of fragments was adequately represented in the ontology. We were able to represent and retrieve information properly through medical ontologies represented in description logics. However, there are practical limitations which must be observed and treated in accordance with the technology used and usage needs. Several difficulties were encountered during the conversion of clinical data into an ontological representation. The more immediate problems relate to the treatment of different types of complex data by realist ontologies. We found limitations inherent to the technology (description logics based implementations) and even the inherent flexibility of natural language interpretation by humans, which is still far from being mimicked by automated systems.Universidade Federal de Minas GeraisUFMGSistemas de informação gerencialCiência da informaçãoRepresentação do conhecimento (Teoria da informação)Ontologias (Recuperação da informação)OntologiaEpistemologiaRegistro eletrônico em saúdeModelos de informação em saúdeA linguagem médica utilizada em prontuários e suas representações em Sistemas de Informação: as ontologias e os modelos de informaçãoinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesisinfo:eu-repo/semantics/openAccessporreponame:Repositório Institucional da UFMGinstname:Universidade Federal de Minas Gerais (UFMG)instacron:UFMGORIGINALdoutorado_andr__andrade_v1_04_br.pdfapplication/pdf2644740https://repositorio.ufmg.br/bitstream/1843/BUBD-9HHGLS/1/doutorado_andr__andrade_v1_04_br.pdfd2800d43efb4fe93ceed9fae892f9291MD51TEXTdoutorado_andr__andrade_v1_04_br.pdf.txtdoutorado_andr__andrade_v1_04_br.pdf.txtExtracted texttext/plain430616https://repositorio.ufmg.br/bitstream/1843/BUBD-9HHGLS/2/doutorado_andr__andrade_v1_04_br.pdf.txtb293f8b54599c7d7a66cadc958f3f7b4MD521843/BUBD-9HHGLS2019-11-14 11:05:53.281oai:repositorio.ufmg.br:1843/BUBD-9HHGLSRepositório de PublicaçõesPUBhttps://repositorio.ufmg.br/oaiopendoar:2019-11-14T14:05:53Repositório Institucional da UFMG - Universidade Federal de Minas Gerais (UFMG)false |
dc.title.pt_BR.fl_str_mv |
A linguagem médica utilizada em prontuários e suas representações em Sistemas de Informação: as ontologias e os modelos de informação |
title |
A linguagem médica utilizada em prontuários e suas representações em Sistemas de Informação: as ontologias e os modelos de informação |
spellingShingle |
A linguagem médica utilizada em prontuários e suas representações em Sistemas de Informação: as ontologias e os modelos de informação André Queiroz de Andrade Ontologia Epistemologia Registro eletrônico em saúde Modelos de informação em saúde Sistemas de informação gerencial Ciência da informação Representação do conhecimento (Teoria da informação) Ontologias (Recuperação da informação) |
title_short |
A linguagem médica utilizada em prontuários e suas representações em Sistemas de Informação: as ontologias e os modelos de informação |
title_full |
A linguagem médica utilizada em prontuários e suas representações em Sistemas de Informação: as ontologias e os modelos de informação |
title_fullStr |
A linguagem médica utilizada em prontuários e suas representações em Sistemas de Informação: as ontologias e os modelos de informação |
title_full_unstemmed |
A linguagem médica utilizada em prontuários e suas representações em Sistemas de Informação: as ontologias e os modelos de informação |
title_sort |
A linguagem médica utilizada em prontuários e suas representações em Sistemas de Informação: as ontologias e os modelos de informação |
author |
André Queiroz de Andrade |
author_facet |
André Queiroz de Andrade |
author_role |
author |
dc.contributor.advisor1.fl_str_mv |
Mauricio Barcellos Almeida |
dc.contributor.referee1.fl_str_mv |
Renato Rocha Souza |
dc.contributor.referee2.fl_str_mv |
Manoel Palhares Moreira |
dc.contributor.referee3.fl_str_mv |
Eduardo de Mattos Pinto Coelho |
dc.contributor.referee4.fl_str_mv |
Renata Maria Abrantes Baracho Porto |
dc.contributor.referee5.fl_str_mv |
Beatriz Valadares Cendon |
dc.contributor.author.fl_str_mv |
André Queiroz de Andrade |
contributor_str_mv |
Mauricio Barcellos Almeida Renato Rocha Souza Manoel Palhares Moreira Eduardo de Mattos Pinto Coelho Renata Maria Abrantes Baracho Porto Beatriz Valadares Cendon |
dc.subject.por.fl_str_mv |
Ontologia Epistemologia Registro eletrônico em saúde Modelos de informação em saúde |
topic |
Ontologia Epistemologia Registro eletrônico em saúde Modelos de informação em saúde Sistemas de informação gerencial Ciência da informação Representação do conhecimento (Teoria da informação) Ontologias (Recuperação da informação) |
dc.subject.other.pt_BR.fl_str_mv |
Sistemas de informação gerencial Ciência da informação Representação do conhecimento (Teoria da informação) Ontologias (Recuperação da informação) |
description |
O enorme volume de dados produzido em pesquisa e no curso da atividade médica exige o uso de soluções baseadas em sistemas informatizados. Uma implementação técnica eficaz desta solução exige que sistemas possam manipular e interpretar as mensagens trocadas entre sistemas, armazenar registros, requisitar informações contidas no outro sistema, atender a requisições de informação, dentre outros vários usos para a informação médica. O presente trabalho busca investigar a representação de dados dos pacientes através de modelos de informação e ontologias biomédicas para identificar pontos de ligação entre uma metodologia bem fundamentada, como o realismo ontológico; e uma metodologia flexível, como os modelos de informação em saúde. Por "modelos de informação médica" entendem-se propostas para definição consensual de termos, variáveis e tipos de dados, que objetivam permitir que os dados médicos disponíveis sejam compartilhados entre sistemas diversos; por "ontologias", entende-se a estrutura de categorias, rigorosamente definida, que espelha a organização pretendida para a informação. O objetivo geral da pesquisa é avaliar a representação ontológica de dados do prontuário, a partir da estruturação do conhecimento contido em modelos de informação médicos. A revisão de literatura cobriu o estado da arte sobre padrões de interoperabilidade em medicina, abordou as ontologias como artefatos de sistemas informatizados e como disciplina filosófica, além de apresentar aspectos relacionados a linguagem e a comunicação. Ao longo da realização da parte empírica foram estudados modelos de informação médica (arquétipos) e fragmentos sentenciais de prontuários, utilizando o realismo ontológico como arcabouço para criar uma representação ontológica de modelos e de afirmações sobre pacientes. A pesquisa foi metodologicamente organizada em 3 etapas: 1) Construção do arcabouço teórico; 2) Análise ontológica do modelo OpenEHR; 3) Representação ontológica da informação médica. O arcabouço, baseado na teoria de três mundos de Karl Popper, reconhece a existência de 4 tipos de entidades representacionais: as entidades de caráter ontológico, as entidades de caráter epistemológico, os registros informacionais e os processos de raciocínio. A análise do modelo de arquétipos openEHR demonstrou que existem limites para a representação exclusivamente realista do prontúario médico, mas que esta representação, se conduzida, reduz significativamente a ambiguidade. Conclui-se que a grande maioria dos fragmentos de informação de cunho médico foi representada adequadamente na ontologia. Observou-se que foi possível representar e recuperar adequadamente a informação médica através de ontologias representadas em lógica descritiva. Concluiu-se ainda que a abordagem ontológica apresenta limitações práticas que devem ser observadas e tratadas de acordo com a tecnologia utilizada e as necessidades de uso. Nesse sentido, os problemas mais imediatos detectados se referem ao tratamento de diferentes tipos de dados por ontologias realistas (por, exemplo, interpretações clínicas e qualidade de processos). Foram encontradas limitações inerentes à tecnologia utillizada (implementações baseadas em lógica descritiva) e mesmo inerentes à maleabilidade de interpretação da linguagem natural por seres humanos, que ainda está longe de ser imitada por sistemas automatizados. |
publishDate |
2013 |
dc.date.issued.fl_str_mv |
2013-11-08 |
dc.date.accessioned.fl_str_mv |
2019-08-10T05:09:40Z |
dc.date.available.fl_str_mv |
2019-08-10T05:09:40Z |
dc.type.status.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/publishedVersion |
dc.type.driver.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/doctoralThesis |
format |
doctoralThesis |
status_str |
publishedVersion |
dc.identifier.uri.fl_str_mv |
http://hdl.handle.net/1843/BUBD-9HHGLS |
url |
http://hdl.handle.net/1843/BUBD-9HHGLS |
dc.language.iso.fl_str_mv |
por |
language |
por |
dc.rights.driver.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/openAccess |
eu_rights_str_mv |
openAccess |
dc.publisher.none.fl_str_mv |
Universidade Federal de Minas Gerais |
dc.publisher.initials.fl_str_mv |
UFMG |
publisher.none.fl_str_mv |
Universidade Federal de Minas Gerais |
dc.source.none.fl_str_mv |
reponame:Repositório Institucional da UFMG instname:Universidade Federal de Minas Gerais (UFMG) instacron:UFMG |
instname_str |
Universidade Federal de Minas Gerais (UFMG) |
instacron_str |
UFMG |
institution |
UFMG |
reponame_str |
Repositório Institucional da UFMG |
collection |
Repositório Institucional da UFMG |
bitstream.url.fl_str_mv |
https://repositorio.ufmg.br/bitstream/1843/BUBD-9HHGLS/1/doutorado_andr__andrade_v1_04_br.pdf https://repositorio.ufmg.br/bitstream/1843/BUBD-9HHGLS/2/doutorado_andr__andrade_v1_04_br.pdf.txt |
bitstream.checksum.fl_str_mv |
d2800d43efb4fe93ceed9fae892f9291 b293f8b54599c7d7a66cadc958f3f7b4 |
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv |
MD5 MD5 |
repository.name.fl_str_mv |
Repositório Institucional da UFMG - Universidade Federal de Minas Gerais (UFMG) |
repository.mail.fl_str_mv |
|
_version_ |
1803589526349676544 |