DNA ambiental metabarcoding aplicado ao manejo e conservação de peixes

• Autor(a) principal: Izabela Santos Mendes
• Data de Publicação: 2023
• Tipo de documento: Tese
• Idioma: por
• Título da fonte: Repositório Institucional da UFMG
• Texto Completo: http://hdl.handle.net/1843/62423
• topic: eDNA; inventariamento; monitoramento; 12S; ictiofauna; região neotropical; Genética; Peixes; Biodiversidade; Monitoramento; DNA Ambiental

A região Neotropical compreende uma das maiores diversidades de peixes de água doce do mundo. Entretanto, essa biodiversidade enfrenta níveis sem precedentes de impactos antrópicos. Dessa forma, a avaliação da biodiversidade é essencial para a definição das mais adequadas estratégias de manejo e conservação. Essa avaliação depende da detecção confiável e da identificação precisa das espécies; assim, métodos adicionais, associados à identificação taxonômica tradicional, estão sendo cada vez mais implementados em todo o mundo, como é o caso do DNA ambiental metabarcoding. Entretanto, apesar do aumento exponencial de publicações de eDNA metabarcoding, a maioria dos estudos tem sido conduzido em regiões temperadas e em áreas razoavelmente acessíveis e poucos estudos são conduzidos em regiões megadiversas, como a região Neotropical, especialmente em regiões afetadas por represamentos, um dos maiores estressores para a comunidade de peixes de água doce. Atualmente, o entendimento de como o eDNA metabarcoding poderá ser um método bem estabelecido para avaliação da biodiversidade e monitoramento ecológico em reservatórios é relativamente limitado e aspectos metodológicos como a falta de conhecimento da biodiversidade local e ausência de sequências no banco de dados referência, vieses de primer e as diferentes formas de identificação taxonômica (MOTUs x ASVs) precisam ser melhor avaliados e compreendidos antes de aplicar essa técnica na identificação da comunidade de peixes em larga escala. Nessa tese, primeiramente, desenvolvemos um conjunto de primers mini-barcodes, baseado em um banco de dados referência customizado. Posteriormente, validamos esse conjunto de marcadores moleculares em uma comunidade simulada de espécies de peixes neotropicais e por fim, aplicamos a metodologia do eDNA metabarcoding em um reservatório Neotropical, comparando os resultados obtidos aos dados de redes de emalhar, representando os métodos tradicionais de pesca. Coletivamente, os resultados dessa tese evidenciam a importância de um banco de dados referência customizado para a identificação correta e confiável do DNA ambiental. Além disso, nossos resultados demonstraram uma diferença significativa na comunidade de peixes, demonstrando o papel complementar do eDNA metabarcoding no monitoramento de peixes.