Genotypic characterization of psittacid herpesvirus isolates from Brazil
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Data de Publicação: | 2016 |
Outros Autores: | , , , , |
Tipo de documento: | Artigo |
Idioma: | eng |
Título da fonte: | Repositório Institucional da UFMG |
Texto Completo: | https://doi.org/10.1016/j.bjm.2015.11.017 http://hdl.handle.net/1843/67429 https://orcid.org/0000-0003-3028-9063 https://orcid.org/0000-0002-8052-5389 https://orcid.org/0000-0002-1416-8694 |
Resumo: | Trinta e seis isolados de herpesvírus psitacídeos (PsHV), obtidos de 12 espécies diferentes de psitacídeos do Brasil, foram caracterizados genotipicamente por análise de polimorfismo de comprimento de fragmentos de restrição (RFLP) e amplificação por PCR. A análise RFLP com a enzima PstI revelou quatro padrões de restrição distintos (A1, X, W e Y), dos quais apenas A1 (correspondente ao PsHV-1) havia sido previamente descrito. Para estudar os padrões de amplificação por PCR, foram utilizados seis pares de primers. Utilizando esse método, foram identificadas seis variantes, das quais as variantes 10, 8 e 9 (nesta ordem) foram as mais prevalentes, seguidas pelas variantes 1, 4 e 5. Não foi possível correlacionar os padrões de PCR e RFLP. Vinte e nove dos 36 isolados demonstraram conter um fragmento de 419 pb do gene UL16, apresentando alta similaridade com as sequências do PsHV-1 disponíveis no GenBank. A comparação dos resultados com os dados da literatura sugere que os 36 isolados brasileiros deste estudo pertencem ao genótipo 1 e ao sorotipo 1. |
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Genotypic characterization of psittacid herpesvirus isolates from BrazilCaracterização genotípica de herpesvírus psitacídeos isolados do BrasilPsittacid herpesvirusPstIRFLPPCRHerpesvírus em animaisPsitacídeoPolimorfismo de fragmento de restriçãoReação em cadeia da polimeraseTrinta e seis isolados de herpesvírus psitacídeos (PsHV), obtidos de 12 espécies diferentes de psitacídeos do Brasil, foram caracterizados genotipicamente por análise de polimorfismo de comprimento de fragmentos de restrição (RFLP) e amplificação por PCR. A análise RFLP com a enzima PstI revelou quatro padrões de restrição distintos (A1, X, W e Y), dos quais apenas A1 (correspondente ao PsHV-1) havia sido previamente descrito. Para estudar os padrões de amplificação por PCR, foram utilizados seis pares de primers. Utilizando esse método, foram identificadas seis variantes, das quais as variantes 10, 8 e 9 (nesta ordem) foram as mais prevalentes, seguidas pelas variantes 1, 4 e 5. Não foi possível correlacionar os padrões de PCR e RFLP. Vinte e nove dos 36 isolados demonstraram conter um fragmento de 419 pb do gene UL16, apresentando alta similaridade com as sequências do PsHV-1 disponíveis no GenBank. A comparação dos resultados com os dados da literatura sugere que os 36 isolados brasileiros deste estudo pertencem ao genótipo 1 e ao sorotipo 1.Thirty-six isolates of psittacid herpesvirus (PsHV), obtained from 12 different species of psittacids in Brazil, were genotypically characterized by restriction fragment length polymorphism (RFLP) analysis and PCR amplification. RFLP analysis with the PstI enzyme revealed four distinct restriction patterns (A1, X, W and Y), of which only A1 (corresponding to PsHV-1) had previously been described. To study PCR amplification patterns, six pairs of primers were used. Using this method, six variants were identified, of which, variants 10, 8, and 9 (in this order) were most prevalent, followed by variants 1, 4, and 5. It was not possible to correlate the PCR and RFLP patterns. Twenty-nine of the 36 isolates were shown to contain a 419 bp fragment of the UL16 gene, displaying high similarity to the PsHV-1 sequences available in GenBank. Comparison of the results with the literature data suggests that the 36 Brazilian isolates from this study belong to genotype 1 and serotype 1.CNPq - Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e TecnológicoFAPEMIG - Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas GeraisCAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível SuperiorUniversidade Federal de Minas GeraisBrasilICB - DEPARTAMENTO DE MICROBIOLOGIAVET - DEPARTAMENTO DE CLÍNICA E CIRURGIAUFMG2024-04-18T20:34:57Z2024-04-18T20:34:57Z2016info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/articlepdfapplication/pdfhttps://doi.org/10.1016/j.bjm.2015.11.0171678-4405http://hdl.handle.net/1843/67429https://orcid.org/0000-0003-3028-9063https://orcid.org/0000-0002-8052-5389https://orcid.org/0000-0002-1416-8694engBrazilian journal of microbiologyMarcela Miranda LuppiAna Paula Moreira Franco LuizFabiana Magalhães CoelhoRoselene EccoFlávio Guimarães da FonsecaMauricio Resendeinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da UFMGinstname:Universidade Federal de Minas Gerais (UFMG)instacron:UFMG2024-04-18T20:34:58Zoai:repositorio.ufmg.br:1843/67429Repositório InstitucionalPUBhttps://repositorio.ufmg.br/oairepositorio@ufmg.bropendoar:2024-04-18T20:34:58Repositório Institucional da UFMG - Universidade Federal de Minas Gerais (UFMG)false |
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Trinta e seis isolados de herpesvírus psitacídeos (PsHV), obtidos de 12 espécies diferentes de psitacídeos do Brasil, foram caracterizados genotipicamente por análise de polimorfismo de comprimento de fragmentos de restrição (RFLP) e amplificação por PCR. A análise RFLP com a enzima PstI revelou quatro padrões de restrição distintos (A1, X, W e Y), dos quais apenas A1 (correspondente ao PsHV-1) havia sido previamente descrito. Para estudar os padrões de amplificação por PCR, foram utilizados seis pares de primers. Utilizando esse método, foram identificadas seis variantes, das quais as variantes 10, 8 e 9 (nesta ordem) foram as mais prevalentes, seguidas pelas variantes 1, 4 e 5. Não foi possível correlacionar os padrões de PCR e RFLP. Vinte e nove dos 36 isolados demonstraram conter um fragmento de 419 pb do gene UL16, apresentando alta similaridade com as sequências do PsHV-1 disponíveis no GenBank. A comparação dos resultados com os dados da literatura sugere que os 36 isolados brasileiros deste estudo pertencem ao genótipo 1 e ao sorotipo 1. |
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